MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_009381	TCA	2	6	255284	255289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597544
4002	NC_009381	AATA	2	8	255315	255322	75 %	25 %	0 %	0 %	145597544
4003	NC_009381	TCA	2	6	255326	255331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597544
4004	NC_009381	TAA	2	6	255487	255492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597545
4005	NC_009381	ACCA	2	8	255543	255550	50 %	0 %	0 %	50 %	145597545
4006	NC_009381	TCT	2	6	255581	255586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597545
4007	NC_009381	TCT	2	6	255658	255663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597545
4008	NC_009381	TGC	2	6	255669	255674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597545
4009	NC_009381	CAAT	2	8	255712	255719	50 %	25 %	0 %	25 %	145597545
4010	NC_009381	TAA	2	6	255770	255775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597545
4011	NC_009381	CTT	2	6	255833	255838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597545
4012	NC_009381	CCCA	2	8	255867	255874	25 %	0 %	0 %	75 %	145597545
4013	NC_009381	TGG	2	6	255891	255896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597545
4014	NC_009381	TCG	2	6	255907	255912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597545
4015	NC_009381	CTT	2	6	255917	255922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597545
4016	NC_009381	CT	3	6	255930	255935	0 %	50 %	0 %	50 %	145597545
4017	NC_009381	GGT	2	6	255957	255962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597545
4018	NC_009381	GTT	2	6	255988	255993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597545
4019	NC_009381	GGC	2	6	256059	256064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597545
4020	NC_009381	ATCA	2	8	256179	256186	50 %	25 %	0 %	25 %	145597545
4021	NC_009381	ACA	2	6	256738	256743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597546
4022	NC_009381	TGA	2	6	256789	256794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597546
4023	NC_009381	CTG	2	6	256796	256801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
4024	NC_009381	TTG	2	6	256836	256841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597546
4025	NC_009381	AG	3	6	256936	256941	50 %	0 %	50 %	0 %	145597546
4026	NC_009381	GGT	2	6	256957	256962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597546
4027	NC_009381	TGC	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
4028	NC_009381	TCG	2	6	257070	257075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597546
4029	NC_009381	GGT	2	6	257086	257091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597546
4030	NC_009381	AGA	2	6	257140	257145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597546
4031	NC_009381	TAA	2	6	257237	257242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597546
4032	NC_009381	TCTT	2	8	257263	257270	0 %	75 %	0 %	25 %	145597547
4033	NC_009381	TCG	2	6	257274	257279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4034	NC_009381	TAT	2	6	257325	257330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597547
4035	NC_009381	C	6	6	257557	257562	0 %	0 %	0 %	100 %	145597547
4036	NC_009381	GCT	2	6	257575	257580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4037	NC_009381	CTG	2	6	257590	257595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4038	NC_009381	GCC	2	6	257610	257615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597547
4039	NC_009381	CTGAA	2	10	257672	257681	40 %	20 %	20 %	20 %	145597547
4040	NC_009381	CA	3	6	257717	257722	50 %	0 %	0 %	50 %	145597547
4041	NC_009381	CTG	2	6	257792	257797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4042	NC_009381	CTA	2	6	257853	257858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4043	NC_009381	CCG	2	6	257861	257866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597547
4044	NC_009381	TTG	2	6	257869	257874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597547
4045	NC_009381	CAG	2	6	257977	257982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4046	NC_009381	ATC	2	6	258098	258103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4047	NC_009381	C	6	6	258106	258111	0 %	0 %	0 %	100 %	145597547
4048	NC_009381	TGC	2	6	258144	258149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597547
4049	NC_009381	CAA	2	6	258151	258156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597547
4050	NC_009381	CAGC	2	8	258226	258233	25 %	0 %	25 %	50 %	145597547
4051	NC_009381	CCA	2	6	258253	258258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597547
4052	NC_009381	CAT	2	6	258269	258274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4053	NC_009381	CAT	2	6	258284	258289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4054	NC_009381	ATC	2	6	258300	258305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4055	NC_009381	ATC	2	6	258360	258365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597547
4056	NC_009381	AAT	2	6	258386	258391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597547
4057	NC_009381	TACC	2	8	258434	258441	25 %	25 %	0 %	50 %	145597548
4058	NC_009381	CG	3	6	258481	258486	0 %	0 %	50 %	50 %	145597548
4059	NC_009381	GGT	2	6	258541	258546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597548
4060	NC_009381	GT	3	6	258545	258550	0 %	50 %	50 %	0 %	145597548
4061	NC_009381	GCC	2	6	258592	258597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
4062	NC_009381	CAT	2	6	258651	258656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597548
