MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ plasmid pYPTS01

Total Repeats: 125

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010635	TA	4	8	429	436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010635	GT	3	6	2661	2666	0 %	50 %	50 %	0 %	186897497
3	NC_010635	CG	3	6	2925	2930	0 %	0 %	50 %	50 %	186897498
4	NC_010635	AG	3	6	4080	4085	50 %	0 %	50 %	0 %	186897499
5	NC_010635	AC	3	6	5452	5457	50 %	0 %	0 %	50 %	186897503
6	NC_010635	AG	3	6	6756	6761	50 %	0 %	50 %	0 %	186897505
7	NC_010635	TC	3	6	6983	6988	0 %	50 %	0 %	50 %	186897506
8	NC_010635	GC	3	6	7013	7018	0 %	0 %	50 %	50 %	186897506
9	NC_010635	AT	3	6	7596	7601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_010635	TA	3	6	8161	8166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_010635	GA	3	6	8338	8343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_010635	AT	3	6	8680	8685	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_010635	CT	3	6	8915	8920	0 %	50 %	0 %	50 %	186897508
14	NC_010635	GC	4	8	11054	11061	0 %	0 %	50 %	50 %	186897510
15	NC_010635	GT	3	6	11132	11137	0 %	50 %	50 %	0 %	186897510
16	NC_010635	CT	3	6	11488	11493	0 %	50 %	0 %	50 %	186897510
17	NC_010635	CT	3	6	11579	11584	0 %	50 %	0 %	50 %	186897510
18	NC_010635	AT	3	6	11799	11804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_010635	TC	4	8	13444	13451	0 %	50 %	0 %	50 %	186897512
20	NC_010635	AT	3	6	13889	13894	50 %	50 %	0 %	0 %	186897512
21	NC_010635	TA	4	8	14285	14292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_010635	AT	3	6	14371	14376	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010635	TC	3	6	14466	14471	0 %	50 %	0 %	50 %	186897513
24	NC_010635	GC	3	6	14907	14912	0 %	0 %	50 %	50 %	186897513
25	NC_010635	GT	3	6	14939	14944	0 %	50 %	50 %	0 %	186897513
26	NC_010635	GT	3	6	15925	15930	0 %	50 %	50 %	0 %	186897513
27	NC_010635	GT	3	6	16348	16353	0 %	50 %	50 %	0 %	186897513
28	NC_010635	AG	3	6	16423	16428	50 %	0 %	50 %	0 %	186897513
29	NC_010635	GC	3	6	16860	16865	0 %	0 %	50 %	50 %	186897514
30	NC_010635	CA	3	6	16967	16972	50 %	0 %	0 %	50 %	186897514
31	NC_010635	CA	3	6	17055	17060	50 %	0 %	0 %	50 %	186897514
32	NC_010635	AT	3	6	17117	17122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010635	GT	3	6	17384	17389	0 %	50 %	50 %	0 %	186897516
34	NC_010635	GC	3	6	18692	18697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_010635	TG	3	6	18710	18715	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_010635	GC	3	6	19402	19407	0 %	0 %	50 %	50 %	186897519
37	NC_010635	CG	3	6	19907	19912	0 %	0 %	50 %	50 %	186897519
38	NC_010635	TG	3	6	20051	20056	0 %	50 %	50 %	0 %	186897519
39	NC_010635	TC	3	6	20416	20421	0 %	50 %	0 %	50 %	186897520
40	NC_010635	GT	3	6	21123	21128	0 %	50 %	50 %	0 %	186897522
41	NC_010635	GT	3	6	21280	21285	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_010635	AT	3	6	21518	21523	50 %	50 %	0 %	0 %	186897523
43	NC_010635	CA	3	6	21530	21535	50 %	0 %	0 %	50 %	186897523
44	NC_010635	CG	3	6	22764	22769	0 %	0 %	50 %	50 %	186897525
45	NC_010635	GA	3	6	23321	23326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010635	GT	3	6	23849	23854	0 %	50 %	50 %	0 %	186897527
47	NC_010635	TC	3	6	24146	24151	0 %	50 %	0 %	50 %	186897527
48	NC_010635	AT	3	6	24856	24861	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_010635	AT	3	6	24978	24983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_010635	TA	3	6	25269	25274	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_010635	TG	3	6	25628	25633	0 %	50 %	50 %	0 %	186897528
52	NC_010635	TC	3	6	26106	26111	0 %	50 %	0 %	50 %	186897529
53	NC_010635	AC	3	6	28162	28167	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_010635	TG	3	6	28183	28188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_010635	CG	3	6	28273	28278	0 %	0 %	50 %	50 %	186897530
56	NC_010635	GT	3	6	28515	28520	0 %	50 %	50 %	0 %	186897530
57	NC_010635	GA	3	6	28642	28647	50 %	0 %	50 %	0 %	186897530
58	NC_010635	TA	3	6	29046	29051	50 %	50 %	0 %	0 %	186897531
59	NC_010635	AC	3	6	29415	29420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_010635	GA	3	6	30330	30335	50 %	0 %	50 %	0 %	186897534
61	NC_010635	TC	3	6	31575	31580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_010635	GT	3	6	32988	32993	0 %	50 %	50 %	0 %	186897537
