MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017168	GTT	2	6	70701	70706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_017168	AGC	2	6	70755	70760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_017168	A	6	6	70843	70848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_017168	CGC	2	6	70921	70926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1505	NC_017168	TGC	2	6	71129	71134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137063
1506	NC_017168	TGC	2	6	71183	71188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137063
1507	NC_017168	ATAA	2	8	71198	71205	75 %	25 %	0 %	0 %	384137063
1508	NC_017168	GAA	2	6	71206	71211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137063
1509	NC_017168	AAT	2	6	71239	71244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137063
1510	NC_017168	GTG	2	6	71306	71311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137063
1511	NC_017168	AG	3	6	71375	71380	50 %	0 %	50 %	0 %	384137063
1512	NC_017168	ATA	2	6	71393	71398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137063
1513	NC_017168	ATC	2	6	71584	71589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137063
1514	NC_017168	CTG	2	6	71591	71596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137063
1515	NC_017168	AACCA	2	10	71683	71692	60 %	0 %	0 %	40 %	384137063
1516	NC_017168	ATA	2	6	71696	71701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137063
1517	NC_017168	AATG	2	8	71725	71732	50 %	25 %	25 %	0 %	384137063
1518	NC_017168	TGC	2	6	71744	71749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137063
1519	NC_017168	CAA	2	6	71819	71824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_017168	AG	3	6	71840	71845	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_017168	GGC	2	6	71956	71961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137064
1522	NC_017168	ATC	2	6	71968	71973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137064
1523	NC_017168	TATC	2	8	71994	72001	25 %	50 %	0 %	25 %	384137064
1524	NC_017168	GCTTT	2	10	72176	72185	0 %	60 %	20 %	20 %	384137064
1525	NC_017168	TCA	2	6	72188	72193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137064
1526	NC_017168	GCG	2	6	72437	72442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137064
1527	NC_017168	GCC	2	6	72458	72463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137064
1528	NC_017168	GGTTT	2	10	72467	72476	0 %	60 %	40 %	0 %	384137064
1529	NC_017168	ACTG	2	8	72478	72485	25 %	25 %	25 %	25 %	384137064
1530	NC_017168	CTT	2	6	72498	72503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137064
1531	NC_017168	TG	3	6	72522	72527	0 %	50 %	50 %	0 %	384137064
1532	NC_017168	AAT	2	6	72620	72625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137065
1533	NC_017168	AACA	2	8	72716	72723	75 %	0 %	0 %	25 %	384137065
1534	NC_017168	GGC	2	6	72742	72747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137065
1535	NC_017168	ACTG	2	8	72833	72840	25 %	25 %	25 %	25 %	384137065
1536	NC_017168	CTG	2	6	72852	72857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137065
1537	NC_017168	ACC	2	6	72944	72949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137065
1538	NC_017168	ATT	2	6	73016	73021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137065
1539	NC_017168	GGC	2	6	73051	73056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137065
1540	NC_017168	ACC	2	6	73057	73062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137065
1541	NC_017168	CGA	2	6	73134	73139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137065
1542	NC_017168	ATT	2	6	73187	73192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137065
1543	NC_017168	ATT	2	6	73319	73324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137065
1544	NC_017168	CAG	3	9	73371	73379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137065
1545	NC_017168	TGAT	2	8	73443	73450	25 %	50 %	25 %	0 %	384137065
1546	NC_017168	TCC	2	6	73456	73461	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137065
1547	NC_017168	GAG	2	6	73463	73468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137065
1548	NC_017168	GTC	2	6	73530	73535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137065
1549	NC_017168	ATCA	2	8	73715	73722	50 %	25 %	0 %	25 %	384137065
1550	NC_017168	CGGAT	2	10	73789	73798	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1551	NC_017168	GGC	2	6	73814	73819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1552	NC_017168	CTG	2	6	73850	73855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1553	NC_017168	ATGT	2	8	73865	73872	25 %	50 %	25 %	0 %	384137066
1554	NC_017168	TC	3	6	73891	73896	0 %	50 %	0 %	50 %	384137066
1555	NC_017168	GGCA	2	8	73898	73905	25 %	0 %	50 %	25 %	384137066
1556	NC_017168	TGT	2	6	73935	73940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137066
1557	NC_017168	CAG	2	6	73976	73981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1558	NC_017168	AAT	2	6	73988	73993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137066
1559	NC_017168	CCG	2	6	74044	74049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137066
1560	NC_017168	CTG	2	6	74213	74218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1561	NC_017168	GTC	2	6	74219	74224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1562	NC_017168	TAT	2	6	74269	74274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137066
