MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis D182038 plasmid pCD1

Total Repeats: 1402

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017157	TCT	2	6	47679	47684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124370
1002	NC_017157	AAC	2	6	47693	47698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124370
1003	NC_017157	CT	3	6	47744	47749	0 %	50 %	0 %	50 %	384124370
1004	NC_017157	GCA	2	6	47796	47801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124370
1005	NC_017157	CT	3	6	47835	47840	0 %	50 %	0 %	50 %	384124370
1006	NC_017157	TGC	2	6	47841	47846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124370
1007	NC_017157	TTAA	2	8	47904	47911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017157	CTATA	2	10	47920	47929	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1009	NC_017157	A	6	6	47935	47940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017157	T	6	6	47943	47948	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017157	TAT	2	6	47965	47970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017157	TAA	2	6	47973	47978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017157	ATT	2	6	48014	48019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_017157	T	6	6	48034	48039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_017157	AT	3	6	48055	48060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_017157	T	6	6	48079	48084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017157	A	6	6	48085	48090	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017157	AAT	2	6	48150	48155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_017157	AGC	2	6	48204	48209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_017157	GCTG	2	8	48217	48224	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1021	NC_017157	CAG	2	6	48302	48307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_017157	AAC	2	6	48354	48359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_017157	CGGA	2	8	48383	48390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_017157	CGG	2	6	48445	48450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_017157	AGGCAC	2	12	48463	48474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1026	NC_017157	GGTC	2	8	48606	48613	0 %	25 %	50 %	25 %	384124371
1027	NC_017157	GAT	2	6	48628	48633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124371
1028	NC_017157	CAGA	2	8	48691	48698	50 %	0 %	25 %	25 %	384124371
1029	NC_017157	GGC	2	6	48893	48898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124371
1030	NC_017157	TTC	2	6	48924	48929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124371
1031	NC_017157	TCA	2	6	48966	48971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124371
1032	NC_017157	GGGA	2	8	49012	49019	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_017157	CTG	2	6	49051	49056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_017157	T	6	6	49069	49074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_017157	CTA	2	6	49200	49205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_017157	TAC	2	6	49242	49247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_017157	AAT	2	6	49260	49265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_017157	TAA	2	6	49269	49274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_017157	T	6	6	49331	49336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_017157	CTTT	2	8	49341	49348	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1041	NC_017157	GAA	2	6	49360	49365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_017157	ACC	2	6	49398	49403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_017157	AGC	2	6	49412	49417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_017157	CAGG	2	8	49484	49491	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1045	NC_017157	AGAA	2	8	49526	49533	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_017157	T	8	8	49691	49698	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
1047	NC_017157	AAC	2	6	49702	49707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124372
1048	NC_017157	T	6	6	49753	49758	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
1049	NC_017157	TAT	2	6	49851	49856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124372
1050	NC_017157	TC	4	8	49880	49887	0 %	50 %	0 %	50 %	384124372
1051	NC_017157	T	7	7	49897	49903	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
1052	NC_017157	CCA	2	6	49959	49964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124372
1053	NC_017157	T	6	6	50180	50185	0 %	100 %	0 %	0 %	384124372
1054	NC_017157	AAGATT	2	12	50218	50229	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384124372
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1057	NC_017157	AT	3	6	50325	50330	50 %	50 %	0 %	0 %	384124372
1058	NC_017157	ATTT	2	8	50416	50423	25 %	75 %	0 %	0 %	384124372
1059	NC_017157	ATTT	2	8	50441	50448	25 %	75 %	0 %	0 %	384124372
1060	NC_017157	GCA	2	6	50553	50558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_017157	TTG	2	6	50689	50694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_017157	TA	4	8	50721	50728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_017157	T	6	6	50734	50739	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_017157	TAA	2	6	50754	50759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_017157	ATT	2	6	50767	50772	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_017157	AT	3	6	50807	50812	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_017157	GTC	2	6	50881	50886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124373
