MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis A1122 chromosome

Total Repeats: 89546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_017168	ATG	2	6	221233	221238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137208
4502	NC_017168	TAA	2	6	221291	221296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137208
4503	NC_017168	TGT	2	6	221314	221319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137208
4504	NC_017168	TTG	2	6	221329	221334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137208
4505	NC_017168	ATG	2	6	221377	221382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137208
4506	NC_017168	T	6	6	221395	221400	0 %	100 %	0 %	0 %	384137208
4507	NC_017168	TTGA	2	8	221424	221431	25 %	50 %	25 %	0 %	384137208
4508	NC_017168	AT	3	6	221482	221487	50 %	50 %	0 %	0 %	384137208
4509	NC_017168	GGT	2	6	221492	221497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_017168	TGAT	2	8	221503	221510	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4511	NC_017168	AT	3	6	221583	221588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_017168	GCT	2	6	221601	221606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_017168	TGT	2	6	221664	221669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137209
4514	NC_017168	A	6	6	221671	221676	100 %	0 %	0 %	0 %	384137209
4515	NC_017168	ATT	2	6	221730	221735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137209
4516	NC_017168	TTG	2	6	221767	221772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137209
4517	NC_017168	TCT	2	6	221777	221782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137209
4518	NC_017168	TTAT	2	8	221790	221797	25 %	75 %	0 %	0 %	384137209
4519	NC_017168	ATC	2	6	221846	221851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137209
4520	NC_017168	TAT	2	6	221926	221931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137209
4521	NC_017168	TCT	2	6	221973	221978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137209
4522	NC_017168	GCA	2	6	222000	222005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4523	NC_017168	TGAA	2	8	222065	222072	50 %	25 %	25 %	0 %	384137209
4524	NC_017168	GCTG	2	8	222105	222112	0 %	25 %	50 %	25 %	384137209
4525	NC_017168	CTT	2	6	222153	222158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137209
4526	NC_017168	TAC	2	6	222202	222207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137209
4527	NC_017168	GCA	2	6	222233	222238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4528	NC_017168	AGC	2	6	222251	222256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4529	NC_017168	ATT	2	6	222289	222294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137209
4530	NC_017168	TTG	2	6	222310	222315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137209
4531	NC_017168	GAT	2	6	222354	222359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137209
4532	NC_017168	TGC	2	6	222399	222404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4533	NC_017168	TTGC	2	8	222440	222447	0 %	50 %	25 %	25 %	384137209
4534	NC_017168	TC	3	6	222579	222584	0 %	50 %	0 %	50 %	384137209
4535	NC_017168	GCA	2	6	222636	222641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4536	NC_017168	ATC	2	6	222689	222694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137209
4537	NC_017168	TGAA	2	8	222698	222705	50 %	25 %	25 %	0 %	384137209
4538	NC_017168	GAG	2	6	222728	222733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137209
4539	NC_017168	GAT	2	6	222735	222740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137209
4540	NC_017168	ATT	2	6	222799	222804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137209
4541	NC_017168	GCA	2	6	222853	222858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4542	NC_017168	TGT	2	6	222900	222905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137209
4543	NC_017168	TAT	2	6	223041	223046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137209
4544	NC_017168	GAA	2	6	223056	223061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137209
4545	NC_017168	CAAAG	2	10	223105	223114	60 %	0 %	20 %	20 %	384137209
4546	NC_017168	GAG	2	6	223120	223125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384137209
4547	NC_017168	GAT	2	6	223143	223148	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137209
4548	NC_017168	CAA	2	6	223157	223162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137209
4549	NC_017168	GCA	2	6	223171	223176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4550	NC_017168	CAG	2	6	223216	223221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4551	NC_017168	CTC	2	6	223277	223282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137209
4552	NC_017168	TGC	2	6	223308	223313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137209
4553	NC_017168	GTTA	2	8	223327	223334	25 %	50 %	25 %	0 %	384137209
4554	NC_017168	AAT	2	6	223365	223370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137210
4555	NC_017168	GCA	2	6	223400	223405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137210
4556	NC_017168	TGT	2	6	223475	223480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137210
4557	NC_017168	GCA	2	6	223481	223486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137210
4558	NC_017168	GCG	2	6	223544	223549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137210
4559	NC_017168	CGG	2	6	223580	223585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137210
4560	NC_017168	CTG	2	6	223650	223655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137210
4561	NC_017168	GGC	2	6	223663	223668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137210
4562	NC_017168	ATT	2	6	223688	223693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137210
4563	NC_017168	AAT	2	6	223722	223727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137210
4564	NC_017168	GGC	2	6	223809	223814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137210
4565	NC_017168	CAT	2	6	223828	223833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137210
4566	NC_017168	TGT	2	6	223942	223947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137210
4567	NC_017168	CTT	2	6	223973	223978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_017168	TGC	2	6	224009	224014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_017168	CATTT	2	10	224079	224088	20 %	60 %	0 %	20 %	384137211
