MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 1778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017155	CGG	2	6	54850	54855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124271
1002	NC_017155	GA	3	6	54857	54862	50 %	0 %	50 %	0 %	384124271
1003	NC_017155	CAT	2	6	54905	54910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124271
1004	NC_017155	GGTT	2	8	54941	54948	0 %	50 %	50 %	0 %	384124271
1005	NC_017155	T	6	6	55175	55180	0 %	100 %	0 %	0 %	384124271
1006	NC_017155	TA	3	6	55223	55228	50 %	50 %	0 %	0 %	384124271
1007	NC_017155	GAAA	2	8	55242	55249	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_017155	GAAG	2	8	55268	55275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_017155	GGGGT	2	10	55283	55292	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_017155	TGA	2	6	55301	55306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_017155	GGA	2	6	55412	55417	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_017155	TGGGTT	2	12	55480	55491	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_017155	CAG	2	6	55493	55498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_017155	GCTGC	2	10	55524	55533	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_017155	CAC	2	6	55561	55566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_017155	A	6	6	55663	55668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_017155	TAG	2	6	55669	55674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_017155	GCC	2	6	55690	55695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_017155	CT	3	6	55769	55774	0 %	50 %	0 %	50 %	384124272
1020	NC_017155	GCGAT	2	10	55832	55841	20 %	20 %	40 %	20 %	384124272
1021	NC_017155	GTG	3	9	56054	56062	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124272
1022	NC_017155	CA	3	6	56177	56182	50 %	0 %	0 %	50 %	384124272
1023	NC_017155	TAAG	2	8	56195	56202	50 %	25 %	25 %	0 %	384124272
1024	NC_017155	TTG	2	6	56240	56245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124272
1025	NC_017155	CTT	2	6	56261	56266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124272
1026	NC_017155	TCA	2	6	56286	56291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124272
1027	NC_017155	A	6	6	56307	56312	100 %	0 %	0 %	0 %	384124272
1028	NC_017155	CCG	2	6	56314	56319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_017155	CAG	2	6	56523	56528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124273
1030	NC_017155	GAC	2	6	56588	56593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124273
1031	NC_017155	CGCCAG	2	12	56625	56636	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124273
1032	NC_017155	GAT	2	6	56658	56663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124273
1033	NC_017155	TGG	2	6	56684	56689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124273
1034	NC_017155	GCC	2	6	56725	56730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124273
1035	NC_017155	TCT	2	6	56744	56749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124273
1036	NC_017155	TTG	3	9	56937	56945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124274
1037	NC_017155	GTC	2	6	57146	57151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1038	NC_017155	CAT	2	6	57184	57189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124274
1039	NC_017155	GTC	2	6	57254	57259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1040	NC_017155	GCC	2	6	57276	57281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124274
1041	NC_017155	TCA	2	6	57289	57294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124274
1042	NC_017155	ACACGC	2	12	57485	57496	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384124274
1043	NC_017155	GCC	2	6	57542	57547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124274
1044	NC_017155	ATG	2	6	57567	57572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124274
1045	NC_017155	AGC	2	6	57592	57597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1046	NC_017155	CAG	2	6	57604	57609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1047	NC_017155	TGG	2	6	57686	57691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124274
1048	NC_017155	GCA	2	6	57765	57770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1049	NC_017155	CAG	2	6	57781	57786	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1050	NC_017155	TTG	2	6	57849	57854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124274
1051	NC_017155	TTC	2	6	57870	57875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124274
1052	NC_017155	CAG	2	6	57943	57948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1053	NC_017155	CTT	2	6	57979	57984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124274
1054	NC_017155	CG	3	6	58025	58030	0 %	0 %	50 %	50 %	384124274
1055	NC_017155	GTG	2	6	58044	58049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124274
1056	NC_017155	ACG	2	6	58092	58097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1057	NC_017155	GTC	2	6	58313	58318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1058	NC_017155	AGC	2	6	58416	58421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1059	NC_017155	CT	3	6	58539	58544	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
1060	NC_017155	CGA	2	6	58705	58710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1061	NC_017155	CGC	2	6	58763	58768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124274
1062	NC_017155	TCC	2	6	58851	58856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124274
1063	NC_017155	GCA	2	6	58890	58895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1064	NC_017155	CGCAG	2	10	58923	58932	20 %	0 %	40 %	40 %	384124274
