MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Yersinia pestis CO92 plasmid pMT1

Total Repeats: 1471

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003134	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082808
502	NC_003134	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	16082808
503	NC_003134	CAG	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
504	NC_003134	AGC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
505	NC_003134	CCA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082809
506	NC_003134	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082809
507	NC_003134	ACG	3	9	29208	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
508	NC_003134	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	16082809
509	NC_003134	CGGAA	2	10	29273	29282	40 %	0 %	40 %	20 %	16082809
510	NC_003134	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	16082809
511	NC_003134	CGA	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
512	NC_003134	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082809
513	NC_003134	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	16082809
514	NC_003134	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	16082809
515	NC_003134	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082809
516	NC_003134	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082809
517	NC_003134	TGG	2	6	29552	29557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082809
518	NC_003134	CAG	3	9	29595	29603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
519	NC_003134	ACG	2	6	29623	29628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082809
520	NC_003134	CCA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082809
521	NC_003134	GTC	2	6	29640	29645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082809
522	NC_003134	ATA	2	6	29658	29663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16082809
523	NC_003134	TGA	3	9	29801	29809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082809
524	NC_003134	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	16082809
525	NC_003134	TGA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082810
526	NC_003134	CGT	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082810
527	NC_003134	ATC	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082810
528	NC_003134	CTT	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082810
529	NC_003134	CAG	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082810
530	NC_003134	GTT	3	9	30023	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082810
531	NC_003134	TTC	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	40787863
532	NC_003134	GTC	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	40787863
533	NC_003134	CCA	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	40787863
534	NC_003134	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	40787863
535	NC_003134	TCG	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	40787863
536	NC_003134	CAG	2	6	30384	30389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40787863
537	NC_003134	TGG	2	6	30404	30409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	40787863
538	NC_003134	TTG	2	6	30442	30447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	40787863
539	NC_003134	GCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	40787863
540	NC_003134	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
541	NC_003134	AGA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082812
542	NC_003134	TCC	2	6	30783	30788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16082812
543	NC_003134	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	16082812
544	NC_003134	CAG	2	6	30826	30831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082812
545	NC_003134	CTT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
546	NC_003134	CTT	2	6	30907	30912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
547	NC_003134	TGC	2	6	30976	30981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
548	NC_003134	CTG	2	6	31055	31060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
549	NC_003134	CGT	2	6	31072	31077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
550	NC_003134	CTT	3	9	31123	31131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082812
551	NC_003134	GTC	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
552	NC_003134	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	16082812
553	NC_003134	GCC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082812
554	NC_003134	CGA	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082812
555	NC_003134	ATG	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082812
556	NC_003134	CGT	2	6	31219	31224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
557	NC_003134	GGC	2	6	31268	31273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082812
558	NC_003134	CTG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082812
559	NC_003134	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	16082812
560	NC_003134	GTA	2	6	31390	31395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082813
561	NC_003134	TGA	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082813
562	NC_003134	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	16082813
563	NC_003134	GCC	2	6	31652	31657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082813
564	NC_003134	TCG	2	6	31661	31666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082813
565	NC_003134	TTC	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16082813
566	NC_003134	CGA	2	6	31770	31775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082813
567	NC_003134	CCA	2	6	31791	31796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082813
568	NC_003134	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	16082813
569	NC_003134	TGA	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
570	NC_003134	GAT	3	9	32473	32481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
571	NC_003134	GCT	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082814
572	NC_003134	CTCG	2	8	32568	32575	0 %	25 %	25 %	50 %	16082814
573	NC_003134	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	16082814
574	NC_003134	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	16082814
575	NC_003134	GCC	2	6	32749	32754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16082814
576	NC_003134	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	16082814
577	NC_003134	ACC	2	6	32784	32789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16082814
578	NC_003134	CTG	2	6	32834	32839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082814
579	NC_003134	ATC	2	6	32860	32865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082814
580	NC_003134	ATG	2	6	33296	33301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082814
581	NC_003134	CAG	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082814
582	NC_003134	GGC	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082814
583	NC_003134	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	16082814
584	NC_003134	TTA	2	6	33549	33554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16082814
585	NC_003134	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	16082814
586	NC_003134	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082814
587	NC_003134	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	16082814
588	NC_003134	TCA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082815
589	NC_003134	GGC	2	6	33864	33869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16082815
590	NC_003134	AGA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082815
591	NC_003134	TGG	2	6	34180	34185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16082816
592	NC_003134	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	16082816
593	NC_003134	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	16082816
594	NC_003134	TTG	2	6	34309	34314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082816
595	NC_003134	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	16082817
596	NC_003134	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	16082817
597	NC_003134	GTC	2	6	34629	34634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082817
598	NC_003134	CAA	2	6	34638	34643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082817
599	NC_003134	TGCCC	2	10	34654	34663	0 %	20 %	20 %	60 %	16082817
600	NC_003134	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	16082817
601	NC_003134	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082817
602	NC_003134	A	6	6	35335	35340	100 %	0 %	0 %	0 %	16082818
603	NC_003134	ATC	2	6	35344	35349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082818
604	NC_003134	GCT	2	6	35353	35358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082818
605	NC_003134	CAA	2	6	35391	35396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082818
606	NC_003134	CAA	2	6	35496	35501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16082818
607	NC_003134	ATG	2	6	35519	35524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082818
608	NC_003134	TAC	2	6	35545	35550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16082818
609	NC_003134	AGCA	2	8	35559	35566	50 %	0 %	25 %	25 %	16082818
610	NC_003134	ATG	2	6	35723	35728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082818
611	NC_003134	TGA	2	6	35765	35770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082818
612	NC_003134	A	6	6	35779	35784	100 %	0 %	0 %	0 %	16082818
613	NC_003134	AAATT	2	10	35792	35801	60 %	40 %	0 %	0 %	16082818
614	NC_003134	CCAA	2	8	35822	35829	50 %	0 %	0 %	50 %	16082818
615	NC_003134	AATC	2	8	35832	35839	50 %	25 %	0 %	25 %	16082818
616	NC_003134	GCT	2	6	35884	35889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16082818
617	NC_003134	GCA	2	6	35901	35906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082818
618	NC_003134	TAAT	2	8	35962	35969	50 %	50 %	0 %	0 %	16082818
619	NC_003134	AGT	2	6	36138	36143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16082819
620	NC_003134	CGA	2	6	36144	36149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16082819
621	NC_003134	GC	3	6	36192	36197	0 %	0 %	50 %	50 %	16082819
622	NC_003134	CCG	2	6	36788	36793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	40787864
623	NC_003134	CT	3	6	36839	36844	0 %	50 %	0 %	50 %	40787864
624	NC_003134	TGG	2	6	36874	36879	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	40787864
625	NC_003134	AAAG	2	8	36884	36891	75 %	0 %	25 %	0 %	40787864
626	NC_003134	CCCCT	2	10	36904	36913	0 %	20 %	0 %	80 %	40787864
627	NC_003134	GCCA	2	8	36921	36928	25 %	0 %	25 %	50 %	40787864
628	NC_003134	GTT	2	6	37035	37040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16082820
629	NC_003134	TCCCC	2	10	37052	37061	0 %	20 %	0 %	80 %	16082820
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752	NC_003134	ACTTA	2	10	47215	47224	40 %	40 %	0 %	20 %	16082831
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758	NC_003134	AGA	2	6	47404	47409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082831
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763	NC_003134	GAA	2	6	47501	47506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16082831
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