MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 2368

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008800	TGGTT	2	10	7087	7096	0 %	60 %	40 %	0 %	123440410
2	NC_008800	GTTCT	2	10	7704	7713	0 %	60 %	20 %	20 %	123440410
3	NC_008800	CCAGA	2	10	12543	12552	40 %	0 %	20 %	40 %	123440414
4	NC_008800	AGGAA	2	10	15315	15324	60 %	0 %	40 %	0 %	123440417
5	NC_008800	ACAGC	2	10	15469	15478	40 %	0 %	20 %	40 %	123440417
6	NC_008800	CCTGA	2	10	24859	24868	20 %	20 %	20 %	40 %	123440422
7	NC_008800	AAATT	2	10	25809	25818	60 %	40 %	0 %	0 %	123440422
8	NC_008800	TAATT	2	10	28176	28185	40 %	60 %	0 %	0 %	123440424
9	NC_008800	TCGCC	2	10	28817	28826	0 %	20 %	20 %	60 %	123440424
10	NC_008800	TTTGG	2	10	29389	29398	0 %	60 %	40 %	0 %	123440424
11	NC_008800	TTGAT	2	10	33089	33098	20 %	60 %	20 %	0 %	123440427
12	NC_008800	ATTCC	2	10	33991	34000	20 %	40 %	0 %	40 %	123440428
13	NC_008800	ATGCA	2	10	34853	34862	40 %	20 %	20 %	20 %	123440428
14	NC_008800	GCCGC	2	10	36004	36013	0 %	0 %	40 %	60 %	123440429
15	NC_008800	TTCCT	2	10	40201	40210	0 %	60 %	0 %	40 %	123440432
16	NC_008800	TTTCT	2	10	43258	43267	0 %	80 %	0 %	20 %	123440436
17	NC_008800	ATTCA	2	10	44445	44454	40 %	40 %	0 %	20 %	123440437
18	NC_008800	AAAAT	2	10	45050	45059	80 %	20 %	0 %	0 %	123440437
19	NC_008800	TAAAA	2	10	45548	45557	80 %	20 %	0 %	0 %	123440438
20	NC_008800	AAAAT	2	10	45766	45775	80 %	20 %	0 %	0 %	123440438
21	NC_008800	GACAG	2	10	46077	46086	40 %	0 %	40 %	20 %	123440439
22	NC_008800	GCCAG	2	10	46226	46235	20 %	0 %	40 %	40 %	123440439
23	NC_008800	AAAAT	2	10	46482	46491	80 %	20 %	0 %	0 %	123440439
24	NC_008800	GACAG	2	10	46793	46802	40 %	0 %	40 %	20 %	123440440
25	NC_008800	GTTTT	2	10	47050	47059	0 %	80 %	20 %	0 %	123440440
26	NC_008800	AAAAT	2	10	47198	47207	80 %	20 %	0 %	0 %	123440440
27	NC_008800	GCCAG	2	10	47657	47666	20 %	0 %	40 %	40 %	123440441
28	NC_008800	AAAAT	2	10	47913	47922	80 %	20 %	0 %	0 %	123440441
29	NC_008800	GGGTA	2	10	48677	48686	20 %	20 %	60 %	0 %	123440442
30	NC_008800	AAATC	2	10	48996	49005	60 %	20 %	0 %	20 %	123440442
31	NC_008800	AGCAC	2	10	49720	49729	40 %	0 %	20 %	40 %	123440442
32	NC_008800	GCGCC	2	10	50857	50866	0 %	0 %	40 %	60 %	123440443
33	NC_008800	TCCGC	2	10	50951	50960	0 %	20 %	20 %	60 %	123440443
34	NC_008800	CCAGA	2	10	51078	51087	40 %	0 %	20 %	40 %	123440443
35	NC_008800	GCACG	2	10	51967	51976	20 %	0 %	40 %	40 %	123440444
36	NC_008800	TAACA	2	10	53311	53320	60 %	20 %	0 %	20 %	123440445
37	NC_008800	TAACG	2	10	54791	54800	40 %	20 %	20 %	20 %	123440445
38	NC_008800	GCGCT	2	10	55126	55135	0 %	20 %	40 %	40 %	123440446
39	NC_008800	ACGCA	2	10	57861	57870	40 %	0 %	20 %	40 %	123440448
40	NC_008800	TCAGA	2	10	58157	58166	40 %	20 %	20 %	20 %	123440449
41	NC_008800	GGCAG	2	10	60402	60411	20 %	0 %	60 %	20 %	123440450
42	NC_008800	GGGTT	2	10	60684	60693	0 %	40 %	60 %	0 %	123440451
43	NC_008800	AAGCC	2	10	60726	60735	40 %	0 %	20 %	40 %	123440451
44	NC_008800	AAAAC	2	10	63125	63134	80 %	0 %	0 %	20 %	123440453
45	NC_008800	ATTTA	2	10	64125	64134	40 %	60 %	0 %	0 %	123440454
46	NC_008800	AGATA	2	10	65884	65893	60 %	20 %	20 %	0 %	123440455
47	NC_008800	ATTCG	2	10	68389	68398	20 %	40 %	20 %	20 %	123440457