4570	NC_017168	TTCAG	2	10	224133	224142	20 %	40 %	20 %	20 %	384137211
4571	NC_017168	CTT	2	6	224150	224155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137211
4572	NC_017168	TCAGC	2	10	224167	224176	20 %	20 %	20 %	40 %	384137211
4573	NC_017168	GTT	2	6	224211	224216	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137211
4574	NC_017168	GAC	2	6	224282	224287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137211
4575	NC_017168	T	6	6	224311	224316	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4576	NC_017168	GTT	2	6	224322	224327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137211
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4578	NC_017168	ACC	2	6	224406	224411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137211
4579	NC_017168	T	6	6	224440	224445	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4580	NC_017168	CTTCAA	2	12	224467	224478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137211
4581	NC_017168	TTG	2	6	224480	224485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137211
4582	NC_017168	AAT	2	6	224525	224530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384137211
4583	NC_017168	TTC	2	6	224603	224608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137211
4584	NC_017168	CCAAA	2	10	224665	224674	60 %	0 %	0 %	40 %	384137211
4585	NC_017168	CTGA	2	8	224693	224700	25 %	25 %	25 %	25 %	384137211
4586	NC_017168	TGG	2	6	224707	224712	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137211
4587	NC_017168	T	6	6	224717	224722	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4588	NC_017168	T	8	8	224737	224744	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4589	NC_017168	CAT	2	6	224758	224763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137211
4590	NC_017168	ATCA	2	8	224780	224787	50 %	25 %	0 %	25 %	384137211
4591	NC_017168	T	6	6	224799	224804	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4592	NC_017168	AGA	2	6	224819	224824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137211
4593	NC_017168	T	6	6	224839	224844	0 %	100 %	0 %	0 %	384137211
4594	NC_017168	GGT	2	6	224879	224884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137211
4595	NC_017168	TTTA	2	8	224945	224952	25 %	75 %	0 %	0 %	384137211
4596	NC_017168	GATA	2	8	224987	224994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4597	NC_017168	AT	3	6	225004	225009	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4598	NC_017168	ATT	2	6	225035	225040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_017168	GCA	2	6	225078	225083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137212
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4601	NC_017168	GC	3	6	225198	225203	0 %	0 %	50 %	50 %	384137212
4602	NC_017168	ACC	2	6	225216	225221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384137212
4603	NC_017168	CGC	2	6	225408	225413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137212
4604	NC_017168	GAA	2	6	225468	225473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137212
4605	NC_017168	GTC	2	6	225552	225557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137212
4606	NC_017168	TTAT	2	8	225572	225579	25 %	75 %	0 %	0 %	384137212
4607	NC_017168	ATC	2	6	225686	225691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137212
4608	NC_017168	GAAT	2	8	225719	225726	50 %	25 %	25 %	0 %	384137212
4609	NC_017168	AT	3	6	225797	225802	50 %	50 %	0 %	0 %	384137212
4610	NC_017168	GTG	2	6	225808	225813	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137212
4611	NC_017168	TTAA	2	8	225816	225823	50 %	50 %	0 %	0 %	384137212
4612	NC_017168	TTA	2	6	225825	225830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137212
4613	NC_017168	CA	3	6	225938	225943	50 %	0 %	0 %	50 %	384137212
4614	NC_017168	AG	3	6	226001	226006	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_017168	CGT	2	6	226022	226027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_017168	TAT	2	6	226040	226045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_017168	TC	3	6	226192	226197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_017168	ATTA	2	8	226259	226266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4619	NC_017168	ATT	2	6	226270	226275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_017168	CTGC	2	8	226290	226297	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4621	NC_017168	GTGG	2	8	226306	226313	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_017168	TAT	2	6	226336	226341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384137213
4623	NC_017168	ACT	2	6	226351	226356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137213
4624	NC_017168	TG	3	6	226368	226373	0 %	50 %	50 %	0 %	384137213
4625	NC_017168	TAC	2	6	226387	226392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137213
4626	NC_017168	GC	3	6	226500	226505	0 %	0 %	50 %	50 %	384137213
4627	NC_017168	CAT	2	6	226507	226512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137213
4628	NC_017168	AAG	2	6	226541	226546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384137213
4629	NC_017168	ACTGTT	2	12	226549	226560	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384137213
4630	NC_017168	ATC	2	6	226574	226579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137213
4631	NC_017168	TG	3	6	226590	226595	0 %	50 %	50 %	0 %	384137213
4632	NC_017168	CG	3	6	226627	226632	0 %	0 %	50 %	50 %	384137213
4633	NC_017168	T	6	6	226661	226666	0 %	100 %	0 %	0 %	384137213
4634	NC_017168	GGT	2	6	226678	226683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137213
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4637	NC_017168	CGG	2	6	226709	226714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137213
4638	NC_017168	CGG	2	6	226719	226724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137213
4639	NC_017168	TGGC	2	8	226801	226808	0 %	25 %	50 %	25 %	384137213
4640	NC_017168	GGT	2	6	226822	226827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137213
4641	NC_017168	CTC	2	6	226876	226881	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137213
