MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004838	GCA	2	6	63587	63592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795407
1002	NC_004838	GAA	2	6	63674	63679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795407
1003	NC_004838	ACA	2	6	63684	63689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795407
1004	NC_004838	GA	3	6	63850	63855	50 %	0 %	50 %	0 %	31795407
1005	NC_004838	AGAA	2	8	63881	63888	75 %	0 %	25 %	0 %	31795407
1006	NC_004838	AAG	2	6	63899	63904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795407
1007	NC_004838	TTG	2	6	63909	63914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795407
1008	NC_004838	T	6	6	64035	64040	0 %	100 %	0 %	0 %	31795408
1009	NC_004838	CAC	2	6	64051	64056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795408
1010	NC_004838	TTTG	2	8	64073	64080	0 %	75 %	25 %	0 %	31795408
1011	NC_004838	CAC	2	6	64119	64124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795408
1012	NC_004838	AGGC	2	8	64187	64194	25 %	0 %	50 %	25 %	31795409
1013	NC_004838	TTCA	2	8	64527	64534	25 %	50 %	0 %	25 %	31795410
1014	NC_004838	CCTC	2	8	64581	64588	0 %	25 %	0 %	75 %	31795410
1015	NC_004838	CA	3	6	64592	64597	50 %	0 %	0 %	50 %	31795410
1016	NC_004838	CGCTT	2	10	64600	64609	0 %	40 %	20 %	40 %	31795410
1017	NC_004838	TTA	2	6	64686	64691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795410
1018	NC_004838	ATG	2	6	64700	64705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795410
1019	NC_004838	CGTT	2	8	64804	64811	0 %	50 %	25 %	25 %	31795410
1020	NC_004838	GTTATT	2	12	64880	64891	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31795410
1021	NC_004838	GAG	2	6	64916	64921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795410
1022	NC_004838	ATC	2	6	64982	64987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795410
1023	NC_004838	TGATT	2	10	65014	65023	20 %	60 %	20 %	0 %	31795410
1024	NC_004838	GTC	2	6	65088	65093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795410
1025	NC_004838	TGA	2	6	65140	65145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795410
1026	NC_004838	CTA	2	6	65185	65190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795410
1027	NC_004838	GCA	2	6	65205	65210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795410
1028	NC_004838	CTG	2	6	65301	65306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795410
1029	NC_004838	CAT	2	6	65416	65421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795410
1030	NC_004838	CCT	2	6	65424	65429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795410
1031	NC_004838	TGA	2	6	65439	65444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795410
1032	NC_004838	GCAG	2	8	65614	65621	25 %	0 %	50 %	25 %	31795410
1033	NC_004838	TGA	3	9	65752	65760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795410
1034	NC_004838	GAA	2	6	65771	65776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795410
1035	NC_004838	TGC	2	6	65961	65966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795411
1036	NC_004838	TCT	2	6	65972	65977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795411
1037	NC_004838	TGA	2	6	66018	66023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795411
1038	NC_004838	CTC	2	6	66040	66045	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795411
1039	NC_004838	CAT	2	6	66054	66059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795411
1040	NC_004838	GC	3	6	66244	66249	0 %	0 %	50 %	50 %	31795411
1041	NC_004838	CCAG	2	8	66523	66530	25 %	0 %	25 %	50 %	31795412
1042	NC_004838	CTGCG	2	10	66545	66554	0 %	20 %	40 %	40 %	31795412
1043	NC_004838	TCG	2	6	66739	66744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795412
1044	NC_004838	A	6	6	66834	66839	100 %	0 %	0 %	0 %	31795412
1045	NC_004838	GCC	2	6	66891	66896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795412
1046	NC_004838	CAC	2	6	67074	67079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795413
1047	NC_004838	CCGA	2	8	67080	67087	25 %	0 %	25 %	50 %	31795413
1048	NC_004838	CA	3	6	67127	67132	50 %	0 %	0 %	50 %	31795413
1049	NC_004838	GCC	2	6	67185	67190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795413
1050	NC_004838	CGT	2	6	67203	67208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795413
1051	NC_004838	CAG	2	6	67251	67256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795413
1052	NC_004838	GCC	2	6	67263	67268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795413
1053	NC_004838	GC	3	6	67274	67279	0 %	0 %	50 %	50 %	31795413
1054	NC_004838	ACG	2	6	67300	67305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795413
1055	NC_004838	TG	3	6	67383	67388	0 %	50 %	50 %	0 %	31795414
1056	NC_004838	GGC	2	6	67498	67503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795414
1057	NC_004838	TTG	2	6	67587	67592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39980775
1058	NC_004838	CGG	2	6	67642	67647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980775
1059	NC_004838	GGAAT	2	10	67668	67677	40 %	20 %	40 %	0 %	39980775
1060	NC_004838	GAA	2	6	67734	67739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980775
1061	NC_004838	CGG	2	6	67810	67815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980775
1062	NC_004838	CGG	2	6	67825	67830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980775
1063	NC_004838	ATC	2	6	67903	67908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980775
1064	NC_004838	CGC	2	6	67929	67934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39980775
1065	NC_004838	GCG	2	6	67944	67949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39980775
1066	NC_004838	A	6	6	67968	67973	100 %	0 %	0 %	0 %	39980775
1067	NC_004838	ACC	2	6	68039	68044	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795416
1068	NC_004838	GC	3	6	68072	68077	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
