MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 93196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_010634	CT	3	6	206423	206428	0 %	50 %	0 %	50 %	186893531
4003	NC_010634	CTG	2	6	206536	206541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893531
4004	NC_010634	CGC	2	6	206542	206547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893531
4005	NC_010634	CAG	2	6	206605	206610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893531
4006	NC_010634	TGG	2	6	206717	206722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893531
4007	NC_010634	TCA	2	6	206772	206777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893531
4008	NC_010634	ATT	2	6	206803	206808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893531
4009	NC_010634	AGGC	2	8	206854	206861	25 %	0 %	50 %	25 %	186893531
4010	NC_010634	TGA	2	6	206919	206924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893531
4011	NC_010634	CAA	2	6	206977	206982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893531
4012	NC_010634	AGC	2	6	207068	207073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893531
4013	NC_010634	TTC	2	6	207085	207090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893531
4014	NC_010634	TTC	2	6	207169	207174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893531
4015	NC_010634	AAGC	2	8	207199	207206	50 %	0 %	25 %	25 %	186893531
4016	NC_010634	TATT	2	8	207266	207273	25 %	75 %	0 %	0 %	186893532
4017	NC_010634	CGG	2	6	207318	207323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893532
4018	NC_010634	TTTAAC	2	12	207330	207341	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	186893532
4019	NC_010634	GTTTT	2	10	207342	207351	0 %	80 %	20 %	0 %	186893532
4020	NC_010634	GGT	2	6	207425	207430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893532
4021	NC_010634	TGT	2	6	207445	207450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893532
4022	NC_010634	AGCC	2	8	207525	207532	25 %	0 %	25 %	50 %	186893532
4023	NC_010634	TGC	2	6	207583	207588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893532
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4025	NC_010634	T	6	6	207710	207715	0 %	100 %	0 %	0 %	186893532
4026	NC_010634	CTT	2	6	207719	207724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893532
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4029	NC_010634	TTC	3	9	207777	207785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893532
4030	NC_010634	TGG	2	6	207830	207835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893532
4031	NC_010634	TGGA	2	8	207893	207900	25 %	25 %	50 %	0 %	186893532
4032	NC_010634	GCG	2	6	207918	207923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893532
4033	NC_010634	CTGG	2	8	207953	207960	0 %	25 %	50 %	25 %	186893532
4034	NC_010634	GC	3	6	208138	208143	0 %	0 %	50 %	50 %	186893532
4035	NC_010634	GGCT	2	8	208219	208226	0 %	25 %	50 %	25 %	186893532
4036	NC_010634	TGG	2	6	208252	208257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893532
4037	NC_010634	G	8	8	208262	208269	0 %	0 %	100 %	0 %	186893532
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4041	NC_010634	GCG	2	6	208368	208373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893532
4042	NC_010634	TTG	2	6	208503	208508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893532
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4045	NC_010634	ATC	2	6	208689	208694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893533
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4051	NC_010634	GCA	2	6	208921	208926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893533
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4057	NC_010634	TCG	2	6	209290	209295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893533
4058	NC_010634	GCT	2	6	209305	209310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893533
4059	NC_010634	TTA	3	9	209323	209331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893533
4060	NC_010634	GTC	2	6	209337	209342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893533
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4062	NC_010634	CGC	2	6	209383	209388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_010634	GCG	2	6	209397	209402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_010634	TCACT	7	35	209416	209450	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4065	NC_010634	CTAA	2	8	209473	209480	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4067	NC_010634	TAGTGG	2	12	209607	209618	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_010634	CTG	2	6	209655	209660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_010634	TTCA	2	8	209742	209749	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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4071	NC_010634	AT	3	6	209798	209803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_010634	CAT	2	6	209837	209842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4073	NC_010634	ATA	2	6	209847	209852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_010634	CAGT	2	8	209880	209887	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4075	NC_010634	AT	3	6	209897	209902	50 %	50 %	0 %	0 %	186893534
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4078	NC_010634	AGCA	2	8	210008	210015	50 %	0 %	25 %	25 %	186893534
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4089	NC_010634	TTGTCA	2	12	210664	210675	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	186893534
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4094	NC_010634	GTAT	2	8	210811	210818	25 %	50 %	25 %	0 %	186893534
4095	NC_010634	GCG	2	6	210820	210825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893534
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4098	NC_010634	CCGG	2	8	210864	210871	0 %	0 %	50 %	50 %	186893534
4099	NC_010634	TGG	2	6	210937	210942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893534
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4103	NC_010634	TGGTCT	2	12	211036	211047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	186893534
4104	NC_010634	CAG	2	6	211086	211091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893534
