MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017157	TTTTG	2	10	1532	1541	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017157	CAGCC	2	10	4584	4593	20 %	0 %	20 %	60 %	384124325
3	NC_017157	TTTGG	2	10	6060	6069	0 %	60 %	40 %	0 %	384124326
4	NC_017157	GGACC	2	10	7059	7068	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017157	TGTAG	2	10	7102	7111	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017157	ATTAA	2	10	8295	8304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017157	AACAT	2	10	10417	10426	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017157	GCTTG	2	10	12987	12996	0 %	40 %	40 %	20 %	384124334
9	NC_017157	TTTTA	2	10	18475	18484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017157	TAAAA	2	10	18614	18623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017157	GATGC	2	10	20313	20322	20 %	20 %	40 %	20 %	384124340
12	NC_017157	GCCGC	2	10	20556	20565	0 %	0 %	40 %	60 %	384124340
13	NC_017157	CCATC	2	10	24436	24445	20 %	20 %	0 %	60 %	384124344
14	NC_017157	GCATC	2	10	24709	24718	20 %	20 %	20 %	40 %	384124344
15	NC_017157	TTCAC	2	10	32289	32298	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017157	TTGTT	2	10	32598	32607	0 %	80 %	20 %	0 %	384124354
17	NC_017157	GCAGA	2	10	33498	33507	40 %	0 %	40 %	20 %	384124355
18	NC_017157	TAAAT	2	10	34812	34821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017157	TTTCT	2	10	34983	34992	0 %	80 %	0 %	20 %	384124356
20	NC_017157	CCAAG	2	10	36251	36260	40 %	0 %	20 %	40 %	384124357
21	NC_017157	TTTGG	2	10	37386	37395	0 %	60 %	40 %	0 %	384124359
22	NC_017157	CGTCT	2	10	37442	37451	0 %	40 %	20 %	40 %	384124359
23	NC_017157	CTGAA	2	10	38285	38294	40 %	20 %	20 %	20 %	384124359
24	NC_017157	GTACG	2	10	38603	38612	20 %	20 %	40 %	20 %	384124359
25	NC_017157	CATTC	2	10	39554	39563	20 %	40 %	0 %	40 %	384124361
26	NC_017157	AAAGT	2	10	39763	39772	60 %	20 %	20 %	0 %	384124361
27	NC_017157	ATTGC	2	10	40732	40741	20 %	40 %	20 %	20 %	384124362
28	NC_017157	GAATG	2	10	40973	40982	40 %	20 %	40 %	0 %	384124362
29	NC_017157	CTATA	2	10	47920	47929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017157	TGGAT	2	10	51928	51937	20 %	40 %	40 %	0 %	384124373
31	NC_017157	GCCAT	2	10	52438	52447	20 %	20 %	20 %	40 %	384124373
32	NC_017157	TGGCT	2	10	52701	52710	0 %	40 %	40 %	20 %	384124373
33	NC_017157	CGGGG	2	10	55098	55107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017157	AAAAG	2	10	55341	55350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017157	AGCGC	2	10	56142	56151	20 %	0 %	40 %	40 %	384124375
36	NC_017157	TCGCC	2	10	56650	56659	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_017157	ATTAA	2	10	58656	58665	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017157	AATCG	2	10	61439	61448	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017157	CCTCA	2	10	61521	61530	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017157	CTGTA	2	10	61716	61725	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017157	GCTAA	2	10	65086	65095	40 %	20 %	20 %	20 %	384124382
42	NC_017157	ACCTT	2	10	69225	69234	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.