MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Yersinia pestis D106004 plasmid pMT1

Total Repeats: 1778

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017155	TCA	2	6	27835	27840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124246
502	NC_017155	TCA	2	6	27907	27912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124246
503	NC_017155	TCA	2	6	27925	27930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124246
504	NC_017155	TCG	2	6	27994	27999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124246
505	NC_017155	CGA	2	6	28035	28040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124246
506	NC_017155	CTT	2	6	28125	28130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124246
507	NC_017155	CCGA	2	8	28158	28165	25 %	0 %	25 %	50 %	384124246
508	NC_017155	TCG	2	6	28180	28185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124246
509	NC_017155	CGCA	2	8	28227	28234	25 %	0 %	25 %	50 %	384124246
510	NC_017155	ACG	2	6	28332	28337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124246
511	NC_017155	TCC	2	6	28351	28356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124246
512	NC_017155	GT	3	6	28367	28372	0 %	50 %	50 %	0 %	384124246
513	NC_017155	CTTCG	2	10	28389	28398	0 %	40 %	20 %	40 %	384124246
514	NC_017155	AAC	2	6	28499	28504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_017155	TA	3	6	28583	28588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017155	TAA	2	6	28591	28596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_017155	TA	4	8	28610	28617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017155	GGT	2	6	28712	28717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_017155	GGC	2	6	28736	28741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_017155	CCA	2	6	28754	28759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017155	GCA	2	6	28820	28825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017155	AGC	2	6	28831	28836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_017155	TGA	2	6	28886	28891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017155	TTTG	2	8	28898	28905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017155	CAG	2	6	28983	28988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
526	NC_017155	AGC	2	6	29080	29085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
527	NC_017155	CCA	2	6	29105	29110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124247
528	NC_017155	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124247
529	NC_017155	ACG	3	9	29208	29216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
530	NC_017155	ACTC	2	8	29222	29229	25 %	25 %	0 %	50 %	384124247
531	NC_017155	CGGAA	2	10	29273	29282	40 %	0 %	40 %	20 %	384124247
532	NC_017155	CGGA	2	8	29331	29338	25 %	0 %	50 %	25 %	384124247
533	NC_017155	CGA	2	6	29385	29390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
534	NC_017155	GAT	2	6	29400	29405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124247
535	NC_017155	GACGCC	2	12	29451	29462	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384124247
536	NC_017155	AACGG	2	10	29481	29490	40 %	0 %	40 %	20 %	384124247
537	NC_017155	GTT	3	9	29505	29513	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124247
538	NC_017155	GGT	2	6	29544	29549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124247
539	NC_017155	TGG	2	6	29552	29557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124247
540	NC_017155	CAG	3	9	29595	29603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
541	NC_017155	ACG	2	6	29623	29628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124247
542	NC_017155	CCA	2	6	29630	29635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124247
543	NC_017155	GTC	2	6	29640	29645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124247
544	NC_017155	ATA	2	6	29658	29663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384124247
545	NC_017155	TGA	3	9	29801	29809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124247
546	NC_017155	TGTC	2	8	29810	29817	0 %	50 %	25 %	25 %	384124247
547	NC_017155	TGA	2	6	29848	29853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017155	CGT	2	6	29932	29937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_017155	ATC	2	6	29943	29948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_017155	CTT	2	6	29995	30000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_017155	CAG	2	6	30002	30007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_017155	GTT	3	9	30023	30031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017155	TTC	2	6	30139	30144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124248
554	NC_017155	GTC	2	6	30157	30162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124248
555	NC_017155	CCA	2	6	30164	30169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124248
556	NC_017155	GCGG	2	8	30189	30196	0 %	0 %	75 %	25 %	384124248
557	NC_017155	TCG	2	6	30256	30261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124248
558	NC_017155	CAG	2	6	30384	30389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124248
559	NC_017155	TGG	2	6	30404	30409	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124248
560	NC_017155	TTG	2	6	30442	30447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124248
561	NC_017155	GCA	2	6	30512	30517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124248
562	NC_017155	CAGC	2	8	30712	30719	25 %	0 %	25 %	50 %	384124249
563	NC_017155	AGA	2	6	30725	30730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384124249
564	NC_017155	TCC	2	6	30783	30788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384124249
