MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_017168	ATGT	2	8	124070	124077	25 %	50 %	25 %	0 %	384137113
2502	NC_017168	GGC	2	6	124078	124083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137113
2503	NC_017168	TCG	2	6	124092	124097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137113
2504	NC_017168	TTG	2	6	124107	124112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137113
2505	NC_017168	TC	3	6	124138	124143	0 %	50 %	0 %	50 %	384137113
2506	NC_017168	GCT	2	6	124195	124200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137113
2507	NC_017168	GCATT	2	10	124206	124215	20 %	40 %	20 %	20 %	384137113
2508	NC_017168	TTGGG	2	10	124221	124230	0 %	40 %	60 %	0 %	384137113
2509	NC_017168	TG	3	6	124234	124239	0 %	50 %	50 %	0 %	384137113
2510	NC_017168	TGG	2	6	124266	124271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137113
2511	NC_017168	TGAAT	2	10	124330	124339	40 %	40 %	20 %	0 %	384137113
2512	NC_017168	GGC	2	6	124456	124461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137113
2513	NC_017168	AGC	2	6	124521	124526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137113
2514	NC_017168	AAG	2	6	124650	124655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137113
2515	NC_017168	TGAT	2	8	124755	124762	25 %	50 %	25 %	0 %	384137113
2516	NC_017168	GAG	2	6	124788	124793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137113
2517	NC_017168	GAT	2	6	124820	124825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137113
2518	NC_017168	CAGTGG	2	12	124849	124860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384137113
2519	NC_017168	AGA	2	6	124881	124886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137113
2520	NC_017168	TGC	2	6	124966	124971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137113
2521	NC_017168	TTTG	2	8	124989	124996	0 %	75 %	25 %	0 %	384137113
2522	NC_017168	GC	3	6	125022	125027	0 %	0 %	50 %	50 %	384137113
2523	NC_017168	TTCAC	2	10	125070	125079	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
2524	NC_017168	TGT	2	6	125181	125186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137114
2525	NC_017168	GCT	2	6	125203	125208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137114
2526	NC_017168	TGA	3	9	125223	125231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2527	NC_017168	TGC	3	9	125244	125252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137114
2528	NC_017168	A	6	6	125325	125330	100 %	0 %	0 %	0 %	384137114
2529	NC_017168	ATTG	2	8	125341	125348	25 %	50 %	25 %	0 %	384137114
2530	NC_017168	AG	3	6	125360	125365	50 %	0 %	50 %	0 %	384137114
2531	NC_017168	AAG	2	6	125390	125395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137114
2532	NC_017168	TGA	2	6	125439	125444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2533	NC_017168	GAT	2	6	125552	125557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2534	NC_017168	TCA	2	6	125574	125579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137114
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2536	NC_017168	TGA	2	6	125893	125898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2537	NC_017168	TTGG	2	8	125929	125936	0 %	50 %	50 %	0 %	384137114
2538	NC_017168	CAC	2	6	126004	126009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137114
2539	NC_017168	TATTT	2	10	126067	126076	20 %	80 %	0 %	0 %	384137114
2540	NC_017168	TTC	2	6	126089	126094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137114
2541	NC_017168	CTT	2	6	126097	126102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137114
2542	NC_017168	GGC	2	6	126160	126165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137114
2543	NC_017168	TTCTA	2	10	126171	126180	20 %	60 %	0 %	20 %	384137114
2544	NC_017168	TGT	2	6	126186	126191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137114
2545	NC_017168	ATTG	2	8	126256	126263	25 %	50 %	25 %	0 %	384137114
2546	NC_017168	CTAT	2	8	126264	126271	25 %	50 %	0 %	25 %	384137114
2547	NC_017168	TTA	2	6	126323	126328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137114
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2551	NC_017168	GGT	2	6	126415	126420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137114
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2553	NC_017168	GAT	2	6	126551	126556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2554	NC_017168	A	9	9	126560	126568	100 %	0 %	0 %	0 %	384137114
2555	NC_017168	GAT	2	6	126569	126574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137114
2556	NC_017168	A	7	7	126580	126586	100 %	0 %	0 %	0 %	384137114
2557	NC_017168	CTAGA	2	10	126636	126645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2558	NC_017168	GGA	2	6	126709	126714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_017168	CAA	2	6	126736	126741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137115
2560	NC_017168	CAC	2	6	126752	126757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137115
2561	NC_017168	ATTG	2	8	126786	126793	25 %	50 %	25 %	0 %	384137115
2562	NC_017168	GCG	2	6	126903	126908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137115
2563	NC_017168	CATA	2	8	126978	126985	50 %	25 %	0 %	25 %	384137115
2564	NC_017168	T	6	6	127173	127178	0 %	100 %	0 %	0 %	384137115
2565	NC_017168	CCA	2	6	127182	127187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137115
2566	NC_017168	ATG	2	6	127232	127237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137115
