MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pCD

Total Repeats: 1031

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008122	AGA	2	6	26766	26771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793674
502	NC_008122	CAAG	2	8	26778	26785	50 %	0 %	25 %	25 %	108793674
503	NC_008122	GCATC	2	10	26798	26807	20 %	20 %	20 %	40 %	108793674
504	NC_008122	TGGC	2	8	26817	26824	0 %	25 %	50 %	25 %	108793674
505	NC_008122	CAT	2	6	26856	26861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793674
506	NC_008122	ATG	2	6	26896	26901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793674
507	NC_008122	GCG	2	6	26947	26952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793674
508	NC_008122	AAT	2	6	27307	27312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793674
509	NC_008122	AAGC	2	8	27316	27323	50 %	0 %	25 %	25 %	108793674
510	NC_008122	ACA	2	6	27330	27335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793674
511	NC_008122	TAA	2	6	27336	27341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793674
512	NC_008122	TAT	2	6	27387	27392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793674
513	NC_008122	AGA	2	6	27405	27410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793674
514	NC_008122	CAA	2	6	27436	27441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793674
515	NC_008122	GAT	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793674
516	NC_008122	TGC	2	6	27485	27490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793674
517	NC_008122	GTTTAA	2	12	27517	27528	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	108793674
518	NC_008122	AATA	2	8	27546	27553	75 %	25 %	0 %	0 %	108793675
519	NC_008122	AGAC	2	8	27557	27564	50 %	0 %	25 %	25 %	108793675
520	NC_008122	A	7	7	27637	27643	100 %	0 %	0 %	0 %	108793675
521	NC_008122	AGA	2	6	27645	27650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793675
522	NC_008122	TTG	3	9	27796	27804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793675
523	NC_008122	CAA	2	6	27844	27849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793675
524	NC_008122	CTA	2	6	27869	27874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793675
525	NC_008122	TGA	2	6	27923	27928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793675
526	NC_008122	GGT	2	6	27939	27944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793675
527	NC_008122	CAT	2	6	27951	27956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793675
528	NC_008122	GCT	2	6	27958	27963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793675
529	NC_008122	AAC	2	6	28055	28060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793675
530	NC_008122	GCA	2	6	28077	28082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793675
531	NC_008122	AG	3	6	28114	28119	50 %	0 %	50 %	0 %	108793675
532	NC_008122	ATT	2	6	28173	28178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793675
533	NC_008122	TCA	2	6	28272	28277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793675
534	NC_008122	AGAA	2	8	28304	28311	75 %	0 %	25 %	0 %	108793675
535	NC_008122	TGC	2	6	28326	28331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793675
536	NC_008122	TTGA	2	8	28399	28406	25 %	50 %	25 %	0 %	108793675
537	NC_008122	ATT	2	6	29094	29099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793677
538	NC_008122	GCT	2	6	29117	29122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793677
539	NC_008122	GCA	2	6	29125	29130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793677
540	NC_008122	CTT	2	6	29145	29150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793677
541	NC_008122	TCA	2	6	29151	29156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793677
542	NC_008122	AATG	2	8	29248	29255	50 %	25 %	25 %	0 %	108793677
543	NC_008122	AAAAAT	2	12	29286	29297	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	108793677
544	NC_008122	GAG	2	6	29384	29389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	108793677
545	NC_008122	T	6	6	29618	29623	0 %	100 %	0 %	0 %	108793678
546	NC_008122	CAA	2	6	29625	29630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793678
547	NC_008122	CAG	2	6	29742	29747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793678
548	NC_008122	AAT	2	6	29779	29784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793678
549	NC_008122	AAT	2	6	30424	30429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
550	NC_008122	AG	3	6	30468	30473	50 %	0 %	50 %	0 %	108793679
551	NC_008122	ATA	2	6	30545	30550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
552	NC_008122	ACC	2	6	30576	30581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793679
553	NC_008122	TAA	2	6	30606	30611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
554	NC_008122	CTT	2	6	30648	30653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793679
555	NC_008122	ATT	2	6	30658	30663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793679
556	NC_008122	A	6	6	30685	30690	100 %	0 %	0 %	0 %	108793679
557	NC_008122	CCT	2	6	30703	30708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793679
558	NC_008122	TGC	2	6	30723	30728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793679
559	NC_008122	TAA	2	6	30732	30737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
560	NC_008122	GAA	2	6	30745	30750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793679
561	NC_008122	CTT	2	6	30774	30779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793679
562	NC_008122	A	6	6	30811	30816	100 %	0 %	0 %	0 %	108793679
563	NC_008122	TTG	2	6	30848	30853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793679
