MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F chromosome

Total Repeats: 71275

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009381	GAAA	2	8	34738	34745	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
502	NC_009381	AAG	2	6	34779	34784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597352
503	NC_009381	A	6	6	34792	34797	100 %	0 %	0 %	0 %	145597352
504	NC_009381	AAGA	2	8	34853	34860	75 %	0 %	25 %	0 %	145597352
505	NC_009381	GAA	2	6	34882	34887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597352
506	NC_009381	TGG	2	6	34905	34910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597352
507	NC_009381	AAG	2	6	34950	34955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597352
508	NC_009381	A	6	6	34970	34975	100 %	0 %	0 %	0 %	145597352
509	NC_009381	ACT	2	6	35152	35157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597353
510	NC_009381	AATT	2	8	35282	35289	50 %	50 %	0 %	0 %	145597353
511	NC_009381	CAT	2	6	35293	35298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597353
512	NC_009381	ATC	2	6	35324	35329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597353
513	NC_009381	AGAT	2	8	35346	35353	50 %	25 %	25 %	0 %	145597353
514	NC_009381	ATAC	2	8	35407	35414	50 %	25 %	0 %	25 %	145597353
515	NC_009381	T	7	7	36266	36272	0 %	100 %	0 %	0 %	145597354
516	NC_009381	TAAAA	2	10	36403	36412	80 %	20 %	0 %	0 %	145597354
517	NC_009381	A	6	6	36409	36414	100 %	0 %	0 %	0 %	145597354
518	NC_009381	ATT	2	6	36431	36436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597354
519	NC_009381	T	7	7	36435	36441	0 %	100 %	0 %	0 %	145597354
520	NC_009381	CCGT	2	8	36453	36460	0 %	25 %	25 %	50 %	145597354
521	NC_009381	CTG	2	6	36703	36708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597355
522	NC_009381	TCT	2	6	36722	36727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597355
523	NC_009381	GCG	4	12	36857	36868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597355
524	NC_009381	TTC	2	6	36871	36876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597355
525	NC_009381	TGC	2	6	36893	36898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597355
526	NC_009381	TCA	2	6	36956	36961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597355
527	NC_009381	TCC	2	6	37019	37024	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597355
528	NC_009381	CCCG	2	8	37181	37188	0 %	0 %	25 %	75 %	145597355
529	NC_009381	CGG	2	6	37200	37205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597355
530	NC_009381	TCAT	2	8	37292	37299	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
531	NC_009381	CAT	2	6	37311	37316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597355
532	NC_009381	GCC	2	6	37327	37332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597355
533	NC_009381	TGT	2	6	37334	37339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597355
534	NC_009381	ATTG	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	145597355
535	NC_009381	TGA	2	6	37376	37381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597355
536	NC_009381	GGC	2	6	37429	37434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597355
537	NC_009381	TCT	2	6	37439	37444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597355
538	NC_009381	CGG	3	9	37446	37454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597355
539	NC_009381	TTG	2	6	37456	37461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597355
540	NC_009381	TCA	2	6	37544	37549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597355
541	NC_009381	TCAT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	0 %	25 %	145597355
542	NC_009381	TCA	2	6	37590	37595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597355
543	NC_009381	TCG	2	6	37607	37612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597355
544	NC_009381	GAT	2	6	37619	37624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597355
545	NC_009381	CTG	2	6	37963	37968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597355
546	NC_009381	TAA	2	6	38065	38070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597355
547	NC_009381	CG	4	8	38073	38080	0 %	0 %	50 %	50 %	145597355
548	NC_009381	ATT	2	6	38182	38187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597355
549	NC_009381	CTTTAT	2	12	38220	38231	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	145597355
550	NC_009381	TGT	2	6	38258	38263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597355
551	NC_009381	CTC	2	6	38272	38277	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	145597355
552	NC_009381	T	6	6	38354	38359	0 %	100 %	0 %	0 %	145597355
553	NC_009381	ATT	2	6	38362	38367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597355
554	NC_009381	TG	3	6	38375	38380	0 %	50 %	50 %	0 %	145597355
