MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis Nepal516 plasmid pMT

Total Repeats: 1574

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008118	CCA	2	6	29102	29107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793760
502	NC_008118	TCG	2	6	29129	29134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793760
503	NC_008118	ACG	3	9	29205	29213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793760
504	NC_008118	ACTC	2	8	29219	29226	25 %	25 %	0 %	50 %	108793760
505	NC_008118	CGGAA	2	10	29270	29279	40 %	0 %	40 %	20 %	108793760
506	NC_008118	CGGA	2	8	29328	29335	25 %	0 %	50 %	25 %	108793760
507	NC_008118	CGA	2	6	29382	29387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793760
508	NC_008118	GAT	2	6	29397	29402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793760
509	NC_008118	GACGCC	2	12	29448	29459	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	108793760
510	NC_008118	AACGG	2	10	29478	29487	40 %	0 %	40 %	20 %	108793760
511	NC_008118	GTT	3	9	29502	29510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793760
512	NC_008118	GGT	2	6	29541	29546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793760
513	NC_008118	TGG	2	6	29549	29554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793760
514	NC_008118	CAG	3	9	29592	29600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793760
515	NC_008118	ACG	2	6	29620	29625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793760
516	NC_008118	CCA	2	6	29627	29632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793760
517	NC_008118	GTC	2	6	29637	29642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793760
518	NC_008118	ATA	2	6	29655	29660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	108793760
519	NC_008118	TGA	3	9	29798	29806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793760
520	NC_008118	TGTC	2	8	29807	29814	0 %	50 %	25 %	25 %	108793760
521	NC_008118	TGA	2	6	29845	29850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793761
522	NC_008118	CGT	2	6	29929	29934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793761
523	NC_008118	ATC	2	6	29940	29945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793761
524	NC_008118	CTT	2	6	29992	29997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793761
525	NC_008118	CAG	2	6	29999	30004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793761
526	NC_008118	GTT	3	9	30020	30028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793761
527	NC_008118	TTC	2	6	30136	30141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793762
528	NC_008118	GTC	2	6	30154	30159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793762
529	NC_008118	CCA	2	6	30161	30166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793762
530	NC_008118	GCGG	2	8	30186	30193	0 %	0 %	75 %	25 %	108793762
531	NC_008118	TCG	2	6	30253	30258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793762
532	NC_008118	CAG	2	6	30381	30386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793762
533	NC_008118	TGG	2	6	30401	30406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793762
534	NC_008118	TTG	2	6	30439	30444	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793762
535	NC_008118	GCA	2	6	30509	30514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793762
536	NC_008118	CAGC	2	8	30709	30716	25 %	0 %	25 %	50 %	108793763
537	NC_008118	AGA	2	6	30722	30727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793763
538	NC_008118	TCC	2	6	30780	30785	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	108793763
539	NC_008118	GCAA	2	8	30792	30799	50 %	0 %	25 %	25 %	108793763
540	NC_008118	CAG	2	6	30823	30828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793763
541	NC_008118	CTT	2	6	30865	30870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793763
542	NC_008118	CTT	2	6	30904	30909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793763
543	NC_008118	TGC	2	6	30973	30978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
544	NC_008118	CTG	2	6	31052	31057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
545	NC_008118	CGT	2	6	31069	31074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
546	NC_008118	CTT	3	9	31120	31128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793763
547	NC_008118	GTC	2	6	31136	31141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
548	NC_008118	CCAG	2	8	31170	31177	25 %	0 %	25 %	50 %	108793763
549	NC_008118	GCC	2	6	31182	31187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793763
550	NC_008118	CGA	2	6	31191	31196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793763
551	NC_008118	ATG	2	6	31209	31214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793763
552	NC_008118	CGT	2	6	31216	31221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
553	NC_008118	GGC	2	6	31265	31270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793763
554	NC_008118	CTG	2	6	31286	31291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793763
555	NC_008118	T	6	6	31301	31306	0 %	100 %	0 %	0 %	108793763
556	NC_008118	GTA	2	6	31387	31392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793764
557	NC_008118	TGA	2	6	31461	31466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793764
558	NC_008118	CTCG	2	8	31545	31552	0 %	25 %	25 %	50 %	108793764
559	NC_008118	GCC	2	6	31649	31654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793764
560	NC_008118	TCG	2	6	31658	31663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793764
