MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_009381	TGC	2	6	198112	198117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597497
3002	NC_009381	GAC	2	6	198121	198126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597497
3003	NC_009381	TA	3	6	198141	198146	50 %	50 %	0 %	0 %	145597497
3004	NC_009381	GCG	2	6	198206	198211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597497
3005	NC_009381	CCA	2	6	198224	198229	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597497
3006	NC_009381	GTG	2	6	198239	198244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597497
3007	NC_009381	TG	3	6	198278	198283	0 %	50 %	50 %	0 %	145597497
3008	NC_009381	CAG	2	6	198313	198318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597497
3009	NC_009381	GCC	2	6	198518	198523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597497
3010	NC_009381	TTC	2	6	198562	198567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597497
3011	NC_009381	AAT	2	6	198598	198603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597497
3012	NC_009381	TCC	2	6	198626	198631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597497
3013	NC_009381	CAAC	2	8	198675	198682	50 %	0 %	0 %	50 %	145597497
3014	NC_009381	AACG	2	8	198720	198727	50 %	0 %	25 %	25 %	145597497
3015	NC_009381	GCC	2	6	198790	198795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597497
3016	NC_009381	CGA	2	6	198804	198809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597497
3017	NC_009381	G	6	6	198840	198845	0 %	0 %	100 %	0 %	145597497
3018	NC_009381	ATC	2	6	198854	198859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597497
3019	NC_009381	CAG	2	6	199308	199313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597498
3020	NC_009381	GAC	2	6	199327	199332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597498
3021	NC_009381	TGG	2	6	199376	199381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597498
3022	NC_009381	A	6	6	199389	199394	100 %	0 %	0 %	0 %	145597498
3023	NC_009381	CTGG	2	8	199450	199457	0 %	25 %	50 %	25 %	145597498
3024	NC_009381	AGA	2	6	199500	199505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597498
3025	NC_009381	TGG	2	6	199556	199561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597498
3026	NC_009381	G	6	6	199693	199698	0 %	0 %	100 %	0 %	145597498
3027	NC_009381	TGG	2	6	199838	199843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597498
3028	NC_009381	CAC	2	6	199857	199862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597498
3029	NC_009381	GC	3	6	199889	199894	0 %	0 %	50 %	50 %	145597498
3030	NC_009381	GCC	2	6	199912	199917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597498
3031	NC_009381	AAT	2	6	199999	200004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597498
3032	NC_009381	TGG	2	6	200028	200033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597498
3033	NC_009381	TATC	2	8	200063	200070	25 %	50 %	0 %	25 %	145597498
3034	NC_009381	GGTT	2	8	200079	200086	0 %	50 %	50 %	0 %	145597498
3035	NC_009381	AAC	2	6	200099	200104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597498
3036	NC_009381	AGA	2	6	200156	200161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597498
3037	NC_009381	CCTG	2	8	200163	200170	0 %	25 %	25 %	50 %	145597498
3038	NC_009381	ACA	2	6	200198	200203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597498
3039	NC_009381	CTT	2	6	200205	200210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597498
3040	NC_009381	AT	3	6	200247	200252	50 %	50 %	0 %	0 %	145597498
3041	NC_009381	CAG	2	6	200275	200280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597498
3042	NC_009381	CAC	2	6	200473	200478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597498
3043	NC_009381	TGT	2	6	200486	200491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597498
3044	NC_009381	CTT	2	6	200496	200501	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597498
3045	NC_009381	CAGA	2	8	200506	200513	50 %	0 %	25 %	25 %	145597498
3046	NC_009381	GCG	3	9	200560	200568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597498
3047	NC_009381	AACT	2	8	200631	200638	50 %	25 %	0 %	25 %	145597498
3048	NC_009381	TGC	2	6	200645	200650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597498
3049	NC_009381	AAC	2	6	200768	200773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597498
3050	NC_009381	AAG	2	6	200810	200815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597498
3051	NC_009381	GATT	2	8	201070	201077	25 %	50 %	25 %	0 %	145597499
3052	NC_009381	TGG	2	6	201094	201099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597499
3053	NC_009381	T	7	7	201100	201106	0 %	100 %	0 %	0 %	145597499
3054	NC_009381	CCT	3	9	201160	201168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597499
3055	NC_009381	ATTT	2	8	201192	201199	25 %	75 %	0 %	0 %	145597499
3056	NC_009381	TATTT	2	10	201267	201276	20 %	80 %	0 %	0 %	145597499
3057	NC_009381	TTCTA	2	10	201353	201362	20 %	60 %	0 %	20 %	145597499
3058	NC_009381	CAC	2	6	201570	201575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597500
3059	NC_009381	CCAG	2	8	201594	201601	25 %	0 %	25 %	50 %	145597500
3060	NC_009381	GGT	2	6	201622	201627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597500
3061	NC_009381	GCG	3	9	201650	201658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597500
3062	NC_009381	CTG	2	6	201697	201702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597500
3063	NC_009381	GCA	2	6	201738	201743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597500
3064	NC_009381	TGC	2	6	201871	201876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597500
3065	NC_009381	CTT	2	6	201879	201884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597500
3066	NC_009381	AT	3	6	201998	202003	50 %	50 %	0 %	0 %	145597500
