MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 1471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_003134	GGC	2	6	61178	61183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082849
1002	NC_003134	CTT	2	6	61192	61197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082849
1003	NC_003134	T	7	7	61213	61219	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
1004	NC_003134	GCT	2	6	61220	61225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082849
1005	NC_003134	T	6	6	61229	61234	0 %	100 %	0 %	0 %	16082849
1006	NC_003134	GCC	2	6	61394	61399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082850
1007	NC_003134	GTC	2	6	61538	61543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082850
1008	NC_003134	GCT	2	6	62322	62327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082851
1009	NC_003134	CGC	2	6	62447	62452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082851
1010	NC_003134	CAT	2	6	62459	62464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082851
1011	NC_003134	CTT	2	6	62531	62536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082851
1012	NC_003134	GCG	2	6	62551	62556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082851
1013	NC_003134	TCCTGG	2	12	62608	62619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082851
1014	NC_003134	TCC	2	6	62677	62682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082851
1015	NC_003134	TGC	2	6	62723	62728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082851
1016	NC_003134	GTG	2	6	62770	62775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082851
1017	NC_003134	TAGAG	2	10	63044	63053	40 %	20 %	40 %	0 %	40787867
1018	NC_003134	AAC	2	6	63104	63109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	40787867
1019	NC_003134	GGA	2	6	63112	63117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	40787867
1020	NC_003134	GCC	3	9	63167	63175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787867
1021	NC_003134	CTG	2	6	63178	63183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	40787867
1022	NC_003134	ATCC	2	8	63275	63282	25 %	25 %	0 %	50 %	40787867
1023	NC_003134	GCA	2	6	63310	63315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40787867
1024	NC_003134	GCT	2	6	63380	63385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082852
1025	NC_003134	CAC	2	6	63419	63424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082852
1026	NC_003134	TCA	2	6	63435	63440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082852
1027	NC_003134	CCAG	2	8	63445	63452	25 %	0 %	25 %	50 %	16082852
1028	NC_003134	CG	3	6	63520	63525	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
1029	NC_003134	GCC	2	6	63534	63539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082852
1030	NC_003134	GC	3	6	63548	63553	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
1031	NC_003134	TCC	2	6	63555	63560	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082852
1032	NC_003134	TCC	2	6	63672	63677	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082852
1033	NC_003134	GCG	2	6	63685	63690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082852
1034	NC_003134	AAT	2	6	63716	63721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082852
1035	NC_003134	ATCC	2	8	63843	63850	25 %	25 %	0 %	50 %	16082852
1036	NC_003134	CCAT	2	8	63896	63903	25 %	25 %	0 %	50 %	16082852
1037	NC_003134	CG	3	6	63919	63924	0 %	0 %	50 %	50 %	16082852
1038	NC_003134	GTG	2	6	63951	63956	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082852
1039	NC_003134	T	6	6	64024	64029	0 %	100 %	0 %	0 %	40787868
1040	NC_003134	CGC	2	6	64048	64053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787868
1041	NC_003134	GGC	2	6	64062	64067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	40787868
1042	NC_003134	GAT	2	6	64089	64094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	40787868
1043	NC_003134	CCG	2	6	64167	64172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787868
1044	NC_003134	CCG	2	6	64182	64187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787868
1045	NC_003134	TGT	2	6	64253	64258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	40787868
1046	NC_003134	ATTCC	2	10	64320	64329	20 %	40 %	0 %	40 %	40787868
1047	NC_003134	CCG	2	6	64350	64355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787868
1048	NC_003134	CAA	2	6	64405	64410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	40787868
1049	NC_003134	GCC	2	6	64494	64499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082854
1050	NC_003134	CA	3	6	64609	64614	50 %	0 %	0 %	50 %	16082854
1051	NC_003134	TCG	2	6	64691	64696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082855
1052	NC_003134	GC	3	6	64718	64723	0 %	0 %	50 %	50 %	16082855
1053	NC_003134	CGG	2	6	64728	64733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082855
1054	NC_003134	GCT	2	6	64740	64745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082855
1055	NC_003134	ACG	2	6	64789	64794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082855
1056	NC_003134	GGC	2	6	64807	64812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082855
1057	NC_003134	TG	3	6	64865	64870	0 %	50 %	50 %	0 %	16082855
1058	NC_003134	TCGG	2	8	64910	64917	0 %	25 %	50 %	25 %	16082855
1059	NC_003134	GTG	2	6	64918	64923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082855
1060	NC_003134	GGC	2	6	65101	65106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082855
1061	NC_003134	T	6	6	65158	65163	0 %	100 %	0 %	0 %	16082855
1062	NC_003134	CGA	2	6	65253	65258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082855
1063	NC_003134	GCG	2	6	65371	65376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	40787869
1064	NC_003134	CGCAG	2	10	65443	65452	20 %	0 %	40 %	40 %	40787869
1065	NC_003134	GCTG	2	8	65466	65473	0 %	25 %	50 %	25 %	40787869
1066	NC_003134	GC	3	6	65748	65753	0 %	0 %	50 %	50 %	16082856
1067	NC_003134	CGGAG	2	10	65836	65845	20 %	0 %	60 %	20 %	16082856
1068	NC_003134	AGA	2	6	65900	65905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082856
