MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 62321

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010634	GCA	2	6	18	23	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_010634	TTG	2	6	407	412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893345
3	NC_010634	GCC	2	6	442	447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893345
4	NC_010634	GGT	2	6	469	474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893345
5	NC_010634	AAT	2	6	631	636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893345
6	NC_010634	TTA	2	6	679	684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893345
7	NC_010634	GAT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893345
8	NC_010634	AAG	2	6	725	730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
9	NC_010634	CAG	2	6	769	774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893345
10	NC_010634	CCA	2	6	871	876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893345
11	NC_010634	GAA	2	6	906	911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
12	NC_010634	TTG	2	6	1081	1086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893345
13	NC_010634	ATA	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893345
14	NC_010634	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893345
15	NC_010634	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893345
16	NC_010634	TCC	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893345
17	NC_010634	TTG	2	6	1490	1495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893346
18	NC_010634	TGG	2	6	1551	1556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
19	NC_010634	TTA	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893346
20	NC_010634	TGG	2	6	2017	2022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
21	NC_010634	TAA	2	6	2053	2058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893346
22	NC_010634	CGC	2	6	2126	2131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893346
23	NC_010634	GAA	2	6	2140	2145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
24	NC_010634	GTG	2	6	2229	2234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893346
25	NC_010634	TAA	2	6	2275	2280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893346
26	NC_010634	GAA	2	6	2291	2296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
27	NC_010634	AGA	2	6	2299	2304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893346
28	NC_010634	GTC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893346
29	NC_010634	GTA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893346
30	NC_010634	CGA	2	6	2605	2610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_010634	GGC	2	6	2729	2734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893347
32	NC_010634	TTA	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893347
33	NC_010634	AGC	2	6	3142	3147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893347
34	NC_010634	CGC	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
35	NC_010634	ATC	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893347
36	NC_010634	GCG	2	6	3264	3269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893347
37	NC_010634	GTT	2	6	3362	3367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893347
38	NC_010634	CCG	2	6	3406	3411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
39	NC_010634	AGA	2	6	3461	3466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893347
40	NC_010634	GCC	2	6	3598	3603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893347
41	NC_010634	CTC	2	6	3789	3794	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893348
42	NC_010634	TGA	2	6	3861	3866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
43	NC_010634	CAC	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893348
44	NC_010634	GAT	2	6	3988	3993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
45	NC_010634	GCA	2	6	4039	4044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893348
46	NC_010634	TCA	2	6	4049	4054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893348
47	NC_010634	CGG	2	6	4107	4112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893348
48	NC_010634	GTT	2	6	4135	4140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
49	NC_010634	GTG	2	6	4237	4242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
50	NC_010634	AGA	2	6	4407	4412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
51	NC_010634	GGT	2	6	4429	4434	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
52	NC_010634	TTG	2	6	4445	4450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
53	NC_010634	CCA	2	6	4502	4507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893348
54	NC_010634	TGG	2	6	4602	4607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
55	NC_010634	AAG	2	6	4667	4672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
56	NC_010634	TGA	2	6	4707	4712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
57	NC_010634	TGT	2	6	4734	4739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
58	NC_010634	TCT	2	6	4795	4800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893348
59	NC_010634	CGG	2	6	4811	4816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893348
60	NC_010634	TGA	2	6	4826	4831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
61	NC_010634	TTG	2	6	4852	4857	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
62	NC_010634	GTT	3	9	5295	5303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893348
63	NC_010634	CTT	2	6	5307	5312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893348
64	NC_010634	ATT	2	6	5332	5337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893348
65	NC_010634	GAA	2	6	5382	5387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
66	NC_010634	GAT	3	9	5413	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893348
67	NC_010634	AGA	2	6	5543	5548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
68	NC_010634	AAG	2	6	5618	5623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893348
69	NC_010634	TGG	2	6	5669	5674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
70	NC_010634	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893348
71	NC_010634	GTG	2	6	5719	5724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
72	NC_010634	TGG	2	6	5820	5825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893348
73	NC_010634	CGT	2	6	5905	5910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
74	NC_010634	CCG	2	6	5961	5966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893348
75	NC_010634	CGT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
76	NC_010634	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
77	NC_010634	CGC	2	6	6084	6089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893348
78	NC_010634	ACT	2	6	6103	6108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893348
79	NC_010634	TCG	2	6	6132	6137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893348
80	NC_010634	TGA	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_010634	TGC	3	9	6488	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893349
82	NC_010634	ATT	2	6	6592	6597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
