MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Angola plasmid pMT-pPCP

Total Repeats: 1593

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_010158	GCC	2	6	71107	71112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417852
1002	NC_010158	AGA	2	6	71118	71123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417852
1003	NC_010158	CTCTG	2	10	71247	71256	0 %	40 %	20 %	40 %	162417852
1004	NC_010158	GCT	2	6	71305	71310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1005	NC_010158	CG	3	6	71328	71333	0 %	0 %	50 %	50 %	162417852
1006	NC_010158	CAG	2	6	71410	71415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1007	NC_010158	CCGATA	2	12	71432	71443	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	162417852
1008	NC_010158	CTG	2	6	71453	71458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1009	NC_010158	GCG	2	6	71489	71494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417852
1010	NC_010158	GCAG	2	8	71559	71566	25 %	0 %	50 %	25 %	162417852
1011	NC_010158	CGC	2	6	71715	71720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417852
1012	NC_010158	CAA	2	6	71766	71771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417852
1013	NC_010158	TGC	2	6	71793	71798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1014	NC_010158	GCA	2	6	71909	71914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1015	NC_010158	TAC	2	6	71968	71973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417852
1016	NC_010158	GGA	2	6	71988	71993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162417852
1017	NC_010158	AGC	2	6	72047	72052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417852
1018	NC_010158	AT	3	6	72055	72060	50 %	50 %	0 %	0 %	162417852
1019	NC_010158	GA	3	6	72066	72071	50 %	0 %	50 %	0 %	162417852
1020	NC_010158	AATC	2	8	72082	72089	50 %	25 %	0 %	25 %	162417852
1021	NC_010158	TTA	2	6	72102	72107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417852
1022	NC_010158	TGAA	2	8	72182	72189	50 %	25 %	25 %	0 %	162417852
1023	NC_010158	CTGGCA	2	12	72987	72998	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1024	NC_010158	ACA	2	6	73056	73061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417871
1025	NC_010158	GAAG	2	8	73135	73142	50 %	0 %	50 %	0 %	162417871
1026	NC_010158	CAT	2	6	73153	73158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417871
1027	NC_010158	TGA	2	6	73264	73269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417871
1028	NC_010158	TCG	2	6	73326	73331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1029	NC_010158	GC	3	6	73417	73422	0 %	0 %	50 %	50 %	162417871
1030	NC_010158	GCG	2	6	73430	73435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417871
1031	NC_010158	TTCAGC	2	12	73483	73494	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	162417871
1032	NC_010158	GCT	2	6	73655	73660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1033	NC_010158	TCT	2	6	73676	73681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417871
1034	NC_010158	GCT	4	12	73742	73753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1035	NC_010158	AGC	2	6	73759	73764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1036	NC_010158	ATG	2	6	73866	73871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417871
1037	NC_010158	GCT	2	6	73919	73924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1038	NC_010158	AGC	2	6	73987	73992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1039	NC_010158	CGG	2	6	74019	74024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417871
1040	NC_010158	GCA	2	6	74127	74132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1041	NC_010158	CAA	2	6	74145	74150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417871
1042	NC_010158	CAG	2	6	74156	74161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1043	NC_010158	GTT	2	6	74165	74170	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417871
1044	NC_010158	AGT	2	6	74177	74182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417871
1045	NC_010158	CTG	3	9	74319	74327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1046	NC_010158	TTG	2	6	74376	74381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417871
1047	NC_010158	GCTG	2	8	74416	74423	0 %	25 %	50 %	25 %	162417871
1048	NC_010158	AGC	2	6	74481	74486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1049	NC_010158	TGGA	2	8	74490	74497	25 %	25 %	50 %	0 %	162417871
1050	NC_010158	TTG	2	6	74552	74557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417871
1051	NC_010158	GGC	2	6	74572	74577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417871
1052	NC_010158	ATT	2	6	74626	74631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417871
1053	NC_010158	GGT	2	6	74688	74693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417871
1054	NC_010158	CAG	2	6	74868	74873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1055	NC_010158	AAT	2	6	74978	74983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417871
