MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pseudotuberculosis IP 32953 plasmid pYV

Total Repeats: 1052

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_006153	GCCGC	2	10	38448	38457	0 %	0 %	40 %	60 %	51593897
502	NC_006153	AAT	2	6	38472	38477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593897
503	NC_006153	CTT	2	6	38485	38490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593897
504	NC_006153	TGT	2	6	38493	38498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593897
505	NC_006153	TGGC	2	8	38511	38518	0 %	25 %	50 %	25 %	51593897
506	NC_006153	GTG	2	6	38530	38535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593897
507	NC_006153	TTG	2	6	38597	38602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593897
508	NC_006153	G	6	6	38611	38616	0 %	0 %	100 %	0 %	51593897
509	NC_006153	GAC	2	6	38939	38944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593898
510	NC_006153	CA	3	6	38988	38993	50 %	0 %	0 %	50 %	51593898
511	NC_006153	AG	3	6	39055	39060	50 %	0 %	50 %	0 %	51593898
512	NC_006153	CCT	2	6	39115	39120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593898
513	NC_006153	AGGA	2	8	39124	39131	50 %	0 %	50 %	0 %	51593898
514	NC_006153	GTC	2	6	39163	39168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593898
515	NC_006153	TTG	2	6	39171	39176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593898
516	NC_006153	TGAA	2	8	39244	39251	50 %	25 %	25 %	0 %	51593899
517	NC_006153	GTT	2	6	39307	39312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593899
518	NC_006153	T	6	6	39311	39316	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
519	NC_006153	GGT	2	6	39357	39362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593899
520	NC_006153	ATT	2	6	39381	39386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593899
521	NC_006153	TAT	2	6	39392	39397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593899
522	NC_006153	T	7	7	39437	39443	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
523	NC_006153	T	9	9	39476	39484	0 %	100 %	0 %	0 %	51593899
524	NC_006153	TGG	2	6	39503	39508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593899
525	NC_006153	CCA	2	6	39628	39633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593899
526	NC_006153	TTA	2	6	39646	39651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593899
527	NC_006153	CGG	2	6	39686	39691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593899
528	NC_006153	TTC	2	6	39705	39710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593899
529	NC_006153	ATG	2	6	39735	39740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593899
530	NC_006153	CAA	2	6	39752	39757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593899
531	NC_006153	ATC	3	9	39771	39779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593899
532	NC_006153	CGG	2	6	39788	39793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593899
533	NC_006153	GAT	2	6	39850	39855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593899
534	NC_006153	GTTG	2	8	39893	39900	0 %	50 %	50 %	0 %	51593899
535	NC_006153	ATC	2	6	39972	39977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593899
536	NC_006153	TTC	2	6	40071	40076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593899
537	NC_006153	GAA	2	6	40084	40089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51593899
538	NC_006153	GTT	2	6	40103	40108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593899
539	NC_006153	TGT	2	6	40141	40146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593899
540	NC_006153	AAT	2	6	40177	40182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593900
541	NC_006153	CAT	2	6	40192	40197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593900
542	NC_006153	TCA	2	6	40265	40270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593900
543	NC_006153	CGG	2	6	40302	40307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593900
544	NC_006153	CA	3	6	40359	40364	50 %	0 %	0 %	50 %	51593900
545	NC_006153	AAT	2	6	40373	40378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593900
546	NC_006153	TCA	2	6	40439	40444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593900
547	NC_006153	GTT	2	6	40515	40520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593901
548	NC_006153	TGA	2	6	40547	40552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593901
549	NC_006153	ACC	2	6	40574	40579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593901
550	NC_006153	GAGC	2	8	40622	40629	25 %	0 %	50 %	25 %	51593901
551	NC_006153	GA	3	6	40641	40646	50 %	0 %	50 %	0 %	51593901
552	NC_006153	ATA	2	6	40680	40685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593901
553	NC_006153	GTT	2	6	40760	40765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593901
554	NC_006153	CAT	2	6	40938	40943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593901
555	NC_006153	CTG	2	6	40976	40981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593902
556	NC_006153	CGA	2	6	41049	41054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
557	NC_006153	CAG	2	6	41146	41151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
558	NC_006153	T	6	6	41203	41208	0 %	100 %	0 %	0 %	51593902
559	NC_006153	CTT	2	6	41215	41220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
560	NC_006153	AT	3	6	41242	41247	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
561	NC_006153	ACT	2	6	41288	41293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593902
562	NC_006153	AT	3	6	41298	41303	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
563	NC_006153	ACG	2	6	41316	41321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
564	NC_006153	CCA	2	6	41344	41349	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593902
565	NC_006153	TCT	2	6	41388	41393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
566	NC_006153	CTT	2	6	41449	41454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