48	NC_008800	GCTGC	2	10	69089	69098	0 %	20 %	40 %	40 %	123440457
49	NC_008800	CGCTG	2	10	73933	73942	0 %	20 %	40 %	40 %	123440463
50	NC_008800	GCAGC	2	10	75646	75655	20 %	0 %	40 %	40 %	123440466
51	NC_008800	AGTTG	2	10	76498	76507	20 %	40 %	40 %	0 %	123440468
52	NC_008800	GTGGC	2	10	77519	77528	0 %	20 %	60 %	20 %	123440469
53	NC_008800	TAATT	2	10	79190	79199	40 %	60 %	0 %	0 %	123440470
54	NC_008800	ACCAA	2	10	79631	79640	60 %	0 %	0 %	40 %	123440470
55	NC_008800	CGCCA	2	10	80568	80577	20 %	0 %	20 %	60 %	123440471
56	NC_008800	CATCA	2	10	80791	80800	40 %	20 %	0 %	40 %	123440471
57	NC_008800	CAGGT	2	10	80948	80957	20 %	20 %	40 %	20 %	123440472
58	NC_008800	CAATA	2	10	84890	84899	60 %	20 %	0 %	20 %	123440475
59	NC_008800	GTTAC	2	10	85946	85955	20 %	40 %	20 %	20 %	229576803
60	NC_008800	GCTTG	2	10	88818	88827	0 %	40 %	40 %	20 %	123440478
61	NC_008800	AACAA	2	10	89603	89612	80 %	0 %	0 %	20 %	123440480
62	NC_008800	GCGGT	2	10	91469	91478	0 %	20 %	60 %	20 %	123440482
63	NC_008800	TGAAT	2	10	93221	93230	40 %	40 %	20 %	0 %	123440484
64	NC_008800	CTGCG	2	10	93460	93469	0 %	20 %	40 %	40 %	123440484
65	NC_008800	AATAA	2	10	98930	98939	80 %	20 %	0 %	0 %	123440489
66	NC_008800	GCCAC	2	10	102970	102979	20 %	0 %	20 %	60 %	123440493
67	NC_008800	GTTGG	2	10	103620	103629	0 %	40 %	60 %	0 %	123440494
68	NC_008800	GGCAG	2	10	104210	104219	20 %	0 %	60 %	20 %	123440495
69	NC_008800	ATGCT	2	10	106333	106342	20 %	40 %	20 %	20 %	123440497
70	NC_008800	TGCTG	2	10	106974	106983	0 %	40 %	40 %	20 %	123440497
71	NC_008800	ACATC	2	10	107510	107519	40 %	20 %	0 %	40 %	123440498
72	NC_008800	CACTT	2	10	107520	107529	20 %	40 %	0 %	40 %	123440498
73	NC_008800	GTGCT	2	10	108492	108501	0 %	40 %	40 %	20 %	123440499
74	NC_008800	GATTG	2	10	108963	108972	20 %	40 %	40 %	0 %	123440499
75	NC_008800	CAATG	2	10	110525	110534	40 %	20 %	20 %	20 %	123440500
76	NC_008800	TCGGT	2	10	113714	113723	0 %	40 %	40 %	20 %	123440504
77	NC_008800	TGCGG	2	10	115768	115777	0 %	20 %	60 %	20 %	123440506
78	NC_008800	CACTT	2	10	117653	117662	20 %	40 %	0 %	40 %	123440508
79	NC_008800	TTTAA	2	10	126285	126294	40 %	60 %	0 %	0 %	123440513
80	NC_008800	ATGGT	2	10	126295	126304	20 %	40 %	40 %	0 %	123440513
81	NC_008800	ATATT	2	10	126864	126873	40 %	60 %	0 %	0 %	123440513
82	NC_008800	AGTTC	2	10	131198	131207	20 %	40 %	20 %	20 %	123440516
83	NC_008800	TGAAG	2	10	131763	131772	40 %	20 %	40 %	0 %	123440516
84	NC_008800	CGGCC	2	10	133128	133137	0 %	0 %	40 %	60 %	123440517
85	NC_008800	ATCAA	2	10	133377	133386	60 %	20 %	0 %	20 %	123440517
86	NC_008800	ATTCG	2	10	139160	139169	20 %	40 %	20 %	20 %	123440521
87	NC_008800	GATGG	2	10	139381	139390	20 %	20 %	60 %	0 %	123440521
88	NC_008800	CAGCA	2	10	140183	140192	40 %	0 %	20 %	40 %	123440521
89	NC_008800	CTTAT	2	10	140826	140835	20 %	60 %	0 %	20 %	123440521
90	NC_008800	TTTAA	2	10	143640	143649	40 %	60 %	0 %	0 %	123440525
91	NC_008800	GGTTC	2	10	145178	145187	0 %	40 %	40 %	20 %	123440526
92	NC_008800	GTCTC	2	10	146180	146189	0 %	40 %	20 %	40 %	123440527
93	NC_008800	ATCTG	2	10	147275	147284	20 %	40 %	20 %	20 %	123440528
94	NC_008800	AGATA	2	10	148229	148238	60 %	20 %	20 %	0 %	123440529
95	NC_008800	TGCGC	2	10	150459	150468	0 %	20 %	40 %	40 %	123440530
