MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia enterocolitica subsp. enterocolitica 8081 chromosome

Total Repeats: 76152

< Previous12...141142143144145146147148149150151152153Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_008800	TGG	2	6	4606428	4606433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123444373
76002	NC_008800	TCAT	2	8	4606435	4606442	25 %	50 %	0 %	25 %	123444373
76003	NC_008800	AGTC	2	8	4606481	4606488	25 %	25 %	25 %	25 %	123444373
76004	NC_008800	CAT	2	6	4606587	4606592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444373
76005	NC_008800	CAC	2	6	4606616	4606621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444373
76006	NC_008800	AAG	2	6	4606721	4606726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123444373
76007	NC_008800	CTT	2	6	4606754	4606759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444373
76008	NC_008800	TGA	2	6	4606859	4606864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444373
76009	NC_008800	AAC	2	6	4606914	4606919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444373
76010	NC_008800	ACC	2	6	4606920	4606925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444373
76011	NC_008800	CGA	2	6	4607246	4607251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444374
76012	NC_008800	TTG	2	6	4607290	4607295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123444374
76013	NC_008800	CCG	2	6	4607326	4607331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123444374
76014	NC_008800	GGC	2	6	4607340	4607345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123444374
76015	NC_008800	CG	3	6	4607362	4607367	0 %	0 %	50 %	50 %	123444374
76016	NC_008800	ACG	2	6	4607392	4607397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444374
76017	NC_008800	AGG	2	6	4607431	4607436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	123444374
76018	NC_008800	CAG	2	6	4607442	4607447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444374
76019	NC_008800	TCT	2	6	4607486	4607491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444374
76020	NC_008800	TTA	2	6	4607572	4607577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123444374
76021	NC_008800	TCA	2	6	4607605	4607610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444374
76022	NC_008800	GCA	2	6	4607618	4607623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444374
76023	NC_008800	CAA	2	6	4607687	4607692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444374
76024	NC_008800	GCC	2	6	4607697	4607702	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123444374
76025	NC_008800	AAAG	2	8	4607712	4607719	75 %	0 %	25 %	0 %	123444374
76026	NC_008800	GCT	2	6	4607722	4607727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444374
76027	NC_008800	T	6	6	4607796	4607801	0 %	100 %	0 %	0 %	123444374
76028	NC_008800	ACC	2	6	4607820	4607825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444374
76029	NC_008800	ACC	2	6	4607848	4607853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444374
76030	NC_008800	GCC	2	6	4607968	4607973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123444374
76031	NC_008800	GGC	2	6	4608003	4608008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123444374
76032	NC_008800	TTG	2	6	4608238	4608243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123444375
76033	NC_008800	CTAC	2	8	4608296	4608303	25 %	25 %	0 %	50 %	123444375
76034	NC_008800	CTG	2	6	4608361	4608366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76035	NC_008800	TGTTTC	2	12	4608389	4608400	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	123444375
76036	NC_008800	CAT	2	6	4608447	4608452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444375
76037	NC_008800	ACC	2	6	4608517	4608522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444375
76038	NC_008800	T	6	6	4608529	4608534	0 %	100 %	0 %	0 %	123444375
76039	NC_008800	CAC	2	6	4608555	4608560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444375
76040	NC_008800	GAAC	2	8	4608669	4608676	50 %	0 %	25 %	25 %	123444375
76041	NC_008800	TTCAC	2	10	4608740	4608749	20 %	40 %	0 %	40 %	123444375
76042	NC_008800	GCA	2	6	4608788	4608793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76043	NC_008800	TGG	2	6	4608850	4608855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123444375
76044	NC_008800	ACG	2	6	4608856	4608861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76045	NC_008800	AGC	2	6	4608863	4608868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76046	NC_008800	TCA	2	6	4608908	4608913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444375
76047	NC_008800	AAT	2	6	4608916	4608921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123444375
76048	NC_008800	TGC	2	6	4608994	4608999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76049	NC_008800	CCA	3	9	4609017	4609025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444375