1056	NC_010158	GTT	2	6	74995	75000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162417871
1057	NC_010158	TA	3	6	75056	75061	50 %	50 %	0 %	0 %	162417871
1058	NC_010158	AGT	2	6	75068	75073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417871
1059	NC_010158	ACC	2	6	75079	75084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417871
1060	NC_010158	CAT	2	6	75151	75156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417871
1061	NC_010158	GT	3	6	75180	75185	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
1062	NC_010158	GGC	2	6	75196	75201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417871
1063	NC_010158	GT	3	6	75216	75221	0 %	50 %	50 %	0 %	162417871
1064	NC_010158	TGGA	2	8	75235	75242	25 %	25 %	50 %	0 %	162417871
1065	NC_010158	ACCA	2	8	75349	75356	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
1066	NC_010158	ACA	2	6	75552	75557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417871
1067	NC_010158	CA	3	6	75556	75561	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
1068	NC_010158	AGT	2	6	75596	75601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417871
1069	NC_010158	CTG	2	6	75633	75638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417871
1070	NC_010158	CTCA	2	8	75684	75691	25 %	25 %	0 %	50 %	162417871
1071	NC_010158	CA	3	6	75738	75743	50 %	0 %	0 %	50 %	162417871
1072	NC_010158	CTG	2	6	76173	76178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417894
1073	NC_010158	AT	3	6	76193	76198	50 %	50 %	0 %	0 %	162417894
1074	NC_010158	ACC	2	6	76262	76267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417894
1075	NC_010158	GAC	2	6	76268	76273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417894
1076	NC_010158	GAA	2	6	76326	76331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417894
1077	NC_010158	ATC	2	6	76333	76338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417894
1078	NC_010158	TC	3	6	76423	76428	0 %	50 %	0 %	50 %	162417894
1079	NC_010158	GAA	2	6	76476	76481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417894
1080	NC_010158	AGA	2	6	76486	76491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417894
1081	NC_010158	TGA	2	6	76531	76536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417894
1082	NC_010158	CAA	2	6	76548	76553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417894
1083	NC_010158	TGA	2	6	76595	76600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417894
1084	NC_010158	GAA	2	6	76704	76709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417894
1085	NC_010158	TAAA	2	8	76727	76734	75 %	25 %	0 %	0 %	162417894
1086	NC_010158	TCTG	2	8	76908	76915	0 %	50 %	25 %	25 %	162417822
1087	NC_010158	TTTGA	2	10	76933	76942	20 %	60 %	20 %	0 %	162417822
1088	NC_010158	GTG	2	6	76954	76959	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162417822
1089	NC_010158	TGC	2	6	76990	76995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1090	NC_010158	GAA	2	6	77086	77091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417822
1091	NC_010158	CTT	2	6	77100	77105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417822
1092	NC_010158	CTGA	2	8	77107	77114	25 %	25 %	25 %	25 %	162417822
1093	NC_010158	TCA	2	6	77132	77137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417822
1094	NC_010158	ATG	2	6	77138	77143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417822
1095	NC_010158	G	6	6	77151	77156	0 %	0 %	100 %	0 %	162417822
1096	NC_010158	CGT	2	6	77176	77181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1097	NC_010158	CTG	3	9	77229	77237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1098	NC_010158	TGAG	2	8	77358	77365	25 %	25 %	50 %	0 %	162417822
1099	NC_010158	T	6	6	77422	77427	0 %	100 %	0 %	0 %	162417822
1100	NC_010158	CTG	2	6	77452	77457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1101	NC_010158	CAGC	2	8	77527	77534	25 %	0 %	25 %	50 %	162417822
1102	NC_010158	ACCTT	2	10	77645	77654	20 %	40 %	0 %	40 %	162417822
1103	NC_010158	GA	3	6	77688	77693	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
1104	NC_010158	ACA	2	6	77793	77798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162417822
1105	NC_010158	CG	3	6	77802	77807	0 %	0 %	50 %	50 %	162417822
1106	NC_010158	CAC	2	6	77811	77816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417822
1107	NC_010158	AAG	2	6	77819	77824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162417822
1108	NC_010158	GTC	2	6	77976	77981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1109	NC_010158	CGAAC	2	10	77994	78003	40 %	0 %	20 %	40 %	162417822
1110	NC_010158	GCTCCT	2	12	78009	78020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	162417822
1111	NC_010158	GA	4	8	78029	78036	50 %	0 %	50 %	0 %	162417822
1112	NC_010158	GAAT	2	8	78039	78046	50 %	25 %	25 %	0 %	162417822
1113	NC_010158	GCGA	2	8	78094	78101	25 %	0 %	50 %	25 %	162417822
