MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 1605

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004838	GAC	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
502	NC_004838	GGC	2	6	32692	32697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
503	NC_004838	ATC	2	6	32801	32806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
504	NC_004838	CT	3	6	32860	32865	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
505	NC_004838	CGA	2	6	32878	32883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
506	NC_004838	TGC	2	6	32890	32895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795374
507	NC_004838	CGC	2	6	32902	32907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
508	NC_004838	GCA	3	9	32933	32941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
509	NC_004838	AGGA	2	8	32990	32997	50 %	0 %	50 %	0 %	31795374
510	NC_004838	GGC	2	6	33019	33024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
511	NC_004838	TC	3	6	33110	33115	0 %	50 %	0 %	50 %	31795374
512	NC_004838	ACC	2	6	33122	33127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795374
513	NC_004838	TCA	2	6	33168	33173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
514	NC_004838	GAT	2	6	33181	33186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795374
515	NC_004838	CGA	2	6	33229	33234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
516	NC_004838	CCG	2	6	33253	33258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795374
517	NC_004838	GAT	2	6	33271	33276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795374
518	NC_004838	CAT	2	6	33304	33309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
519	NC_004838	TGG	2	6	33456	33461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
520	NC_004838	GGCA	2	8	33463	33470	25 %	0 %	50 %	25 %	31795374
521	NC_004838	TCA	2	6	33480	33485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795374
522	NC_004838	TGGGGA	2	12	33708	33719	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	31795374
523	NC_004838	CGA	2	6	33834	33839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
524	NC_004838	CAG	2	6	33881	33886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795374
525	NC_004838	CAAC	2	8	33909	33916	50 %	0 %	0 %	50 %	31795374
526	NC_004838	TCT	2	6	33996	34001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795374
527	NC_004838	TGG	3	9	34138	34146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795374
528	NC_004838	TCC	2	6	34169	34174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795374
529	NC_004838	CAA	2	6	34192	34197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795374
530	NC_004838	GGC	2	6	34226	34231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
531	NC_004838	GGC	2	6	34259	34264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
532	NC_004838	GGC	3	9	34430	34438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795374
533	NC_004838	GCGCA	2	10	34529	34538	20 %	0 %	40 %	40 %	31795374
534	NC_004838	TAAC	2	8	34612	34619	50 %	25 %	0 %	25 %	31795374
535	NC_004838	GACT	2	8	34667	34674	25 %	25 %	25 %	25 %	31795375
536	NC_004838	AGA	2	6	34788	34793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795375
537	NC_004838	TCA	2	6	34826	34831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795375
538	NC_004838	CG	3	6	34858	34863	0 %	0 %	50 %	50 %	31795375
539	NC_004838	GAA	2	6	35076	35081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795376
540	NC_004838	ACC	2	6	35160	35165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795376
541	NC_004838	GT	3	6	35230	35235	0 %	50 %	50 %	0 %	31795376
542	NC_004838	TGG	2	6	35365	35370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795376
543	NC_004838	CAT	2	6	35378	35383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
544	NC_004838	TCG	2	6	35482	35487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795376
545	NC_004838	AGA	2	6	35491	35496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795376
546	NC_004838	ATC	2	6	35577	35582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
547	NC_004838	AAC	2	6	35649	35654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795376
548	NC_004838	ACC	2	6	35661	35666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795376
549	NC_004838	ACGC	2	8	35710	35717	25 %	0 %	25 %	50 %	31795376
550	NC_004838	ACT	2	6	35722	35727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795376
551	NC_004838	ATCT	2	8	35824	35831	25 %	50 %	0 %	25 %	39980770
552	NC_004838	CGAA	2	8	35852	35859	50 %	0 %	25 %	25 %	39980770
553	NC_004838	TAC	2	6	35880	35885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39980770
554	NC_004838	GAC	2	6	35959	35964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39980770
555	NC_004838	GAA	2	6	36099	36104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39980770
556	NC_004838	CTG	2	6	36210	36215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39980770
557	NC_004838	GTG	2	6	36377	36382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39980770
558	NC_004838	TCT	2	6	36386	36391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39980770
559	NC_004838	CAC	2	6	36454	36459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39980770
560	NC_004838	TTA	2	6	36486	36491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39980770
561	NC_004838	AC	3	6	36510	36515	50 %	0 %	0 %	50 %	39980770
562	NC_004838	CAC	2	6	36520	36525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39980770
563	NC_004838	AGTT	2	8	36568	36575	25 %	50 %	25 %	0 %	39980770
564	NC_004838	TGG	2	6	36587	36592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795378
