MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	ATCTAT	2	12	2467	2478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384124324
2	NC_017157	GATGTC	2	12	5994	6005	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384124326
3	NC_017157	TTTCCA	2	12	8015	8026	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384124328
4	NC_017157	TACATT	2	12	13026	13037	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384124334
5	NC_017157	ATTTTT	2	12	17823	17834	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384124338
6	NC_017157	TTAAAC	2	12	19592	19603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384124340
7	NC_017157	TTATTT	2	12	22593	22604	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017157	CAAGAT	2	12	23947	23958	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384124344
9	NC_017157	AATTAC	2	12	27381	27392	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017157	TGAGCG	2	12	29163	29174	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384124350
11	NC_017157	GAAGAT	2	12	29248	29259	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384124350
12	NC_017157	CAAGAA	2	12	29290	29301	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384124350
13	NC_017157	TAGAAC	2	12	30412	30423	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384124351
14	NC_017157	TTGGTT	2	12	35367	35378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017157	TAACGT	2	12	36868	36879	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384124358
16	NC_017157	GTTACT	2	12	37161	37172	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384124359
17	NC_017157	TTATGT	2	12	37218	37229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384124359
18	NC_017157	TTTTGC	2	12	42528	42539	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384124365
19	NC_017157	GGTTAT	2	12	44621	44632	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017157	AATTGA	2	12	45654	45665	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384124369
21	NC_017157	TGAATG	2	12	47483	47494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124370
22	NC_017157	AGGCAC	2	12	48463	48474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017157	AAGATT	2	12	50218	50229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384124372
24	NC_017157	CCGGTT	2	12	54835	54846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017157	CCAATC	2	12	54859	54870	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017157	TTTCCA	2	12	58376	58387	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384124377
27	NC_017157	TGGAAA	2	12	59526	59537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017157	CAATTG	2	12	60605	60616	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384124379

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.