MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 76152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008800	TTG	2	6	36078	36083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440429
502	NC_008800	GTT	2	6	36095	36100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440429
503	NC_008800	TAA	2	6	36291	36296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440429
504	NC_008800	GTG	2	6	36305	36310	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440429
505	NC_008800	ATC	2	6	36384	36389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440429
506	NC_008800	GA	3	6	36411	36416	50 %	0 %	50 %	0 %	123440429
507	NC_008800	TCT	2	6	36668	36673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440430
508	NC_008800	CGT	2	6	36702	36707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440430
509	NC_008800	CCA	2	6	36719	36724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440430
510	NC_008800	CTT	3	9	36801	36809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440430
511	NC_008800	TGA	2	6	36864	36869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440430
512	NC_008800	GCCA	2	8	36880	36887	25 %	0 %	25 %	50 %	123440430
513	NC_008800	CAG	2	6	36889	36894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440430
514	NC_008800	GCT	2	6	36920	36925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440430
515	NC_008800	GC	3	6	36937	36942	0 %	0 %	50 %	50 %	123440430
516	NC_008800	ACG	2	6	36949	36954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440430
517	NC_008800	TGA	2	6	37107	37112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440430
518	NC_008800	CCG	2	6	37115	37120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440430
519	NC_008800	CAC	2	6	37288	37293	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440430
520	NC_008800	T	6	6	37321	37326	0 %	100 %	0 %	0 %	123440430
521	NC_008800	TGG	2	6	37382	37387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440430
522	NC_008800	TTC	2	6	37411	37416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440430
523	NC_008800	GAA	2	6	37451	37456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440430
524	NC_008800	GGA	2	6	37463	37468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	123440430
525	NC_008800	CTG	2	6	37491	37496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440430
526	NC_008800	GCC	2	6	37513	37518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440430
527	NC_008800	ATC	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440430
528	NC_008800	CGT	2	6	37602	37607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440430
529	NC_008800	GAA	2	6	37615	37620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440430
530	NC_008800	TCTGGC	2	12	37622	37633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440430
531	NC_008800	AGA	2	6	37660	37665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440430
532	NC_008800	TTC	2	6	37675	37680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440430
533	NC_008800	GAA	2	6	37774	37779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440430
534	NC_008800	CCA	2	6	37847	37852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440430
535	NC_008800	GAG	2	6	37856	37861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	123440430
536	NC_008800	CTT	2	6	37878	37883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440430
537	NC_008800	GAA	2	6	37885	37890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440430
538	NC_008800	TGA	2	6	37904	37909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440430
539	NC_008800	CAA	2	6	37962	37967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440430
540	NC_008800	ATT	2	6	38556	38561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440432
541	NC_008800	ACC	2	6	38583	38588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123440432
542	NC_008800	ACA	2	6	38606	38611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440432
543	NC_008800	CGG	2	6	38771	38776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440432
544	NC_008800	TGC	2	6	38812	38817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440432
545	NC_008800	ATGG	2	8	38832	38839	25 %	25 %	50 %	0 %	123440432
546	NC_008800	A	6	6	38868	38873	100 %	0 %	0 %	0 %	123440432
547	NC_008800	GC	3	6	38929	38934	0 %	0 %	50 %	50 %	123440432
548	NC_008800	CGA	2	6	38990	38995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440432
549	NC_008800	GGC	2	6	39065	39070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440432
550	NC_008800	TTG	2	6	39097	39102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440432
551	NC_008800	ACA	2	6	39169	39174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440432
552	NC_008800	TGA	2	6	39434	39439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440432
553	NC_008800	AAG	2	6	39490	39495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440432
554	NC_008800	GAA	2	6	39570	39575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440432
555	NC_008800	CTGT	2	8	39624	39631	0 %	50 %	25 %	25 %	123440432
556	NC_008800	CGT	2	6	39648	39653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440432
557	NC_008800	GCAA	2	8	39712	39719	50 %	0 %	25 %	25 %	123440432