1069	NC_003134	GAT	2	6	65937	65942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082856
1070	NC_003134	AGG	2	6	65953	65958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082856
1071	NC_003134	ATC	2	6	65973	65978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082856
1072	NC_003134	GAA	2	6	66018	66023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082856
1073	NC_003134	AGC	2	6	66030	66035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082856
1074	NC_003134	TTC	2	6	66221	66226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082857
1075	NC_003134	TCA	3	9	66237	66245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082857
1076	NC_003134	CTGC	2	8	66376	66383	0 %	25 %	25 %	50 %	16082857
1077	NC_003134	TCA	2	6	66553	66558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082857
1078	NC_003134	AGG	2	6	66568	66573	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	16082857
1079	NC_003134	ATG	2	6	66576	66581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082857
1080	NC_003134	CAG	2	6	66691	66696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082857
1081	NC_003134	TGC	2	6	66787	66792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082857
1082	NC_003134	TAG	2	6	66807	66812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082857
1083	NC_003134	ATC	2	6	66851	66856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082857
1084	NC_003134	GAC	2	6	66904	66909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082857
1085	NC_003134	AATCA	2	10	66974	66983	60 %	20 %	0 %	20 %	16082857
1086	NC_003134	GAT	2	6	67010	67015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082857
1087	NC_003134	GCT	2	6	67072	67077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082857
1088	NC_003134	TCA	2	6	67101	67106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082857
1089	NC_003134	GAAC	2	8	67185	67192	50 %	0 %	25 %	25 %	16082857
1090	NC_003134	CAT	2	6	67292	67297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082857
1091	NC_003134	TAA	2	6	67306	67311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082857
1092	NC_003134	AAGCG	2	10	67388	67397	40 %	0 %	40 %	20 %	16082857
1093	NC_003134	TG	3	6	67400	67405	0 %	50 %	50 %	0 %	16082857
1094	NC_003134	GAGG	2	8	67409	67416	25 %	0 %	75 %	0 %	16082857
1095	NC_003134	TGAA	2	8	67463	67470	50 %	25 %	25 %	0 %	16082857
1096	NC_003134	ACA	2	6	68082	68087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082858
1097	NC_003134	CTT	2	6	68093	68098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082858
1098	NC_003134	TTTC	2	8	68108	68115	0 %	75 %	0 %	25 %	16082858
1099	NC_003134	TC	3	6	68142	68147	0 %	50 %	0 %	50 %	16082858
1100	NC_003134	TTG	2	6	68307	68312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082858
1101	NC_003134	CTT	2	6	68317	68322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082858
1102	NC_003134	CTG	2	6	68404	68409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082858
1103	NC_003134	GA	4	8	68440	68447	50 %	0 %	50 %	0 %	16082858
1104	NC_003134	TTTC	2	8	68449	68456	0 %	75 %	0 %	25 %	16082858
1105	NC_003134	TCT	2	6	68466	68471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082858
1106	NC_003134	ATC	2	6	68585	68590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082858
1107	NC_003134	TTA	2	6	68619	68624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082858
1108	NC_003134	GCAG	2	8	68630	68637	25 %	0 %	50 %	25 %	16082858
1109	NC_003134	ACG	2	6	68639	68644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082858
1110	NC_003134	CTG	2	6	68705	68710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082858
1111	NC_003134	CG	3	6	68746	68751	0 %	0 %	50 %	50 %	16082858
1112	NC_003134	AACG	2	8	68789	68796	50 %	0 %	25 %	25 %	16082858
1113	NC_003134	AT	3	6	68975	68980	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
1114	NC_003134	ATG	2	6	69080	69085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082859
1115	NC_003134	CAC	2	6	69099	69104	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082859
1116	NC_003134	CTT	3	9	69255	69263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082859
1117	NC_003134	AGGGGT	2	12	69334	69345	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	16082859
1118	NC_003134	CAT	2	6	69531	69536	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082859
1119	NC_003134	AAT	2	6	69568	69573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082859
1120	NC_003134	GCG	2	6	69635	69640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082859
1121	NC_003134	TACTG	2	10	69778	69787	20 %	40 %	20 %	20 %	16082859
1122	NC_003134	GAC	2	6	69817	69822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082859
1123	NC_003134	AT	4	8	69880	69887	50 %	50 %	0 %	0 %	16082859
1124	NC_003134	TTA	2	6	69941	69946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082859
1125	NC_003134	TTC	2	6	69961	69966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082859
1126	NC_003134	TGA	2	6	70043	70048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082859
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1128	NC_003134	A	8	8	70490	70497	100 %	0 %	0 %	0 %	16082860
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1384	NC_003134	ACC	2	6	86254	86259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082876
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1387	NC_003134	GCA	2	6	86412	86417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082876
1388	NC_003134	GTAACC	2	12	86436	86447	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	16082876
1389	NC_003134	AAT	2	6	86458	86463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082876
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1423	NC_003134	CGA	2	6	90625	90630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082880
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1462	NC_003134	CCAG	2	8	92515	92522	25 %	0 %	25 %	50 %	16082881
1463	NC_003134	ATC	2	6	92543	92548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082881
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