MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009381	TGA	2	6	97034	97039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597404
1502	NC_009381	ACG	2	6	97043	97048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597404
1503	NC_009381	CAA	2	6	97145	97150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597404
1504	NC_009381	TCA	2	6	97156	97161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597404
1505	NC_009381	GAT	2	6	97191	97196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597404
1506	NC_009381	GTG	2	6	97363	97368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597404
1507	NC_009381	A	6	6	97395	97400	100 %	0 %	0 %	0 %	145597404
1508	NC_009381	TTTG	2	8	97458	97465	0 %	75 %	25 %	0 %	145597404
1509	NC_009381	TCC	2	6	97523	97528	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597404
1510	NC_009381	ATC	2	6	97693	97698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597404
1511	NC_009381	GGC	2	6	97700	97705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597404
1512	NC_009381	GTC	2	6	97716	97721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597404
1513	NC_009381	GC	3	6	97725	97730	0 %	0 %	50 %	50 %	145597404
1514	NC_009381	CGC	2	6	98176	98181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597405
1515	NC_009381	AG	3	6	98419	98424	50 %	0 %	50 %	0 %	145597405
1516	NC_009381	GGT	2	6	98534	98539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597405
1517	NC_009381	TTGA	2	8	98588	98595	25 %	50 %	25 %	0 %	145597405
1518	NC_009381	CGG	2	6	98629	98634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597405
1519	NC_009381	GCA	2	6	98666	98671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597405
1520	NC_009381	TGTT	2	8	98682	98689	0 %	75 %	25 %	0 %	145597405
1521	NC_009381	TCAA	2	8	98706	98713	50 %	25 %	0 %	25 %	145597405
1522	NC_009381	TGC	2	6	98722	98727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597405
1523	NC_009381	GGC	2	6	98761	98766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597405
1524	NC_009381	GTG	2	6	98791	98796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162202303
1525	NC_009381	GC	3	6	98830	98835	0 %	0 %	50 %	50 %	162202303
1526	NC_009381	TGCC	2	8	98881	98888	0 %	25 %	25 %	50 %	162202303
1527	NC_009381	GC	3	6	98945	98950	0 %	0 %	50 %	50 %	162202303
1528	NC_009381	TAT	2	6	99018	99023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162202303
1529	NC_009381	TTG	2	6	99136	99141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162202303
1530	NC_009381	TCA	2	6	99184	99189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162202303
1531	NC_009381	GAT	2	6	99198	99203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162202303
1532	NC_009381	GTG	3	9	99204	99212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162202303
1533	NC_009381	TATT	2	8	99237	99244	25 %	75 %	0 %	0 %	162202303
1534	NC_009381	GGC	2	6	99320	99325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162202303
1535	NC_009381	CCA	2	6	99379	99384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162202303
1536	NC_009381	GCG	2	6	99527	99532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597407
1537	NC_009381	GAT	2	6	99601	99606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597407
1538	NC_009381	TTG	2	6	99626	99631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597407
1539	NC_009381	TGCA	2	8	99635	99642	25 %	25 %	25 %	25 %	145597407
1540	NC_009381	GAA	2	6	99726	99731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597407
1541	NC_009381	GC	3	6	99847	99852	0 %	0 %	50 %	50 %	145597407
1542	NC_009381	GGC	2	6	99900	99905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597407
1543	NC_009381	ACCA	2	8	99925	99932	50 %	0 %	0 %	50 %	145597407
1544	NC_009381	AGC	2	6	99956	99961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597407
1545	NC_009381	AAT	2	6	99997	100002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597407
1546	NC_009381	GGT	2	6	100149	100154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597407
1547	NC_009381	TGA	2	6	100185	100190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597407
1548	NC_009381	ATG	2	6	100208	100213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597407
1549	NC_009381	A	6	6	100219	100224	100 %	0 %	0 %	0 %	145597407
1550	NC_009381	TCTG	2	8	100251	100258	0 %	50 %	25 %	25 %	145597407
1551	NC_009381	GAGC	2	8	100359	100366	25 %	0 %	50 %	25 %	145597407
1552	NC_009381	GTT	2	6	100404	100409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597407
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1555	NC_009381	ATC	2	6	100667	100672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597408
1556	NC_009381	GGC	2	6	100678	100683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597408
1557	NC_009381	CGA	2	6	100726	100731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597408
1558	NC_009381	TC	3	6	100882	100887	0 %	50 %	0 %	50 %	145597408
1559	NC_009381	A	6	6	100909	100914	100 %	0 %	0 %	0 %	145597408
1560	NC_009381	TGTT	2	8	100919	100926	0 %	75 %	25 %	0 %	145597408
1561	NC_009381	GCC	2	6	100932	100937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597408
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1563	NC_009381	GCG	2	6	101052	101057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597408
1564	NC_009381	CGC	2	6	101116	101121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597408
