MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua chromosome

Total Repeats: 76244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_008150	TTG	2	6	227385	227390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806188
3502	NC_008150	CTT	2	6	227398	227403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806188
3503	NC_008150	GTG	2	6	227414	227419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806188
3504	NC_008150	CCA	2	6	227439	227444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806188
3505	NC_008150	GT	3	6	227493	227498	0 %	50 %	50 %	0 %	108806188
3506	NC_008150	GC	3	6	227599	227604	0 %	0 %	50 %	50 %	108806189
3507	NC_008150	TAA	2	6	227611	227616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806189
3508	NC_008150	GCC	2	6	227638	227643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806189
3509	NC_008150	ATC	2	6	227723	227728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806189
3510	NC_008150	ATA	2	6	227732	227737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806189
3511	NC_008150	TGC	2	6	227754	227759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806189
3512	NC_008150	AACA	2	8	227857	227864	75 %	0 %	0 %	25 %	108806189
3513	NC_008150	TGCA	2	8	227908	227915	25 %	25 %	25 %	25 %	108806189
3514	NC_008150	TTG	2	6	227941	227946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806189
3515	NC_008150	TAAG	2	8	227962	227969	50 %	25 %	25 %	0 %	108806189
3516	NC_008150	GA	3	6	228012	228017	50 %	0 %	50 %	0 %	108806189
3517	NC_008150	CCAA	2	8	228038	228045	50 %	0 %	0 %	50 %	108806189
3518	NC_008150	CAA	2	6	228090	228095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806189
3519	NC_008150	TGT	2	6	228172	228177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806189
3520	NC_008150	CAG	2	6	228178	228183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806189
3521	NC_008150	ACC	2	6	228192	228197	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806189
3522	NC_008150	AAT	2	6	228427	228432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806190
3523	NC_008150	TGC	2	6	228456	228461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806190
3524	NC_008150	TTA	2	6	228464	228469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806190
3525	NC_008150	TTG	2	6	228478	228483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806190
3526	NC_008150	GCA	2	6	228492	228497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806190
3527	NC_008150	ATA	2	6	228527	228532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806190
3528	NC_008150	CAT	2	6	228565	228570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806190
3529	NC_008150	GTG	2	6	228580	228585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806190
3530	NC_008150	CAG	2	6	228646	228651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806190
3531	NC_008150	ATG	2	6	228656	228661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806190
3532	NC_008150	ATC	2	6	228674	228679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806190
3533	NC_008150	GAT	2	6	228709	228714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806190
3534	NC_008150	CAG	2	6	228802	228807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806190
3535	NC_008150	G	6	6	228831	228836	0 %	0 %	100 %	0 %	108806190
3536	NC_008150	AG	3	6	228862	228867	50 %	0 %	50 %	0 %	108806190
3537	NC_008150	ATT	2	6	228986	228991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806190
3538	NC_008150	GGC	2	6	229013	229018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806190
3539	NC_008150	CGC	2	6	229066	229071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806190
3540	NC_008150	AC	3	6	229091	229096	50 %	0 %	0 %	50 %	108806190
3541	NC_008150	GTGG	2	8	229108	229115	0 %	25 %	75 %	0 %	108806190
3542	NC_008150	TGG	2	6	229148	229153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806190
3543	NC_008150	ATT	2	6	229162	229167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806190
3544	NC_008150	CAC	2	6	229185	229190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806190
3545	NC_008150	TAT	2	6	229196	229201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108806190
3546	NC_008150	GGT	2	6	229224	229229	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806190
3547	NC_008150	G	6	6	229291	229296	0 %	0 %	100 %	0 %	108806190
3548	NC_008150	ATCA	2	8	229397	229404	50 %	25 %	0 %	25 %	108806190
3549	NC_008150	CCA	2	6	229429	229434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806191
3550	NC_008150	TGT	2	6	229462	229467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806191
3551	NC_008150	GCT	2	6	229489	229494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806191
3552	NC_008150	GAAA	2	8	229525	229532	75 %	0 %	25 %	0 %	108806191
3553	NC_008150	CCA	2	6	229585	229590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806191
3554	NC_008150	CAT	2	6	229739	229744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806191
3555	NC_008150	CGA	2	6	229777	229782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806191
3556	NC_008150	AAG	2	6	229812	229817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806191
3557	NC_008150	TTC	2	6	229820	229825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806191
3558	NC_008150	CCTG	2	8	229992	229999	0 %	25 %	25 %	50 %	108806191
3559	NC_008150	GCG	3	9	230010	230018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806191
3560	NC_008150	ATC	2	6	230054	230059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806191
3561	NC_008150	ATGA	2	8	230099	230106	50 %	25 %	25 %	0 %	108806191
3562	NC_008150	TGT	2	6	230115	230120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806191
3563	NC_008150	CAT	2	6	230140	230145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806191
3564	NC_008150	TGA	2	6	230209	230214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806191