76050	NC_008800	AC	3	6	4609110	4609115	50 %	0 %	0 %	50 %	123444375
76051	NC_008800	TGA	2	6	4609140	4609145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444375
76052	NC_008800	GAT	2	6	4609189	4609194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444375
76053	NC_008800	GACT	2	8	4609234	4609241	25 %	25 %	25 %	25 %	123444375
76054	NC_008800	TCA	2	6	4609262	4609267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444375
76055	NC_008800	CGT	2	6	4609320	4609325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76056	NC_008800	GAC	2	6	4609369	4609374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76057	NC_008800	CGAC	2	8	4609391	4609398	25 %	0 %	25 %	50 %	123444375
76058	NC_008800	ATC	2	6	4609535	4609540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444375
76059	NC_008800	GCT	2	6	4609650	4609655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444375
76060	NC_008800	GAC	2	6	4609739	4609744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444376
76061	NC_008800	TAC	2	6	4609785	4609790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444376
76062	NC_008800	TCG	2	6	4609882	4609887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444376
76063	NC_008800	GAA	2	6	4609973	4609978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123444376
76064	NC_008800	CAC	2	6	4610042	4610047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444376
76065	NC_008800	GCT	2	6	4610197	4610202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444376
76066	NC_008800	AGC	2	6	4610294	4610299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444377
76067	NC_008800	GAT	2	6	4610318	4610323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444377
76068	NC_008800	CTGC	2	8	4610404	4610411	0 %	25 %	25 %	50 %	123444377
76069	NC_008800	TCA	2	6	4610460	4610465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444377
76070	NC_008800	AAT	2	6	4610498	4610503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	123444377
76071	NC_008800	CTT	2	6	4610525	4610530	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444377
76072	NC_008800	GGTC	2	8	4610536	4610543	0 %	25 %	50 %	25 %	123444377
76073	NC_008800	T	6	6	4610570	4610575	0 %	100 %	0 %	0 %	123444377
76074	NC_008800	AGA	2	6	4610588	4610593	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123444377
76075	NC_008800	GA	3	6	4610592	4610597	50 %	0 %	50 %	0 %	123444377
76076	NC_008800	CGG	2	6	4610642	4610647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123444377
76077	NC_008800	AT	3	6	4610650	4610655	50 %	50 %	0 %	0 %	123444377
76078	NC_008800	TGGCC	2	10	4610692	4610701	0 %	20 %	40 %	40 %	123444377
76079	NC_008800	TTG	2	6	4610707	4610712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123444377
76080	NC_008800	CAGACC	2	12	4610810	4610821	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	123444378
76081	NC_008800	GCA	2	6	4610878	4610883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444378
76082	NC_008800	TCAGG	2	10	4610890	4610899	20 %	20 %	40 %	20 %	123444378
76083	NC_008800	ACC	2	6	4610927	4610932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444378
76084	NC_008800	GCA	2	6	4610952	4610957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444378
76085	NC_008800	CAT	2	6	4610975	4610980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444378
76086	NC_008800	CAG	2	6	4610999	4611004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444378
76087	NC_008800	ACC	2	6	4611319	4611324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444379
76088	NC_008800	CAG	2	6	4611413	4611418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444379
76089	NC_008800	GAAT	2	8	4611448	4611455	50 %	25 %	25 %	0 %	123444379
76090	NC_008800	GCC	2	6	4611497	4611502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123444379
76091	NC_008800	CAGGAT	2	12	4611530	4611541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	123444379
76092	NC_008800	GGTA	2	8	4611584	4611591	25 %	25 %	50 %	0 %	123444379
76093	NC_008800	CGCAG	2	10	4611597	4611606	20 %	0 %	40 %	40 %	123444379
76094	NC_008800	GTA	2	6	4611652	4611657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444379
76095	NC_008800	CAT	2	6	4611662	4611667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444379
76096	NC_008800	TCA	2	6	4611670	4611675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444379
76097	NC_008800	CAAA	2	8	4611684	4611691	75 %	0 %	0 %	25 %	123444379
76098	NC_008800	ACTTT	2	10	4611717	4611726	20 %	60 %	0 %	20 %	123444379
76099	NC_008800	CAC	2	6	4611805	4611810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444379
76100	NC_008800	TGG	2	6	4611811	4611816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	123444379
76101	NC_008800	AAAC	2	8	4611838	4611845	75 %	0 %	0 %	25 %	123444379
76102	NC_008800	AGA	2	6	4611871	4611876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	123444379