83	NC_010634	AAC	2	6	6606	6611	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893349
84	NC_010634	GGC	2	6	6629	6634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893349
85	NC_010634	TGA	3	9	6862	6870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
86	NC_010634	TGA	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
87	NC_010634	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893349
88	NC_010634	TAT	2	6	6938	6943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
89	NC_010634	ATT	2	6	7211	7216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893349
90	NC_010634	GTC	2	6	7303	7308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010634	AGG	2	6	7319	7324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010634	CAT	2	6	7336	7341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_010634	GTT	2	6	7377	7382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_010634	AGC	2	6	7402	7407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_010634	CAT	2	6	7423	7428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_010634	GTT	2	6	7464	7469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_010634	AGC	2	6	7489	7494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_010634	TAA	2	6	7551	7556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_010634	AGC	2	6	7600	7605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_010634	GAA	2	6	7611	7616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_010634	ATG	2	6	7695	7700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_010634	GCG	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893350
103	NC_010634	ATG	2	6	8034	8039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893350
104	NC_010634	AAG	2	6	8137	8142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893350
105	NC_010634	CTA	2	6	8167	8172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893350
106	NC_010634	AGC	2	6	8317	8322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893350
107	NC_010634	CAG	2	6	8352	8357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_010634	TAT	2	6	8411	8416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893351
109	NC_010634	TGA	2	6	8443	8448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893351
110	NC_010634	GAC	2	6	8487	8492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893351
111	NC_010634	AAG	2	6	8538	8543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893351
112	NC_010634	TGA	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893351
113	NC_010634	CGG	2	6	8609	8614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893351
114	NC_010634	TGG	2	6	8641	8646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893351
115	NC_010634	GTG	2	6	8704	8709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893351
116	NC_010634	TAA	2	6	8776	8781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893351
117	NC_010634	ATT	2	6	8786	8791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893351
118	NC_010634	AGC	2	6	8812	8817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893351
119	NC_010634	AAG	2	6	8871	8876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893351
120	NC_010634	TTC	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893351
121	NC_010634	AAG	2	6	9044	9049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893351
122	NC_010634	ATT	2	6	9096	9101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893351
123	NC_010634	TCA	2	6	9277	9282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893352
124	NC_010634	TTC	2	6	9362	9367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010634	GCT	2	6	9373	9378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_010634	GAT	2	6	9438	9443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_010634	GCT	2	6	9460	9465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_010634	CAA	2	6	9484	9489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_010634	ATT	2	6	9625	9630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_010634	TTA	3	9	9715	9723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_010634	CCG	2	6	9967	9972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893353
132	NC_010634	CGT	2	6	9977	9982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893353
133	NC_010634	CTT	2	6	10072	10077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893353
134	NC_010634	GAA	2	6	10139	10144	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893353
135	NC_010634	TGC	2	6	10219	10224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893353
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137	NC_010634	TTG	2	6	10623	10628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893353
138	NC_010634	TGA	2	6	10632	10637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893353
139	NC_010634	CGC	2	6	10639	10644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893353
140	NC_010634	CCG	2	6	10686	10691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893353
141	NC_010634	GAT	2	6	10798	10803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893353
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146	NC_010634	GAG	2	6	10982	10987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_010634	AAT	2	6	11345	11350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_010634	ATA	2	6	11396	11401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_010634	TAA	2	6	11471	11476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893355
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163	NC_010634	CAA	2	6	12504	12509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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248	NC_010634	ATT	2	6	20633	20638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_010634	CTG	2	6	20646	20651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_010634	TCA	2	6	20665	20670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_010634	ATC	2	6	20722	20727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
252	NC_010634	GCT	2	6	20740	20745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
253	NC_010634	TGG	2	6	20797	20802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893364
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259	NC_010634	GTC	2	6	21534	21539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
260	NC_010634	GCG	2	6	21551	21556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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386	NC_010634	TTC	2	6	30851	30856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
387	NC_010634	TTG	2	6	30863	30868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_010634	TGC	2	6	30993	30998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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391	NC_010634	CCT	2	6	31093	31098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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498	NC_010634	TGA	2	6	39418	39423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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