3565	NC_008150	ACT	2	6	230226	230231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806191
3566	NC_008150	C	6	6	230562	230567	0 %	0 %	0 %	100 %	108806192
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3569	NC_008150	TAA	2	6	230656	230661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806192
3570	NC_008150	A	6	6	230695	230700	100 %	0 %	0 %	0 %	108806192
3571	NC_008150	A	7	7	230702	230708	100 %	0 %	0 %	0 %	108806192
3572	NC_008150	AATA	2	8	230713	230720	75 %	25 %	0 %	0 %	108806192
3573	NC_008150	GAA	2	6	230728	230733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806192
3574	NC_008150	TAG	2	6	230737	230742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806192
3575	NC_008150	GAG	2	6	230756	230761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108806192
3576	NC_008150	A	8	8	230808	230815	100 %	0 %	0 %	0 %	108806192
3577	NC_008150	AGA	2	6	230836	230841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806192
3578	NC_008150	ACC	2	6	230886	230891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806192
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3584	NC_008150	C	6	6	231312	231317	0 %	0 %	0 %	100 %	108806192
3585	NC_008150	TGA	2	6	231331	231336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806192
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3587	NC_008150	CAGG	2	8	231574	231581	25 %	0 %	50 %	25 %	108806192
3588	NC_008150	AAT	2	6	231595	231600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806192
3589	NC_008150	TCT	2	6	231641	231646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806192
3590	NC_008150	TTC	2	6	231655	231660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806192
3591	NC_008150	A	7	7	231699	231705	100 %	0 %	0 %	0 %	108806192
3592	NC_008150	AAT	2	6	231735	231740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806192
3593	NC_008150	TTAT	2	8	231813	231820	25 %	75 %	0 %	0 %	108806193
3594	NC_008150	GCTGTT	2	12	231821	231832	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	108806193
3595	NC_008150	ATA	2	6	231901	231906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806193
3596	NC_008150	CAT	2	6	231975	231980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806193
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3598	NC_008150	CTTC	2	8	232094	232101	0 %	50 %	0 %	50 %	108806193
3599	NC_008150	CAGT	2	8	232180	232187	25 %	25 %	25 %	25 %	108806193
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3601	NC_008150	CTT	2	6	232358	232363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806193
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3603	NC_008150	TGAA	2	8	232435	232442	50 %	25 %	25 %	0 %	108806193
3604	NC_008150	TATCAA	2	12	232532	232543	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	108806193
3605	NC_008150	ATA	2	6	232596	232601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108806193
3606	NC_008150	ACC	2	6	232678	232683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108806193
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3608	NC_008150	AGTG	2	8	232762	232769	25 %	25 %	50 %	0 %	108806193
3609	NC_008150	GAC	2	6	232806	232811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806193
3610	NC_008150	GCAGAT	2	12	232822	232833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	108806193
3611	NC_008150	GCA	2	6	232855	232860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108806193
3612	NC_008150	GCC	2	6	232882	232887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806193
3613	NC_008150	TCA	2	6	233587	233592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108806194
3614	NC_008150	TCGC	2	8	233623	233630	0 %	25 %	25 %	50 %	108806194
3615	NC_008150	CCG	2	6	233639	233644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806194
3616	NC_008150	GAA	2	6	233772	233777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108806194
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3618	NC_008150	CT	3	6	233852	233857	0 %	50 %	0 %	50 %	108806194
3619	NC_008150	TTG	2	6	234084	234089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108806194
3620	NC_008150	GT	3	6	234112	234117	0 %	50 %	50 %	0 %	108806194
3621	NC_008150	TGC	2	6	234176	234181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108806194
3622	NC_008150	ACA	2	6	234194	234199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108806194
3623	NC_008150	GTA	2	6	234399	234404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806194
3624	NC_008150	CGC	2	6	234451	234456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806194
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3626	NC_008150	TGA	2	6	234619	234624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806194
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3631	NC_008150	CCG	2	6	234874	234879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108806194
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3642	NC_008150	GCGG	2	8	236052	236059	0 %	0 %	75 %	25 %	108806195
3643	NC_008150	TTC	2	6	236152	236157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108806195
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3987	NC_008150	TGG	2	6	257575	257580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806217
3988	NC_008150	GGC	2	6	257705	257710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108806217
3989	NC_008150	GAT	2	6	257755	257760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108806217
3990	NC_008150	GTTT	2	8	257799	257806	0 %	75 %	25 %	0 %	108806217
3991	NC_008150	TGG	2	6	257835	257840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108806217
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3995	NC_008150	TTGA	2	8	258155	258162	25 %	50 %	25 %	0 %	108806217
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3999	NC_008150	TC	3	6	258602	258607	0 %	50 %	0 %	50 %	162100187
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