561	NC_008118	TTC	2	6	31711	31716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	108793764
562	NC_008118	CGA	2	6	31767	31772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793764
563	NC_008118	CCA	2	6	31788	31793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793764
564	NC_008118	A	6	6	31924	31929	100 %	0 %	0 %	0 %	108793764
565	NC_008118	TGA	2	6	32185	32190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793765
566	NC_008118	GAT	3	9	32470	32478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793765
567	NC_008118	GCT	2	6	32528	32533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793765
568	NC_008118	AATC	2	8	32607	32614	50 %	25 %	0 %	25 %	108793765
569	NC_008118	CG	3	6	32621	32626	0 %	0 %	50 %	50 %	108793765
570	NC_008118	GCC	2	6	32746	32751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	108793765
571	NC_008118	A	6	6	32771	32776	100 %	0 %	0 %	0 %	108793765
572	NC_008118	ACC	2	6	32781	32786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	108793765
573	NC_008118	CTG	2	6	32831	32836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793765
574	NC_008118	ATC	2	6	32857	32862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793765
575	NC_008118	ATG	2	6	33293	33298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793765
576	NC_008118	CAG	2	6	33367	33372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793765
577	NC_008118	GGC	2	6	33376	33381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793765
578	NC_008118	GGTGGC	2	12	33461	33472	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	108793765
579	NC_008118	TTA	2	6	33546	33551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	108793765
580	NC_008118	AATA	2	8	33572	33579	75 %	25 %	0 %	0 %	108793765
581	NC_008118	ACG	2	6	33620	33625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793765
582	NC_008118	AG	3	6	33686	33691	50 %	0 %	50 %	0 %	108793765
583	NC_008118	TCA	2	6	33815	33820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793766
584	NC_008118	GGC	2	6	33861	33866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	108793766
585	NC_008118	AGA	2	6	33939	33944	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793766
586	NC_008118	TGG	2	6	34177	34182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	108793767
587	NC_008118	CATC	2	8	34222	34229	25 %	25 %	0 %	50 %	108793767
588	NC_008118	GA	3	6	34240	34245	50 %	0 %	50 %	0 %	108793767
589	NC_008118	TTG	2	6	34306	34311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793767
590	NC_008118	CG	3	6	34511	34516	0 %	0 %	50 %	50 %	108793768
591	NC_008118	TC	3	6	34558	34563	0 %	50 %	0 %	50 %	108793768
592	NC_008118	GTC	2	6	34626	34631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793768
593	NC_008118	CAA	2	6	34635	34640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793768
594	NC_008118	TGCCC	2	10	34651	34660	0 %	20 %	20 %	60 %	108793768
595	NC_008118	G	7	7	34884	34890	0 %	0 %	100 %	0 %	108793768
596	NC_008118	GTC	2	6	34948	34953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793768
597	NC_008118	A	6	6	35334	35339	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
598	NC_008118	ATC	2	6	35343	35348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793769
599	NC_008118	GCT	2	6	35352	35357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793769
600	NC_008118	CAA	2	6	35390	35395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793769
601	NC_008118	CAA	2	6	35495	35500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	108793769
602	NC_008118	ATG	2	6	35518	35523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793769
603	NC_008118	TAC	2	6	35544	35549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793769
604	NC_008118	AGCA	2	8	35558	35565	50 %	0 %	25 %	25 %	108793769
605	NC_008118	ATG	2	6	35722	35727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793769
606	NC_008118	TGA	2	6	35764	35769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	108793769
607	NC_008118	A	6	6	35778	35783	100 %	0 %	0 %	0 %	108793769
608	NC_008118	AAATT	2	10	35791	35800	60 %	40 %	0 %	0 %	108793769
609	NC_008118	CCAA	2	8	35821	35828	50 %	0 %	0 %	50 %	108793769
610	NC_008118	AATC	2	8	35831	35838	50 %	25 %	0 %	25 %	108793769
611	NC_008118	GCT	2	6	35883	35888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793769
612	NC_008118	GCA	2	6	35900	35905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	108793769
613	NC_008118	TAAT	2	8	35961	35968	50 %	50 %	0 %	0 %	108793769
614	NC_008118	GCCA	2	8	36920	36927	25 %	0 %	25 %	50 %	108793770
615	NC_008118	GTT	2	6	37034	37039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	108793770
616	NC_008118	TCCCC	2	10	37051	37060	0 %	20 %	0 %	80 %	108793770
617	NC_008118	CTG	2	6	37262	37267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793770
618	NC_008118	ATC	2	6	37651	37656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	108793771
619	NC_008118	GAA	2	6	37755	37760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	108793771
620	NC_008118	TTAC	2	8	38083	38090	25 %	50 %	0 %	25 %	108793772
621	NC_008118	CA	3	6	38365	38370	50 %	0 %	0 %	50 %	108793772
622	NC_008118	TTGC	2	8	38873	38880	0 %	50 %	25 %	25 %	108793773
623	NC_008118	GCT	2	6	38902	38907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	108793773
624	NC_008118	CTTC	2	8	38932	38939	0 %	50 %	0 %	50 %	108793773
625	NC_008118	CACG	2	8	39008	39015	25 %	0 %	25 %	50 %	108793773
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