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4106	NC_010634	CAT	2	6	211368	211373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_010634	TTC	2	6	211374	211379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_010634	A	6	6	211381	211386	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_010634	GTA	2	6	211413	211418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_010634	TG	3	6	211525	211530	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4111	NC_010634	GGT	2	6	211541	211546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_010634	ACG	2	6	211560	211565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_010634	AAG	2	6	211590	211595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_010634	TGG	2	6	211599	211604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_010634	TGG	2	6	211697	211702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_010634	TCCC	2	8	211763	211770	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4117	NC_010634	CAC	2	6	211775	211780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4119	NC_010634	GA	3	6	211824	211829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_010634	AGC	2	6	211842	211847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_010634	CT	3	6	211917	211922	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_010634	AGA	2	6	211937	211942	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_010634	T	8	8	211960	211967	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_010634	GACC	2	8	212021	212028	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4125	NC_010634	C	6	6	212038	212043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4126	NC_010634	TCC	2	6	212057	212062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_010634	CTG	2	6	212116	212121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_010634	AT	3	6	212230	212235	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_010634	CGT	2	6	212259	212264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_010634	ATGA	2	8	212320	212327	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4131	NC_010634	A	7	7	212337	212343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4132	NC_010634	TTA	2	6	212349	212354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4133	NC_010634	TTA	2	6	212364	212369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_010634	CTG	2	6	212407	212412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4135	NC_010634	TTA	2	6	212464	212469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4136	NC_010634	TCA	2	6	212572	212577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4137	NC_010634	TGAG	2	8	212595	212602	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4138	NC_010634	TTG	2	6	212612	212617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4139	NC_010634	T	10	10	212663	212672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4140	NC_010634	AGC	2	6	212692	212697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4141	NC_010634	GAT	2	6	212780	212785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893535
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4143	NC_010634	ACG	2	6	212821	212826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893535
4144	NC_010634	GCCA	2	8	212873	212880	25 %	0 %	25 %	50 %	186893535
4145	NC_010634	GCT	2	6	212915	212920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893535
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4147	NC_010634	TCA	2	6	213089	213094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893535
4148	NC_010634	CAT	2	6	213135	213140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893535
4149	NC_010634	ATC	2	6	213142	213147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893535
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4151	NC_010634	ATG	2	6	213269	213274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893535
4152	NC_010634	TTG	2	6	213286	213291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893535
4153	NC_010634	CTT	2	6	213306	213311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893535
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4155	NC_010634	GGCG	2	8	213456	213463	0 %	0 %	75 %	25 %	186893535
4156	NC_010634	CG	3	6	213544	213549	0 %	0 %	50 %	50 %	186893535
4157	NC_010634	ATTG	2	8	213558	213565	25 %	50 %	25 %	0 %	186893535
4158	NC_010634	GGC	2	6	213592	213597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893535
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4163	NC_010634	CGC	2	6	213703	213708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893535
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4166	NC_010634	AAAG	2	8	213808	213815	75 %	0 %	25 %	0 %	186893535
4167	NC_010634	CCA	2	6	213816	213821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893535
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4171	NC_010634	TGGC	2	8	214053	214060	0 %	25 %	50 %	25 %	186893536
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4204	NC_010634	ATCA	2	8	215784	215791	50 %	25 %	0 %	25 %	186893537
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4222	NC_010634	CAA	2	6	216966	216971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4223	NC_010634	ATGT	2	8	216972	216979	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4224	NC_010634	TGA	2	6	217011	217016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4227	NC_010634	AAT	2	6	217190	217195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4228	NC_010634	TTC	2	6	217206	217211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4229	NC_010634	T	6	6	217222	217227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4230	NC_010634	CAA	2	6	217236	217241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4231	NC_010634	T	6	6	217278	217283	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4232	NC_010634	AAT	2	6	217295	217300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4233	NC_010634	GGC	2	6	217385	217390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893539
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4235	NC_010634	TCA	2	6	217445	217450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893539
4236	NC_010634	GTCT	2	8	217494	217501	0 %	50 %	25 %	25 %	186893539
4237	NC_010634	ACA	2	6	217520	217525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893539
4238	NC_010634	G	6	6	217580	217585	0 %	0 %	100 %	0 %	186893539
4239	NC_010634	CCT	2	6	217624	217629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893539
4240	NC_010634	CA	3	6	217644	217649	50 %	0 %	0 %	50 %	186893539
4241	NC_010634	CCA	2	6	217673	217678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893539
4242	NC_010634	TTGG	2	8	217682	217689	0 %	50 %	50 %	0 %	186893539
4243	NC_010634	GGC	2	6	217742	217747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893539
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4245	NC_010634	TGA	2	6	217781	217786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893539
4246	NC_010634	G	8	8	217820	217827	0 %	0 %	100 %	0 %	186893539
4247	NC_010634	AGA	3	9	217931	217939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893539