96	NC_008800	TGTCA	2	10	152021	152030	20 %	40 %	20 %	20 %	123440532
97	NC_008800	TTCGC	2	10	153249	153258	0 %	40 %	20 %	40 %	123440533
98	NC_008800	TGCCA	2	10	155373	155382	20 %	20 %	20 %	40 %	123440535
99	NC_008800	TCGGC	2	10	156646	156655	0 %	20 %	40 %	40 %	123440536
100	NC_008800	AAGGT	2	10	167211	167220	40 %	20 %	40 %	0 %	123440539
101	NC_008800	TCTGC	2	10	175014	175023	0 %	40 %	20 %	40 %	123440546
102	NC_008800	TGCTT	2	10	175143	175152	0 %	60 %	20 %	20 %	123440546
103	NC_008800	CAGAA	2	10	179932	179941	60 %	0 %	20 %	20 %	123440550
104	NC_008800	AAGGC	2	10	180124	180133	40 %	0 %	40 %	20 %	123440550
105	NC_008800	TTCAG	2	10	181648	181657	20 %	40 %	20 %	20 %	123440551
106	NC_008800	TAAAC	2	10	181837	181846	60 %	20 %	0 %	20 %	123440551
107	NC_008800	CCACA	2	10	183101	183110	40 %	0 %	0 %	60 %	123440552
108	NC_008800	ACTGT	2	10	183650	183659	20 %	40 %	20 %	20 %	123440552
109	NC_008800	ATGAA	2	10	185290	185299	60 %	20 %	20 %	0 %	123440553
110	NC_008800	CACCG	2	10	186940	186949	20 %	0 %	20 %	60 %	123440555
111	NC_008800	TGCAG	2	10	192920	192929	20 %	20 %	40 %	20 %	123440559
112	NC_008800	TGAAA	2	10	193341	193350	60 %	20 %	20 %	0 %	123440560
113	NC_008800	TCATT	2	10	193715	193724	20 %	60 %	0 %	20 %	123440560
114	NC_008800	GCATT	2	10	195604	195613	20 %	40 %	20 %	20 %	123440561
115	NC_008800	GCTTG	2	10	197916	197925	0 %	40 %	40 %	20 %	123440562
116	NC_008800	CAGGC	2	10	199112	199121	20 %	0 %	40 %	40 %	123440563
117	NC_008800	TTTTG	2	10	199739	199748	0 %	80 %	20 %	0 %	123440563
118	NC_008800	GGCAC	2	10	200507	200516	20 %	0 %	40 %	40 %	123440564
119	NC_008800	TCTGA	2	10	201328	201337	20 %	40 %	20 %	20 %	123440565
120	NC_008800	GGTGT	2	10	204992	205001	0 %	40 %	60 %	0 %	123440567
121	NC_008800	AACCA	2	10	206446	206455	60 %	0 %	0 %	40 %	123440569
122	NC_008800	CAGGT	2	10	206724	206733	20 %	20 %	40 %	20 %	123440569
123	NC_008800	CCGCA	2	10	206851	206860	20 %	0 %	20 %	60 %	123440569
124	NC_008800	GGCCA	2	10	208376	208385	20 %	0 %	40 %	40 %	123440570
125	NC_008800	GCTGG	2	10	208428	208437	0 %	20 %	60 %	20 %	123440570
126	NC_008800	TGGTG	2	10	209222	209231	0 %	40 %	60 %	0 %	123440571
127	NC_008800	ATCAA	2	10	211143	211152	60 %	20 %	0 %	20 %	123440573
128	NC_008800	CGATG	2	10	211952	211961	20 %	20 %	40 %	20 %	123440574
129	NC_008800	ATTTA	2	10	213242	213251	40 %	60 %	0 %	0 %	123440575
130	NC_008800	TATTT	2	10	213610	213619	20 %	80 %	0 %	0 %	123440575
131	NC_008800	ATTGC	2	10	217385	217394	20 %	40 %	20 %	20 %	123440578
132	NC_008800	CTTGG	2	10	217696	217705	0 %	40 %	40 %	20 %	123440578
133	NC_008800	TAGCG	2	10	222265	222274	20 %	20 %	40 %	20 %	123440581
134	NC_008800	GGCAT	2	10	222842	222851	20 %	20 %	40 %	20 %	123440582
135	NC_008800	ATCAG	2	10	222974	222983	40 %	20 %	20 %	20 %	123440582
136	NC_008800	GTGCA	2	10	229655	229664	20 %	20 %	40 %	20 %	123440588
137	NC_008800	CCGTA	2	10	231715	231724	20 %	20 %	20 %	40 %	123440590
138	NC_008800	CCCAT	2	10	235285	235294	20 %	20 %	0 %	60 %	123440592
139	NC_008800	TTGTG	2	10	235988	235997	0 %	60 %	40 %	0 %	123440593
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174	NC_008800	AGTTA	2	10	295601	295610	40 %	40 %	20 %	0 %	123440647
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