MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006153	GTC	2	6	55	60	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
2	NC_006153	AGT	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
3	NC_006153	ATC	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
4	NC_006153	CCT	2	6	185	190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
5	NC_006153	GCC	2	6	211	216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593847
6	NC_006153	ATC	2	6	217	222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
7	NC_006153	CTG	4	12	366	377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
8	NC_006153	TGC	2	6	391	396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
9	NC_006153	CGA	2	6	593	598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593847
10	NC_006153	GAT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
11	NC_006153	CCA	2	6	776	781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
12	NC_006153	TGC	2	6	831	836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
13	NC_006153	CTT	2	6	879	884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593847
14	NC_006153	CTC	2	6	963	968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
15	NC_006153	TGA	2	6	1055	1060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593847
16	NC_006153	GTT	2	6	1313	1318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593847
17	NC_006153	AAC	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
18	NC_006153	TAC	2	6	1410	1415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593847
19	NC_006153	AAC	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593847
20	NC_006153	TCC	2	6	1582	1587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
21	NC_006153	CAC	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593847
22	NC_006153	GCT	2	6	1736	1741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593847
23	NC_006153	TAT	2	6	1755	1760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593847
24	NC_006153	TCC	2	6	2097	2102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593847
25	NC_006153	CTG	2	6	2266	2271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
26	NC_006153	CTG	2	6	2277	2282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
27	NC_006153	TCG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593848
28	NC_006153	TTC	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593848
29	NC_006153	GCG	2	6	2462	2467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593848
30	NC_006153	TCA	2	6	2531	2536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593848
31	NC_006153	ATA	2	6	2546	2551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593848
32	NC_006153	GGT	2	6	2653	2658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593848
33	NC_006153	CCA	2	6	2974	2979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593849
34	NC_006153	TAA	2	6	3002	3007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593849
35	NC_006153	ATG	2	6	3042	3047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593849
36	NC_006153	TCC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593849
37	NC_006153	CAG	2	6	3225	3230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593849
38	NC_006153	GGT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593850
39	NC_006153	TGA	2	6	3577	3582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
40	NC_006153	TAA	2	6	3595	3600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593850
41	NC_006153	AGT	2	6	3632	3637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593850
42	NC_006153	GTT	2	6	5131	5136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229310098
43	NC_006153	GCT	2	6	5178	5183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229310098
44	NC_006153	GTA	2	6	5479	5484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
45	NC_006153	CGG	2	6	5486	5491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229310098
46	NC_006153	ATG	2	6	5657	5662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229310098
47	NC_006153	TGG	2	6	5676	5681	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229310098
48	NC_006153	GTT	2	6	6168	6173	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593853
49	NC_006153	ATG	2	6	6779	6784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593854
50	NC_006153	GCT	2	6	6940	6945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593854
51	NC_006153	AGG	2	6	6961	6966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
52	NC_006153	GGA	2	6	7002	7007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593854
53	NC_006153	CCA	2	6	7104	7109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593854
54	NC_006153	TCA	2	6	7518	7523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593855
55	NC_006153	CTT	3	9	7644	7652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593855
56	NC_006153	CTG	2	6	8314	8319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593856
57	NC_006153	GGC	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593856
58	NC_006153	GCC	2	6	8428	8433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593856
59	NC_006153	AGA	2	6	8612	8617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593857
60	NC_006153	TGA	2	6	8740	8745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593857
61	NC_006153	GCC	2	6	8814	8819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593858
62	NC_006153	ATG	2	6	9120	9125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593859
63	NC_006153	ACT	2	6	9418	9423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
64	NC_006153	GAA	2	6	9467	9472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593859
65	NC_006153	TTC	2	6	9532	9537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593859
66	NC_006153	GTT	2	6	9551	9556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593859
67	NC_006153	CAT	2	6	9681	9686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
68	NC_006153	TAC	2	6	9939	9944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593859
69	NC_006153	CTG	3	9	10044	10052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
70	NC_006153	GCT	2	6	10058	10063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
71	NC_006153	CAG	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593859
72	NC_006153	CTG	2	6	10281	10286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593859