1565	NC_009381	CTG	2	6	101183	101188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597408
1566	NC_009381	CA	3	6	101219	101224	50 %	0 %	0 %	50 %	145597408
1567	NC_009381	GTG	2	6	101225	101230	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597408
1568	NC_009381	TCA	2	6	101281	101286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597408
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1570	NC_009381	CTG	2	6	101336	101341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597408
1571	NC_009381	AGTG	2	8	101411	101418	25 %	25 %	50 %	0 %	145597408
1572	NC_009381	GTT	2	6	101431	101436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597408
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1574	NC_009381	TGC	2	6	101547	101552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597408
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1582	NC_009381	CAG	2	6	101999	102004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597408
1583	NC_009381	AGA	2	6	102028	102033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597408
1584	NC_009381	AGT	2	6	102040	102045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597408
1585	NC_009381	ATT	2	6	102133	102138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597409
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1590	NC_009381	CCAG	2	8	102454	102461	25 %	0 %	25 %	50 %	145597409
1591	NC_009381	GT	3	6	102525	102530	0 %	50 %	50 %	0 %	145597409
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1594	NC_009381	AAT	2	6	102705	102710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597409
1595	NC_009381	ATG	2	6	102723	102728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597409
1596	NC_009381	GAT	2	6	102815	102820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597409
1597	NC_009381	CT	3	6	102876	102881	0 %	50 %	0 %	50 %	145597409
1598	NC_009381	ATCTTC	2	12	103182	103193	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	145597410
1599	NC_009381	CAAA	2	8	103194	103201	75 %	0 %	0 %	25 %	145597410
1600	NC_009381	TGC	2	6	103222	103227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597410
1601	NC_009381	CTG	2	6	103368	103373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597410
1602	NC_009381	TCC	2	6	103455	103460	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597411
1603	NC_009381	GGGC	2	8	103494	103501	0 %	0 %	75 %	25 %	145597411
1604	NC_009381	TAA	2	6	103561	103566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597411
1605	NC_009381	TGC	2	6	103586	103591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597411
1606	NC_009381	GTAG	2	8	103702	103709	25 %	25 %	50 %	0 %	145597411
1607	NC_009381	C	6	6	103715	103720	0 %	0 %	0 %	100 %	145597411
1608	NC_009381	CCAG	2	8	103732	103739	25 %	0 %	25 %	50 %	145597411
1609	NC_009381	CGG	2	6	103762	103767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597411
1610	NC_009381	CAT	2	6	103781	103786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597411
1611	NC_009381	GCC	2	6	103862	103867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597411
1612	NC_009381	GAT	2	6	103907	103912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597411
1613	NC_009381	ATTTT	2	10	103969	103978	20 %	80 %	0 %	0 %	145597411
1614	NC_009381	GTGCG	2	10	103979	103988	0 %	20 %	60 %	20 %	145597411
1615	NC_009381	TCAA	2	8	104130	104137	50 %	25 %	0 %	25 %	145597411
1616	NC_009381	ACG	2	6	104244	104249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597411
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1618	NC_009381	ACG	2	6	104392	104397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597411
1619	NC_009381	CAG	2	6	104399	104404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597411
1620	NC_009381	ACCG	2	8	104408	104415	25 %	0 %	25 %	50 %	145597411
1621	NC_009381	ATT	2	6	104546	104551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597411
1622	NC_009381	CTTA	2	8	104567	104574	25 %	50 %	0 %	25 %	145597411
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1624	NC_009381	GCG	2	6	104652	104657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597411
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1870	NC_009381	TA	3	6	123332	123337	50 %	50 %	0 %	0 %	145597423
1871	NC_009381	T	7	7	123397	123403	0 %	100 %	0 %	0 %	145597423
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1989	NC_009381	GCTGA	2	10	129335	129344	20 %	20 %	40 %	20 %	145597430
1990	NC_009381	CCG	2	6	129381	129386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597430
1991	NC_009381	ATT	2	6	129437	129442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597430
1992	NC_009381	AAC	2	6	129504	129509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597430
1993	NC_009381	AATG	2	8	129510	129517	50 %	25 %	25 %	0 %	145597430
1994	NC_009381	AATATT	2	12	129568	129579	50 %	50 %	0 %	0 %	145597431
1995	NC_009381	CAG	2	6	129676	129681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597431
1996	NC_009381	GAA	2	6	129748	129753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597431
1997	NC_009381	CCG	2	6	129770	129775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597431
1998	NC_009381	CGC	2	6	129830	129835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597431
1999	NC_009381	GCC	2	6	129853	129858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597431
2000	NC_009381	AAC	2	6	129860	129865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597431

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