MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 1049

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 23Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_009704	GATTTT	2	12	55706	55717	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	153930577
1002	NC_009704	T	7	7	55714	55720	0 %	100 %	0 %	0 %	153930577
1003	NC_009704	ATC	2	6	55738	55743	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930577
1004	NC_009704	ACC	2	6	55744	55749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930577
1005	NC_009704	TAT	2	6	55758	55763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930577
1006	NC_009704	ATT	2	6	55771	55776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930577
1007	NC_009704	AGA	2	6	55849	55854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930577
1008	NC_009704	ATC	2	6	55870	55875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930577
1009	NC_009704	TAT	2	6	55881	55886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930577
1010	NC_009704	GCA	2	6	55899	55904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930577
1011	NC_009704	ATCCTC	2	12	55933	55944	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	153930577
1012	NC_009704	AGC	2	6	56089	56094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930577
1013	NC_009704	TCT	2	6	56127	56132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930577
1014	NC_009704	T	7	7	56256	56262	0 %	100 %	0 %	0 %	153930577
1015	NC_009704	GC	3	6	56279	56284	0 %	0 %	50 %	50 %	153930577
1016	NC_009704	TCT	2	6	56423	56428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930577
1017	NC_009704	TCG	2	6	56450	56455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930577
1018	NC_009704	TTG	2	6	56484	56489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930577
1019	NC_009704	GAT	2	6	56549	56554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930577
1020	NC_009704	T	8	8	56554	56561	0 %	100 %	0 %	0 %	153930577
1021	NC_009704	AT	3	6	56599	56604	50 %	50 %	0 %	0 %	153930613
1022	NC_009704	CTT	2	6	56621	56626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930613
1023	NC_009704	TGC	2	6	56628	56633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930613
1024	NC_009704	AGC	2	6	56640	56645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930613
1025	NC_009704	T	7	7	56648	56654	0 %	100 %	0 %	0 %	153930613
1026	NC_009704	ATC	2	6	56725	56730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930613
1027	NC_009704	CTT	2	6	56744	56749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930613
1028	NC_009704	ATG	2	6	56825	56830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930613
1029	NC_009704	TGA	2	6	56849	56854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930613
1030	NC_009704	GTA	2	6	56857	56862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930613
1031	NC_009704	ACA	2	6	56914	56919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930613
1032	NC_009704	AAC	2	6	56982	56987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930613
1033	NC_009704	CAA	2	6	57035	57040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930613
1034	NC_009704	TAA	2	6	57099	57104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930613
1035	NC_009704	A	6	6	57261	57266	100 %	0 %	0 %	0 %	153930613
1036	NC_009704	CAA	2	6	57323	57328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930613
1037	NC_009704	T	6	6	57341	57346	0 %	100 %	0 %	0 %	153930613
1038	NC_009704	T	7	7	57356	57362	0 %	100 %	0 %	0 %	153930613
1039	NC_009704	TTGC	2	8	57529	57536	0 %	50 %	25 %	25 %	153930613
1040	NC_009704	TTG	2	6	57578	57583	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930613
1041	NC_009704	T	6	6	57635	57640	0 %	100 %	0 %	0 %	153930613
1042	NC_009704	AT	3	6	57655	57660	50 %	50 %	0 %	0 %	153930613
1043	NC_009704	ATC	2	6	57837	57842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930624
1044	NC_009704	T	7	7	57852	57858	0 %	100 %	0 %	0 %	153930624
1045	NC_009704	A	7	7	57877	57883	100 %	0 %	0 %	0 %	153930624
1046	NC_009704	CAA	2	6	58016	58021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930624
1047	NC_009704	CAA	2	6	58059	58064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930624
1048	NC_009704	ATTG	2	8	58093	58100	25 %	50 %	25 %	0 %	153930624
1049	NC_009704	CGT	2	6	58102	58107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930624

< Previous 1 23Next >