4063	NC_009381	GCC	2	6	258670	258675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
4064	NC_009381	AGGC	2	8	258676	258683	25 %	0 %	50 %	25 %	145597548
4065	NC_009381	AGA	2	6	258747	258752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597548
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4067	NC_009381	CCG	2	6	258901	258906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597548
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4070	NC_009381	A	6	6	259025	259030	100 %	0 %	0 %	0 %	145597548
4071	NC_009381	GAG	2	6	259033	259038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597548
4072	NC_009381	GCG	2	6	259051	259056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597548
4073	NC_009381	GC	3	6	259128	259133	0 %	0 %	50 %	50 %	145597548
4074	NC_009381	GAT	2	6	259159	259164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597548
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4076	NC_009381	CAG	2	6	259216	259221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597548
4077	NC_009381	CTGCA	2	10	259229	259238	20 %	20 %	20 %	40 %	145597548
4078	NC_009381	CGG	2	6	259239	259244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597548
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4080	NC_009381	GGGGC	2	10	259301	259310	0 %	0 %	80 %	20 %	145597548
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4083	NC_009381	TTG	2	6	259438	259443	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597548
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4086	NC_009381	GAG	2	6	259556	259561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597548
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4089	NC_009381	TGGC	2	8	259637	259644	0 %	25 %	50 %	25 %	145597549
4090	NC_009381	GGTT	2	8	259662	259669	0 %	50 %	50 %	0 %	145597549
4091	NC_009381	GTG	2	6	259732	259737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597549
4092	NC_009381	CAG	2	6	259760	259765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597549
4093	NC_009381	GCA	2	6	259798	259803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597549
4094	NC_009381	TCA	2	6	259822	259827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597549
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4101	NC_009381	GCGT	2	8	260119	260126	0 %	25 %	50 %	25 %	145597549
4102	NC_009381	TGG	4	12	260236	260247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597549
4103	NC_009381	CAA	2	6	260337	260342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597549
4104	NC_009381	GTT	2	6	260518	260523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
4105	NC_009381	TGCTC	2	10	260578	260587	0 %	40 %	20 %	40 %	145597550
4106	NC_009381	AGG	2	6	260622	260627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597550
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4108	NC_009381	GGGCT	2	10	260666	260675	0 %	20 %	60 %	20 %	145597550
4109	NC_009381	TGA	2	6	260692	260697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597550
4110	NC_009381	AATG	2	8	260741	260748	50 %	25 %	25 %	0 %	145597550
4111	NC_009381	TTG	3	9	260822	260830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
4112	NC_009381	TTG	2	6	260921	260926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597550
4113	NC_009381	GTGA	2	8	260939	260946	25 %	25 %	50 %	0 %	145597550
4114	NC_009381	TTGA	2	8	260975	260982	25 %	50 %	25 %	0 %	145597550
4115	NC_009381	C	7	7	261092	261098	0 %	0 %	0 %	100 %	145597550
4116	NC_009381	CGG	2	6	261158	261163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597550
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4118	NC_009381	AGC	2	6	262457	262462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597552
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4122	NC_009381	CCTG	2	8	262647	262654	0 %	25 %	25 %	50 %	145597552
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4355	NC_009381	AGGAT	2	10	276303	276312	40 %	20 %	40 %	0 %	145597562
4356	NC_009381	CAAGC	2	10	276345	276354	40 %	0 %	20 %	40 %	145597562
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4363	NC_009381	CA	3	6	276949	276954	50 %	0 %	0 %	50 %	145597562
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4487	NC_009381	GGCATG	2	12	286534	286545	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145597573
4488	NC_009381	A	6	6	286553	286558	100 %	0 %	0 %	0 %	145597573
4489	NC_009381	GCG	3	9	286563	286571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597573
4490	NC_009381	TTC	2	6	286573	286578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597573
4491	NC_009381	GCT	2	6	286617	286622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597573
4492	NC_009381	GTCT	2	8	286675	286682	0 %	50 %	25 %	25 %	145597573
4493	NC_009381	GTG	2	6	286693	286698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
4494	NC_009381	G	6	6	286709	286714	0 %	0 %	100 %	0 %	145597573
4495	NC_009381	ATC	2	6	286717	286722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597573
4496	NC_009381	TCA	2	6	286793	286798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597573
4497	NC_009381	GTG	2	6	286840	286845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
4498	NC_009381	ACTG	2	8	286854	286861	25 %	25 %	25 %	25 %	145597573
4499	NC_009381	GGT	2	6	286863	286868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597573
4500	NC_009381	G	7	7	286881	286887	0 %	0 %	100 %	0 %	145597573

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