MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017168	CAC	2	6	149778	149783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137143
3002	NC_017168	GAT	2	6	149797	149802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137143
3003	NC_017168	TGAT	2	8	149816	149823	25 %	50 %	25 %	0 %	384137143
3004	NC_017168	CGG	2	6	149830	149835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137143
3005	NC_017168	GCC	2	6	149839	149844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137143
3006	NC_017168	GATT	2	8	149871	149878	25 %	50 %	25 %	0 %	384137143
3007	NC_017168	TGA	2	6	149901	149906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137143
3008	NC_017168	CAG	2	6	150004	150009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137143
3009	NC_017168	TGA	2	6	150027	150032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137143
3010	NC_017168	TTAC	2	8	150084	150091	25 %	50 %	0 %	25 %	384137143
3011	NC_017168	TGC	2	6	150098	150103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137143
3012	NC_017168	TTGGT	2	10	150125	150134	0 %	60 %	40 %	0 %	384137143
3013	NC_017168	GCT	2	6	150175	150180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137143
3014	NC_017168	GTC	2	6	150202	150207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137143
3015	NC_017168	ATC	2	6	150218	150223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137143
3016	NC_017168	AAT	2	6	150248	150253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137143
3017	NC_017168	CGT	2	6	150266	150271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017168	TTG	2	6	150317	150322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_017168	GA	3	6	150340	150345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017168	ACTC	2	8	150394	150401	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3021	NC_017168	TATTT	2	10	150402	150411	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_017168	T	7	7	150409	150415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_017168	AATAAA	2	12	150435	150446	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_017168	T	6	6	150451	150456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_017168	TTG	2	6	150506	150511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_017168	TG	3	6	150510	150515	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_017168	AATA	2	8	150813	150820	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_017168	ATA	2	6	150823	150828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_017168	TAC	2	6	151010	151015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137144
3030	NC_017168	ATT	2	6	151322	151327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137144
3031	NC_017168	GTC	2	6	151328	151333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137144
3032	NC_017168	GT	3	6	151335	151340	0 %	50 %	50 %	0 %	384137144
3033	NC_017168	TAT	2	6	151438	151443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137144
3034	NC_017168	A	6	6	151475	151480	100 %	0 %	0 %	0 %	384137144
3035	NC_017168	ATTAA	2	10	151493	151502	60 %	40 %	0 %	0 %	384137144
3036	NC_017168	A	7	7	151520	151526	100 %	0 %	0 %	0 %	384137144
3037	NC_017168	A	6	6	151578	151583	100 %	0 %	0 %	0 %	384137144
3038	NC_017168	A	7	7	151599	151605	100 %	0 %	0 %	0 %	384137144
3039	NC_017168	TTA	2	6	151649	151654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017168	TGA	2	6	151751	151756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_017168	AATA	2	8	151760	151767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017168	GCA	2	6	151779	151784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017168	GC	3	6	151985	151990	0 %	0 %	50 %	50 %	384137145
3044	NC_017168	TGA	2	6	152156	152161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137145
3045	NC_017168	GGC	2	6	152163	152168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3046	NC_017168	CGA	2	6	152196	152201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017168	TTC	2	6	152278	152283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137146
3048	NC_017168	CAT	2	6	152349	152354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137146
3049	NC_017168	GGC	2	6	152388	152393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137146
3050	NC_017168	GAT	2	6	152442	152447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137146
3051	NC_017168	GTCA	2	8	152517	152524	25 %	25 %	25 %	25 %	384137146
3052	NC_017168	CTT	2	6	152623	152628	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137147
3053	NC_017168	CGCA	2	8	152693	152700	25 %	0 %	25 %	50 %	384137147
3054	NC_017168	TGCAT	2	10	152733	152742	20 %	40 %	20 %	20 %	384137147
3055	NC_017168	CAGTGT	2	12	152921	152932	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384137147
3056	NC_017168	GATA	2	8	152935	152942	50 %	25 %	25 %	0 %	384137147
3057	NC_017168	TGA	2	6	152969	152974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137147
3058	NC_017168	CTT	2	6	152977	152982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137147
3059	NC_017168	CAG	2	6	153035	153040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137147
3060	NC_017168	GCC	2	6	153107	153112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137147
3061	NC_017168	TCT	2	6	153129	153134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137147
3062	NC_017168	ACC	2	6	153152	153157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137147
3063	NC_017168	T	6	6	153166	153171	0 %	100 %	0 %	0 %	384137147
3064	NC_017168	ACC	2	6	153203	153208	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137147
3065	NC_017168	GAT	2	6	153214	153219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137147