76103	NC_008800	ATG	2	6	4612023	4612028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444379
76104	NC_008800	GCT	2	6	4612165	4612170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444380
76105	NC_008800	AGC	2	6	4612263	4612268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444380
76106	NC_008800	GGC	2	6	4612283	4612288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	123444380
76107	NC_008800	ACA	2	6	4612295	4612300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444380
76108	NC_008800	CCT	2	6	4612333	4612338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	123444380
76109	NC_008800	AAC	2	6	4612392	4612397	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444380
76110	NC_008800	CAA	2	6	4612413	4612418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444380
76111	NC_008800	AGTT	2	8	4613129	4613136	25 %	50 %	25 %	0 %	123444381
76112	NC_008800	AAC	2	6	4613191	4613196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444381
76113	NC_008800	CAA	2	6	4613202	4613207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444381
76114	NC_008800	TCA	2	6	4613234	4613239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444381
76115	NC_008800	ATG	2	6	4613293	4613298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444381
76116	NC_008800	TTA	2	6	4613340	4613345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123444381
76117	NC_008800	GCCCAG	2	12	4613520	4613531	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	123444381
76118	NC_008800	CTG	2	6	4613715	4613720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444381
76119	NC_008800	CAG	2	6	4613725	4613730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444381
76120	NC_008800	T	7	7	4613740	4613746	0 %	100 %	0 %	0 %	123444381
76121	NC_008800	ACA	2	6	4613750	4613755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444381
76122	NC_008800	CAA	2	6	4613914	4613919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444382
76123	NC_008800	T	6	6	4613926	4613931	0 %	100 %	0 %	0 %	123444382
76124	NC_008800	CAA	2	6	4613941	4613946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444382
76125	NC_008800	CTG	2	6	4614121	4614126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444382
76126	NC_008800	CTG	2	6	4614171	4614176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	123444382
76127	NC_008800	GTT	2	6	4614215	4614220	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	123444382
76128	NC_008800	TTC	2	6	4614256	4614261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444382
76129	NC_008800	CTT	2	6	4614270	4614275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444382
76130	NC_008800	GGCGTT	2	12	4614351	4614362	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	123444382
76131	NC_008800	T	6	6	4614381	4614386	0 %	100 %	0 %	0 %	123444382
76132	NC_008800	CAT	2	6	4614408	4614413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444382
76133	NC_008800	GCA	2	6	4614471	4614476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444382
76134	NC_008800	TACGG	2	10	4614507	4614516	20 %	20 %	40 %	20 %	123444382
76135	NC_008800	CCA	2	6	4614546	4614551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444382
76136	NC_008800	CCAT	2	8	4614586	4614593	25 %	25 %	0 %	50 %	123444382
76137	NC_008800	AGC	2	6	4614632	4614637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	123444382
76138	NC_008800	CTT	2	6	4614651	4614656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444382
76139	NC_008800	AT	3	6	4614704	4614709	50 %	50 %	0 %	0 %	123444382
76140	NC_008800	ACGA	2	8	4614775	4614782	50 %	0 %	25 %	25 %	123444382
76141	NC_008800	TCGA	2	8	4614947	4614954	25 %	25 %	25 %	25 %	123444382
76142	NC_008800	TTA	2	6	4615016	4615021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	123444382
76143	NC_008800	T	6	6	4615038	4615043	0 %	100 %	0 %	0 %	123444382
76144	NC_008800	GCTG	2	8	4615083	4615090	0 %	25 %	50 %	25 %	123444382
76145	NC_008800	GATG	2	8	4615246	4615253	25 %	25 %	50 %	0 %	123444382
76146	NC_008800	GCC	2	6	4615270	4615275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	123444382
76147	NC_008800	CAA	2	6	4615398	4615403	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	123444382
76148	NC_008800	TCT	2	6	4615409	4615414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	123444382
76149	NC_008800	ATC	2	6	4615430	4615435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	123444382
76150	NC_008800	TTGCCA	2	12	4615569	4615580	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	123444382
76151	NC_008800	ACC	3	9	4615744	4615752	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	123444382
76152	NC_008800	ATG	3	9	4615754	4615762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	123444382

< Previous12...141142143144145146147148149150151152153Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.