MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Yersinia pestis Pestoides F plasmid CD

Total Repeats: 1019

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009377	TGAG	2	8	33153	33160	25 %	25 %	50 %	0 %	145597143
502	NC_009377	AGA	2	6	33232	33237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597143
503	NC_009377	TACC	2	8	33445	33452	25 %	25 %	0 %	50 %	145597143
504	NC_009377	ATT	2	6	33541	33546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597143
505	NC_009377	CAA	2	6	33581	33586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597143
506	NC_009377	TTA	2	6	33618	33623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597143
507	NC_009377	GTGA	2	8	33656	33663	25 %	25 %	50 %	0 %	145597143
508	NC_009377	T	7	7	33686	33692	0 %	100 %	0 %	0 %	145597143
509	NC_009377	GAG	2	6	33894	33899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	145597144
510	NC_009377	CGAT	2	8	33934	33941	25 %	25 %	25 %	25 %	145597144
511	NC_009377	GAA	2	6	33963	33968	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	145597144
512	NC_009377	TGAG	2	8	33970	33977	25 %	25 %	50 %	0 %	145597144
513	NC_009377	CAT	2	6	33990	33995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597145
514	NC_009377	AAC	2	6	34091	34096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597145
515	NC_009377	CGG	2	6	34181	34186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597145
516	NC_009377	GGT	2	6	34220	34225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597145
517	NC_009377	TGA	2	6	34260	34265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	145597145
518	NC_009377	GCA	2	6	34320	34325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	145597145
519	NC_009377	ATA	2	6	34350	34355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597146
520	NC_009377	C	6	6	34360	34365	0 %	0 %	0 %	100 %	145597146
521	NC_009377	GCC	2	6	34439	34444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	145597146
522	NC_009377	AAGC	2	8	34496	34503	50 %	0 %	25 %	25 %	145597146
523	NC_009377	ACC	2	6	34602	34607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597146
524	NC_009377	AGTC	2	8	34608	34615	25 %	25 %	25 %	25 %	145597146
525	NC_009377	GCT	2	6	34640	34645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597146
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529	NC_009377	ACA	2	6	34729	34734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597147
530	NC_009377	TGC	2	6	34743	34748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597147
531	NC_009377	GGTT	2	8	34754	34761	0 %	50 %	50 %	0 %	145597147
532	NC_009377	GC	3	6	34786	34791	0 %	0 %	50 %	50 %	145597147
533	NC_009377	TAA	3	9	34870	34878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	145597147
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535	NC_009377	CAA	2	6	34967	34972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	145597147
536	NC_009377	ATT	2	6	35013	35018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597147
537	NC_009377	TGC	2	6	35101	35106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597148
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539	NC_009377	C	8	8	35141	35148	0 %	0 %	0 %	100 %	145597148
540	NC_009377	GTG	2	6	35190	35195	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597148
541	NC_009377	CAC	2	6	35297	35302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	145597148
542	NC_009377	TCG	2	6	35359	35364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597148
543	NC_009377	TCG	2	6	35380	35385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597148
544	NC_009377	ATC	2	6	35403	35408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	145597148
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546	NC_009377	GATGC	2	10	35481	35490	20 %	20 %	40 %	20 %	145597148
547	NC_009377	CG	3	6	35562	35567	0 %	0 %	50 %	50 %	145597148
548	NC_009377	AAAG	2	8	35577	35584	75 %	0 %	25 %	0 %	145597148
549	NC_009377	ATT	2	6	35649	35654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597148
550	NC_009377	AT	3	6	35665	35670	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
551	NC_009377	GGC	2	6	35673	35678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	145597148
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553	NC_009377	CCTGC	2	10	35775	35784	0 %	20 %	20 %	60 %	145597148
554	NC_009377	TAT	2	6	35804	35809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	145597148
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558	NC_009377	CTG	2	6	35907	35912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597148
559	NC_009377	TGG	2	6	35981	35986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	145597148
560	NC_009377	GCT	2	6	36072	36077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	145597148
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562	NC_009377	TGAT	2	8	36157	36164	25 %	50 %	25 %	0 %	145597148
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565	NC_009377	AT	3	6	36308	36313	50 %	50 %	0 %	0 %	145597148
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