558	NC_008800	GAA	2	6	39750	39755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440432
559	NC_008800	ACT	2	6	39847	39852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440432
560	NC_008800	CATGAC	2	12	39893	39904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	123440432
561	NC_008800	CTG	2	6	39918	39923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440432
562	NC_008800	ATG	3	9	39943	39951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440432
563	NC_008800	ATC	2	6	40095	40100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440432
564	NC_008800	TCAC	2	8	40106	40113	25 %	25 %	0 %	50 %	123440432
565	NC_008800	TTCCT	2	10	40201	40210	0 %	60 %	0 %	40 %	123440432
566	NC_008800	GAA	2	6	40211	40216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440432
567	NC_008800	CGATGA	2	12	40244	40255	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	123440432
568	NC_008800	ATCCGT	2	12	40281	40292	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	123440432
569	NC_008800	AGA	2	6	40343	40348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440432
570	NC_008800	TTG	2	6	40679	40684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440433
571	NC_008800	TGAG	2	8	40748	40755	25 %	25 %	50 %	0 %	123440433
572	NC_008800	CAG	2	6	40780	40785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440433
573	NC_008800	GTG	3	9	40954	40962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440433
574	NC_008800	ATT	2	6	40991	40996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440433
575	NC_008800	GCT	3	9	41020	41028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440433
576	NC_008800	TGA	2	6	41139	41144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440433
577	NC_008800	TTG	2	6	41159	41164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440433
578	NC_008800	ACCG	2	8	41200	41207	25 %	0 %	25 %	50 %	123440433
579	NC_008800	GCTG	2	8	41429	41436	0 %	25 %	50 %	25 %	123440434
580	NC_008800	TC	3	6	41463	41468	0 %	50 %	0 %	50 %	123440434
581	NC_008800	GCT	2	6	41502	41507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440434
582	NC_008800	ATC	2	6	41583	41588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440434
583	NC_008800	TTG	2	6	41608	41613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440434
584	NC_008800	GTG	2	6	41634	41639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440434
585	NC_008800	GCA	2	6	41713	41718	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440434
586	NC_008800	TCG	2	6	41785	41790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440434
587	NC_008800	TGGC	2	8	41832	41839	0 %	25 %	50 %	25 %	123440434
588	NC_008800	GTG	2	6	41928	41933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440434
589	NC_008800	TGC	2	6	41981	41986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440434
590	NC_008800	ATT	2	6	41987	41992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440434
591	NC_008800	TGT	2	6	42118	42123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440434
592	NC_008800	AGA	2	6	42187	42192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123440434
593	NC_008800	TGG	2	6	42262	42267	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440435
594	NC_008800	GTG	2	6	42279	42284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440435
595	NC_008800	CAG	2	6	42327	42332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440435
596	NC_008800	TGA	2	6	42392	42397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440435
597	NC_008800	TGG	2	6	42445	42450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440435
598	NC_008800	CAG	2	6	42520	42525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440435
599	NC_008800	TTG	2	6	42550	42555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440435
600	NC_008800	ATT	2	6	42593	42598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440435
601	NC_008800	ACG	2	6	42628	42633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440435
602	NC_008800	ATT	2	6	42957	42962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440436
603	NC_008800	ATG	2	6	43029	43034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440436
604	NC_008800	TGG	3	9	43053	43061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440436
605	NC_008800	TA	3	6	43095	43100	50 %	50 %	0 %	0 %	123440436
606	NC_008800	AGTC	2	8	43194	43201	25 %	25 %	25 %	25 %	123440436
607	NC_008800	GT	3	6	43229	43234	0 %	50 %	50 %	0 %	123440436
608	NC_008800	TTTCT	2	10	43258	43267	0 %	80 %	0 %	20 %	123440436
609	NC_008800	GTCA	2	8	43280	43287	25 %	25 %	25 %	25 %	123440436
610	NC_008800	CGC	2	6	43302	43307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123440436
611	NC_008800	GAT	2	6	43358	43363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440436
612	NC_008800	GCA	2	6	43396	43401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440436
613	NC_008800	A	6	6	43431	43436	100 %	0 %	0 %	0 %	123440436
614	NC_008800	TCA	2	6	43510	43515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440436
615	NC_008800	GGC	2	6	43601	43606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440436
616	NC_008800	TAT	2	6	43609	43614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440436
617	NC_008800	GGC	2	6	43656	43661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440436