1114	NC_010158	CAG	2	6	78186	78191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417822
1115	NC_010158	GGC	2	6	78209	78214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162417822
1116	NC_010158	CGTT	2	8	78418	78425	0 %	50 %	25 %	25 %	162417895
1117	NC_010158	CAG	2	6	78427	78432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417895
1118	NC_010158	TGCTTG	2	12	78467	78478	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	162417895
1119	NC_010158	TCGCCA	2	12	78533	78544	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	162417895
1120	NC_010158	CAG	2	6	78547	78552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417895
1121	NC_010158	GA	3	6	78588	78593	50 %	0 %	50 %	0 %	162417895
1122	NC_010158	GTC	2	6	78610	78615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417895
1123	NC_010158	TCA	2	6	78660	78665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417895
1124	NC_010158	CTT	2	6	78699	78704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417895
1125	NC_010158	TCT	2	6	78708	78713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417895
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1249	NC_010158	CAGC	2	8	86818	86825	25 %	0 %	25 %	50 %	162417848
1250	NC_010158	CGC	2	6	86891	86896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162417848
1251	NC_010158	TCG	2	6	86931	86936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417848
1252	NC_010158	TGA	2	6	87019	87024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417848
1253	NC_010158	CTGG	2	8	87046	87053	0 %	25 %	50 %	25 %	162417848
1254	NC_010158	AC	3	6	87055	87060	50 %	0 %	0 %	50 %	162417848
1255	NC_010158	TCA	2	6	87090	87095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417848
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1257	NC_010158	CGAG	2	8	87165	87172	25 %	0 %	50 %	25 %	162417848
1258	NC_010158	CTT	2	6	87193	87198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417848
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1261	NC_010158	CAT	2	6	87323	87328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417848
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1269	NC_010158	CAC	2	6	87753	87758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162417848
1270	NC_010158	TTC	2	6	87785	87790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417848
1271	NC_010158	GAC	2	6	87941	87946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417839
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1273	NC_010158	CGT	2	6	87999	88004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417839
1274	NC_010158	GTCA	2	8	88010	88017	25 %	25 %	25 %	25 %	162417839
1275	NC_010158	GCA	2	6	88104	88109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162417839
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1283	NC_010158	TCT	2	6	88518	88523	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417839
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1322	NC_010158	TGGC	2	8	93419	93426	0 %	25 %	50 %	25 %	162417845
1323	NC_010158	A	6	6	93472	93477	100 %	0 %	0 %	0 %	162417845
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1363	NC_010158	AAT	2	6	97846	97851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162417824
1364	NC_010158	TCA	2	6	97958	97963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417824
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1373	NC_010158	T	6	6	98300	98305	0 %	100 %	0 %	0 %	162417824
1374	NC_010158	ATT	2	6	98321	98326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162417824
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1475	NC_010158	CA	3	6	106386	106391	50 %	0 %	0 %	50 %	162417928
1476	NC_010158	CGCTT	2	10	106394	106403	0 %	40 %	20 %	40 %	162417928
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1480	NC_010158	GTTATT	2	12	106674	106685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	162417928
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1484	NC_010158	GTC	2	6	106882	106887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417928
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1493	NC_010158	TGA	3	9	107546	107554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417928
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1495	NC_010158	TGC	2	6	107755	107760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162417897
1496	NC_010158	TCT	2	6	107766	107771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162417897
1497	NC_010158	TGA	2	6	107812	107817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162417897
1498	NC_010158	CTC	2	6	107834	107839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417897
1499	NC_010158	CAT	2	6	107848	107853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162417897
1500	NC_010158	CTC	2	6	108148	108153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162417873

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