63	NC_010635	CT	3	6	33461	33466	0 %	50 %	0 %	50 %	186897537
64	NC_010635	TA	3	6	34170	34175	50 %	50 %	0 %	0 %	186897540
65	NC_010635	AT	3	6	34263	34268	50 %	50 %	0 %	0 %	186897540
66	NC_010635	AT	3	6	34278	34283	50 %	50 %	0 %	0 %	186897540
67	NC_010635	TC	3	6	35459	35464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_010635	TA	3	6	35559	35564	50 %	50 %	0 %	0 %	186897542
69	NC_010635	TA	3	6	35566	35571	50 %	50 %	0 %	0 %	186897542
70	NC_010635	AT	3	6	35922	35927	50 %	50 %	0 %	0 %	186897543
71	NC_010635	AT	3	6	36086	36091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_010635	AC	3	6	36403	36408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_010635	TC	3	6	37609	37614	0 %	50 %	0 %	50 %	186897546
74	NC_010635	GA	4	8	37836	37843	50 %	0 %	50 %	0 %	186897546
75	NC_010635	AT	3	6	39656	39661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010635	TA	3	6	39855	39860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_010635	AC	3	6	40041	40046	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010635	GT	3	6	40412	40417	0 %	50 %	50 %	0 %	186897549
79	NC_010635	AC	3	6	40692	40697	50 %	0 %	0 %	50 %	186897550
80	NC_010635	AT	3	6	40807	40812	50 %	50 %	0 %	0 %	186897550
81	NC_010635	CA	3	6	40819	40824	50 %	0 %	0 %	50 %	186897550
82	NC_010635	TG	3	6	41719	41724	0 %	50 %	50 %	0 %	186897552
83	NC_010635	AG	3	6	42958	42963	50 %	0 %	50 %	0 %	186897553
84	NC_010635	AT	3	6	43556	43561	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_010635	AT	3	6	43811	43816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_010635	GA	3	6	44172	44177	50 %	0 %	50 %	0 %	186897554
87	NC_010635	TC	3	6	44616	44621	0 %	50 %	0 %	50 %	186897554
88	NC_010635	TA	3	6	45315	45320	50 %	50 %	0 %	0 %	186897556
89	NC_010635	TA	4	8	45531	45538	50 %	50 %	0 %	0 %	186897556
90	NC_010635	AT	3	6	46719	46724	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_010635	AT	3	6	46817	46822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010635	CT	3	6	47703	47708	0 %	50 %	0 %	50 %	186897559
93	NC_010635	CT	3	6	48892	48897	0 %	50 %	0 %	50 %	186897559
94	NC_010635	TA	3	6	49247	49252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_010635	TA	3	6	49255	49260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_010635	CA	3	6	50827	50832	50 %	0 %	0 %	50 %	186897561
97	NC_010635	TA	3	6	52148	52153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_010635	CT	3	6	52570	52575	0 %	50 %	0 %	50 %	186897562
99	NC_010635	CA	3	6	54665	54670	50 %	0 %	0 %	50 %	186897564
100	NC_010635	AG	3	6	54732	54737	50 %	0 %	50 %	0 %	186897564
101	NC_010635	CA	3	6	56036	56041	50 %	0 %	0 %	50 %	186897566
102	NC_010635	GA	3	6	56318	56323	50 %	0 %	50 %	0 %	186897567
103	NC_010635	AT	3	6	56919	56924	50 %	50 %	0 %	0 %	186897568
104	NC_010635	AT	3	6	56975	56980	50 %	50 %	0 %	0 %	186897568
105	NC_010635	GA	3	6	57255	57260	50 %	0 %	50 %	0 %	186897568
106	NC_010635	AT	3	6	58098	58103	50 %	50 %	0 %	0 %	186897568
107	NC_010635	CG	3	6	58201	58206	0 %	0 %	50 %	50 %	186897568
108	NC_010635	AG	3	6	58289	58294	50 %	0 %	50 %	0 %	186897568
109	NC_010635	GC	3	6	58977	58982	0 %	0 %	50 %	50 %	186897569
110	NC_010635	CT	3	6	62045	62050	0 %	50 %	0 %	50 %	186897574
111	NC_010635	AG	3	6	63274	63279	50 %	0 %	50 %	0 %	186897576
112	NC_010635	CG	3	6	63834	63839	0 %	0 %	50 %	50 %	186897576
113	NC_010635	GC	3	6	63919	63924	0 %	0 %	50 %	50 %	186897576
114	NC_010635	CA	3	6	65017	65022	50 %	0 %	0 %	50 %	186897577
115	NC_010635	CT	3	6	66528	66533	0 %	50 %	0 %	50 %	186897580
116	NC_010635	GC	3	6	66935	66940	0 %	0 %	50 %	50 %	186897581
117	NC_010635	AT	3	6	67513	67518	50 %	50 %	0 %	0 %	186897581
118	NC_010635	AT	3	6	68131	68136	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010635	AT	3	6	68153	68158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_010635	TG	3	6	68501	68506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_010635	CA	3	6	68645	68650	50 %	0 %	0 %	50 %	186897582
122	NC_010635	CT	3	6	68797	68802	0 %	50 %	0 %	50 %	186897582
123	NC_010635	AT	3	6	69006	69011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_010635	TA	3	6	69122	69127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_010635	TC	3	6	69507	69512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.