MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Antiqua plasmid pMT

Total Repeats: 1541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008120	CGAG	2	8	61326	61333	25 %	0 %	50 %	25 %	108793592
1002	NC_008120	CTT	2	6	61354	61359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1003	NC_008120	CAG	2	6	61400	61405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1004	NC_008120	GAAGA	2	10	61423	61432	60 %	0 %	40 %	0 %	108793592
1005	NC_008120	CAT	2	6	61484	61489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793592
1006	NC_008120	TTC	3	9	61530	61538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1007	NC_008120	GT	3	6	61564	61569	0 %	50 %	50 %	0 %	108793592
1008	NC_008120	AGC	2	6	61635	61640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793592
1009	NC_008120	CCA	2	6	61651	61656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793592
1010	NC_008120	GA	3	6	61774	61779	50 %	0 %	50 %	0 %	108793592
1011	NC_008120	CAC	2	6	61817	61822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793592
1012	NC_008120	CGTCCA	2	12	61825	61836	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	108793592
1013	NC_008120	CAC	2	6	61914	61919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793592
1014	NC_008120	TTC	2	6	61946	61951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793592
1015	NC_008120	GAC	2	6	62102	62107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1016	NC_008120	GTA	2	6	62153	62158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793593
1017	NC_008120	CGT	2	6	62160	62165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1018	NC_008120	GTCA	2	8	62171	62178	25 %	25 %	25 %	25 %	108793593
1019	NC_008120	GCA	2	6	62265	62270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1020	NC_008120	T	7	7	62302	62308	0 %	100 %	0 %	0 %	108793593
1021	NC_008120	TCC	2	6	62310	62315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793593
1022	NC_008120	GCA	2	6	62458	62463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1023	NC_008120	TGA	2	6	62539	62544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793593
1024	NC_008120	GCC	2	6	62618	62623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793593
1025	NC_008120	CTG	2	6	62648	62653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1026	NC_008120	ACGC	2	8	62655	62662	25 %	0 %	25 %	50 %	108793593
1027	NC_008120	TCT	2	6	62679	62684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1028	NC_008120	GTC	2	6	62702	62707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1029	NC_008120	TGAAC	2	10	62767	62776	40 %	20 %	20 %	20 %	108793593
1030	NC_008120	GCTC	2	8	62796	62803	0 %	25 %	25 %	50 %	108793593
1031	NC_008120	GAA	2	6	62823	62828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793593
1032	NC_008120	CAGA	2	8	62836	62843	50 %	0 %	25 %	25 %	108793593
1033	NC_008120	TCA	2	6	62967	62972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793593
1034	NC_008120	TGG	2	6	63049	63054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793593
1035	NC_008120	CTT	2	6	63088	63093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1036	NC_008120	TCG	2	6	63099	63104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1037	NC_008120	TCC	2	6	63120	63125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793593
1038	NC_008120	TCT	2	6	63246	63251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1039	NC_008120	CTC	2	6	63260	63265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793593
1040	NC_008120	GCG	2	6	63312	63317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793593
1041	NC_008120	ACC	2	6	63395	63400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793593
1042	NC_008120	TCG	2	6	63402	63407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1043	NC_008120	CAT	2	6	63433	63438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793593
1044	NC_008120	CAT	2	6	63583	63588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793593
1045	NC_008120	CTT	2	6	63589	63594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1046	NC_008120	GTC	3	9	63605	63613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1047	NC_008120	TCG	2	6	63657	63662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1048	NC_008120	GAT	2	6	63717	63722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793593
1049	NC_008120	AGC	2	6	63782	63787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1050	NC_008120	TTC	2	6	63890	63895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793593
1051	NC_008120	ACG	2	6	63936	63941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793593
1052	NC_008120	TCTG	2	8	64038	64045	0 %	50 %	25 %	25 %	108793594
1053	NC_008120	TTTGA	2	10	64063	64072	20 %	60 %	20 %	0 %	108793594
1054	NC_008120	GTG	2	6	64084	64089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793594
1055	NC_008120	TGC	2	6	64120	64125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793594
1056	NC_008120	GAA	2	6	64216	64221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793594
1057	NC_008120	CTT	2	6	64230	64235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793594
1058	NC_008120	CTGA	2	8	64237	64244	25 %	25 %	25 %	25 %	108793594
1059	NC_008120	TCA	2	6	64262	64267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793594
1060	NC_008120	ATG	2	6	64268	64273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793594
1061	NC_008120	G	6	6	64281	64286	0 %	0 %	100 %	0 %	108793594