3067	NC_009381	CCA	2	6	202035	202040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597500
3068	NC_009381	GGT	2	6	202135	202140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597500
3069	NC_009381	G	7	7	202220	202226	0 %	0 %	100 %	0 %	145597500
3070	NC_009381	CGCCTT	2	12	202567	202578	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	145597501
3071	NC_009381	C	6	6	202655	202660	0 %	0 %	0 %	100 %	145597501
3072	NC_009381	TTA	2	6	202689	202694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597501
3073	NC_009381	ATC	2	6	202716	202721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597501
3074	NC_009381	CCAT	2	8	202788	202795	25 %	25 %	0 %	50 %	145597501
3075	NC_009381	GTC	2	6	202814	202819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3076	NC_009381	ATC	2	6	202851	202856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597501
3077	NC_009381	AAAT	2	8	202943	202950	75 %	25 %	0 %	0 %	145597501
3078	NC_009381	ACG	2	6	203020	203025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3079	NC_009381	GATA	2	8	203056	203063	50 %	25 %	25 %	0 %	145597501
3080	NC_009381	CAC	2	6	203090	203095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597501
3081	NC_009381	TCG	2	6	203196	203201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3082	NC_009381	CAGG	2	8	203437	203444	25 %	0 %	50 %	25 %	145597501
3083	NC_009381	GAC	2	6	203470	203475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3084	NC_009381	TAA	2	6	203482	203487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597501
3085	NC_009381	TTGG	2	8	203523	203530	0 %	50 %	50 %	0 %	145597501
3086	NC_009381	CGT	2	6	203596	203601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3087	NC_009381	TTGG	2	8	203720	203727	0 %	50 %	50 %	0 %	145597501
3088	NC_009381	CTG	2	6	203730	203735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597501
3089	NC_009381	TAGT	2	8	203736	203743	25 %	50 %	25 %	0 %	145597501
3090	NC_009381	GGCGAT	2	12	203747	203758	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	145597501
3091	NC_009381	AACA	2	8	203780	203787	75 %	0 %	0 %	25 %	145597501
3092	NC_009381	GCG	2	6	203834	203839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597501
3093	NC_009381	AACC	2	8	203960	203967	50 %	0 %	0 %	50 %	145597501
3094	NC_009381	CCA	2	6	203987	203992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597501
3095	NC_009381	T	6	6	204003	204008	0 %	100 %	0 %	0 %	145597501
3096	NC_009381	TGG	2	6	204364	204369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597502
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3100	NC_009381	TGGC	2	8	204578	204585	0 %	25 %	50 %	25 %	145597502
3101	NC_009381	GCA	2	6	204598	204603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597502
3102	NC_009381	TAAT	2	8	204615	204622	50 %	50 %	0 %	0 %	145597502
3103	NC_009381	TTA	2	6	204684	204689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597502
3104	NC_009381	GCT	2	6	204693	204698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597502
3105	NC_009381	ATT	2	6	204785	204790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597502
3106	NC_009381	TTC	2	6	204801	204806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597502
3107	NC_009381	CAT	2	6	204808	204813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597502
3108	NC_009381	GCG	2	6	204852	204857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597502
3109	NC_009381	CTT	2	6	204967	204972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597502
3110	NC_009381	TGT	2	6	204985	204990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597502
3111	NC_009381	CCA	2	6	205134	205139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597502
3112	NC_009381	AGA	2	6	205156	205161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597502
3113	NC_009381	GCG	2	6	205185	205190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597502
3114	NC_009381	TTC	2	6	205205	205210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597502
3115	NC_009381	CTT	2	6	205327	205332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597502
3116	NC_009381	AG	3	6	205355	205360	50 %	0 %	50 %	0 %	145597502
3117	NC_009381	ATT	2	6	206035	206040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597503
3118	NC_009381	GTT	2	6	206067	206072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597503
3119	NC_009381	GGC	2	6	206132	206137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597503
3120	NC_009381	GC	3	6	206141	206146	0 %	0 %	50 %	50 %	145597503
3121	NC_009381	GA	3	6	206150	206155	50 %	0 %	50 %	0 %	145597503
3122	NC_009381	TCA	2	6	206157	206162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597503
3123	NC_009381	TTCA	2	8	206216	206223	25 %	50 %	0 %	25 %	145597503
3124	NC_009381	GTT	2	6	206238	206243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597503
3125	NC_009381	GCAA	2	8	206247	206254	50 %	0 %	25 %	25 %	145597503
3126	NC_009381	AGC	2	6	206284	206289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597504
3127	NC_009381	TTG	2	6	206366	206371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597504
3128	NC_009381	GCT	2	6	206397	206402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597504
3129	NC_009381	GAT	2	6	206406	206411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597504
3130	NC_009381	TTG	2	6	206443	206448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597504
3131	NC_009381	TGG	2	6	206451	206456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597504
3132	NC_009381	ATGA	2	8	206464	206471	50 %	25 %	25 %	0 %	145597504
3133	NC_009381	GCC	2	6	206475	206480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597504
3134	NC_009381	AAAG	2	8	206580	206587	75 %	0 %	25 %	0 %	145597504
3135	NC_009381	TGC	2	6	206624	206629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597504
