MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Z176003 plasmid pCD1

Total Repeats: 1386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_014017	AT	3	6	23206	23211	50 %	50 %	0 %	0 %	294496830
502	NC_014017	ATA	2	6	23220	23225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496830
503	NC_014017	CTTT	2	8	23292	23299	0 %	75 %	0 %	25 %	294496830
504	NC_014017	TCG	2	6	23305	23310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496830
505	NC_014017	CG	3	6	23309	23314	0 %	0 %	50 %	50 %	294496830
506	NC_014017	GCATC	2	10	23386	23395	20 %	20 %	20 %	40 %	294496830
507	NC_014017	AG	3	6	23397	23402	50 %	0 %	50 %	0 %	294496830
508	NC_014017	TGA	2	6	23467	23472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496830
509	NC_014017	CGA	2	6	23491	23496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496830
510	NC_014017	ACG	2	6	23511	23516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496830
511	NC_014017	GTG	2	6	23574	23579	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496830
512	NC_014017	AAC	2	6	23676	23681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496830
513	NC_014017	G	8	8	23728	23735	0 %	0 %	100 %	0 %	294496830
514	NC_014017	CAT	2	6	23747	23752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496830
515	NC_014017	CAG	2	6	23768	23773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496830
516	NC_014017	AAT	2	6	23858	23863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496831
517	NC_014017	GTT	2	6	23903	23908	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496831
518	NC_014017	CTT	2	6	23972	23977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496831
519	NC_014017	TTA	3	9	23998	24006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496831
520	NC_014017	GC	3	6	24085	24090	0 %	0 %	50 %	50 %	294496831
521	NC_014017	AACC	2	8	24115	24122	50 %	0 %	0 %	50 %	294496831
522	NC_014017	AGC	2	6	24127	24132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496831
523	NC_014017	TGT	2	6	24142	24147	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496831
524	NC_014017	ATT	2	6	24192	24197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496832
525	NC_014017	ATC	3	9	24209	24217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496832
526	NC_014017	TTG	2	6	24218	24223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496832
527	NC_014017	AGC	2	6	24231	24236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496832
528	NC_014017	GACT	2	8	24261	24268	25 %	25 %	25 %	25 %	294496832
529	NC_014017	GGT	2	6	24269	24274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496832
530	NC_014017	GCTT	2	8	24373	24380	0 %	50 %	25 %	25 %	294496832
531	NC_014017	GGC	2	6	24432	24437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496832
532	NC_014017	G	6	6	24511	24516	0 %	0 %	100 %	0 %	294496832
533	NC_014017	TTA	2	6	24520	24525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496832
534	NC_014017	TGC	2	6	24551	24556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496833
535	NC_014017	TCA	2	6	24611	24616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496833
536	NC_014017	ACC	2	6	24651	24656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496833
537	NC_014017	GCC	2	6	24689	24694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496833
538	NC_014017	TGT	2	6	24779	24784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496833
539	NC_014017	ATG	2	6	24881	24886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496833
540	NC_014017	ACTC	2	8	24898	24905	25 %	25 %	0 %	50 %	294496833
541	NC_014017	TTC	2	6	24908	24913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_014017	ATCG	2	8	24935	24942	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_014017	CTC	2	6	24977	24982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
544	NC_014017	A	7	7	25184	25190	100 %	0 %	0 %	0 %	294496834
545	NC_014017	TCAC	2	8	25213	25220	25 %	25 %	0 %	50 %	294496834
546	NC_014017	TAA	2	6	25253	25258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496834
547	NC_014017	TTG	2	6	25290	25295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	294496834
548	NC_014017	AAT	2	6	25330	25335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496834
549	NC_014017	GGTA	2	8	25424	25431	25 %	25 %	50 %	0 %	294496834
550	NC_014017	TTC	2	6	25638	25643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496834
551	NC_014017	AGC	2	6	25711	25716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496834
552	NC_014017	TCAC	2	8	25717	25724	25 %	25 %	0 %	50 %	294496834
553	NC_014017	CTC	2	6	25776	25781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496834
554	NC_014017	ACT	2	6	25959	25964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496834
555	NC_014017	CGT	2	6	26022	26027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496834
556	NC_014017	ACT	2	6	26032	26037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_014017	AATTAC	2	12	26058	26069	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_014017	TGC	2	6	26127	26132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_014017	T	6	6	26171	26176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_014017	TCA	2	6	26251	26256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
561	NC_014017	GTAG	2	8	26273	26280	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
562	NC_014017	TTA	2	6	26327	26332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496835
563	NC_014017	TTAC	2	8	26371	26378	25 %	50 %	0 %	25 %	294496835
564	NC_014017	ACA	2	6	26388	26393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496835
565	NC_014017	TCT	2	6	26474	26479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496835
566	NC_014017	GGGT	2	8	26520	26527	0 %	25 %	75 %	0 %	294496835
567	NC_014017	CTG	2	6	26534	26539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496835