1069	NC_004838	ATGG	2	8	68094	68101	25 %	25 %	50 %	0 %	31795416
1070	NC_004838	GGAT	2	8	68147	68154	25 %	25 %	50 %	0 %	31795416
1071	NC_004838	ATT	2	6	68276	68281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31795416
1072	NC_004838	CGC	2	6	68307	68312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795416
1073	NC_004838	GGA	2	6	68320	68325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795416
1074	NC_004838	GC	3	6	68444	68449	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
1075	NC_004838	GGC	2	6	68458	68463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795416
1076	NC_004838	CG	3	6	68472	68477	0 %	0 %	50 %	50 %	31795416
1077	NC_004838	CTG	2	6	68542	68547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795416
1078	NC_004838	GAT	2	6	68555	68560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795416
1079	NC_004838	GGT	2	6	68572	68577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795416
1080	NC_004838	CAG	2	6	68611	68616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795416
1081	NC_004838	TGC	2	6	68682	68687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795416
1082	NC_004838	TGGA	2	8	68714	68721	25 %	25 %	50 %	0 %	31795416
1083	NC_004838	CAG	2	6	68814	68819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795417
1084	NC_004838	GCG	2	6	68823	68828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795417
1085	NC_004838	TCC	2	6	68880	68885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795417
1086	NC_004838	GTT	2	6	68888	68893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795417
1087	NC_004838	CTCTA	2	10	68944	68953	20 %	40 %	0 %	40 %	31795417
1088	NC_004838	ACC	2	6	69220	69225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795418
1089	NC_004838	GCA	2	6	69269	69274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795418
1090	NC_004838	GGA	2	6	69315	69320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795418
1091	NC_004838	CCAGGA	2	12	69378	69389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795418
1092	NC_004838	CGC	2	6	69441	69446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795418
1093	NC_004838	GAA	2	6	69460	69465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795418
1094	NC_004838	TGA	2	6	69531	69536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795418
1095	NC_004838	CAG	2	6	69669	69674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795418
1096	NC_004838	CGA	2	6	70453	70458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795419
1097	NC_004838	GCG	2	6	70490	70495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795419
1098	NC_004838	GGC	2	6	70598	70603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795419
1099	NC_004838	AAGA	2	8	70656	70663	75 %	0 %	25 %	0 %	31795419
1100	NC_004838	A	6	6	70763	70768	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
1101	NC_004838	AGC	2	6	70772	70777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1102	NC_004838	A	7	7	70778	70784	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
1103	NC_004838	GAA	2	6	70799	70804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795420
1104	NC_004838	GCC	2	6	70814	70819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795420
1105	NC_004838	CTG	2	6	70946	70951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1106	NC_004838	CGGA	2	8	70977	70984	25 %	0 %	50 %	25 %	31795420
1107	NC_004838	GGT	2	6	71003	71008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795420
1108	NC_004838	GACT	2	8	71013	71020	25 %	25 %	25 %	25 %	31795420
1109	NC_004838	CTG	2	6	71030	71035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1110	NC_004838	GAC	2	6	71090	71095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1111	NC_004838	CCTCG	2	10	71104	71113	0 %	20 %	20 %	60 %	31795420
1112	NC_004838	AGC	2	6	71127	71132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1113	NC_004838	GC	3	6	71131	71136	0 %	0 %	50 %	50 %	31795420
1114	NC_004838	CCG	2	6	71148	71153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795420
1115	NC_004838	TCGGCT	2	12	71220	71231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1116	NC_004838	GCA	2	6	71492	71497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1117	NC_004838	ACGGC	2	10	71541	71550	20 %	0 %	40 %	40 %	31795420
1118	NC_004838	CAG	2	6	71612	71617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1119	NC_004838	AGC	4	12	71727	71738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1120	NC_004838	CGA	2	6	71785	71790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1121	NC_004838	AGG	2	6	71826	71831	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795420
1122	NC_004838	GAC	2	6	71855	71860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1123	NC_004838	GAA	2	6	71948	71953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795420
1124	NC_004838	CAG	2	6	71962	71967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795420
1125	NC_004838	CGC	2	6	72001	72006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795420
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1127	NC_004838	GGC	2	6	72067	72072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795420
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1383	NC_004838	TGA	2	6	88258	88263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795433
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1497	NC_004838	TGA	2	6	95462	95467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39980779
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1499	NC_004838	CTG	2	6	95566	95571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39980779
1500	NC_004838	CTG	2	6	95610	95615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39980779

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