567	NC_006153	TAAT	2	8	41455	41462	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
568	NC_006153	CCT	2	6	41472	41477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593902
569	NC_006153	GA	3	6	41578	41583	50 %	0 %	50 %	0 %	51593902
570	NC_006153	CTC	2	6	41612	41617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593902
571	NC_006153	CACG	2	8	41713	41720	25 %	0 %	25 %	50 %	51593902
572	NC_006153	CTT	2	6	41761	41766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
573	NC_006153	ATA	2	6	41775	41780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593902
574	NC_006153	CAAGAT	2	12	41839	41850	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	51593902
575	NC_006153	TCA	2	6	41877	41882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593902
576	NC_006153	ATCA	2	8	41927	41934	50 %	25 %	0 %	25 %	51593902
577	NC_006153	CTT	2	6	41959	41964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
578	NC_006153	AGC	2	6	42014	42019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
579	NC_006153	ACC	2	6	42104	42109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593902
580	NC_006153	CAG	2	6	42179	42184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
581	NC_006153	CCA	2	6	42189	42194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593902
582	NC_006153	TGA	2	6	42251	42256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593902
583	NC_006153	TCT	2	6	42258	42263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593902
584	NC_006153	ATA	2	6	42282	42287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593902
585	NC_006153	CAG	2	6	42305	42310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
586	NC_006153	CCATC	2	10	42328	42337	20 %	20 %	0 %	60 %	51593902
587	NC_006153	CGC	2	6	42412	42417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593902
588	NC_006153	AT	3	6	42421	42426	50 %	50 %	0 %	0 %	51593902
589	NC_006153	ATA	2	6	42435	42440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593902
590	NC_006153	CTTT	2	8	42507	42514	0 %	75 %	0 %	25 %	51593902
591	NC_006153	TCG	2	6	42520	42525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593902
592	NC_006153	CG	3	6	42524	42529	0 %	0 %	50 %	50 %	51593902
593	NC_006153	GCATC	2	10	42601	42610	20 %	20 %	20 %	40 %	51593902
594	NC_006153	AG	3	6	42612	42617	50 %	0 %	50 %	0 %	51593902
595	NC_006153	TGA	2	6	42682	42687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593902
596	NC_006153	CGA	2	6	42706	42711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
597	NC_006153	ACG	2	6	42726	42731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
598	NC_006153	GTG	2	6	42789	42794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593902
599	NC_006153	AAC	2	6	42891	42896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51593902
600	NC_006153	G	8	8	42943	42950	0 %	0 %	100 %	0 %	51593902
601	NC_006153	CAT	2	6	42962	42967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593902
602	NC_006153	CAG	2	6	42983	42988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593902
603	NC_006153	AAT	2	6	43073	43078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51593903
604	NC_006153	GTT	2	6	43118	43123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593903
605	NC_006153	CTT	2	6	43187	43192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593903
606	NC_006153	TTA	3	9	43213	43221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593903
607	NC_006153	GC	3	6	43300	43305	0 %	0 %	50 %	50 %	51593903
608	NC_006153	AACC	2	8	43330	43337	50 %	0 %	0 %	50 %	51593903
609	NC_006153	AGC	2	6	43342	43347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593903
610	NC_006153	TGT	2	6	43357	43362	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593903
611	NC_006153	ATT	2	6	43407	43412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593904
612	NC_006153	ATC	3	9	43424	43432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593904
613	NC_006153	TTG	2	6	43433	43438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593904
614	NC_006153	AGC	2	6	43446	43451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51593904
615	NC_006153	GACT	2	8	43476	43483	25 %	25 %	25 %	25 %	51593904
616	NC_006153	GGT	2	6	43484	43489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51593904
617	NC_006153	GCTT	2	8	43588	43595	0 %	50 %	25 %	25 %	51593904
618	NC_006153	GGC	2	6	43647	43652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51593904
619	NC_006153	G	6	6	43726	43731	0 %	0 %	100 %	0 %	51593904
620	NC_006153	TTA	2	6	43735	43740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51593904
621	NC_006153	TGC	2	6	43766	43771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51593905
622	NC_006153	TCA	2	6	43826	43831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51593905
623	NC_006153	ACC	2	6	43866	43871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51593905
624	NC_006153	GCC	2	6	43904	43909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593905
625	NC_006153	TGT	2	6	43994	43999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51593905
626	NC_006153	ATG	2	6	44096	44101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593905
627	NC_006153	ACTC	2	8	44113	44120	25 %	25 %	0 %	50 %	51593905
628	NC_006153	TTC	2	6	44123	44128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51593906
629	NC_006153	ATCG	2	8	44150	44157	25 %	25 %	25 %	25 %	51593906
630	NC_006153	CTC	2	6	44192	44197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51593906
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754	NC_006153	CGC	2	6	50973	50978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51593915
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759	NC_006153	ATG	2	6	51133	51138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51593915
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