1065	NC_017155	TTCA	2	8	58991	58998	25 %	50 %	0 %	25 %	384124274
1066	NC_017155	TGA	2	6	59074	59079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124274
1067	NC_017155	AGA	2	6	59091	59096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124274
1068	NC_017155	CAC	2	6	59133	59138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124274
1069	NC_017155	CCA	2	6	59140	59145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124274
1070	NC_017155	TCA	2	6	59206	59211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124274
1071	NC_017155	GGT	2	6	59310	59315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124274
1072	NC_017155	GT	3	6	59314	59319	0 %	50 %	50 %	0 %	384124274
1073	NC_017155	GTA	2	6	59334	59339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124274
1074	NC_017155	CAGC	2	8	59362	59369	25 %	0 %	25 %	50 %	384124274
1075	NC_017155	TCA	2	6	59371	59376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124274
1076	NC_017155	TCG	2	6	59388	59393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1077	NC_017155	TGG	2	6	59414	59419	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124274
1078	NC_017155	GTT	2	6	59466	59471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124274
1079	NC_017155	GGC	2	6	59539	59544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124274
1080	NC_017155	TGG	2	6	59568	59573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124274
1081	NC_017155	TGT	2	6	59608	59613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124274
1082	NC_017155	CGT	2	6	59647	59652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1083	NC_017155	TAA	2	6	59664	59669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124274
1084	NC_017155	TCC	2	6	59789	59794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124274
1085	NC_017155	CAG	2	6	59864	59869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1086	NC_017155	GAT	2	6	59870	59875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124274
1087	NC_017155	GCC	2	6	59895	59900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124274
1088	NC_017155	TCA	2	6	59959	59964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124274
1089	NC_017155	TC	3	6	60050	60055	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
1090	NC_017155	GGCG	2	8	60070	60077	0 %	0 %	75 %	25 %	384124274
1091	NC_017155	TCG	2	6	60096	60101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1092	NC_017155	TCG	2	6	60138	60143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1093	NC_017155	CAG	2	6	60202	60207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124274
1094	NC_017155	TC	3	6	60219	60224	0 %	50 %	0 %	50 %	384124274
1095	NC_017155	TGG	2	6	60391	60396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_017155	AG	3	6	60454	60459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_017155	TCT	2	6	60493	60498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124275
1098	NC_017155	TGGA	2	8	60529	60536	25 %	25 %	50 %	0 %	384124275
1099	NC_017155	CAT	2	6	60584	60589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124275
1100	NC_017155	AGC	3	9	60606	60614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124275
1101	NC_017155	TGGC	2	8	60629	60636	0 %	25 %	50 %	25 %	384124275
1102	NC_017155	TGC	2	6	60645	60650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124275
1103	NC_017155	TCT	2	6	60688	60693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124275
1104	NC_017155	CAGC	2	8	60721	60728	25 %	0 %	25 %	50 %	384124275
1105	NC_017155	CGC	2	6	60794	60799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124275
1106	NC_017155	TCG	2	6	60834	60839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124275
1107	NC_017155	TGA	2	6	60922	60927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124275
1108	NC_017155	CTGG	2	8	60949	60956	0 %	25 %	50 %	25 %	384124275
1109	NC_017155	AC	3	6	60958	60963	50 %	0 %	0 %	50 %	384124275
1110	NC_017155	TCA	2	6	60993	60998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124275
1111	NC_017155	CGCCAG	2	12	61025	61036	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124275
1112	NC_017155	CGAG	2	8	61068	61075	25 %	0 %	50 %	25 %	384124275
1113	NC_017155	CTT	2	6	61096	61101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124275
1114	NC_017155	CAG	2	6	61142	61147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124275
1115	NC_017155	GAAGA	2	10	61165	61174	60 %	0 %	40 %	0 %	384124275
1116	NC_017155	CAT	2	6	61226	61231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124275
1117	NC_017155	TTC	3	9	61272	61280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124275
1118	NC_017155	GT	3	6	61306	61311	0 %	50 %	50 %	0 %	384124275
1119	NC_017155	AGC	2	6	61377	61382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124275
1120	NC_017155	CCA	2	6	61393	61398	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124275
1121	NC_017155	GA	3	6	61516	61521	50 %	0 %	50 %	0 %	384124275
1122	NC_017155	CAC	2	6	61559	61564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124275
1123	NC_017155	CGTCCA	2	12	61567	61578	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384124275
1124	NC_017155	CAC	2	6	61656	61661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124275
1125	NC_017155	TTC	2	6	61688	61693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124275
1126	NC_017155	TCGT	2	8	61738	61745	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_017155	TA	3	6	61757	61762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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