1068	NC_017157	TC	3	6	50902	50907	0 %	50 %	0 %	50 %	384124373
1069	NC_017157	AGT	2	6	50956	50961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124373
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1072	NC_017157	GCC	2	6	51037	51042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124373
1073	NC_017157	ATC	2	6	51043	51048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124373
1074	NC_017157	CTG	4	12	51192	51203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124373
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1077	NC_017157	GT	3	6	51375	51380	0 %	50 %	50 %	0 %	384124373
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1080	NC_017157	C	6	6	51574	51579	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
1081	NC_017157	CCA	2	6	51602	51607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124373
1082	NC_017157	C	8	8	51632	51639	0 %	0 %	0 %	100 %	384124373
1083	NC_017157	TGC	2	6	51657	51662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124373
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1098	NC_017157	TAT	2	6	52581	52586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124373
1099	NC_017157	TGGCT	2	10	52701	52710	0 %	40 %	40 %	20 %	384124373
1100	NC_017157	GT	3	6	52784	52789	0 %	50 %	50 %	0 %	384124373
1101	NC_017157	AG	3	6	52859	52864	50 %	0 %	50 %	0 %	384124373
1102	NC_017157	TCC	2	6	52923	52928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124373
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1105	NC_017157	TCG	2	6	53177	53182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124374
1106	NC_017157	TTC	2	6	53215	53220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124374
1107	NC_017157	A	7	7	53273	53279	100 %	0 %	0 %	0 %	384124374
1108	NC_017157	GCG	2	6	53288	53293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124374
1109	NC_017157	GC	3	6	53296	53301	0 %	0 %	50 %	50 %	384124374
1110	NC_017157	TCA	2	6	53357	53362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124374
1111	NC_017157	ATA	2	6	53372	53377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124374
1112	NC_017157	CA	3	6	53403	53408	50 %	0 %	0 %	50 %	384124374
1113	NC_017157	GGT	2	6	53479	53484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124374
1114	NC_017157	CA	3	6	53491	53496	50 %	0 %	0 %	50 %	384124374
1115	NC_017157	AT	3	6	53553	53558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1119	NC_017157	CCA	2	6	53804	53809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_017157	GT	3	6	53824	53829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_017157	TAA	2	6	53832	53837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_017157	ATG	2	6	53870	53875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_017157	TCC	2	6	53992	53997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_017157	CCCT	2	8	54032	54039	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1125	NC_017157	CAG	2	6	54053	54058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_017157	TTG	2	6	54120	54125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1129	NC_017157	GGT	2	6	54392	54397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_017157	TGA	2	6	54405	54410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_017157	TAA	2	6	54423	54428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_017157	AGT	2	6	54460	54465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_017157	T	6	6	54467	54472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1134	NC_017157	TGC	2	6	54507	54512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_017157	GTC	2	6	54534	54539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_017157	CGC	2	6	54613	54618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1137	NC_017157	CCGGTT	2	12	54835	54846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1139	NC_017157	TCC	2	6	54871	54876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1142	NC_017157	GC	3	6	55130	55135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1143	NC_017157	T	7	7	55164	55170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1149	NC_017157	AAAAG	2	10	55341	55350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1150	NC_017157	AAG	2	6	55359	55364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1172	NC_017157	CACT	2	8	56784	56791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1173	NC_017157	TC	3	6	56854	56859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1174	NC_017157	TCTG	2	8	56881	56888	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1181	NC_017157	ACC	2	6	57285	57290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1248	NC_017157	CCTCA	2	10	61521	61530	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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1251	NC_017157	T	7	7	61646	61652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1254	NC_017157	A	6	6	61674	61679	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1255	NC_017157	A	7	7	61683	61689	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1258	NC_017157	CTGTA	2	10	61716	61725	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1259	NC_017157	GAG	2	6	61787	61792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1399	NC_017157	GT	3	6	69423	69428	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1400	NC_017157	GTA	2	6	69626	69631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1401	NC_017157	GCA	2	6	69634	69639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1402	NC_017157	CGCC	2	8	69645	69652	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding

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