MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pMT1

Total Repeats: 1816

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017158	TCA	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
502	NC_017158	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
503	NC_017158	TCA	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124412
504	NC_017158	TCG	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124412
505	NC_017158	CGA	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124412
506	NC_017158	CTT	2	6	28125	28130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124412
507	NC_017158	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	384124412
508	NC_017158	TCG	2	6	28180	28185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124412
509	NC_017158	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	384124412
510	NC_017158	ACG	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124412
511	NC_017158	TCC	2	6	28351	28356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124412
512	NC_017158	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	384124412
513	NC_017158	CTTCG	2	10	28389	28398	0 %	40 %	20 %	40 %	384124412
514	NC_017158	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017158	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017158	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017158	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017158	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017158	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017158	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017158	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017158	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017158	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017158	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017158	CAG	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124413
526	NC_017158	AGC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124413
527	NC_017158	CCA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124413
528	NC_017158	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124413
529	NC_017158	ACG	3	9	29208	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124413
530	NC_017158	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	384124413
531	NC_017158	CGGAA	2	10	29273	29282	40 %	0 %	40 %	20 %	384124413
532	NC_017158	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	384124413
533	NC_017158	CGA	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124413
534	NC_017158	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124413
535	NC_017158	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124413
536	NC_017158	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	384124413
537	NC_017158	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124413
538	NC_017158	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124414
539	NC_017158	TGG	3	9	29552	29560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124414
540	NC_017158	CAG	3	9	29594	29602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124414
541	NC_017158	ACG	2	6	29622	29627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124414
542	NC_017158	CCA	2	6	29629	29634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124414
543	NC_017158	GTC	2	6	29639	29644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124414
544	NC_017158	ATA	2	6	29657	29662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124414
545	NC_017158	TGA	3	9	29800	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124414
546	NC_017158	TGTC	2	8	29809	29816	0 %	50 %	25 %	25 %	384124414
547	NC_017158	TGA	2	6	29847	29852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017158	CGT	2	6	29931	29936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017158	ATC	2	6	29942	29947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017158	CTT	2	6	29994	29999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017158	CAG	2	6	30001	30006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017158	GTT	3	9	30022	30030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017158	TTC	2	6	30138	30143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124415
554	NC_017158	GTC	2	6	30156	30161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124415
555	NC_017158	CCA	2	6	30163	30168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124415
556	NC_017158	GCGG	2	8	30188	30195	0 %	0 %	75 %	25 %	384124415
557	NC_017158	TCG	2	6	30255	30260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124415
558	NC_017158	CAG	2	6	30383	30388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124415
559	NC_017158	TGG	2	6	30403	30408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124415
560	NC_017158	TTG	2	6	30441	30446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124415
561	NC_017158	GCA	2	6	30511	30516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124415
562	NC_017158	CAGC	2	8	30711	30718	25 %	0 %	25 %	50 %	384124416
563	NC_017158	AGA	2	6	30724	30729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124416
564	NC_017158	TCC	2	6	30782	30787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124416
565	NC_017158	GCAA	2	8	30794	30801	50 %	0 %	25 %	25 %	384124416
566	NC_017158	CAG	2	6	30825	30830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124416
567	NC_017158	CTT	2	6	30867	30872	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
568	NC_017158	CTT	2	6	30906	30911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
569	NC_017158	TGC	2	6	30975	30980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
570	NC_017158	CTG	2	6	31054	31059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
571	NC_017158	CGT	2	6	31071	31076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
572	NC_017158	CTT	3	9	31122	31130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124416
573	NC_017158	GTC	2	6	31138	31143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
574	NC_017158	CCAG	2	8	31172	31179	25 %	0 %	25 %	50 %	384124416
575	NC_017158	GCC	2	6	31184	31189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124416
576	NC_017158	CGA	2	6	31193	31198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124416
577	NC_017158	ATG	2	6	31211	31216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124416
578	NC_017158	CGT	2	6	31218	31223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
579	NC_017158	GGC	2	6	31267	31272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124416
580	NC_017158	CTG	2	6	31288	31293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124416
581	NC_017158	T	6	6	31303	31308	0 %	100 %	0 %	0 %	384124416
582	NC_017158	GTA	2	6	31389	31394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
583	NC_017158	TGA	2	6	31463	31468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124417
584	NC_017158	CTCG	2	8	31547	31554	0 %	25 %	25 %	50 %	384124417
585	NC_017158	GCC	2	6	31651	31656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124417
586	NC_017158	TCG	2	6	31660	31665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124417
587	NC_017158	TTC	2	6	31713	31718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124417
588	NC_017158	CGA	2	6	31769	31774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124417
589	NC_017158	CCA	2	6	31790	31795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124417
590	NC_017158	A	6	6	31926	31931	100 %	0 %	0 %	0 %	384124417
591	NC_017158	TA	3	6	32073	32078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017158	TACT	3	12	32081	32092	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017158	ATA	2	6	32093	32098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017158	TGA	2	6	32187	32192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
595	NC_017158	GAT	3	9	32472	32480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
596	NC_017158	GCT	2	6	32530	32535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124418
597	NC_017158	AATC	2	8	32609	32616	50 %	25 %	0 %	25 %	384124418
598	NC_017158	CG	3	6	32623	32628	0 %	0 %	50 %	50 %	384124418
599	NC_017158	GCC	2	6	32748	32753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124418
600	NC_017158	A	6	6	32773	32778	100 %	0 %	0 %	0 %	384124418
601	NC_017158	ACC	2	6	32783	32788	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124418
602	NC_017158	CTG	2	6	32833	32838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124418
603	NC_017158	ATC	2	6	32859	32864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124418
604	NC_017158	ATG	2	6	33295	33300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124418
605	NC_017158	CAG	2	6	33369	33374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124418
606	NC_017158	GGC	2	6	33378	33383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124418
607	NC_017158	GGTGGC	2	12	33463	33474	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384124418
608	NC_017158	TTA	2	6	33548	33553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124418
609	NC_017158	AATA	2	8	33574	33581	75 %	25 %	0 %	0 %	384124418
610	NC_017158	ACG	2	6	33622	33627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124418
611	NC_017158	AG	3	6	33688	33693	50 %	0 %	50 %	0 %	384124418
612	NC_017158	TCA	2	6	33817	33822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017158	GGC	2	6	33863	33868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017158	AGA	2	6	33941	33946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017158	TGG	2	6	34179	34184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124419
616	NC_017158	CATC	2	8	34224	34231	25 %	25 %	0 %	50 %	384124419
617	NC_017158	GA	3	6	34242	34247	50 %	0 %	50 %	0 %	384124419
618	NC_017158	TTG	2	6	34308	34313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124419
619	NC_017158	CG	3	6	34513	34518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
620	NC_017158	TC	3	6	34560	34565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_017158	GTC	2	6	34628	34633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_017158	CAA	2	6	34637	34642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_017158	TGCCC	2	10	34654	34663	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
624	NC_017158	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017158	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_017158	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017158	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017158	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017158	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_017158	GAA	2	6	35174	35179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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632	NC_017158	A	6	6	35199	35204	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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