MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_017168	TGC	2	6	271268	271273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137240
5502	NC_017168	GC	3	6	271322	271327	0 %	0 %	50 %	50 %	384137240
5503	NC_017168	T	7	7	271413	271419	0 %	100 %	0 %	0 %	384137240
5504	NC_017168	TTA	2	6	271432	271437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137240
5505	NC_017168	ATATT	2	10	271444	271453	40 %	60 %	0 %	0 %	384137240
5506	NC_017168	TAAAA	2	10	271476	271485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_017168	ATG	2	6	271524	271529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_017168	AAAAAT	2	12	271561	271572	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_017168	T	6	6	271594	271599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_017168	TTTTTA	2	12	271602	271613	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_017168	TAT	2	6	271631	271636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_017168	TAA	2	6	271662	271667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_017168	AT	6	12	271669	271680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5514	NC_017168	CTTT	2	8	271705	271712	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5515	NC_017168	TGT	2	6	271755	271760	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_017168	ATA	2	6	271812	271817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_017168	TAT	2	6	271822	271827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_017168	AGTC	2	8	271858	271865	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5519	NC_017168	T	6	6	271903	271908	0 %	100 %	0 %	0 %	384137241
5520	NC_017168	T	6	6	271921	271926	0 %	100 %	0 %	0 %	384137241
5521	NC_017168	ACC	2	6	271930	271935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137241
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5523	NC_017168	AAT	2	6	272040	272045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137241
5524	NC_017168	TTG	2	6	272067	272072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137241
5525	NC_017168	AATA	2	8	272133	272140	75 %	25 %	0 %	0 %	384137241
5526	NC_017168	CAT	2	6	272162	272167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137241
5527	NC_017168	TGACA	2	10	272189	272198	40 %	20 %	20 %	20 %	384137241
5528	NC_017168	CTT	2	6	272210	272215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137241
5529	NC_017168	AAT	2	6	272243	272248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137241
5530	NC_017168	TGT	2	6	272253	272258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137241
5531	NC_017168	TAT	2	6	272262	272267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137241
5532	NC_017168	TG	3	6	272330	272335	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_017168	GCT	2	6	272339	272344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_017168	TGC	2	6	272403	272408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5535	NC_017168	ATT	2	6	272424	272429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_017168	ATT	2	6	272454	272459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_017168	AGC	2	6	272468	272473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_017168	ATT	2	6	272485	272490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_017168	A	6	6	272646	272651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_017168	ATT	2	6	272717	272722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_017168	T	6	6	272736	272741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5542	NC_017168	ATGT	2	8	272746	272753	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_017168	TTG	2	6	272813	272818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5544	NC_017168	T	7	7	272833	272839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5545	NC_017168	T	7	7	272850	272856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_017168	TTG	2	6	272865	272870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_017168	TAA	2	6	272876	272881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_017168	AT	3	6	272899	272904	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5549	NC_017168	AT	6	12	272955	272966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_017168	TTC	2	6	272994	272999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5551	NC_017168	A	7	7	273028	273034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_017168	TTAG	2	8	273059	273066	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5553	NC_017168	TGA	2	6	273088	273093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_017168	GGGC	2	8	273094	273101	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_017168	A	7	7	273126	273132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5556	NC_017168	GATT	2	8	273250	273257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_017168	TCA	2	6	273272	273277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_017168	CAC	2	6	273294	273299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5559	NC_017168	GAA	2	6	273323	273328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_017168	TA	3	6	273337	273342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_017168	GTT	2	6	273393	273398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_017168	GTT	2	6	273413	273418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_017168	ATAA	2	8	273428	273435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_017168	TC	3	6	273522	273527	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5565	NC_017168	GCC	2	6	273532	273537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_017168	ATTT	2	8	273551	273558	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_017168	CGG	2	6	273766	273771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_017168	ACT	2	6	273799	273804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_017168	ATGGA	2	10	273819	273828	40 %	20 %	40 %	0 %	384137242
5570	NC_017168	TGC	2	6	273910	273915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
5571	NC_017168	TAG	2	6	273928	273933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137242
5572	NC_017168	GCT	2	6	273962	273967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
5573	NC_017168	TGG	2	6	273989	273994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137242
5574	NC_017168	TCG	2	6	274018	274023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
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5576	NC_017168	GCT	2	6	274065	274070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
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5583	NC_017168	TGA	2	6	274469	274474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137242
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5588	NC_017168	CGT	2	6	274579	274584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
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5591	NC_017168	AATGG	2	10	274679	274688	40 %	20 %	40 %	0 %	384137242
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5598	NC_017168	TGC	2	6	274925	274930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
5599	NC_017168	GGT	2	6	275117	275122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137242
5600	NC_017168	GGT	2	6	275132	275137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137242
5601	NC_017168	CTG	2	6	275139	275144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137242
5602	NC_017168	ATC	2	6	275239	275244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5605	NC_017168	T	6	6	275383	275388	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_017168	AGAT	2	8	275407	275414	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_017168	CGT	2	6	275447	275452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_017168	AACG	2	8	275481	275488	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_017168	AT	3	6	275556	275561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_017168	ATGA	2	8	275594	275601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_017168	TAAA	2	8	275633	275640	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_017168	ACG	2	6	275682	275687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_017168	AT	3	6	275740	275745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_017168	ATCTG	2	10	275783	275792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5615	NC_017168	T	8	8	275838	275845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5619	NC_017168	TAT	2	6	275881	275886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_017168	T	6	6	275935	275940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_017168	CTAT	2	8	275953	275960	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5622	NC_017168	CAA	2	6	275992	275997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_017168	TGA	2	6	276029	276034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5625	NC_017168	TA	3	6	276166	276171	50 %	50 %	0 %	0 %	384137243
5626	NC_017168	AG	3	6	276178	276183	50 %	0 %	50 %	0 %	384137243
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5631	NC_017168	AAC	2	6	276631	276636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137243
5632	NC_017168	AGAT	2	8	276662	276669	50 %	25 %	25 %	0 %	384137243
5633	NC_017168	CCA	2	6	276821	276826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137243
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5735	NC_017168	A	7	7	282391	282397	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
5736	NC_017168	A	7	7	282439	282445	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
5737	NC_017168	A	6	6	282462	282467	100 %	0 %	0 %	0 %	384137245
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5745	NC_017168	GTAA	2	8	282778	282785	50 %	25 %	25 %	0 %	384137246
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5751	NC_017168	ATA	2	6	282988	282993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137246
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