565	NC_004838	GCC	2	6	36613	36618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795378
566	NC_004838	TGA	2	6	36770	36775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795378
567	NC_004838	ATG	2	6	36789	36794	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795378
568	NC_004838	ACA	2	6	36805	36810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795378
569	NC_004838	GCG	2	6	36847	36852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795378
570	NC_004838	TGGT	2	8	36863	36870	0 %	50 %	50 %	0 %	31795378
571	NC_004838	ATG	2	6	36948	36953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795378
572	NC_004838	G	6	6	36953	36958	0 %	0 %	100 %	0 %	31795378
573	NC_004838	AGGC	2	8	37002	37009	25 %	0 %	50 %	25 %	31795378
574	NC_004838	AACTCG	2	12	37014	37025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31795378
575	NC_004838	GTA	2	6	37113	37118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795378
576	NC_004838	TTC	2	6	37121	37126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795378
577	NC_004838	AAG	3	9	37182	37190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795379
578	NC_004838	CGA	2	6	37262	37267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795379
579	NC_004838	TGG	2	6	37333	37338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795379
580	NC_004838	TGA	2	6	37361	37366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795379
581	NC_004838	AGTC	2	8	37483	37490	25 %	25 %	25 %	25 %	31795379
582	NC_004838	ACG	2	6	37513	37518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795379
583	NC_004838	A	6	6	37718	37723	100 %	0 %	0 %	0 %	31795379
584	NC_004838	CTA	2	6	37733	37738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795379
585	NC_004838	TGC	2	6	37792	37797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
586	NC_004838	GTGG	2	8	37841	37848	0 %	25 %	75 %	0 %	31795379
587	NC_004838	TCG	2	6	37864	37869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
588	NC_004838	TCGT	2	8	37949	37956	0 %	50 %	25 %	25 %	31795379
589	NC_004838	AC	3	6	38003	38008	50 %	0 %	0 %	50 %	31795379
590	NC_004838	TGT	2	6	38047	38052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31795379
591	NC_004838	CCTG	2	8	38064	38071	0 %	25 %	25 %	50 %	31795379
592	NC_004838	GAA	2	6	38178	38183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31795379
593	NC_004838	TCT	2	6	38299	38304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31795379
594	NC_004838	TGG	2	6	38309	38314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31795379
595	NC_004838	ATG	2	6	38355	38360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795379
596	NC_004838	CCGT	2	8	38420	38427	0 %	25 %	25 %	50 %	31795379
597	NC_004838	ACA	3	9	38446	38454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795379
598	NC_004838	AGG	2	6	38497	38502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795379
599	NC_004838	CGT	2	6	38508	38513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
600	NC_004838	GCT	2	6	38588	38593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
601	NC_004838	CGCA	2	8	38600	38607	25 %	0 %	25 %	50 %	31795379
602	NC_004838	CTTC	2	8	38647	38654	0 %	50 %	0 %	50 %	31795379
603	NC_004838	TGA	2	6	38902	38907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31795379
604	NC_004838	GCGT	2	8	38950	38957	0 %	25 %	50 %	25 %	31795379
605	NC_004838	AAT	2	6	39015	39020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795379
606	NC_004838	AAC	2	6	39069	39074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795379
607	NC_004838	TCAA	2	8	39156	39163	50 %	25 %	0 %	25 %	31795379
608	NC_004838	CGT	2	6	39213	39218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
609	NC_004838	AAC	2	6	39228	39233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795379
610	NC_004838	CAT	2	6	39353	39358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31795379
611	NC_004838	CGC	2	6	39391	39396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795379
612	NC_004838	CT	3	6	39410	39415	0 %	50 %	0 %	50 %	31795379
613	NC_004838	GTTG	2	8	39530	39537	0 %	50 %	50 %	0 %	31795379
614	NC_004838	GCC	2	6	39543	39548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795379
615	NC_004838	CAC	2	6	39551	39556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31795379
616	NC_004838	CG	3	6	39606	39611	0 %	0 %	50 %	50 %	31795379
617	NC_004838	CCG	2	6	39636	39641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795379
618	NC_004838	GCT	2	6	39728	39733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31795379
619	NC_004838	GGA	2	6	39734	39739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31795379
620	NC_004838	CAA	2	6	39779	39784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795379
621	NC_004838	AG	3	6	39794	39799	50 %	0 %	50 %	0 %	31795379
622	NC_004838	ACG	2	6	39922	39927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795379
623	NC_004838	CAA	2	6	39933	39938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31795379
624	NC_004838	GCG	2	6	40020	40025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31795379
625	NC_004838	TCC	2	6	40125	40130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31795379
626	NC_004838	GCC	2	6	40146	40151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31795379
627	NC_004838	AAT	2	6	40287	40292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31795379
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629	NC_004838	CGA	2	6	40325	40330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31795379
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