MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 1816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017158	GAC	2	6	54670	54675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124437
1002	NC_017158	CTT	2	6	54827	54832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124437
1003	NC_017158	TGG	2	6	54833	54838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124437
1004	NC_017158	CG	3	6	54844	54849	0 %	0 %	50 %	50 %	384124437
1005	NC_017158	TC	3	6	54958	54963	0 %	50 %	0 %	50 %	384124437
1006	NC_017158	AAGGT	2	10	54997	55006	40 %	20 %	40 %	0 %	384124437
1007	NC_017158	GCTG	2	8	55116	55123	0 %	25 %	50 %	25 %	384124437
1008	NC_017158	AGC	2	6	55191	55196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124437
1009	NC_017158	A	6	6	55223	55228	100 %	0 %	0 %	0 %	384124437
1010	NC_017158	TGA	2	6	55246	55251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124437
1011	NC_017158	CAT	2	6	55283	55288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_017158	TGA	2	6	55328	55333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124438
1013	NC_017158	AGCGC	2	10	55396	55405	20 %	0 %	40 %	40 %	384124438
1014	NC_017158	GAA	2	6	55474	55479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124438
1015	NC_017158	TCA	2	6	55491	55496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124438
1016	NC_017158	CGG	2	6	55535	55540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124438
1017	NC_017158	CTCA	2	8	55611	55618	25 %	25 %	0 %	50 %	384124438
1018	NC_017158	CAG	3	9	55739	55747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124438
1019	NC_017158	ACG	2	6	55795	55800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124438
1020	NC_017158	C	6	6	55820	55825	0 %	0 %	0 %	100 %	384124438
1021	NC_017158	TCA	2	6	55832	55837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124438
1022	NC_017158	TGA	2	6	55839	55844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124438
1023	NC_017158	TCAG	2	8	55862	55869	25 %	25 %	25 %	25 %	384124438
1024	NC_017158	GAA	2	6	55870	55875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124438
1025	NC_017158	TTC	2	6	55885	55890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124438
1026	NC_017158	GCA	2	6	55981	55986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124438
1027	NC_017158	TCAAA	2	10	56034	56043	60 %	20 %	0 %	20 %	384124438
1028	NC_017158	CAGA	2	8	56061	56068	50 %	0 %	25 %	25 %	384124438
1029	NC_017158	TGG	2	6	56134	56139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_017158	CGT	2	6	56165	56170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_017158	CA	3	6	56186	56191	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_017158	GGT	2	6	56235	56240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017158	GAA	2	6	56295	56300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_017158	GTC	2	6	56313	56318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_017158	CGAG	2	8	56516	56523	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1036	NC_017158	ATA	2	6	56528	56533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1037	NC_017158	TACT	2	8	56540	56547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_017158	ATC	2	6	56549	56554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_017158	CGG	2	6	56646	56651	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124439
1040	NC_017158	GA	3	6	56653	56658	50 %	0 %	50 %	0 %	384124439
1041	NC_017158	CAT	2	6	56701	56706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124439
1042	NC_017158	GGTT	2	8	56737	56744	0 %	50 %	50 %	0 %	384124439
1043	NC_017158	T	6	6	56971	56976	0 %	100 %	0 %	0 %	384124439
1044	NC_017158	TA	3	6	57019	57024	50 %	50 %	0 %	0 %	384124439
1045	NC_017158	GAAA	2	8	57038	57045	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017158	GAAG	2	8	57064	57071	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_017158	GGGGT	2	10	57079	57088	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_017158	TGA	2	6	57097	57102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_017158	GGA	2	6	57208	57213	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_017158	TGGGTT	2	12	57276	57287	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_017158	CAG	2	6	57289	57294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_017158	GCTGC	2	10	57320	57329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1053	NC_017158	CAC	2	6	57357	57362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1054	NC_017158	A	6	6	57459	57464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_017158	TAG	2	6	57465	57470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_017158	GCC	2	6	57486	57491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_017158	CT	3	6	57565	57570	0 %	50 %	0 %	50 %	384124440
1058	NC_017158	GCGAT	2	10	57628	57637	20 %	20 %	40 %	20 %	384124440
1059	NC_017158	GTG	3	9	57850	57858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124440
1060	NC_017158	CA	3	6	57973	57978	50 %	0 %	0 %	50 %	384124440
1061	NC_017158	TAAG	2	8	57991	57998	50 %	25 %	25 %	0 %	384124440
1062	NC_017158	TTG	2	6	58036	58041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124440
1063	NC_017158	CTT	2	6	58057	58062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124440
1064	NC_017158	TCA	2	6	58082	58087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124440
1065	NC_017158	A	6	6	58103	58108	100 %	0 %	0 %	0 %	384124440
1066	NC_017158	CCG	2	6	58110	58115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_017158	CAG	2	6	58319	58324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124441
1068	NC_017158	GAC	2	6	58384	58389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124441