3066	NC_017168	AT	3	6	153258	153263	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017168	AT	3	6	153277	153282	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017168	AAGA	2	8	153293	153300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_017168	A	8	8	153304	153311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017168	AT	3	6	153313	153318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_017168	A	6	6	153449	153454	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_017168	G	6	6	153503	153508	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_017168	TCAG	2	8	153522	153529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3074	NC_017168	CTA	2	6	153564	153569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017168	AT	3	6	153610	153615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3076	NC_017168	AGC	2	6	153650	153655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017168	TTG	2	6	153732	153737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137148
3078	NC_017168	AGA	2	6	153919	153924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137148
3079	NC_017168	CCG	2	6	154165	154170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137148
3080	NC_017168	TGA	3	9	154316	154324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137148
3081	NC_017168	CAA	2	6	154325	154330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137148
3082	NC_017168	T	6	6	154434	154439	0 %	100 %	0 %	0 %	384137148
3083	NC_017168	TAA	2	6	154472	154477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137148
3084	NC_017168	A	6	6	154497	154502	100 %	0 %	0 %	0 %	384137148
3085	NC_017168	ATA	2	6	154577	154582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017168	GCTT	2	8	154646	154653	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3087	NC_017168	TGT	3	9	154705	154713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3088	NC_017168	GGT	2	6	154747	154752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_017168	TA	4	8	154763	154770	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3090	NC_017168	TC	3	6	154824	154829	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3091	NC_017168	TGC	2	6	154833	154838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017168	CTTAA	2	10	155055	155064	40 %	40 %	0 %	20 %	384137149
3093	NC_017168	T	6	6	155070	155075	0 %	100 %	0 %	0 %	384137149
3094	NC_017168	CTT	2	6	155083	155088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137149
3095	NC_017168	TA	3	6	155089	155094	50 %	50 %	0 %	0 %	384137149
3096	NC_017168	AAT	2	6	155119	155124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137149
3097	NC_017168	T	7	7	155137	155143	0 %	100 %	0 %	0 %	384137149
3098	NC_017168	TTATT	2	10	155179	155188	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
3099	NC_017168	CTG	2	6	155212	155217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137149
3100	NC_017168	TTTA	2	8	155237	155244	25 %	75 %	0 %	0 %	384137149
3101	NC_017168	TTA	2	6	155313	155318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137149
3102	NC_017168	ATG	2	6	155319	155324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137149
3103	NC_017168	T	7	7	155326	155332	0 %	100 %	0 %	0 %	384137149
3104	NC_017168	T	8	8	155337	155344	0 %	100 %	0 %	0 %	384137149
3105	NC_017168	TTGAA	2	10	155357	155366	40 %	40 %	20 %	0 %	384137149
3106	NC_017168	ATA	2	6	155380	155385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137149
3107	NC_017168	ATTTT	2	10	155403	155412	20 %	80 %	0 %	0 %	384137149
3108	NC_017168	ACGA	2	8	155511	155518	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3109	NC_017168	ATA	2	6	155546	155551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3110	NC_017168	ATTAA	2	10	155596	155605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017168	CAT	2	6	155635	155640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017168	CT	3	6	155703	155708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_017168	T	6	6	155725	155730	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_017168	ATAA	2	8	155759	155766	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_017168	TCT	2	6	155779	155784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_017168	CTA	2	6	155789	155794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3117	NC_017168	GAT	2	6	155796	155801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017168	GAATG	2	10	155880	155889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_017168	AAT	2	6	155940	155945	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_017168	ATT	2	6	155972	155977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_017168	TGA	2	6	156022	156027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017168	CAG	2	6	156152	156157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3123	NC_017168	ATC	2	6	156185	156190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017168	TC	3	6	156189	156194	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3125	NC_017168	AGC	2	6	156211	156216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137150
3126	NC_017168	TTG	2	6	156276	156281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137150
3127	NC_017168	TGC	2	6	156304	156309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137150
3128	NC_017168	CAT	2	6	156408	156413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137150
3129	NC_017168	CAT	2	6	156800	156805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137150
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3240	NC_017168	T	6	6	161922	161927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3243	NC_017168	CA	3	6	162050	162055	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3244	NC_017168	ATG	2	6	162056	162061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3251	NC_017168	CAA	2	6	162425	162430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137154
3252	NC_017168	GGT	2	6	162503	162508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137154
3253	NC_017168	ACT	2	6	162560	162565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137154
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3270	NC_017168	ACTG	2	8	163560	163567	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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3350	NC_017168	TATT	2	8	167027	167034	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3374	NC_017168	CG	3	6	168747	168752	0 %	0 %	50 %	50 %	384137158
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