73	NC_006153	CTC	2	6	10321	10326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593859
74	NC_006153	AAC	2	6	10349	10354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593859
75	NC_006153	ATC	2	6	11446	11451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
76	NC_006153	TCT	2	6	11537	11542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593860
77	NC_006153	GGC	2	6	11709	11714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
78	NC_006153	CGA	2	6	11747	11752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
79	NC_006153	TCA	3	9	11759	11767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
80	NC_006153	AAG	2	6	11776	11781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593860
81	NC_006153	ATG	2	6	11813	11818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
82	NC_006153	AGT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593860
83	NC_006153	CAT	2	6	11914	11919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
84	NC_006153	TCA	2	6	11972	11977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
85	NC_006153	CTG	2	6	12139	12144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
86	NC_006153	CGC	2	6	12342	12347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593860
87	NC_006153	GCG	2	6	12355	12360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593860
88	NC_006153	GGT	2	6	12650	12655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593860
89	NC_006153	CTC	2	6	12700	12705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593860
90	NC_006153	CTG	2	6	12719	12724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593860
91	NC_006153	TGT	2	6	12830	12835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593860
92	NC_006153	CAA	2	6	12913	12918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593860
93	NC_006153	CAG	2	6	12997	13002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
94	NC_006153	TAA	2	6	13071	13076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593860
95	NC_006153	CAT	2	6	13089	13094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593860
96	NC_006153	AGG	2	6	13097	13102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593860
97	NC_006153	AGC	2	6	13241	13246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
98	NC_006153	CAG	2	6	13309	13314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593860
99	NC_006153	GTG	2	6	13400	13405	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593860
100	NC_006153	TAA	2	6	13503	13508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593860
101	NC_006153	CGC	2	6	13571	13576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593860
102	NC_006153	AAC	2	6	13653	13658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593860
103	NC_006153	CTG	2	6	14012	14017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593861
104	NC_006153	GAA	2	6	14030	14035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593861
105	NC_006153	GAA	2	6	14053	14058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593861
106	NC_006153	TGA	2	6	14143	14148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593861
107	NC_006153	CAG	2	6	14199	14204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593861
108	NC_006153	ACT	2	6	14314	14319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593861
109	NC_006153	TCA	2	6	14397	14402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593861
110	NC_006153	GAA	2	6	15488	15493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593862
111	NC_006153	GAA	2	6	15539	15544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593862
112	NC_006153	GAA	3	9	15589	15597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593862
113	NC_006153	TGG	2	6	15672	15677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593862
114	NC_006153	TGC	2	6	15702	15707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593862
115	NC_006153	CTG	2	6	15766	15771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593863
116	NC_006153	GCG	2	6	15772	15777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593863
117	NC_006153	TGA	2	6	15809	15814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593863
118	NC_006153	CTG	2	6	15931	15936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593863
119	NC_006153	CGG	2	6	16021	16026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593863
120	NC_006153	GAT	2	6	16204	16209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593863
121	NC_006153	GGC	2	6	16469	16474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593863
122	NC_006153	TTC	2	6	16500	16505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593863
123	NC_006153	TCA	2	6	16542	16547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593863
124	NC_006153	GAT	2	6	16730	16735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593864
125	NC_006153	GAT	2	6	16743	16748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593864
126	NC_006153	TCC	2	6	16751	16756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593864
127	NC_006153	ATC	2	6	16879	16884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593864
128	NC_006153	TAC	2	6	17026	17031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593864
129	NC_006153	TTC	2	6	17083	17088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593864
130	NC_006153	TTC	2	6	17110	17115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593864
131	NC_006153	GCT	2	6	17551	17556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593865
132	NC_006153	GGA	2	6	17599	17604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51593865
133	NC_006153	CAG	2	6	17607	17612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593865
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135	NC_006153	CAG	2	6	17844	17849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593865
136	NC_006153	CAG	2	6	17892	17897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593865
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139	NC_006153	CTG	2	6	18044	18049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593866
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162	NC_006153	GGT	2	6	20737	20742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593869
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256	NC_006153	ATT	2	6	31597	31602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593886
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