MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

< Previous12...168169170171172173174175176177178179180Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
89501	NC_017168	TCCAG	2	10	4551370	4551379	20 %	20 %	20 %	40 %	384141137
89502	NC_017168	CCG	2	6	4551491	4551496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141137
89503	NC_017168	GAACC	2	10	4551526	4551535	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
89504	NC_017168	ATA	2	6	4551712	4551717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89505	NC_017168	TA	3	6	4551716	4551721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89506	NC_017168	GGC	2	6	4551747	4551752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89507	NC_017168	CAGC	2	8	4551807	4551814	25 %	0 %	25 %	50 %	384141138
89508	NC_017168	AAAT	2	8	4551854	4551861	75 %	25 %	0 %	0 %	384141138
89509	NC_017168	ATGGG	2	10	4551917	4551926	20 %	20 %	60 %	0 %	384141138
89510	NC_017168	GTTG	2	8	4551945	4551952	0 %	50 %	50 %	0 %	384141138
89511	NC_017168	AGC	2	6	4552002	4552007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384141138
89512	NC_017168	GCG	2	6	4552089	4552094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384141138
89513	NC_017168	CTT	2	6	4552128	4552133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141138
89514	NC_017168	TGA	2	6	4552181	4552186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141138
89515	NC_017168	CT	4	8	4552238	4552245	0 %	50 %	0 %	50 %	384141138
89516	NC_017168	TGA	2	6	4552274	4552279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141138
89517	NC_017168	GAT	2	6	4552353	4552358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141138
89518	NC_017168	GTT	2	6	4552423	4552428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384141138
89519	NC_017168	T	6	6	4552561	4552566	0 %	100 %	0 %	0 %	384141138
89520	NC_017168	CATTA	2	10	4552752	4552761	40 %	40 %	0 %	20 %	384141138
89521	NC_017168	TG	3	6	4552762	4552767	0 %	50 %	50 %	0 %	384141138
89522	NC_017168	ATC	2	6	4552774	4552779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141138
89523	NC_017168	TAA	2	6	4552809	4552814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384141138
89524	NC_017168	GTCA	2	8	4552821	4552828	25 %	25 %	25 %	25 %	384141138
89525	NC_017168	ATG	2	6	4552861	4552866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141138
89526	NC_017168	GAT	2	6	4552887	4552892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384141138
89527	NC_017168	CTA	2	6	4552914	4552919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384141138
89528	NC_017168	GTCG	2	8	4552980	4552987	0 %	25 %	50 %	25 %	384141138
89529	NC_017168	AT	3	6	4553031	4553036	50 %	50 %	0 %	0 %	384141138
89530	NC_017168	CCG	2	6	4553099	4553104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384141138
89531	NC_017168	GTG	2	6	4553113	4553118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384141138
89532	NC_017168	TTC	2	6	4553168	4553173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384141138
89533	NC_017168	GAA	2	6	4553176	4553181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384141138
89534	NC_017168	GCC	2	6	4553253	4553258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89535	NC_017168	TTAA	2	8	4553288	4553295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89536	NC_017168	GTA	2	6	4553303	4553308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89537	NC_017168	ATT	2	6	4553411	4553416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89538	NC_017168	TGA	2	6	4553423	4553428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89539	NC_017168	AAC	2	6	4553465	4553470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89540	NC_017168	CTAT	2	8	4553472	4553479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89541	NC_017168	AAC	2	6	4553483	4553488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89542	NC_017168	AGT	2	6	4553493	4553498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89543	NC_017168	GC	3	6	4553576	4553581	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89544	NC_017168	GGT	2	6	4553593	4553598	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89545	NC_017168	ACT	2	6	4553659	4553664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89546	NC_017168	TTG	2	6	4553728	4553733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...168169170171172173174175176177178179180Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.