1062	NC_008120	CGT	2	6	64306	64311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793594
1063	NC_008120	CTG	3	9	64359	64367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793594
1064	NC_008120	TGAG	2	8	64488	64495	25 %	25 %	50 %	0 %	108793594
1065	NC_008120	CCG	2	6	64566	64571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793594
1066	NC_008120	TGA	2	6	64610	64615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793594
1067	NC_008120	TTC	2	6	64627	64632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793594
1068	NC_008120	TGT	2	6	64685	64690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793594
1069	NC_008120	GCGCT	2	10	64701	64710	0 %	20 %	40 %	40 %	108793594
1070	NC_008120	CAT	2	6	64771	64776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793594
1071	NC_008120	CTC	2	6	64784	64789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793595
1072	NC_008120	GAT	2	6	64817	64822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793595
1073	NC_008120	TCA	2	6	64855	64860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793595
1074	NC_008120	T	6	6	64878	64883	0 %	100 %	0 %	0 %	108793595
1075	NC_008120	CTG	2	6	64908	64913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793595
1076	NC_008120	CAGC	2	8	64983	64990	25 %	0 %	25 %	50 %	108793595
1077	NC_008120	ACCTT	2	10	65101	65110	20 %	40 %	0 %	40 %	108793595
1078	NC_008120	GA	3	6	65144	65149	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
1079	NC_008120	ACA	2	6	65249	65254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793595
1080	NC_008120	CG	3	6	65258	65263	0 %	0 %	50 %	50 %	108793595
1081	NC_008120	CAC	2	6	65267	65272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793595
1082	NC_008120	AAG	2	6	65275	65280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793595
1083	NC_008120	GTC	2	6	65432	65437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793595
1084	NC_008120	CGAAC	2	10	65450	65459	40 %	0 %	20 %	40 %	108793595
1085	NC_008120	GCTCCT	2	12	65465	65476	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	108793595
1086	NC_008120	GA	4	8	65485	65492	50 %	0 %	50 %	0 %	108793595
1087	NC_008120	GAAT	2	8	65495	65502	50 %	25 %	25 %	0 %	108793595
1088	NC_008120	GCGA	2	8	65550	65557	25 %	0 %	50 %	25 %	108793595
1089	NC_008120	CAG	2	6	65642	65647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793595
1090	NC_008120	GGC	2	6	65665	65670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793595
1091	NC_008120	CGTT	2	8	65874	65881	0 %	50 %	25 %	25 %	108793596
1092	NC_008120	GAC	2	6	65894	65899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793596
1093	NC_008120	GAA	2	6	65909	65914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793596
1094	NC_008120	TG	3	6	66003	66008	0 %	50 %	50 %	0 %	108793596
1095	NC_008120	ACG	2	6	66020	66025	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793596
1096	NC_008120	CT	3	6	66109	66114	0 %	50 %	0 %	50 %	108793596
1097	NC_008120	CGT	2	6	66211	66216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793596
1098	NC_008120	CGC	2	6	66250	66255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793596
1099	NC_008120	TGA	2	6	66545	66550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793597
1100	NC_008120	TGTT	2	8	66559	66566	0 %	75 %	25 %	0 %	108793597
1101	NC_008120	TTC	2	6	66615	66620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793597
1102	NC_008120	CCAT	2	8	66652	66659	25 %	25 %	0 %	50 %	108793597
1103	NC_008120	CTA	2	6	67072	67077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793599
1104	NC_008120	CAA	2	6	67106	67111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793599
1105	NC_008120	TC	3	6	67116	67121	0 %	50 %	0 %	50 %	108793599
1106	NC_008120	TTC	2	6	67245	67250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793599
1107	NC_008120	GAA	2	6	67254	67259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793599
1108	NC_008120	A	6	6	67285	67290	100 %	0 %	0 %	0 %	108793599
1109	NC_008120	ATCAG	2	10	67337	67346	40 %	20 %	20 %	20 %	108793599
1110	NC_008120	GTT	2	6	67347	67352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793599
1111	NC_008120	TTG	2	6	67443	67448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793598
1112	NC_008120	GATG	2	8	67455	67462	25 %	25 %	50 %	0 %	108793598
1113	NC_008120	ATT	2	6	67558	67563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793598
1114	NC_008120	CTT	2	6	67574	67579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793598
1115	NC_008120	GTG	2	6	67631	67636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793598
1116	NC_008120	TTC	2	6	67676	67681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793598
1117	NC_008120	CTT	3	9	67728	67736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793600
1118	NC_008120	CTGG	2	8	67755	67762	0 %	25 %	50 %	25 %	108793600
1119	NC_008120	AAC	2	6	67778	67783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793600
1120	NC_008120	GCA	2	6	67925	67930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793600
1121	NC_008120	GCC	2	6	67946	67951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793600
1122	NC_008120	AAT	2	6	67977	67982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793600
1123	NC_008120	CG	3	6	68031	68036	0 %	0 %	50 %	50 %	108793600
1124	NC_008120	TTG	2	6	68063	68068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793600
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