MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pMT1

Total Repeats: 1777

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_014022	CGG	2	6	54852	54857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502041
1002	NC_014022	GA	3	6	54859	54864	50 %	0 %	50 %	0 %	294502041
1003	NC_014022	CAT	2	6	54907	54912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502041
1004	NC_014022	GGTT	2	8	54943	54950	0 %	50 %	50 %	0 %	294502041
1005	NC_014022	T	6	6	55177	55182	0 %	100 %	0 %	0 %	294502041
1006	NC_014022	TA	3	6	55225	55230	50 %	50 %	0 %	0 %	294502041
1007	NC_014022	GAAA	2	8	55244	55251	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_014022	GAAG	2	8	55270	55277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_014022	GGGGT	2	10	55285	55294	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_014022	TGA	2	6	55303	55308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_014022	GGA	2	6	55414	55419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_014022	TGGGTT	2	12	55482	55493	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_014022	CAG	2	6	55495	55500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_014022	GCTGC	2	10	55526	55535	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1015	NC_014022	CAC	2	6	55563	55568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_014022	A	6	6	55665	55670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_014022	TAG	2	6	55671	55676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_014022	GCC	2	6	55692	55697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_014022	CT	3	6	55771	55776	0 %	50 %	0 %	50 %	294502042
1020	NC_014022	GCGAT	2	10	55834	55843	20 %	20 %	40 %	20 %	294502042
1021	NC_014022	GTG	3	9	56056	56064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502042
1022	NC_014022	CA	3	6	56179	56184	50 %	0 %	0 %	50 %	294502042
1023	NC_014022	TAAG	2	8	56197	56204	50 %	25 %	25 %	0 %	294502042
1024	NC_014022	TTG	2	6	56242	56247	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502042
1025	NC_014022	CTT	2	6	56263	56268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502042
1026	NC_014022	TCA	2	6	56288	56293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502042
1027	NC_014022	A	6	6	56309	56314	100 %	0 %	0 %	0 %	294502042
1028	NC_014022	CCG	2	6	56316	56321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_014022	CAG	2	6	56525	56530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502043
1030	NC_014022	GAC	2	6	56590	56595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502043
1031	NC_014022	CGCCAG	2	12	56627	56638	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502043
1032	NC_014022	GAT	2	6	56660	56665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502043
1033	NC_014022	TGG	2	6	56686	56691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502043
1034	NC_014022	GCC	2	6	56727	56732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502043
1035	NC_014022	TCT	2	6	56746	56751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502043
1036	NC_014022	TTG	3	9	56939	56947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502044
1037	NC_014022	GTC	2	6	57148	57153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1038	NC_014022	CAT	2	6	57186	57191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502044
1039	NC_014022	GTC	2	6	57256	57261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1040	NC_014022	GCC	2	6	57278	57283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502044
1041	NC_014022	TCA	2	6	57291	57296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502044
1042	NC_014022	ACACGC	2	12	57487	57498	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	294502044
1043	NC_014022	GCC	2	6	57544	57549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502044
1044	NC_014022	ATG	2	6	57569	57574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502044
1045	NC_014022	AGC	2	6	57594	57599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1046	NC_014022	CAG	2	6	57606	57611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1047	NC_014022	TGG	2	6	57688	57693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502044
1048	NC_014022	GCA	2	6	57767	57772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1049	NC_014022	CAG	2	6	57783	57788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1050	NC_014022	TTG	2	6	57851	57856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502044
1051	NC_014022	TTC	2	6	57872	57877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502044
1052	NC_014022	CAG	2	6	57945	57950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1053	NC_014022	CTT	2	6	57981	57986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502044
1054	NC_014022	CG	3	6	58027	58032	0 %	0 %	50 %	50 %	294502044
1055	NC_014022	GTG	2	6	58046	58051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502044
1056	NC_014022	ACG	2	6	58094	58099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1057	NC_014022	GTC	2	6	58315	58320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1058	NC_014022	AGC	2	6	58418	58423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1059	NC_014022	CT	3	6	58541	58546	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
1060	NC_014022	CGA	2	6	58707	58712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1061	NC_014022	CGC	2	6	58765	58770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502044
1062	NC_014022	TCC	2	6	58853	58858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502044
1063	NC_014022	GCA	2	6	58892	58897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1064	NC_014022	CGCAG	2	10	58925	58934	20 %	0 %	40 %	40 %	294502044
1065	NC_014022	TTCA	2	8	58993	59000	25 %	50 %	0 %	25 %	294502044
1066	NC_014022	TGA	2	6	59076	59081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502044
1067	NC_014022	AGA	2	6	59093	59098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294502044
1068	NC_014022	CAC	2	6	59135	59140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502044
1069	NC_014022	CCA	2	6	59142	59147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502044
1070	NC_014022	TCA	2	6	59208	59213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502044
1071	NC_014022	GGT	2	6	59312	59317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502044
1072	NC_014022	GT	3	6	59316	59321	0 %	50 %	50 %	0 %	294502044
1073	NC_014022	GTA	2	6	59336	59341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502044
1074	NC_014022	CAGC	2	8	59364	59371	25 %	0 %	25 %	50 %	294502044
1075	NC_014022	TCA	2	6	59373	59378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502044
1076	NC_014022	TCG	2	6	59390	59395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1077	NC_014022	TGG	2	6	59416	59421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502044
1078	NC_014022	GTT	2	6	59468	59473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502044