1563	NC_017168	CA	3	6	74347	74352	50 %	0 %	0 %	50 %	384137066
1564	NC_017168	CAG	2	6	74413	74418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1565	NC_017168	TTG	2	6	74534	74539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137066
1566	NC_017168	GCC	2	6	74567	74572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137066
1567	NC_017168	CGG	2	6	74725	74730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137066
1568	NC_017168	CTG	2	6	74789	74794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137066
1569	NC_017168	TGT	3	9	74919	74927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137066
1570	NC_017168	GCG	2	6	75005	75010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137067
1571	NC_017168	GCG	2	6	75042	75047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137067
1572	NC_017168	CAAAT	2	10	75056	75065	60 %	20 %	0 %	20 %	384137067
1573	NC_017168	GAG	2	6	75138	75143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137067
1574	NC_017168	AGA	2	6	75316	75321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137067
1575	NC_017168	GC	3	6	75350	75355	0 %	0 %	50 %	50 %	384137067
1576	NC_017168	ATT	2	6	75554	75559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137067
1577	NC_017168	GTA	2	6	75583	75588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137067
1578	NC_017168	TAAT	2	8	75625	75632	50 %	50 %	0 %	0 %	384137067
1579	NC_017168	TAT	2	6	75637	75642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137067
1580	NC_017168	GAT	2	6	75722	75727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137067
1581	NC_017168	GCA	2	6	75816	75821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137067
1582	NC_017168	A	7	7	75859	75865	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_017168	CTG	2	6	75895	75900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_017168	CGC	2	6	75909	75914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1585	NC_017168	TGCT	2	8	76024	76031	0 %	50 %	25 %	25 %	384137068
1586	NC_017168	CGA	2	6	76205	76210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137068
1587	NC_017168	GTT	2	6	76227	76232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137068
1588	NC_017168	CCAT	2	8	76238	76245	25 %	25 %	0 %	50 %	384137068
1589	NC_017168	TGC	2	6	76307	76312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137068
1590	NC_017168	AAT	2	6	76420	76425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137068
1591	NC_017168	CTGC	2	8	76499	76506	0 %	25 %	25 %	50 %	384137069
1592	NC_017168	GCC	2	6	76601	76606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137069
1593	NC_017168	TAA	2	6	76629	76634	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137069
1594	NC_017168	GGT	2	6	76683	76688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137069
1595	NC_017168	ATC	2	6	76690	76695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137069
1596	NC_017168	TAC	2	6	76788	76793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137069
1597	NC_017168	ATG	2	6	76986	76991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137069
1598	NC_017168	TAT	2	6	77006	77011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_017168	ACACC	2	10	77097	77106	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1600	NC_017168	CACG	2	8	77205	77212	25 %	0 %	25 %	50 %	384137070
1601	NC_017168	AAT	2	6	77254	77259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137070
1602	NC_017168	CCAAC	2	10	77262	77271	40 %	0 %	0 %	60 %	384137070
1603	NC_017168	GGGC	2	8	77342	77349	0 %	0 %	75 %	25 %	384137070
1604	NC_017168	CTT	2	6	77460	77465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137070
1605	NC_017168	AAG	2	6	77477	77482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137070
1606	NC_017168	GCT	2	6	77503	77508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137070
1607	NC_017168	C	6	6	77579	77584	0 %	0 %	0 %	100 %	384137070
1608	NC_017168	GAT	2	6	77605	77610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137070
1609	NC_017168	TGG	2	6	77624	77629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137070
1610	NC_017168	CAC	2	6	77740	77745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137070
1611	NC_017168	TCT	2	6	77759	77764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137070
1612	NC_017168	CGG	2	6	77809	77814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137070
1613	NC_017168	CGG	2	6	77912	77917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137070
1614	NC_017168	GCGCT	2	10	77989	77998	0 %	20 %	40 %	40 %	384137070
1615	NC_017168	ATAGC	2	10	78003	78012	40 %	20 %	20 %	20 %	384137070
1616	NC_017168	TCTT	2	8	78023	78030	0 %	75 %	0 %	25 %	384137070
1617	NC_017168	GCA	2	6	78169	78174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137071
1618	NC_017168	CAG	2	6	78185	78190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137071
1619	NC_017168	TCA	2	6	78228	78233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137071
1620	NC_017168	AG	3	6	78236	78241	50 %	0 %	50 %	0 %	384137071
1621	NC_017168	TGAG	2	8	78277	78284	25 %	25 %	50 %	0 %	384137071
1622	NC_017168	AGGG	2	8	78287	78294	25 %	0 %	75 %	0 %	384137071
1623	NC_017168	GGC	2	6	78422	78427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137071
1624	NC_017168	T	6	6	78436	78441	0 %	100 %	0 %	0 %	384137071
1625	NC_017168	T	7	7	78454	78460	0 %	100 %	0 %	0 %	384137071
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