1069	NC_017158	CGCCAG	2	12	58421	58432	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124441
1070	NC_017158	GAT	2	6	58454	58459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124441
1071	NC_017158	TGG	2	6	58480	58485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124441
1072	NC_017158	GCC	2	6	58521	58526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124441
1073	NC_017158	TCT	2	6	58540	58545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124441
1074	NC_017158	TTG	3	9	58733	58741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124442
1075	NC_017158	GTC	2	6	58942	58947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1076	NC_017158	CAT	2	6	58980	58985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124442
1077	NC_017158	GTC	2	6	59050	59055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1078	NC_017158	GCC	2	6	59072	59077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124442
1079	NC_017158	TCA	2	6	59085	59090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124442
1080	NC_017158	ACACGC	2	12	59281	59292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384124442
1081	NC_017158	GCC	2	6	59338	59343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124442
1082	NC_017158	ATG	2	6	59363	59368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124442
1083	NC_017158	AGC	2	6	59388	59393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1084	NC_017158	CAG	2	6	59400	59405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1085	NC_017158	TGG	2	6	59482	59487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124442
1086	NC_017158	GCA	2	6	59561	59566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1087	NC_017158	CAG	2	6	59577	59582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1088	NC_017158	TTG	2	6	59645	59650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124442
1089	NC_017158	TTC	2	6	59666	59671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124442
1090	NC_017158	CAG	2	6	59739	59744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1091	NC_017158	CTT	2	6	59775	59780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124442
1092	NC_017158	CG	3	6	59821	59826	0 %	0 %	50 %	50 %	384124442
1093	NC_017158	GTG	2	6	59840	59845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124442
1094	NC_017158	ACG	2	6	59888	59893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1095	NC_017158	GTC	2	6	60109	60114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1096	NC_017158	AGC	2	6	60212	60217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1097	NC_017158	CT	3	6	60335	60340	0 %	50 %	0 %	50 %	384124442
1098	NC_017158	CGA	2	6	60501	60506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1099	NC_017158	CGC	2	6	60559	60564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124442
1100	NC_017158	TCC	2	6	60647	60652	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124442
1101	NC_017158	GCA	2	6	60686	60691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1102	NC_017158	CGCAG	2	10	60719	60728	20 %	0 %	40 %	40 %	384124442
1103	NC_017158	TTCA	2	8	60787	60794	25 %	50 %	0 %	25 %	384124442
1104	NC_017158	TGA	2	6	60870	60875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124442
1105	NC_017158	AGA	2	6	60887	60892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124442
1106	NC_017158	CAC	2	6	60929	60934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124442
1107	NC_017158	CCA	2	6	60936	60941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124442
1108	NC_017158	TCA	2	6	61002	61007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124442
1109	NC_017158	GGT	2	6	61106	61111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124442
1110	NC_017158	GT	3	6	61110	61115	0 %	50 %	50 %	0 %	384124442
1111	NC_017158	GTA	2	6	61130	61135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124442
1112	NC_017158	CAGC	2	8	61158	61165	25 %	0 %	25 %	50 %	384124442
1113	NC_017158	TCA	2	6	61167	61172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124442
1114	NC_017158	TCG	2	6	61184	61189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1115	NC_017158	TGG	2	6	61210	61215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124442
1116	NC_017158	GTT	2	6	61262	61267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124442
1117	NC_017158	GGC	2	6	61335	61340	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124442
1118	NC_017158	TGG	2	6	61364	61369	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124442
1119	NC_017158	TGT	2	6	61404	61409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124442
1120	NC_017158	CGT	2	6	61443	61448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1121	NC_017158	TAA	2	6	61460	61465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124442
1122	NC_017158	TCC	2	6	61585	61590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124442
1123	NC_017158	CAG	2	6	61660	61665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124442
1124	NC_017158	GAT	2	6	61666	61671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124442
1125	NC_017158	GCC	2	6	61691	61696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124442
1126	NC_017158	TCA	2	6	61755	61760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124442
1127	NC_017158	TC	3	6	61846	61851	0 %	50 %	0 %	50 %	384124442
1128	NC_017158	GGCG	2	8	61866	61873	0 %	0 %	75 %	25 %	384124442
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1251	NC_017158	TTG	2	6	68261	68266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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