MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009381	AAG	2	6	228671	228676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597525
3502	NC_009381	GCA	2	6	228727	228732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3503	NC_009381	GCT	2	6	228746	228751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3504	NC_009381	TTA	2	6	228770	228775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597525
3505	NC_009381	AAC	2	6	228800	228805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3506	NC_009381	TAT	2	6	228860	228865	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597525
3507	NC_009381	ATT	2	6	228907	228912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597525
3508	NC_009381	TCA	2	6	228927	228932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597525
3509	NC_009381	GAT	2	6	228933	228938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597525
3510	NC_009381	TCA	2	6	228981	228986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597525
3511	NC_009381	CTG	2	6	229057	229062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3512	NC_009381	GCG	2	6	229141	229146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597525
3513	NC_009381	CGGA	2	8	229162	229169	25 %	0 %	50 %	25 %	145597525
3514	NC_009381	GCA	2	6	229185	229190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3515	NC_009381	ATG	2	6	229225	229230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597525
3516	NC_009381	GTT	2	6	229263	229268	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597525
3517	NC_009381	CGT	2	6	229305	229310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3518	NC_009381	CTG	2	6	229315	229320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3519	NC_009381	G	6	6	229364	229369	0 %	0 %	100 %	0 %	145597525
3520	NC_009381	ACG	2	6	229483	229488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3521	NC_009381	GA	3	6	229547	229552	50 %	0 %	50 %	0 %	145597525
3522	NC_009381	A	6	6	229568	229573	100 %	0 %	0 %	0 %	145597525
3523	NC_009381	GGGT	2	8	229601	229608	0 %	25 %	75 %	0 %	145597525
3524	NC_009381	ACT	2	6	229643	229648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597525
3525	NC_009381	CTT	2	6	229701	229706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597525
3526	NC_009381	GCT	2	6	229758	229763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3527	NC_009381	AAT	2	6	229849	229854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597525
3528	NC_009381	ACTT	2	8	229876	229883	25 %	50 %	0 %	25 %	145597525
3529	NC_009381	TGA	2	6	229916	229921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597525
3530	NC_009381	AAC	2	6	229934	229939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3531	NC_009381	CGC	2	6	229944	229949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597525
3532	NC_009381	AT	3	6	230040	230045	50 %	50 %	0 %	0 %	145597525
3533	NC_009381	CAA	2	6	230062	230067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3534	NC_009381	AC	3	6	230127	230132	50 %	0 %	0 %	50 %	145597525
3535	NC_009381	GCA	2	6	230214	230219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3536	NC_009381	GCC	2	6	230289	230294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597525
3537	NC_009381	GAC	2	6	230332	230337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3538	NC_009381	CTG	2	6	230362	230367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3539	NC_009381	TCA	2	6	230411	230416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597525
3540	NC_009381	AAC	2	6	230648	230653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3541	NC_009381	CCG	2	6	230658	230663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597525
3542	NC_009381	ACA	2	6	230684	230689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3543	NC_009381	AGC	2	6	230729	230734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3544	NC_009381	GCT	2	6	230739	230744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3545	NC_009381	CTG	3	9	230761	230769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3546	NC_009381	CGG	2	6	230801	230806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597525
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3549	NC_009381	ACA	2	6	230954	230959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3550	NC_009381	TGGG	2	8	231019	231026	0 %	25 %	75 %	0 %	145597525
3551	NC_009381	GTG	2	6	231052	231057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597525
3552	NC_009381	ATG	2	6	231058	231063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597525
3553	NC_009381	AGTGG	2	10	231084	231093	20 %	20 %	60 %	0 %	145597525
3554	NC_009381	ACCT	2	8	231121	231128	25 %	25 %	0 %	50 %	145597525
3555	NC_009381	CTT	2	6	231192	231197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597525
3556	NC_009381	CAG	2	6	231229	231234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597525
3557	NC_009381	AAC	2	6	231256	231261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3558	NC_009381	CTT	2	6	231345	231350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597525
3559	NC_009381	CA	3	6	231372	231377	50 %	0 %	0 %	50 %	145597525
3560	NC_009381	CAA	2	6	231408	231413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597525
3561	NC_009381	GCG	2	6	231470	231475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597525
3562	NC_009381	GGC	2	6	231667	231672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597525
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3565	NC_009381	CCGG	2	8	231943	231950	0 %	0 %	50 %	50 %	145597526
3566	NC_009381	CAA	2	6	231976	231981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597526
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3568	NC_009381	TTGA	2	8	232019	232026	25 %	50 %	25 %	0 %	145597526
3569	NC_009381	CGG	2	6	232074	232079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597526
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3571	NC_009381	TGGCC	2	10	232111	232120	0 %	20 %	40 %	40 %	145597526
3572	NC_009381	A	6	6	232397	232402	100 %	0 %	0 %	0 %	145597526
3573	NC_009381	GCG	2	6	232421	232426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597526
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3579	NC_009381	TGG	2	6	232619	232624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597526
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3581	NC_009381	TGG	2	6	232877	232882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597527
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3586	NC_009381	CCG	2	6	233087	233092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597527
3587	NC_009381	TGA	2	6	233133	233138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597527
3588	NC_009381	CAC	2	6	233167	233172	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597527
3589	NC_009381	GCA	2	6	233178	233183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597527
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3591	NC_009381	GCC	2	6	233308	233313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597528
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3593	NC_009381	GGC	2	6	233371	233376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597528
3594	NC_009381	ATCA	2	8	233392	233399	50 %	25 %	0 %	25 %	145597528
3595	NC_009381	GCC	2	6	233401	233406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597528
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3598	NC_009381	GGCCC	2	10	233485	233494	0 %	0 %	40 %	60 %	145597528
3599	NC_009381	G	6	6	233530	233535	0 %	0 %	100 %	0 %	145597528
3600	NC_009381	GCC	2	6	233581	233586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597528
3601	NC_009381	CGG	2	6	233631	233636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597528
3602	NC_009381	CGGG	2	8	233660	233667	0 %	0 %	75 %	25 %	145597528
3603	NC_009381	CGG	3	9	233696	233704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597528
3604	NC_009381	GAC	2	6	233736	233741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597528
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3607	NC_009381	CGG	2	6	233843	233848	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597528
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3612	NC_009381	ATC	2	6	234061	234066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597528
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3615	NC_009381	CACCCG	2	12	234118	234129	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	145597528
3616	NC_009381	GATTTT	2	12	234163	234174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	145597528
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3740	NC_009381	TAAT	2	8	241661	241668	50 %	50 %	0 %	0 %	145597534
3741	NC_009381	CCG	2	6	241673	241678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597534
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3988	NC_009381	TC	3	6	254720	254725	0 %	50 %	0 %	50 %	145597544
3989	NC_009381	TGC	2	6	254729	254734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597544
3990	NC_009381	AATC	2	8	254795	254802	50 %	25 %	0 %	25 %	145597544
3991	NC_009381	TG	3	6	254920	254925	0 %	50 %	50 %	0 %	145597544
3992	NC_009381	CAC	2	6	254928	254933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597544
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4000	NC_009381	CGGT	2	8	255274	255281	0 %	25 %	50 %	25 %	145597544

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