MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 31758 plasmid_59kb

Total Repeats: 1049

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009704	GT	3	6	27023	27028	0 %	50 %	50 %	0 %	153930572
502	NC_009704	CCA	2	6	27032	27037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	153930572
503	NC_009704	AGT	2	6	27045	27050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930572
504	NC_009704	GC	3	6	27100	27105	0 %	0 %	50 %	50 %	153930572
505	NC_009704	CAGG	2	8	27115	27122	25 %	0 %	50 %	25 %	153930572
506	NC_009704	ATT	2	6	27140	27145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930572
507	NC_009704	AAC	2	6	27174	27179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930572
508	NC_009704	AAT	2	6	27491	27496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930570
509	NC_009704	AGAATT	2	12	27518	27529	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	153930570
510	NC_009704	GAAA	2	8	27564	27571	75 %	0 %	25 %	0 %	153930570
511	NC_009704	TTA	2	6	27603	27608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930570
512	NC_009704	TTAAA	2	10	27652	27661	60 %	40 %	0 %	0 %	153930570
513	NC_009704	TTA	2	6	27670	27675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930570
514	NC_009704	GAA	2	6	27708	27713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930570
515	NC_009704	TTA	2	6	27748	27753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930570
516	NC_009704	TGTT	2	8	27834	27841	0 %	75 %	25 %	0 %	153930570
517	NC_009704	TAA	2	6	27850	27855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930570
518	NC_009704	TAA	2	6	27883	27888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930570
519	NC_009704	ATG	2	6	27919	27924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930618
520	NC_009704	TTTATT	2	12	27934	27945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	153930618
521	NC_009704	ACA	2	6	27977	27982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930618
522	NC_009704	GCT	2	6	28012	28017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930618
523	NC_009704	CAA	2	6	28019	28024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930618
524	NC_009704	ACT	2	6	28093	28098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930618
525	NC_009704	ATG	2	6	28141	28146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930618
526	NC_009704	ACAG	2	8	28246	28253	50 %	0 %	25 %	25 %	153930618
527	NC_009704	ATA	2	6	28261	28266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930618
528	NC_009704	CCGT	2	8	28291	28298	0 %	25 %	25 %	50 %	153930618
529	NC_009704	T	8	8	28359	28366	0 %	100 %	0 %	0 %	153930604
530	NC_009704	AAT	2	6	28373	28378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930604
531	NC_009704	CAA	2	6	28381	28386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930604
532	NC_009704	TAC	2	6	28402	28407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930604
533	NC_009704	AGAGC	2	10	28422	28431	40 %	0 %	40 %	20 %	153930604
534	NC_009704	AAGTT	2	10	28456	28465	40 %	40 %	20 %	0 %	153930604
535	NC_009704	TG	3	6	28518	28523	0 %	50 %	50 %	0 %	153930604
536	NC_009704	T	6	6	28531	28536	0 %	100 %	0 %	0 %	153930604
537	NC_009704	TGC	2	6	28726	28731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930604
538	NC_009704	CT	3	6	28812	28817	0 %	50 %	0 %	50 %	153930604
539	NC_009704	CTA	2	6	28957	28962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930604
540	NC_009704	TA	3	6	28961	28966	50 %	50 %	0 %	0 %	153930604
541	NC_009704	TTA	2	6	29025	29030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930583
542	NC_009704	AGT	2	6	29040	29045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930583
543	NC_009704	AGC	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930583
544	NC_009704	TATC	2	8	29104	29111	25 %	50 %	0 %	25 %	153930583
545	NC_009704	AGT	2	6	29124	29129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930583
546	NC_009704	AGA	2	6	29180	29185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930583
547	NC_009704	A	6	6	29406	29411	100 %	0 %	0 %	0 %	153930583
548	NC_009704	ATT	2	6	29457	29462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930583
549	NC_009704	ATT	2	6	29543	29548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930609
550	NC_009704	CTAATT	2	12	29553	29564	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153930609
551	NC_009704	AAAT	2	8	29593	29600	75 %	25 %	0 %	0 %	153930609
552	NC_009704	TAA	2	6	29656	29661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930609
553	NC_009704	TTG	2	6	29680	29685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930609
554	NC_009704	TTAT	2	8	29703	29710	25 %	75 %	0 %	0 %	153930609
555	NC_009704	A	7	7	29756	29762	100 %	0 %	0 %	0 %	153930609
556	NC_009704	ATC	2	6	29792	29797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930609
557	NC_009704	ATG	2	6	29803	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930609
558	NC_009704	GAT	2	6	29810	29815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930609
559	NC_009704	TTG	3	9	29869	29877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930609
560	NC_009704	TA	3	6	29886	29891	50 %	50 %	0 %	0 %	153930609
561	NC_009704	ACA	2	6	29926	29931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930609
562	NC_009704	AACA	2	8	29940	29947	75 %	0 %	0 %	25 %	153930609
563	NC_009704	TTA	2	6	29962	29967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930609
564	NC_009704	TTA	2	6	30031	30036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930602