4248	NC_010634	GAT	2	6	217947	217952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893539
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4250	NC_010634	CAG	2	6	218029	218034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893539
4251	NC_010634	TTG	3	9	218109	218117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893539
4252	NC_010634	CTG	2	6	218151	218156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893539
4253	NC_010634	ACA	2	6	218171	218176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893539
4254	NC_010634	ATG	2	6	218223	218228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893539
4255	NC_010634	GCT	2	6	218293	218298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893539
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4257	NC_010634	CCAG	2	8	218334	218341	25 %	0 %	25 %	50 %	186893539
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4263	NC_010634	GCG	2	6	218583	218588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893539
4264	NC_010634	CTG	2	6	218677	218682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893539
4265	NC_010634	CTGG	2	8	218698	218705	0 %	25 %	50 %	25 %	186893539
4266	NC_010634	TG	3	6	218854	218859	0 %	50 %	50 %	0 %	186893539
4267	NC_010634	ACC	2	6	219003	219008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893539
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4280	NC_010634	AAG	2	6	219826	219831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893539
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4282	NC_010634	AG	3	6	219925	219930	50 %	0 %	50 %	0 %	186893540
4283	NC_010634	TTAT	2	8	219957	219964	25 %	75 %	0 %	0 %	186893540
4284	NC_010634	TCA	2	6	219988	219993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893540
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4313	NC_010634	ATTTT	2	10	221736	221745	20 %	80 %	0 %	0 %	186893542
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4339	NC_010634	GAAT	2	8	222800	222807	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4340	NC_010634	AAT	3	9	222805	222813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4341	NC_010634	TTAT	2	8	222854	222861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4342	NC_010634	AT	3	6	222909	222914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4343	NC_010634	CTT	2	6	222984	222989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893543
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4354	NC_010634	A	6	6	223437	223442	100 %	0 %	0 %	0 %	186893544
4355	NC_010634	A	6	6	223445	223450	100 %	0 %	0 %	0 %	186893544
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4360	NC_010634	TCTG	2	8	223597	223604	0 %	50 %	25 %	25 %	186893544
4361	NC_010634	CAA	2	6	223777	223782	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4362	NC_010634	AGT	2	6	223790	223795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_010634	GAT	2	6	224302	224307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893545
4374	NC_010634	GTC	2	6	224395	224400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893545
4375	NC_010634	GTG	2	6	224465	224470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893545
4376	NC_010634	TGC	2	6	224475	224480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893545
4377	NC_010634	GTG	2	6	224494	224499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893545
4378	NC_010634	GGC	2	6	224539	224544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893545
4379	NC_010634	GGCCA	2	10	224567	224576	20 %	0 %	40 %	40 %	186893545
4380	NC_010634	AT	3	6	224661	224666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4381	NC_010634	AT	3	6	224695	224700	50 %	50 %	0 %	0 %	186893546
4382	NC_010634	GAA	2	6	224701	224706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893546
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4387	NC_010634	TGAA	2	8	224937	224944	50 %	25 %	25 %	0 %	186893546
4388	NC_010634	GTT	2	6	224947	224952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893546
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4392	NC_010634	TGG	2	6	225234	225239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893546
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4394	NC_010634	CCT	2	6	225373	225378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893546
4395	NC_010634	TGC	2	6	225567	225572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893547
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4397	NC_010634	GCA	2	6	225596	225601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893547
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4399	NC_010634	TGC	2	6	225686	225691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893547
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4463	NC_010634	CCCG	2	8	229077	229084	0 %	0 %	25 %	75 %	186893549
4464	NC_010634	CCG	2	6	229093	229098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893549
4465	NC_010634	GTG	2	6	229200	229205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893549
4466	NC_010634	TGG	2	6	229300	229305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4467	NC_010634	CTAT	2	8	229327	229334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4468	NC_010634	ATT	2	6	229395	229400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4469	NC_010634	GCC	2	6	229424	229429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893550
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4483	NC_010634	CTG	2	6	230275	230280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4484	NC_010634	A	6	6	230350	230355	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4485	NC_010634	A	6	6	230371	230376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4486	NC_010634	A	6	6	230406	230411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_010634	CCA	2	6	230468	230473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4488	NC_010634	ACA	2	6	230585	230590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893551
4489	NC_010634	AG	3	6	230614	230619	50 %	0 %	50 %	0 %	186893551
4490	NC_010634	GTC	2	6	230679	230684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893551
4491	NC_010634	T	6	6	230691	230696	0 %	100 %	0 %	0 %	186893551
4492	NC_010634	GTG	2	6	230697	230702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893551
4493	NC_010634	TGG	2	6	230797	230802	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893551
4494	NC_010634	CCA	2	6	230865	230870	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893551
4495	NC_010634	GAT	2	6	230917	230922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893551
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