1079	NC_014022	GGC	2	6	59541	59546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294502044
1080	NC_014022	TGG	2	6	59570	59575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294502044
1081	NC_014022	TGT	2	6	59610	59615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294502044
1082	NC_014022	CGT	2	6	59649	59654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1083	NC_014022	TAA	2	6	59666	59671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294502044
1084	NC_014022	TCC	2	6	59791	59796	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294502044
1085	NC_014022	CAG	2	6	59866	59871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1086	NC_014022	GAT	2	6	59872	59877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502044
1087	NC_014022	GCC	2	6	59897	59902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502044
1088	NC_014022	TCA	2	6	59961	59966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502044
1089	NC_014022	TC	3	6	60052	60057	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
1090	NC_014022	GGCG	2	8	60072	60079	0 %	0 %	75 %	25 %	294502044
1091	NC_014022	TCG	2	6	60098	60103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1092	NC_014022	TCG	2	6	60140	60145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1093	NC_014022	CAG	2	6	60204	60209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502044
1094	NC_014022	TC	3	6	60221	60226	0 %	50 %	0 %	50 %	294502044
1095	NC_014022	TGG	2	6	60393	60398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_014022	AG	3	6	60456	60461	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1097	NC_014022	TCT	2	6	60495	60500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502045
1098	NC_014022	TGGA	2	8	60531	60538	25 %	25 %	50 %	0 %	294502045
1099	NC_014022	CAT	2	6	60586	60591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502045
1100	NC_014022	AGC	3	9	60608	60616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502045
1101	NC_014022	TGGC	2	8	60631	60638	0 %	25 %	50 %	25 %	294502045
1102	NC_014022	TGC	2	6	60647	60652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502045
1103	NC_014022	TCT	2	6	60690	60695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502045
1104	NC_014022	CAGC	2	8	60723	60730	25 %	0 %	25 %	50 %	294502045
1105	NC_014022	CGC	2	6	60796	60801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294502045
1106	NC_014022	TCG	2	6	60836	60841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294502045
1107	NC_014022	TGA	2	6	60924	60929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294502045
1108	NC_014022	CTGG	2	8	60951	60958	0 %	25 %	50 %	25 %	294502045
1109	NC_014022	AC	3	6	60960	60965	50 %	0 %	0 %	50 %	294502045
1110	NC_014022	TCA	2	6	60995	61000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502045
1111	NC_014022	CGCCAG	2	12	61027	61038	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	294502045
1112	NC_014022	CGAG	2	8	61070	61077	25 %	0 %	50 %	25 %	294502045
1113	NC_014022	CTT	2	6	61098	61103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502045
1114	NC_014022	CAG	2	6	61144	61149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502045
1115	NC_014022	GAAGA	2	10	61167	61176	60 %	0 %	40 %	0 %	294502045
1116	NC_014022	CAT	2	6	61228	61233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502045
1117	NC_014022	TTC	3	9	61274	61282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502045
1118	NC_014022	GT	3	6	61308	61313	0 %	50 %	50 %	0 %	294502045
1119	NC_014022	AGC	2	6	61379	61384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502045
1120	NC_014022	CCA	2	6	61395	61400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502045
1121	NC_014022	GA	3	6	61518	61523	50 %	0 %	50 %	0 %	294502045
1122	NC_014022	CAC	2	6	61561	61566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502045
1123	NC_014022	CGTCCA	2	12	61569	61580	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294502045
1124	NC_014022	CAC	2	6	61658	61663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502045
1125	NC_014022	TTC	2	6	61690	61695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294502045
1126	NC_014022	TCGT	2	8	61740	61747	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1127	NC_014022	TA	3	6	61759	61764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_014022	AT	3	6	61766	61771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_014022	AGTA	2	8	61782	61789	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_014022	GAC	2	6	61846	61851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502046
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1137	NC_014022	GCA	2	6	62202	62207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502046
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1174	NC_014022	TG	3	6	64220	64225	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1249	NC_014022	AG	3	6	67566	67571	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1323	NC_014022	CAT	2	6	70956	70961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1355	NC_014022	CGC	2	6	72299	72304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1357	NC_014022	GAT	2	6	72379	72384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1358	NC_014022	GGAAT	2	10	72385	72394	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1359	NC_014022	AACC	2	8	72400	72407	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1360	NC_014022	CAA	2	6	72466	72471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1361	NC_014022	CGA	2	6	72700	72705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502053
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1363	NC_014022	ACC	2	6	72833	72838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294502053
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1367	NC_014022	CAT	2	6	73246	73251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294502053
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1372	NC_014022	GAC	2	6	73559	73564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294502053
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1377	NC_014022	TAA	2	6	73783	73788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1378	NC_014022	T	7	7	73810	73816	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1379	NC_014022	A	7	7	73835	73841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1380	NC_014022	ACG	2	6	73872	73877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1381	NC_014022	A	6	6	73911	73916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1382	NC_014022	GAT	2	6	73940	73945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1383	NC_014022	AAT	2	6	73946	73951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1384	NC_014022	GT	3	6	74028	74033	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1385	NC_014022	A	6	6	74066	74071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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