565	NC_009704	A	7	7	30039	30045	100 %	0 %	0 %	0 %	153930602
566	NC_009704	GCT	2	6	30099	30104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930602
567	NC_009704	AGT	2	6	30116	30121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930602
568	NC_009704	AGAA	2	8	30157	30164	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
569	NC_009704	T	7	7	30185	30191	0 %	100 %	0 %	0 %	153930602
570	NC_009704	AAAG	2	8	30209	30216	75 %	0 %	25 %	0 %	153930602
571	NC_009704	GT	3	6	30310	30315	0 %	50 %	50 %	0 %	153930602
572	NC_009704	ACA	2	6	30489	30494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930605
573	NC_009704	AAG	2	6	30502	30507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930605
574	NC_009704	A	6	6	30541	30546	100 %	0 %	0 %	0 %	153930605
575	NC_009704	TGC	2	6	30566	30571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930605
576	NC_009704	A	7	7	30618	30624	100 %	0 %	0 %	0 %	153930605
577	NC_009704	GTT	2	6	30663	30668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930605
578	NC_009704	AAT	2	6	30806	30811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930567
579	NC_009704	TTG	2	6	30816	30821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930567
580	NC_009704	AT	3	6	30898	30903	50 %	50 %	0 %	0 %	153930567
581	NC_009704	AGTA	2	8	30929	30936	50 %	25 %	25 %	0 %	153930567
582	NC_009704	TGGT	2	8	31002	31009	0 %	50 %	50 %	0 %	153930567
583	NC_009704	TAA	2	6	31039	31044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930567
584	NC_009704	GGGAA	2	10	31056	31065	40 %	0 %	60 %	0 %	153930567
585	NC_009704	TGCTT	2	10	32137	32146	0 %	60 %	20 %	20 %	153930594
586	NC_009704	ATC	2	6	32152	32157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930594
587	NC_009704	CAA	2	6	32161	32166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930594
588	NC_009704	CAA	2	6	32187	32192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930594
589	NC_009704	GTT	3	9	32277	32285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930594
590	NC_009704	CTT	2	6	32310	32315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930594
591	NC_009704	T	6	6	32328	32333	0 %	100 %	0 %	0 %	153930594
592	NC_009704	AT	3	6	32353	32358	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
593	NC_009704	AT	3	6	32414	32419	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
594	NC_009704	AT	3	6	32454	32459	50 %	50 %	0 %	0 %	153930594
595	NC_009704	TAA	2	6	32482	32487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930594
596	NC_009704	TTG	2	6	32515	32520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930594
597	NC_009704	AAT	2	6	32657	32662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930594
598	NC_009704	CATTAT	2	12	32691	32702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	153930594
599	NC_009704	T	7	7	32714	32720	0 %	100 %	0 %	0 %	153930594
600	NC_009704	ATTG	2	8	32824	32831	25 %	50 %	25 %	0 %	153930601
601	NC_009704	GCCA	2	8	32863	32870	25 %	0 %	25 %	50 %	153930601
602	NC_009704	GCT	2	6	32925	32930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	153930601
603	NC_009704	ATC	2	6	32978	32983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930601
604	NC_009704	TGA	2	6	33389	33394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930623
605	NC_009704	A	8	8	33396	33403	100 %	0 %	0 %	0 %	153930623
606	NC_009704	TGA	2	6	33515	33520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930623
607	NC_009704	ATGT	2	8	33543	33550	25 %	50 %	25 %	0 %	153930623
608	NC_009704	A	7	7	33574	33580	100 %	0 %	0 %	0 %	153930623
609	NC_009704	CAA	2	6	33672	33677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930623
610	NC_009704	GTT	2	6	33703	33708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	153930623
611	NC_009704	ACA	2	6	33755	33760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	153930623
612	NC_009704	TTA	2	6	33769	33774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	153930623
613	NC_009704	ACT	2	6	33813	33818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	153930623
614	NC_009704	GAA	2	6	33825	33830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	153930623
615	NC_009704	CGA	2	6	33845	33850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930623
616	NC_009704	A	7	7	34392	34398	100 %	0 %	0 %	0 %	153930586
617	NC_009704	A	6	6	34473	34478	100 %	0 %	0 %	0 %	153930586
618	NC_009704	T	6	6	34495	34500	0 %	100 %	0 %	0 %	153930586
619	NC_009704	TGGC	2	8	34506	34513	0 %	25 %	50 %	25 %	153930586
620	NC_009704	TAA	2	6	34542	34547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930586
621	NC_009704	TGG	2	6	34614	34619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	153930586
622	NC_009704	TCC	2	6	35052	35057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	153930565
623	NC_009704	GAC	2	6	35098	35103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	153930565
624	NC_009704	GAT	2	6	35112	35117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	153930565
625	NC_009704	TAA	2	6	35118	35123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	153930565
626	NC_009704	CTT	2	6	35179	35184	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	153930565
627	NC_009704	A	6	6	35193	35198	100 %	0 %	0 %	0 %	153930565
628	NC_009704	CGC	2	6	35243	35248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	153930565
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630	NC_009704	A	6	6	35323	35328	100 %	0 %	0 %	0 %	153930565
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