MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010158	TC	4	8	393	400	0 %	50 %	0 %	50 %	162417828
2	NC_010158	CG	3	6	622	627	0 %	0 %	50 %	50 %	162417828
3	NC_010158	TC	3	6	736	741	0 %	50 %	0 %	50 %	162417828
4	NC_010158	AG	3	6	4617	4622	50 %	0 %	50 %	0 %	162417887
5	NC_010158	TC	3	6	4650	4655	0 %	50 %	0 %	50 %	162417887
6	NC_010158	AC	3	6	6236	6241	50 %	0 %	0 %	50 %	162417857
7	NC_010158	AT	3	6	6745	6750	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
8	NC_010158	AT	3	6	6889	6894	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
9	NC_010158	AT	3	6	7247	7252	50 %	50 %	0 %	0 %	162417902
10	NC_010158	GA	3	6	7352	7357	50 %	0 %	50 %	0 %	162417902
11	NC_010158	GT	3	6	8101	8106	0 %	50 %	50 %	0 %	162417890
12	NC_010158	TC	4	8	10001	10008	0 %	50 %	0 %	50 %	162417912
13	NC_010158	CG	3	6	10230	10235	0 %	0 %	50 %	50 %	162417912
14	NC_010158	TC	3	6	10344	10349	0 %	50 %	0 %	50 %	162417912
15	NC_010158	AG	3	6	14225	14230	50 %	0 %	50 %	0 %	162417849
16	NC_010158	TC	3	6	14258	14263	0 %	50 %	0 %	50 %	162417849
17	NC_010158	AC	3	6	15844	15849	50 %	0 %	0 %	50 %	162417846
18	NC_010158	AT	3	6	16353	16358	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
19	NC_010158	AT	3	6	16497	16502	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
20	NC_010158	AT	3	6	16855	16860	50 %	50 %	0 %	0 %	162417870
21	NC_010158	GA	3	6	16960	16965	50 %	0 %	50 %	0 %	162417870
22	NC_010158	GT	3	6	17709	17714	0 %	50 %	50 %	0 %	162417863
23	NC_010158	TC	4	8	19609	19616	0 %	50 %	0 %	50 %	162417833
24	NC_010158	CG	3	6	19838	19843	0 %	0 %	50 %	50 %	162417833
25	NC_010158	TC	3	6	19952	19957	0 %	50 %	0 %	50 %	162417833
26	NC_010158	CT	3	6	22318	22323	0 %	50 %	0 %	50 %	162417927
27	NC_010158	GC	4	8	22427	22434	0 %	0 %	50 %	50 %	162417927
28	NC_010158	AG	3	6	23351	23356	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
29	NC_010158	GC	3	6	23606	23611	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
30	NC_010158	CG	3	6	24070	24075	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
31	NC_010158	AG	3	6	24464	24469	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
32	NC_010158	CG	3	6	24590	24595	0 %	0 %	50 %	50 %	162417878
33	NC_010158	GA	3	6	24624	24629	50 %	0 %	50 %	0 %	162417878
34	NC_010158	AG	3	6	26371	26376	50 %	0 %	50 %	0 %	162417866
35	NC_010158	TG	3	6	26591	26596	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
36	NC_010158	GT	3	6	27689	27694	0 %	50 %	50 %	0 %	162417866
37	NC_010158	AG	3	6	29033	29038	50 %	0 %	50 %	0 %	162417843
38	NC_010158	TC	4	8	30950	30957	0 %	50 %	0 %	50 %	162417893
39	NC_010158	CA	3	6	32222	32227	50 %	0 %	0 %	50 %	162417869
40	NC_010158	GT	3	6	35451	35456	0 %	50 %	50 %	0 %	162417913
41	NC_010158	CG	4	8	38605	38612	0 %	0 %	50 %	50 %	162417832
42	NC_010158	TG	3	6	40401	40406	0 %	50 %	50 %	0 %	162417905
43	NC_010158	AG	3	6	41928	41933	50 %	0 %	50 %	0 %	162417830
44	NC_010158	GC	3	6	42575	42580	0 %	0 %	50 %	50 %	162417929
45	NC_010158	GA	3	6	44207	44212	50 %	0 %	50 %	0 %	162417841
46	NC_010158	CG	3	6	44254	44259	0 %	0 %	50 %	50 %	162417841
47	NC_010158	TC	3	6	44525	44530	0 %	50 %	0 %	50 %	162417842
48	NC_010158	CT	3	6	45079	45084	0 %	50 %	0 %	50 %	162417900
49	NC_010158	CG	3	6	46014	46019	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
50	NC_010158	CG	3	6	46144	46149	0 %	0 %	50 %	50 %	162417900
51	NC_010158	AC	3	6	50401	50406	50 %	0 %	0 %	50 %	162417941
52	NC_010158	GT	3	6	51044	51049	0 %	50 %	50 %	0 %	162417876
53	NC_010158	CG	3	6	51098	51103	0 %	0 %	50 %	50 %	162417876
54	NC_010158	GT	3	6	51812	51817	0 %	50 %	50 %	0 %	162417876
55	NC_010158	AT	3	6	51921	51926	50 %	50 %	0 %	0 %	162417876
56	NC_010158	CG	3	6	52695	52700	0 %	0 %	50 %	50 %	162417881
57	NC_010158	CG	4	8	52789	52796	0 %	0 %	50 %	50 %	162417881
58	NC_010158	CT	3	6	53503	53508	0 %	50 %	0 %	50 %	162417881
59	NC_010158	AT	3	6	53754	53759	50 %	50 %	0 %	0 %	162417881
60	NC_010158	CT	3	6	55519	55524	0 %	50 %	0 %	50 %	162417932
61	NC_010158	GA	3	6	58447	58452	50 %	0 %	50 %	0 %	162417888
62	NC_010158	TC	3	6	59498	59503	0 %	50 %	0 %	50 %	162417924
