MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 1777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_014022	ATG	2	6	79567	79572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502058
1502	NC_014022	A	8	8	79636	79643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_014022	GGTAA	2	10	79724	79733	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_014022	CTT	2	6	79811	79816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_014022	A	6	6	79859	79864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_014022	T	6	6	79880	79885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_014022	CATA	2	8	79928	79935	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_014022	TA	3	6	79992	79997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_014022	A	6	6	80072	80077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_014022	T	7	7	80094	80100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_014022	GTC	2	6	80148	80153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_014022	CCGTT	2	10	80285	80294	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1513	NC_014022	GGA	2	6	80318	80323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_014022	CGT	2	6	80337	80342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_014022	GCC	2	6	80445	80450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1516	NC_014022	ATG	2	6	80497	80502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_014022	CTA	2	6	80505	80510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_014022	AAG	2	6	80524	80529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_014022	CCG	2	6	80550	80555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1520	NC_014022	TGG	2	6	80560	80565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_014022	ACC	2	6	80567	80572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_014022	AGCG	2	8	80605	80612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_014022	CTT	2	6	80673	80678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502059
1524	NC_014022	GTT	2	6	80751	80756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502059
1525	NC_014022	TGT	2	6	80822	80827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502059
1526	NC_014022	GCCT	2	8	80908	80915	0 %	25 %	25 %	50 %	294502059
1527	NC_014022	TAA	2	6	80917	80922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502059
1528	NC_014022	AG	3	6	80953	80958	50 %	0 %	50 %	0 %	294502059
1529	NC_014022	TGA	2	6	81014	81019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502059
1530	NC_014022	GCA	2	6	81030	81035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502059
1531	NC_014022	GCC	2	6	81044	81049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502059
1532	NC_014022	TGC	2	6	81051	81056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502059
1533	NC_014022	ATA	2	6	81065	81070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502059
1534	NC_014022	GTC	2	6	81142	81147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502059
1535	NC_014022	ACC	2	6	81159	81164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502059
1536	NC_014022	ATC	2	6	81400	81405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502059
1537	NC_014022	CAA	2	6	81408	81413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502059
1538	NC_014022	CAT	2	6	81534	81539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502059
1539	NC_014022	TCT	2	6	81561	81566	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502059
1540	NC_014022	TCA	2	6	81567	81572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502059
1541	NC_014022	ATG	2	6	81589	81594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502059
1542	NC_014022	CGCTTT	2	12	81792	81803	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	294502060
1543	NC_014022	CAT	2	6	81876	81881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502060
1544	NC_014022	TGC	2	6	81902	81907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502060
1545	NC_014022	TGGT	2	8	81950	81957	0 %	50 %	50 %	0 %	294502060
1546	NC_014022	GCT	2	6	81980	81985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502060
1547	NC_014022	CGT	2	6	82022	82027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502060
1548	NC_014022	AAT	2	6	82062	82067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502060
1549	NC_014022	TTC	2	6	82183	82188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502060
1550	NC_014022	T	6	6	82195	82200	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
1551	NC_014022	T	6	6	82256	82261	0 %	100 %	0 %	0 %	294502060
1552	NC_014022	AGT	2	6	82281	82286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_014022	CCTG	2	8	82497	82504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_014022	TTA	2	6	82527	82532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_014022	TCC	2	6	82538	82543	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_014022	ATG	2	6	82673	82678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_014022	ATC	2	6	82732	82737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_014022	AGT	2	6	82795	82800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_014022	AGT	2	6	82861	82866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_014022	CGT	2	6	82895	82900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_014022	TTC	2	6	82950	82955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_014022	T	8	8	82975	82982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_014022	AAC	2	6	83010	83015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_014022	TTG	2	6	83057	83062	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_014022	CAA	2	6	83063	83068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_014022	ACC	2	6	83119	83124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_014022	ATG	2	6	83183	83188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_014022	AAT	2	6	83202	83207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_014022	TGT	2	6	83227	83232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_014022	T	6	6	83236	83241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_014022	GT	3	6	83242	83247	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_014022	AT	3	6	83277	83282	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
1573	NC_014022	ATCT	2	8	83292	83299	25 %	50 %	0 %	25 %	294502061
1574	NC_014022	AAAGA	2	10	83396	83405	80 %	0 %	20 %	0 %	294502061
1575	NC_014022	ATC	2	6	83423	83428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502061
1576	NC_014022	GAA	2	6	83506	83511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502061
1577	NC_014022	TAA	2	6	83526	83531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502061