555	NC_009381	TCG	2	6	38450	38455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597355
556	NC_009381	TTC	2	6	38491	38496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597355
557	NC_009381	GGT	2	6	38518	38523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597355
558	NC_009381	A	6	6	38558	38563	100 %	0 %	0 %	0 %	145597355
559	NC_009381	T	7	7	38575	38581	0 %	100 %	0 %	0 %	145597355
560	NC_009381	AAT	2	6	38608	38613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597355
561	NC_009381	GCG	2	6	39050	39055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597356
562	NC_009381	GTA	2	6	39071	39076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597356
563	NC_009381	AAC	2	6	39170	39175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597356
564	NC_009381	CGT	2	6	39187	39192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597356
565	NC_009381	CCAG	2	8	39212	39219	25 %	0 %	25 %	50 %	145597356
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569	NC_009381	GTT	2	6	39374	39379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597356
570	NC_009381	CAG	2	6	39400	39405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597356
571	NC_009381	CAT	2	6	39559	39564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597356
572	NC_009381	TTTTA	2	10	40032	40041	20 %	80 %	0 %	0 %	145597357
573	NC_009381	CGCC	2	8	40067	40074	0 %	0 %	25 %	75 %	145597357
574	NC_009381	GTG	2	6	40134	40139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597357
575	NC_009381	GCG	2	6	40140	40145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597357
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582	NC_009381	GACC	2	8	40366	40373	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
583	NC_009381	GTT	2	6	40474	40479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597357
584	NC_009381	GCG	3	9	40520	40528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597357
585	NC_009381	CGG	2	6	40548	40553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597357
586	NC_009381	AATAG	2	10	40604	40613	60 %	20 %	20 %	0 %	145597357
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589	NC_009381	CAT	2	6	40691	40696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597357
590	NC_009381	CAC	2	6	40697	40702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597357
591	NC_009381	CTT	2	6	40738	40743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	145597357
592	NC_009381	GCCA	2	8	40746	40753	25 %	0 %	25 %	50 %	145597357
593	NC_009381	CTG	2	6	40757	40762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597357
594	NC_009381	CAG	2	6	41063	41068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597358
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597	NC_009381	GC	3	6	41177	41182	0 %	0 %	50 %	50 %	145597358
598	NC_009381	AAAG	2	8	41268	41275	75 %	0 %	25 %	0 %	145597358
599	NC_009381	ATC	2	6	41302	41307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597358
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601	NC_009381	AGA	2	6	41468	41473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597358
602	NC_009381	ACG	2	6	41500	41505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597358
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607	NC_009381	CAA	2	6	41933	41938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597359
608	NC_009381	GAT	2	6	42009	42014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597359
609	NC_009381	TG	4	8	42129	42136	0 %	50 %	50 %	0 %	145597359
610	NC_009381	CTG	2	6	42141	42146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597359
611	NC_009381	GCA	2	6	42293	42298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597359
612	NC_009381	GAT	2	6	42332	42337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597359
613	NC_009381	CTGA	2	8	42414	42421	25 %	25 %	25 %	25 %	145597359
614	NC_009381	TGT	2	6	42430	42435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597359
615	NC_009381	TACC	2	8	42491	42498	25 %	25 %	0 %	50 %	145597359
616	NC_009381	CCAGG	2	10	42528	42537	20 %	0 %	40 %	40 %	145597359
617	NC_009381	ACT	2	6	42541	42546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597359
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622	NC_009381	GTT	2	6	42904	42909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	145597359
623	NC_009381	GCTG	2	8	42946	42953	0 %	25 %	50 %	25 %	145597359
624	NC_009381	TATGCG	2	12	43025	43036	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	145597359
625	NC_009381	GAA	2	6	43125	43130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597359
626	NC_009381	A	6	6	43197	43202	100 %	0 %	0 %	0 %	145597359
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