MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 1593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010158	CCAG	2	8	108317	108324	25 %	0 %	25 %	50 %	162417938
1502	NC_010158	CTGCG	2	10	108339	108348	0 %	20 %	40 %	40 %	162417938
1503	NC_010158	AT	3	6	108528	108533	50 %	50 %	0 %	0 %	162417875
1504	NC_010158	A	6	6	108628	108633	100 %	0 %	0 %	0 %	162417875
1505	NC_010158	GCC	2	6	108685	108690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417875
1506	NC_010158	CAC	2	6	108868	108873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417875
1507	NC_010158	CCGA	2	8	108874	108881	25 %	0 %	25 %	50 %	162417875
1508	NC_010158	CA	3	6	108921	108926	50 %	0 %	0 %	50 %	162417875
1509	NC_010158	GCC	2	6	108979	108984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417875
1510	NC_010158	CGT	2	6	108997	109002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417875
1511	NC_010158	CAG	2	6	109045	109050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417875
1512	NC_010158	GCC	2	6	109057	109062	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417875
1513	NC_010158	GC	3	6	109068	109073	0 %	0 %	50 %	50 %	162417875
1514	NC_010158	ACG	2	6	109094	109099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417875
1515	NC_010158	TG	3	6	109177	109182	0 %	50 %	50 %	0 %	162417936
1516	NC_010158	GGC	2	6	109292	109297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417936
1517	NC_010158	ACC	2	6	109833	109838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417896
1518	NC_010158	GC	3	6	109866	109871	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
1519	NC_010158	ATGG	2	8	109888	109895	25 %	25 %	50 %	0 %	162417896
1520	NC_010158	GGAT	2	8	109941	109948	25 %	25 %	50 %	0 %	162417896
1521	NC_010158	ATT	2	6	110070	110075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417896
1522	NC_010158	CGC	2	6	110101	110106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417896
1523	NC_010158	GGA	2	6	110114	110119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417896
1524	NC_010158	GC	3	6	110238	110243	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
1525	NC_010158	GGC	2	6	110252	110257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417896
1526	NC_010158	CG	3	6	110266	110271	0 %	0 %	50 %	50 %	162417896
1527	NC_010158	CTG	2	6	110336	110341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417896
1528	NC_010158	GAT	2	6	110349	110354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417896
1529	NC_010158	GGT	2	6	110366	110371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417896
1530	NC_010158	CAG	2	6	110405	110410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417896
1531	NC_010158	TGC	2	6	110476	110481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417896
1532	NC_010158	TGGA	2	8	110508	110515	25 %	25 %	50 %	0 %	162417896
1533	NC_010158	ACC	2	6	111014	111019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417823
1534	NC_010158	GCA	2	6	111063	111068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417823
1535	NC_010158	GGA	2	6	111109	111114	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417823
1536	NC_010158	CCAGGA	2	12	111172	111183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417823
1537	NC_010158	CGC	2	6	111235	111240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417823
1538	NC_010158	GAA	2	6	111254	111259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417823
1539	NC_010158	TGA	2	6	111325	111330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417823
1540	NC_010158	CAG	2	6	111463	111468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417823
1541	NC_010158	TGC	2	6	111942	111947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417904
1542	NC_010158	CTT	2	6	111952	111957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417904
1543	NC_010158	CG	3	6	111980	111985	0 %	0 %	50 %	50 %	162417904
1544	NC_010158	CGT	2	6	111989	111994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417904
1545	NC_010158	CGA	2	6	112247	112252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417935
1546	NC_010158	GCG	2	6	112284	112289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417935
1547	NC_010158	GGC	2	6	112392	112397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417935
1548	NC_010158	AAGA	2	8	112450	112457	75 %	0 %	25 %	0 %	162417935
1549	NC_010158	A	6	6	112557	112562	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859
1550	NC_010158	AGC	2	6	112566	112571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1551	NC_010158	A	7	7	112572	112578	100 %	0 %	0 %	0 %	162417859
1552	NC_010158	GAA	2	6	112593	112598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417859
1553	NC_010158	GCC	2	6	112608	112613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417859
1554	NC_010158	CTG	2	6	112740	112745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1555	NC_010158	CGGA	2	8	112771	112778	25 %	0 %	50 %	25 %	162417859
1556	NC_010158	GGT	2	6	112797	112802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417859
1557	NC_010158	GACT	2	8	112807	112814	25 %	25 %	25 %	25 %	162417859
1558	NC_010158	CTG	2	6	112824	112829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1559	NC_010158	GAC	2	6	112884	112889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1560	NC_010158	CCTCG	2	10	112898	112907	0 %	20 %	20 %	60 %	162417859
1561	NC_010158	AGC	2	6	112921	112926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1562	NC_010158	GC	3	6	112925	112930	0 %	0 %	50 %	50 %	162417859
1563	NC_010158	CCG	2	6	112942	112947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417859
1564	NC_010158	TCGGCT	2	12	113014	113025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1565	NC_010158	GCA	2	6	113286	113291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1566	NC_010158	ACGGC	2	10	113335	113344	20 %	0 %	40 %	40 %	162417859
1567	NC_010158	CAG	2	6	113406	113411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1568	NC_010158	AGC	4	12	113521	113532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1569	NC_010158	CGA	2	6	113579	113584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1570	NC_010158	AGG	2	6	113620	113625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417859
1571	NC_010158	GAC	2	6	113649	113654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1572	NC_010158	GAA	2	6	113742	113747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417859
1573	NC_010158	CAG	2	6	113756	113761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1574	NC_010158	CGC	2	6	113795	113800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417859
1575	NC_010158	GCT	2	6	113819	113824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1576	NC_010158	GGC	2	6	113861	113866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417859
1577	NC_010158	GCA	2	6	113873	113878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1578	NC_010158	TCT	2	6	113926	113931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417859
1579	NC_010158	ACG	2	6	113946	113951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1580	NC_010158	CTG	2	6	114069	114074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1581	NC_010158	CAC	2	6	114098	114103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417859
1582	NC_010158	CTT	2	6	114104	114109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417859
1583	NC_010158	CGG	2	6	114119	114124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417859
1584	NC_010158	GGC	2	6	114227	114232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417859
1585	NC_010158	TGG	2	6	114255	114260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417859
1586	NC_010158	CGA	2	6	114265	114270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1587	NC_010158	GCG	2	6	114342	114347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417859
1588	NC_010158	GAA	2	6	114365	114370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417859
1589	NC_010158	GCA	2	6	114378	114383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1590	NC_010158	GCA	2	6	114404	114409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1591	NC_010158	GAC	2	6	114468	114473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417859
1592	NC_010158	ACC	2	6	114507	114512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417859
1593	NC_010158	CGC	2	6	114524	114529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417859

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.