564	NC_008122	TAA	2	6	30858	30863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
565	NC_008122	GAA	2	6	30871	30876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793679
566	NC_008122	CTT	2	6	30900	30905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793679
567	NC_008122	ATT	2	6	30989	30994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793679
568	NC_008122	CTT	2	6	31029	31034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793679
569	NC_008122	T	6	6	31052	31057	0 %	100 %	0 %	0 %	108793679
570	NC_008122	CCA	2	6	31075	31080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793679
571	NC_008122	TAT	2	6	31087	31092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793679
572	NC_008122	GAA	2	6	31147	31152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793679
573	NC_008122	TAA	3	9	31164	31172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793679
574	NC_008122	ATC	2	6	31229	31234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793679
575	NC_008122	GA	3	6	31296	31301	50 %	0 %	50 %	0 %	108793679
576	NC_008122	GAT	2	6	31402	31407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793679
577	NC_008122	AGT	2	6	31415	31420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793679
578	NC_008122	AAAT	2	8	31496	31503	75 %	25 %	0 %	0 %	108793680
579	NC_008122	CATT	2	8	31563	31570	25 %	50 %	0 %	25 %	108793680
580	NC_008122	T	6	6	31735	31740	0 %	100 %	0 %	0 %	108793680
581	NC_008122	CGA	2	6	32008	32013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793681
582	NC_008122	GTT	2	6	32113	32118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793681
583	NC_008122	ATT	2	6	32127	32132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793681
584	NC_008122	AAT	2	6	33087	33092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793682
585	NC_008122	AAC	2	6	33101	33106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793682
586	NC_008122	GTC	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793682
587	NC_008122	AAT	2	6	33786	33791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793683
588	NC_008122	ATC	2	6	33851	33856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793683
589	NC_008122	TTG	2	6	33911	33916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793683
590	NC_008122	CAAA	2	8	33976	33983	75 %	0 %	0 %	25 %	108793683
591	NC_008122	GTTG	2	8	33989	33996	0 %	50 %	50 %	0 %	108793683
592	NC_008122	AAC	2	6	34020	34025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793683
593	NC_008122	TTG	2	6	34034	34039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793683
594	NC_008122	AAATGT	2	12	34082	34093	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	108793683
595	NC_008122	CAAGC	2	10	34124	34133	40 %	0 %	20 %	40 %	108793683
596	NC_008122	CCT	2	6	34182	34187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793684
597	NC_008122	GAA	2	6	34327	34332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793684
598	NC_008122	CGC	2	6	34360	34365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793684
599	NC_008122	GA	3	6	34391	34396	50 %	0 %	50 %	0 %	108793684
600	NC_008122	T	7	7	34401	34407	0 %	100 %	0 %	0 %	108793684
601	NC_008122	TAA	2	6	34447	34452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793684
602	NC_008122	CGT	2	6	34474	34479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793684
603	NC_008122	CGCC	2	8	34652	34659	0 %	0 %	25 %	75 %	108793684
604	NC_008122	TAT	2	6	34759	34764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793684
605	NC_008122	GAA	2	6	34770	34775	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793684
606	NC_008122	CT	3	6	34834	34839	0 %	50 %	0 %	50 %	108793684
607	NC_008122	GCT	2	6	34906	34911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793684
608	NC_008122	TGG	2	6	34983	34988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793684
609	NC_008122	AAT	2	6	35100	35105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793684
610	NC_008122	CCT	2	6	36375	36380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793685
611	NC_008122	CGC	2	6	36394	36399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793685
612	NC_008122	AAC	2	6	36407	36412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793685
613	NC_008122	GTCG	2	8	36471	36478	0 %	25 %	50 %	25 %	108793685
614	NC_008122	GGTG	2	8	36509	36516	0 %	25 %	75 %	0 %	108793685
615	NC_008122	GAT	2	6	36543	36548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793685
616	NC_008122	A	6	6	36859	36864	100 %	0 %	0 %	0 %	108793686
617	NC_008122	C	6	6	36894	36899	0 %	0 %	0 %	100 %	108793686
618	NC_008122	AGA	2	6	36949	36954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793686
619	NC_008122	TGC	2	6	37045	37050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793686
620	NC_008122	ATTGG	2	10	37118	37127	20 %	40 %	40 %	0 %	108793686
621	NC_008122	TTG	2	6	37137	37142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793686
622	NC_008122	ACC	2	6	37220	37225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793686
623	NC_008122	GGC	2	6	37243	37248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793686
624	NC_008122	CA	3	6	37288	37293	50 %	0 %	0 %	50 %	108793686
625	NC_008122	CAA	2	6	37300	37305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793686
626	NC_008122	TTC	2	6	37330	37335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793686
627	NC_008122	GAA	2	6	37361	37366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793686
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629	NC_008122	AGA	2	6	37682	37687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793687
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