63	NC_010158	GT	3	6	59585	59590	0 %	50 %	50 %	0 %	162417924
64	NC_010158	TC	3	6	61845	61850	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
65	NC_010158	CT	3	6	63278	63283	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
66	NC_010158	TC	3	6	63528	63533	0 %	50 %	0 %	50 %	162417827
67	NC_010158	CG	3	6	65276	65281	0 %	0 %	50 %	50 %	162417886
68	NC_010158	GT	3	6	65648	65653	0 %	50 %	50 %	0 %	162417880
69	NC_010158	AC	3	6	66928	66933	50 %	0 %	0 %	50 %	162417931
70	NC_010158	AC	3	6	68421	68426	50 %	0 %	0 %	50 %	162417852
71	NC_010158	CT	3	6	69828	69833	0 %	50 %	0 %	50 %	162417852
72	NC_010158	CG	3	6	70024	70029	0 %	0 %	50 %	50 %	162417852
73	NC_010158	AG	3	6	70212	70217	50 %	0 %	50 %	0 %	162417852
74	NC_010158	CG	3	6	71328	71333	0 %	0 %	50 %	50 %	162417852
75	NC_010158	AT	3	6	72055	72060	50 %	50 %	0 %	0 %	162417852
76	NC_010158	GA	3	6	72066	72071	50 %	0 %	50 %	0 %	162417852
77	NC_010158	GC	3	6	73417	73422	0 %	0 %	50 %	50 %	162417871
78	NC_010158	TA	3	6	75056	75061	50 %	50 %	0 %	0 %	162417871
79	NC_010158	GT	3	6	75180	75185	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
80	NC_010158	GT	3	6	75216	75221	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
81	NC_010158	CA	3	6	75556	75561	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
82	NC_010158	CA	3	6	75738	75743	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
83	NC_010158	AT	3	6	76193	76198	50 %	50 %	0 %	0 %	162417894
84	NC_010158	TC	3	6	76423	76428	0 %	50 %	0 %	50 %	162417894
85	NC_010158	GA	3	6	77688	77693	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
86	NC_010158	CG	3	6	77802	77807	0 %	0 %	50 %	50 %	162417822
87	NC_010158	GA	4	8	78029	78036	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
88	NC_010158	GA	3	6	78588	78593	50 %	0 %	50 %	0 %	162417895
89	NC_010158	GT	4	8	79206	79213	0 %	50 %	50 %	0 %	162417940
90	NC_010158	CA	3	6	79776	79781	50 %	0 %	0 %	50 %	162417940
91	NC_010158	CT	3	6	81155	81160	0 %	50 %	0 %	50 %	162417834
92	NC_010158	CA	3	6	81563	81568	50 %	0 %	0 %	50 %	162417834
93	NC_010158	TG	3	6	82038	82043	0 %	50 %	50 %	0 %	162417889
94	NC_010158	CG	3	6	84122	84127	0 %	0 %	50 %	50 %	162417899
95	NC_010158	CT	3	6	84636	84641	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
96	NC_010158	GT	3	6	85411	85416	0 %	50 %	50 %	0 %	162417899
97	NC_010158	AT	3	6	86142	86147	50 %	50 %	0 %	0 %	162417899
98	NC_010158	CT	3	6	86148	86153	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
99	NC_010158	TC	3	6	86316	86321	0 %	50 %	0 %	50 %	162417899
100	NC_010158	AG	3	6	86551	86556	50 %	0 %	50 %	0 %	162417911
101	NC_010158	AC	3	6	87055	87060	50 %	0 %	0 %	50 %	162417848
102	NC_010158	GT	3	6	87403	87408	0 %	50 %	50 %	0 %	162417848
103	NC_010158	GA	3	6	87613	87618	50 %	0 %	50 %	0 %	162417848
104	NC_010158	TG	3	6	89883	89888	0 %	50 %	50 %	0 %	162417839
105	NC_010158	CT	3	6	89989	89994	0 %	50 %	0 %	50 %	162417839
106	NC_010158	CA	3	6	93118	93123	50 %	0 %	0 %	50 %	162417845
107	NC_010158	TG	3	6	98779	98784	0 %	50 %	50 %	0 %	162417824
108	NC_010158	TA	3	6	99274	99279	50 %	50 %	0 %	0 %	162417824
109	NC_010158	GA	3	6	99827	99832	50 %	0 %	50 %	0 %	162417854
110	NC_010158	AG	3	6	101272	101277	50 %	0 %	50 %	0 %	162417860
111	NC_010158	AT	4	8	103904	103911	50 %	50 %	0 %	0 %	162417915
112	NC_010158	AT	3	6	104811	104816	50 %	50 %	0 %	0 %	162417915
113	NC_010158	CA	3	6	106386	106391	50 %	0 %	0 %	50 %	162417928
114	NC_010158	AT	3	6	108528	108533	50 %	50 %	0 %	0 %	162417875
115	NC_010158	CA	3	6	108921	108926	50 %	0 %	0 %	50 %	162417875
116	NC_010158	GC	3	6	109068	109073	0 %	0 %	50 %	50 %	162417875
117	NC_010158	TG	3	6	109177	109182	0 %	50 %	50 %	0 %	162417936
118	NC_010158	GC	3	6	109866	109871	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
119	NC_010158	GC	3	6	110238	110243	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
120	NC_010158	CG	3	6	110266	110271	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
121	NC_010158	CG	3	6	111980	111985	0 %	0 %	50 %	50 %	162417904
122	NC_010158	GC	3	6	112925	112930	0 %	0 %	50 %	50 %	162417859

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.