2567	NC_017168	TAA	2	6	127255	127260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_017168	TCA	2	6	127293	127298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_017168	TCAA	2	8	127318	127325	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2570	NC_017168	AG	4	8	127326	127333	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_017168	AC	3	6	127463	127468	50 %	0 %	0 %	50 %	384137116
2572	NC_017168	GC	3	6	127486	127491	0 %	0 %	50 %	50 %	384137116
2573	NC_017168	TCCT	2	8	127511	127518	0 %	50 %	0 %	50 %	384137116
2574	NC_017168	CCA	2	6	127548	127553	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137116
2575	NC_017168	GCTCG	2	10	127554	127563	0 %	20 %	40 %	40 %	384137116
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2579	NC_017168	GTG	2	6	127838	127843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137116
2580	NC_017168	GAA	2	6	127889	127894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137116
2581	NC_017168	GGCC	2	8	127928	127935	0 %	0 %	50 %	50 %	384137116
2582	NC_017168	TTGG	2	8	127936	127943	0 %	50 %	50 %	0 %	384137116
2583	NC_017168	GCATC	2	10	128014	128023	20 %	20 %	20 %	40 %	384137116
2584	NC_017168	CTG	2	6	128102	128107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137116
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2587	NC_017168	TGC	3	9	128286	128294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137117
2588	NC_017168	GAT	2	6	128333	128338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137117
2589	NC_017168	A	7	7	128359	128365	100 %	0 %	0 %	0 %	384137117
2590	NC_017168	CAA	2	6	128375	128380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137117
2591	NC_017168	TGA	2	6	128421	128426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137117
2592	NC_017168	GCG	2	6	128433	128438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137117
2593	NC_017168	CAG	2	6	128451	128456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137117
2594	NC_017168	CTG	2	6	128468	128473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137117
2595	NC_017168	A	6	6	128537	128542	100 %	0 %	0 %	0 %	384137117
2596	NC_017168	TAA	2	6	128767	128772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137117
2597	NC_017168	TGA	2	6	128779	128784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137117
2598	NC_017168	AAT	2	6	128795	128800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137117
2599	NC_017168	AGCA	2	8	128834	128841	50 %	0 %	25 %	25 %	384137117
2600	NC_017168	TGC	2	6	128889	128894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137117
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2602	NC_017168	GGT	2	6	128978	128983	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137117
2603	NC_017168	CGC	2	6	129014	129019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137118
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2605	NC_017168	CGT	2	6	129071	129076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137118
2606	NC_017168	TGGCA	2	10	129138	129147	20 %	20 %	40 %	20 %	384137118
2607	NC_017168	TTA	2	6	129179	129184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137118
2608	NC_017168	CAA	2	6	129185	129190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137118
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2610	NC_017168	ATTGTC	2	12	129212	129223	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384137118
2611	NC_017168	GGC	2	6	129287	129292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137118
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2613	NC_017168	CGG	2	6	129501	129506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137118
2614	NC_017168	CAT	2	6	129511	129516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137118
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2619	NC_017168	TGG	2	6	129675	129680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137118
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2623	NC_017168	CTG	2	6	129911	129916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137118
2624	NC_017168	TG	3	6	130020	130025	0 %	50 %	50 %	0 %	384137118
2625	NC_017168	CAG	2	6	130042	130047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137118
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2638	NC_017168	A	6	6	130925	130930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2639	NC_017168	ATG	2	6	130985	130990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2641	NC_017168	GAA	2	6	131008	131013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2689	NC_017168	TA	3	6	133917	133922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2729	NC_017168	TAA	3	9	135949	135957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2730	NC_017168	ACTCT	2	10	135987	135996	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2737	NC_017168	CAC	2	6	136613	136618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137126
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2741	NC_017168	AGC	2	6	136685	136690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137126
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2743	NC_017168	GAT	2	6	136715	136720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137126
2744	NC_017168	TAAT	2	8	136776	136783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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