1578	NC_014022	AT	4	8	83585	83592	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
1579	NC_014022	GTC	2	6	83650	83655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502061
1580	NC_014022	CAGT	2	8	83681	83688	25 %	25 %	25 %	25 %	294502061
1581	NC_014022	CCG	2	6	83831	83836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502061
1582	NC_014022	TAT	2	6	83898	83903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502061
1583	NC_014022	TGA	2	6	83934	83939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502061
1584	NC_014022	ACCCCT	2	12	84127	84138	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	294502061
1585	NC_014022	GAA	3	9	84208	84216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502061
1586	NC_014022	CAT	2	6	84387	84392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502061
1587	NC_014022	AT	3	6	84492	84497	50 %	50 %	0 %	0 %	294502061
1588	NC_014022	CGTT	2	8	84676	84683	0 %	50 %	25 %	25 %	294502062
1589	NC_014022	CG	3	6	84721	84726	0 %	0 %	50 %	50 %	294502062
1590	NC_014022	GCA	2	6	84761	84766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502062
1591	NC_014022	CGT	2	6	84828	84833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502062
1592	NC_014022	CTGC	2	8	84835	84842	0 %	25 %	25 %	50 %	294502062
1593	NC_014022	TAA	2	6	84848	84853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502062
1594	NC_014022	GAT	2	6	84882	84887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502062
1595	NC_014022	AGA	2	6	85001	85006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502062
1596	NC_014022	GAAA	2	8	85016	85023	75 %	0 %	25 %	0 %	294502062
1597	NC_014022	TC	4	8	85025	85032	0 %	50 %	0 %	50 %	294502062
1598	NC_014022	GCA	2	6	85062	85067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502062
1599	NC_014022	GAA	2	6	85149	85154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502062
1600	NC_014022	ACA	2	6	85159	85164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294502062
1601	NC_014022	GA	3	6	85325	85330	50 %	0 %	50 %	0 %	294502062
1602	NC_014022	AGAA	2	8	85356	85363	75 %	0 %	25 %	0 %	294502062
1603	NC_014022	AAG	2	6	85374	85379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502062
1604	NC_014022	TTG	2	6	85384	85389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502062
1605	NC_014022	T	6	6	85510	85515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_014022	CAC	2	6	85526	85531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1607	NC_014022	TTTG	2	8	85548	85555	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_014022	CAC	2	6	85594	85599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1609	NC_014022	AGGC	2	8	85662	85669	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1610	NC_014022	ATC	2	6	85845	85850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_014022	TTCA	2	8	86002	86009	25 %	50 %	0 %	25 %	294502063
1612	NC_014022	CCTC	2	8	86056	86063	0 %	25 %	0 %	75 %	294502063
1613	NC_014022	CA	3	6	86067	86072	50 %	0 %	0 %	50 %	294502063
1614	NC_014022	CGCTT	2	10	86075	86084	0 %	40 %	20 %	40 %	294502063
1615	NC_014022	TTA	2	6	86161	86166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294502063
1616	NC_014022	ATG	2	6	86175	86180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502063
1617	NC_014022	CGTT	2	8	86279	86286	0 %	50 %	25 %	25 %	294502063
1618	NC_014022	GTTATT	2	12	86355	86366	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294502063
1619	NC_014022	GAG	2	6	86391	86396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294502063
1620	NC_014022	ATC	2	6	86457	86462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502063
1621	NC_014022	TGATT	2	10	86489	86498	20 %	60 %	20 %	0 %	294502063
1622	NC_014022	GTC	2	6	86563	86568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502063
1623	NC_014022	TGA	2	6	86615	86620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502063
1624	NC_014022	CTA	2	6	86660	86665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502063
1625	NC_014022	GCA	2	6	86680	86685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502063
1626	NC_014022	CTG	2	6	86776	86781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502063
1627	NC_014022	CAT	2	6	86891	86896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502063
1628	NC_014022	CCT	2	6	86899	86904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502063
1629	NC_014022	TGA	2	6	86914	86919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502063
1630	NC_014022	GCAG	2	8	87089	87096	25 %	0 %	50 %	25 %	294502063
1631	NC_014022	TGA	3	9	87227	87235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502063
1632	NC_014022	GAA	2	6	87246	87251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502063
1633	NC_014022	AATG	2	8	87271	87278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_014022	TA	3	6	87293	87298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1638	NC_014022	TGA	2	6	87493	87498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1760	NC_014022	ACG	2	6	93627	93632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1761	NC_014022	CTG	2	6	93750	93755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1762	NC_014022	CAC	2	6	93779	93784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502068
1763	NC_014022	CTT	2	6	93785	93790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502068
1764	NC_014022	CGG	2	6	93800	93805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502068
1765	NC_014022	GGC	2	6	93908	93913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502068
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1767	NC_014022	CGA	2	6	93946	93951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1768	NC_014022	GCG	2	6	94023	94028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502068
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1770	NC_014022	GCA	2	6	94059	94064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1771	NC_014022	GCA	2	6	94085	94090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1772	NC_014022	GAC	2	6	94149	94154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502068
1773	NC_014022	ACC	2	6	94188	94193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502068
1774	NC_014022	CGC	2	6	94205	94210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502068
1775	NC_014022	GCC	2	6	94224	94229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1776	NC_014022	TG	3	6	94232	94237	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1777	NC_014022	GGC	2	6	94243	94248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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