565	NC_017155	GCAA	2	8	30795	30802	50 %	0 %	25 %	25 %	384124249
566	NC_017155	CAG	2	6	30826	30831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124249
567	NC_017155	CTT	2	6	30868	30873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124249
568	NC_017155	CTT	2	6	30907	30912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124249
569	NC_017155	TGC	2	6	30976	30981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
570	NC_017155	CTG	2	6	31055	31060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
571	NC_017155	CGT	2	6	31072	31077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
572	NC_017155	CTT	3	9	31123	31131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124249
573	NC_017155	GTC	2	6	31139	31144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
574	NC_017155	CCAG	2	8	31173	31180	25 %	0 %	25 %	50 %	384124249
575	NC_017155	GCC	2	6	31185	31190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124249
576	NC_017155	CGA	2	6	31194	31199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124249
577	NC_017155	ATG	2	6	31212	31217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124249
578	NC_017155	CGT	2	6	31219	31224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
579	NC_017155	GGC	2	6	31268	31273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124249
580	NC_017155	CTG	2	6	31289	31294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124249
581	NC_017155	T	6	6	31304	31309	0 %	100 %	0 %	0 %	384124249
582	NC_017155	GTA	2	6	31390	31395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124250
583	NC_017155	TGA	2	6	31464	31469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124250
584	NC_017155	CTCG	2	8	31548	31555	0 %	25 %	25 %	50 %	384124250
585	NC_017155	GCC	2	6	31652	31657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124250
586	NC_017155	TCG	2	6	31661	31666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124250
587	NC_017155	TTC	2	6	31714	31719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384124250
588	NC_017155	CGA	2	6	31770	31775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124250
589	NC_017155	CCA	2	6	31791	31796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124250
590	NC_017155	A	6	6	31927	31932	100 %	0 %	0 %	0 %	384124250
591	NC_017155	TA	3	6	32074	32079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_017155	TACT	3	12	32082	32093	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
593	NC_017155	ATA	2	6	32094	32099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_017155	TGA	2	6	32188	32193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124251
595	NC_017155	GAT	3	9	32473	32481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124251
596	NC_017155	GCT	2	6	32531	32536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124251
597	NC_017155	AATC	2	8	32610	32617	50 %	25 %	0 %	25 %	384124251
598	NC_017155	CG	3	6	32624	32629	0 %	0 %	50 %	50 %	384124251
599	NC_017155	GCC	2	6	32749	32754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384124251
600	NC_017155	A	6	6	32774	32779	100 %	0 %	0 %	0 %	384124251
601	NC_017155	ACC	2	6	32784	32789	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384124251
602	NC_017155	CTG	2	6	32834	32839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124251
603	NC_017155	ATC	2	6	32860	32865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384124251
604	NC_017155	ATG	2	6	33296	33301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384124251
605	NC_017155	CAG	2	6	33370	33375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124251
606	NC_017155	GGC	2	6	33379	33384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384124251
607	NC_017155	GGTGGC	2	12	33464	33475	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384124251
608	NC_017155	TTA	2	6	33549	33554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384124251
609	NC_017155	AATA	2	8	33575	33582	75 %	25 %	0 %	0 %	384124251
610	NC_017155	ACG	2	6	33623	33628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384124251
611	NC_017155	AG	3	6	33689	33694	50 %	0 %	50 %	0 %	384124251
612	NC_017155	TCA	2	6	33818	33823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_017155	GGC	2	6	33864	33869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_017155	AGA	2	6	33942	33947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_017155	TGG	2	6	34180	34185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384124252
616	NC_017155	CATC	2	8	34225	34232	25 %	25 %	0 %	50 %	384124252
617	NC_017155	GA	3	6	34243	34248	50 %	0 %	50 %	0 %	384124252
618	NC_017155	TTG	2	6	34309	34314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384124252
619	NC_017155	CG	3	6	34514	34519	0 %	0 %	50 %	50 %	384124253
620	NC_017155	TC	3	6	34561	34566	0 %	50 %	0 %	50 %	384124253
621	NC_017155	GTC	2	6	34629	34634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124253
622	NC_017155	CAA	2	6	34638	34643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384124253
623	NC_017155	TGCCC	2	10	34654	34663	0 %	20 %	20 %	60 %	384124253
624	NC_017155	G	7	7	34887	34893	0 %	0 %	100 %	0 %	384124253
625	NC_017155	GTC	2	6	34951	34956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384124253
626	NC_017155	TAA	2	6	35004	35009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_017155	TTA	2	6	35024	35029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_017155	AT	3	6	35085	35090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_017155	ATTT	2	8	35114	35121	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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