3136	NC_009381	TTG	2	6	206641	206646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597504
3137	NC_009381	TCAGGT	2	12	207078	207089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597504
3138	NC_009381	CTG	2	6	207127	207132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597504
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3142	NC_009381	TGA	2	6	207444	207449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597505
3143	NC_009381	GGT	2	6	207566	207571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597505
3144	NC_009381	AAC	2	6	207573	207578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597505
3145	NC_009381	AAG	2	6	207672	207677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597505
3146	NC_009381	TGA	2	6	207730	207735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597505
3147	NC_009381	CTA	2	6	207868	207873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597505
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3149	NC_009381	AAC	2	6	208019	208024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597505
3150	NC_009381	ACG	2	6	208029	208034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597505
3151	NC_009381	CGG	2	6	208063	208068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597505
3152	NC_009381	AAG	2	6	208110	208115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597505
3153	NC_009381	CAA	2	6	208195	208200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597505
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3156	NC_009381	ATG	2	6	208337	208342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597505
3157	NC_009381	CAA	2	6	208526	208531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597505
3158	NC_009381	GGCA	2	8	208533	208540	25 %	0 %	50 %	25 %	145597505
3159	NC_009381	TGG	2	6	208709	208714	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597505
3160	NC_009381	CTG	2	6	208970	208975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597506
3161	NC_009381	ACC	2	6	209078	209083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597506
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3163	NC_009381	TGCCT	2	10	209200	209209	0 %	40 %	20 %	40 %	145597506
3164	NC_009381	CAG	2	6	209239	209244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597506
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3167	NC_009381	CAT	2	6	209353	209358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597506
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3186	NC_009381	A	6	6	210526	210531	100 %	0 %	0 %	0 %	145597507
3187	NC_009381	AT	3	6	210534	210539	50 %	50 %	0 %	0 %	145597507
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3195	NC_009381	TGG	2	6	210931	210936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597508
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3202	NC_009381	CTG	2	6	211917	211922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597509
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3209	NC_009381	ATA	2	6	212306	212311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597509
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3213	NC_009381	ATC	2	6	212584	212589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597510
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3215	NC_009381	CATG	2	8	212727	212734	25 %	25 %	25 %	25 %	145597510
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3220	NC_009381	CTT	2	6	212943	212948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597510
3221	NC_009381	CAG	2	6	212979	212984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597510
3222	NC_009381	CTC	2	6	213098	213103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597510
3223	NC_009381	CTTAC	2	10	213117	213126	20 %	40 %	0 %	40 %	145597510
3224	NC_009381	ACT	2	6	213158	213163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597510
3225	NC_009381	CCTG	2	8	213227	213234	0 %	25 %	25 %	50 %	145597510
3226	NC_009381	ATT	2	6	213271	213276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597510
3227	NC_009381	GGC	2	6	213289	213294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597510
3228	NC_009381	CGT	2	6	213379	213384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597510
3229	NC_009381	CGC	2	6	213444	213449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597510
3230	NC_009381	TTC	2	6	213451	213456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597510
3231	NC_009381	ATC	2	6	213559	213564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597510
3232	NC_009381	CCA	2	6	213688	213693	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597510
3233	NC_009381	CGT	2	6	213709	213714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597510
3234	NC_009381	CGA	2	6	213860	213865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597511
3235	NC_009381	CTT	2	6	213874	213879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597511
3236	NC_009381	GTTT	2	8	213905	213912	0 %	75 %	25 %	0 %	145597511
3237	NC_009381	TCC	2	6	213943	213948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597511
3238	NC_009381	ATG	2	6	214061	214066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597511
3239	NC_009381	CGA	2	6	214227	214232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597511
3240	NC_009381	CCG	2	6	214275	214280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597511
3241	NC_009381	GCTTT	2	10	214444	214453	0 %	60 %	20 %	20 %	145597512
3242	NC_009381	A	6	6	214474	214479	100 %	0 %	0 %	0 %	145597512
3243	NC_009381	GAT	2	6	214482	214487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597512
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3489	NC_009381	TTA	2	6	228108	228113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597524
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