618	NC_008800	GTC	2	6	43719	43724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440436
619	NC_008800	ATTCA	2	10	44445	44454	40 %	40 %	0 %	20 %	123440437
620	NC_008800	TAA	2	6	44465	44470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440437
621	NC_008800	ATA	2	6	44537	44542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440437
622	NC_008800	ACT	2	6	44664	44669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440437
623	NC_008800	T	7	7	44733	44739	0 %	100 %	0 %	0 %	123440437
624	NC_008800	TAG	2	6	44793	44798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440437
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626	NC_008800	AG	3	6	44890	44895	50 %	0 %	50 %	0 %	123440437
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756	NC_008800	ATA	2	6	50883	50888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440443
757	NC_008800	CAT	2	6	50935	50940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440443
758	NC_008800	TCCGC	2	10	50951	50960	0 %	20 %	20 %	60 %	123440443
759	NC_008800	AACC	2	8	51039	51046	50 %	0 %	0 %	50 %	123440443
760	NC_008800	CCAGA	2	10	51078	51087	40 %	0 %	20 %	40 %	123440443
761	NC_008800	CAA	2	6	51177	51182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440443
762	NC_008800	GCA	2	6	51206	51211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440443
763	NC_008800	G	6	6	51230	51235	0 %	0 %	100 %	0 %	123440443
764	NC_008800	TCT	2	6	51239	51244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440443
765	NC_008800	AATT	2	8	51253	51260	50 %	50 %	0 %	0 %	123440443
766	NC_008800	CTG	2	6	51280	51285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440443
767	NC_008800	CGG	2	6	51300	51305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440443
768	NC_008800	A	7	7	51646	51652	100 %	0 %	0 %	0 %	123440444
769	NC_008800	GGT	2	6	51677	51682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440444
770	NC_008800	CTG	2	6	51683	51688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440444
771	NC_008800	ATG	2	6	51698	51703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440444
772	NC_008800	CTG	2	6	51704	51709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440444
773	NC_008800	CAA	2	6	51783	51788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123440444
774	NC_008800	GGC	2	6	51824	51829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440444
775	NC_008800	GT	3	6	51840	51845	0 %	50 %	50 %	0 %	123440444
776	NC_008800	GTC	2	6	51857	51862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440444
777	NC_008800	TTA	2	6	51935	51940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123440444
778	NC_008800	GCACG	2	10	51967	51976	20 %	0 %	40 %	40 %	123440444
779	NC_008800	GCG	2	6	51980	51985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440444
780	NC_008800	TTG	2	6	51999	52004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440444
781	NC_008800	TGGG	2	8	52068	52075	0 %	25 %	75 %	0 %	123440444
782	NC_008800	GGC	2	6	52082	52087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440444
783	NC_008800	CTG	2	6	52176	52181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440444
784	NC_008800	TG	3	6	52304	52309	0 %	50 %	50 %	0 %	123440444
785	NC_008800	TGA	2	6	52428	52433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123440444
786	NC_008800	TTAC	2	8	52527	52534	25 %	50 %	0 %	25 %	123440444
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788	NC_008800	TGG	2	6	52671	52676	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123440444
789	NC_008800	TGGT	2	8	52683	52690	0 %	50 %	50 %	0 %	123440444
790	NC_008800	TGC	2	6	52740	52745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123440444
791	NC_008800	TTAT	2	8	52833	52840	25 %	75 %	0 %	0 %	123440445
792	NC_008800	TTG	2	6	52909	52914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440445
793	NC_008800	GCG	2	6	53118	53123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123440445
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799	NC_008800	TAACA	2	10	53311	53320	60 %	20 %	0 %	20 %	123440445
800	NC_008800	CAG	2	6	53409	53414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123440445
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811	NC_008800	GC	3	6	53984	53989	0 %	0 %	50 %	50 %	123440445
812	NC_008800	CAT	2	6	54049	54054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440445
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815	NC_008800	GTT	2	6	54153	54158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123440445
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824	NC_008800	TAACG	2	10	54791	54800	40 %	20 %	20 %	20 %	123440445
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830	NC_008800	GCGCT	2	10	55126	55135	0 %	20 %	40 %	40 %	123440446
831	NC_008800	ATC	2	6	55190	55195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123440446
832	NC_008800	AAT	2	6	55198	55203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123440446
833	NC_008800	CTT	2	6	55230	55235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123440446
834	NC_008800	T	6	6	55248	55253	0 %	100 %	0 %	0 %	123440446
835	NC_008800	CAGA	2	8	55317	55324	50 %	0 %	25 %	25 %	123440446
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