MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 66075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
66001	NC_010159	CATA	2	8	4499148	4499155	50 %	25 %	0 %	25 %	162419287
66002	NC_010159	TGGCC	2	10	4499191	4499200	0 %	20 %	40 %	40 %	162419287
66003	NC_010159	TTG	2	6	4499206	4499211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419287
66004	NC_010159	CAGACC	2	12	4499310	4499321	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	162419968
66005	NC_010159	GCA	2	6	4499378	4499383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419968
66006	NC_010159	TCAGG	2	10	4499390	4499399	20 %	20 %	40 %	20 %	162419968
66007	NC_010159	ACC	2	6	4499427	4499432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419968
66008	NC_010159	GCA	2	6	4499452	4499457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419968
66009	NC_010159	CAT	2	6	4499475	4499480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419968
66010	NC_010159	CAG	2	6	4499499	4499504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419968
66011	NC_010159	GA	3	6	4499597	4499602	50 %	0 %	50 %	0 %	292659870
66012	NC_010159	ACC	2	6	4499694	4499699	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	292659870
66013	NC_010159	CAG	2	6	4499788	4499793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292659870
66014	NC_010159	GAAT	2	8	4499823	4499830	50 %	25 %	25 %	0 %	292659870
66015	NC_010159	GCC	2	6	4499872	4499877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	292659870
66016	NC_010159	AAT	2	6	4499905	4499910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	292659870
66017	NC_010159	CAT	2	6	4500037	4500042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292659870
66018	NC_010159	TCA	2	6	4500045	4500050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	292659870
66019	NC_010159	CAAA	2	8	4500059	4500066	75 %	0 %	0 %	25 %	292659870
66020	NC_010159	ACTTT	2	10	4500092	4500101	20 %	60 %	0 %	20 %	292659870
66021	NC_010159	CAG	2	6	4500156	4500161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292659870
66022	NC_010159	TGG	2	6	4500186	4500191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	292659870
66023	NC_010159	GCA	2	6	4500197	4500202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	292659870
66024	NC_010159	AGA	2	6	4500246	4500251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	292659870
66025	NC_010159	GCT	2	6	4500623	4500628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419205
66026	NC_010159	GGC	2	6	4500642	4500647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419205
66027	NC_010159	C	6	6	4500691	4500696	0 %	0 %	0 %	100 %	162419205
66028	NC_010159	AAC	2	6	4500751	4500756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419205
66029	NC_010159	AGTT	2	8	4501486	4501493	25 %	50 %	25 %	0 %	162419517
66030	NC_010159	AAT	2	6	4501503	4501508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419517
66031	NC_010159	TCCA	2	8	4501521	4501528	25 %	25 %	0 %	50 %	162419517
66032	NC_010159	TCA	3	9	4501591	4501599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419517
66033	NC_010159	GTG	2	6	4501650	4501655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419517
66034	NC_010159	CTCTG	2	10	4501739	4501748	0 %	40 %	20 %	40 %	162419517
66035	NC_010159	CAA	2	6	4501824	4501829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419517
66036	NC_010159	AGC	2	6	4502017	4502022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419517
66037	NC_010159	AG	3	6	4502086	4502091	50 %	0 %	50 %	0 %	162419517
66038	NC_010159	T	7	7	4502097	4502103	0 %	100 %	0 %	0 %	162419517
66039	NC_010159	GCG	2	6	4502263	4502268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420790
66040	NC_010159	CAA	2	6	4502269	4502274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420790
66041	NC_010159	T	6	6	4502281	4502286	0 %	100 %	0 %	0 %	162420790
66042	NC_010159	AGAT	2	8	4502301	4502308	50 %	25 %	25 %	0 %	162421890
66043	NC_010159	GTT	2	6	4502457	4502462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421890
66044	NC_010159	CTG	2	6	4502476	4502481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421890
66045	NC_010159	ATG	2	6	4502559	4502564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421890
66046	NC_010159	CAA	2	6	4502575	4502580	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421890
66047	NC_010159	CTT	2	6	4502625	4502630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162421890
66048	NC_010159	CAG	2	6	4502647	4502652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421890
66049	NC_010159	ATC	2	6	4502764	4502769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421890
66050	NC_010159	TCAG	2	8	4502795	4502802	25 %	25 %	25 %	25 %	162421890
66051	NC_010159	GCA	2	6	4502826	4502831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421890
66052	NC_010159	TACGG	2	10	4502862	4502871	20 %	20 %	40 %	20 %	162421890
66053	NC_010159	CCA	2	6	4502901	4502906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421890
66054	NC_010159	TCA	2	6	4502924	4502929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421890
66055	NC_010159	TCC	2	6	4502948	4502953	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162421890
66056	NC_010159	AGC	2	6	4502987	4502992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421890
66057	NC_010159	AT	3	6	4503059	4503064	50 %	50 %	0 %	0 %	162421890
66058	NC_010159	ATAGC	2	10	4503116	4503125	40 %	20 %	20 %	20 %	162421890
66059	NC_010159	AAT	2	6	4503133	4503138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162421890
66060	NC_010159	TCGA	2	8	4503302	4503309	25 %	25 %	25 %	25 %	162421890
66061	NC_010159	GAT	2	6	4503337	4503342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421890
66062	NC_010159	T	6	6	4503393	4503398	0 %	100 %	0 %	0 %	162421890
66063	NC_010159	TGT	2	6	4503437	4503442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162421890
66064	NC_010159	AAGA	2	8	4503455	4503462	75 %	0 %	25 %	0 %	162421890
66065	NC_010159	GTG	2	6	4503534	4503539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162421890
66066	NC_010159	CCA	2	6	4503626	4503631	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421890
66067	NC_010159	AAGG	2	8	4503667	4503674	50 %	0 %	50 %	0 %	162421890
66068	NC_010159	CAC	2	6	4503688	4503693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421890
66069	NC_010159	TG	3	6	4503722	4503727	0 %	50 %	50 %	0 %	162421890
66070	NC_010159	CAA	2	6	4503753	4503758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421890
66071	NC_010159	ATC	2	6	4503785	4503790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421890
66072	NC_010159	CCG	2	6	4503986	4503991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162421890
66073	NC_010159	GGC	2	6	4504078	4504083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421890
66074	NC_010159	CCA	2	6	4504100	4504105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162421890
66075	NC_010159	GAT	3	9	4504108	4504116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421890

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.