568	NC_014017	G	6	6	26576	26581	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
569	NC_014017	CGG	2	6	26595	26600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496835
570	NC_014017	TTA	2	6	26649	26654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496835
571	NC_014017	CAC	2	6	26658	26663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496835
572	NC_014017	GCC	2	6	26735	26740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496835
573	NC_014017	G	9	9	26741	26749	0 %	0 %	100 %	0 %	294496835
574	NC_014017	TGCT	2	8	26760	26767	0 %	50 %	25 %	25 %	294496835
575	NC_014017	GTG	2	6	26891	26896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	294496835
576	NC_014017	ACC	2	6	27058	27063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496835
577	NC_014017	CGC	2	6	27068	27073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496835
578	NC_014017	TCC	2	6	27079	27084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	294496835
579	NC_014017	CT	3	6	27153	27158	0 %	50 %	0 %	50 %	294496835
580	NC_014017	CGA	2	6	27202	27207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496835
581	NC_014017	ATT	2	6	27233	27238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496835
582	NC_014017	TGA	2	6	27306	27311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496835
583	NC_014017	GAA	2	6	27377	27382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496835
584	NC_014017	CGC	2	6	27550	27555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	294496836
585	NC_014017	GCTT	2	8	27616	27623	0 %	50 %	25 %	25 %	294496836
586	NC_014017	GCAG	2	8	27624	27631	25 %	0 %	50 %	25 %	294496836
587	NC_014017	TCA	2	6	27642	27647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496836
588	NC_014017	TGA	2	6	27690	27695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496836
589	NC_014017	A	6	6	27720	27725	100 %	0 %	0 %	0 %	294496836
590	NC_014017	CAC	2	6	27726	27731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496836
591	NC_014017	AGG	2	6	27788	27793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496836
592	NC_014017	ATT	2	6	27819	27824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496836
593	NC_014017	TGAGCG	2	12	27840	27851	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294496836
594	NC_014017	TGC	2	6	27872	27877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496836
595	NC_014017	CGA	2	6	27919	27924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496836
596	NC_014017	GAAGAT	2	12	27925	27936	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294496836
597	NC_014017	CAA	2	6	27946	27951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496836
598	NC_014017	GAA	2	6	27961	27966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496836
599	NC_014017	CAAGAA	2	12	27967	27978	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294496836
600	NC_014017	CAC	2	6	28019	28024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496837
601	NC_014017	CAT	2	6	28068	28073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496837
602	NC_014017	ATA	3	9	28114	28122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496837
603	NC_014017	AGA	2	6	28142	28147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496837
604	NC_014017	A	6	6	28182	28187	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
605	NC_014017	TGCG	2	8	28210	28217	0 %	25 %	50 %	25 %	294496837
606	NC_014017	GCG	2	6	28230	28235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496837
607	NC_014017	GGAA	2	8	28248	28255	50 %	0 %	50 %	0 %	294496837
608	NC_014017	AAT	2	6	28290	28295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496837
609	NC_014017	CAG	2	6	28353	28358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496837
610	NC_014017	TGA	2	6	28370	28375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496837
611	NC_014017	AG	3	6	28382	28387	50 %	0 %	50 %	0 %	294496837
612	NC_014017	TAT	2	6	28388	28393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496837
613	NC_014017	ATG	2	6	28483	28488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496837
614	NC_014017	GCT	2	6	28572	28577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	294496837
615	NC_014017	A	6	6	28634	28639	100 %	0 %	0 %	0 %	294496837
616	NC_014017	AGA	2	6	28670	28675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496837
617	NC_014017	TCA	2	6	28688	28693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294496837
618	NC_014017	GAT	2	6	28740	28745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294496837
619	NC_014017	AGC	2	6	28893	28898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	294496837
620	NC_014017	ACC	2	6	28913	28918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	294496837
621	NC_014017	CG	3	6	28942	28947	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
622	NC_014017	CAA	2	6	29020	29025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294496837
623	NC_014017	GC	3	6	29027	29032	0 %	0 %	50 %	50 %	294496837
624	NC_014017	TAGAAC	2	12	29089	29100	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294496837
625	NC_014017	GCG	2	6	29104	29109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	294496837
626	NC_014017	TAT	2	6	29159	29164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294496837
627	NC_014017	TCT	2	6	29255	29260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	294496837
628	NC_014017	GAG	2	6	29352	29357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	294496837
629	NC_014017	GAA	2	6	29367	29372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	294496837
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753	NC_014017	AAT	2	6	35368	35373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	294496844
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