4642	NC_017168	TGA	2	6	226956	226961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137213
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4644	NC_017168	CA	3	6	227026	227031	50 %	0 %	0 %	50 %	384137213
4645	NC_017168	TCG	2	6	227097	227102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137213
4646	NC_017168	TTG	2	6	227153	227158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137213
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4653	NC_017168	GTT	2	6	227440	227445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137213
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4655	NC_017168	CTG	2	6	227548	227553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137214
4656	NC_017168	GAT	2	6	227588	227593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137214
4657	NC_017168	CGG	2	6	227783	227788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384137214
4658	NC_017168	TCC	2	6	227798	227803	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137214
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4660	NC_017168	GAT	2	6	227910	227915	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137214
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4673	NC_017168	ATT	2	6	228596	228601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4674	NC_017168	TGA	2	6	228610	228615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4680	NC_017168	TGAAT	2	10	228991	229000	40 %	40 %	20 %	0 %	384137215
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4720	NC_017168	TGAT	2	8	230864	230871	25 %	50 %	25 %	0 %	384137216
4721	NC_017168	G	6	6	231004	231009	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4722	NC_017168	GTTT	2	8	231069	231076	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4723	NC_017168	GA	3	6	231235	231240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4724	NC_017168	CAT	2	6	231249	231254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137217
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4731	NC_017168	TTG	2	6	231479	231484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384137217
4732	NC_017168	CTG	2	6	231554	231559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137217
4733	NC_017168	TCT	2	6	231586	231591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384137217
4734	NC_017168	CAT	2	6	231604	231609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384137217
4735	NC_017168	GTGGCG	2	12	231641	231652	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384137217
4736	NC_017168	G	6	6	231680	231685	0 %	0 %	100 %	0 %	384137217
4737	NC_017168	CGGG	2	8	231735	231742	0 %	0 %	75 %	25 %	384137217
4738	NC_017168	GTG	2	6	231760	231765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137217
4739	NC_017168	TGG	2	6	231792	231797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137217
4740	NC_017168	TCC	2	6	231823	231828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384137217
4741	NC_017168	TGA	2	6	231915	231920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137217
4742	NC_017168	GTTGGC	2	12	231984	231995	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384137217
4743	NC_017168	ATG	2	6	232022	232027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137217
4744	NC_017168	TG	3	6	232048	232053	0 %	50 %	50 %	0 %	384137217
4745	NC_017168	AGC	2	6	232123	232128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137217
4746	NC_017168	CAA	2	6	232168	232173	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384137217
4747	NC_017168	GTG	2	6	232229	232234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137217
4748	NC_017168	GCCA	2	8	232362	232369	25 %	0 %	25 %	50 %	384137217
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4755	NC_017168	TGG	2	6	232594	232599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384137217
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4759	NC_017168	TGA	2	6	232803	232808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384137217
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4835	NC_017168	TGTC	2	8	237335	237342	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4836	NC_017168	CTG	2	6	237374	237379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137220
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4841	NC_017168	CAA	2	6	237984	237989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4845	NC_017168	AGGG	2	8	238146	238153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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4852	NC_017168	GTTT	2	8	238920	238927	0 %	75 %	25 %	0 %	384137222
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4857	NC_017168	AT	3	6	239131	239136	50 %	50 %	0 %	0 %	384137222
4858	NC_017168	ATCA	2	8	239193	239200	50 %	25 %	0 %	25 %	384137222
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4861	NC_017168	ATTGC	2	10	239330	239339	20 %	40 %	20 %	20 %	384137222
4862	NC_017168	CCTT	2	8	239343	239350	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4863	NC_017168	GTT	2	6	239411	239416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4864	NC_017168	A	6	6	239523	239528	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4865	NC_017168	TAAT	2	8	239588	239595	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4866	NC_017168	TCA	2	6	239613	239618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4867	NC_017168	TAATG	2	10	239632	239641	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4868	NC_017168	TGA	2	6	239645	239650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4993	NC_017168	CGC	2	6	246625	246630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384137229
4994	NC_017168	CTG	2	6	246634	246639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384137229
4995	NC_017168	TCGC	2	8	246724	246731	0 %	25 %	25 %	50 %	384137229
4996	NC_017168	CATT	2	8	246778	246785	25 %	50 %	0 %	25 %	384137229
4997	NC_017168	TC	4	8	246789	246796	0 %	50 %	0 %	50 %	384137229
4998	NC_017168	CAGGAG	2	12	246804	246815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384137229
4999	NC_017168	GTTCG	2	10	246822	246831	0 %	40 %	40 %	20 %	384137229
5000	NC_017168	GAC	2	6	246844	246849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384137229

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