MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 93196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2003	NC_010634	CCA	2	6	102331	102336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893441
2004	NC_010634	ATC	2	6	102477	102482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_010634	CTG	2	6	102638	102643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893442
2006	NC_010634	AAAC	2	8	102659	102666	75 %	0 %	0 %	25 %	186893442
2007	NC_010634	TAA	2	6	102696	102701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893442
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2013	NC_010634	GCA	2	6	102917	102922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893442
2014	NC_010634	ATA	2	6	102954	102959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893442
2015	NC_010634	AACC	2	8	102976	102983	50 %	0 %	0 %	50 %	186893442
2016	NC_010634	GAA	2	6	102984	102989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893442
2017	NC_010634	GTAA	2	8	103047	103054	50 %	25 %	25 %	0 %	186893442
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2156	NC_010634	GTG	2	6	110421	110426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2248	NC_010634	GTTG	2	8	114073	114080	0 %	50 %	50 %	0 %	186893453
2249	NC_010634	TCA	2	6	114110	114115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893453
2250	NC_010634	CGT	2	6	114132	114137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893453
2251	NC_010634	ATA	2	6	114238	114243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893453
2252	NC_010634	TGA	2	6	114248	114253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893453
2253	NC_010634	TGGT	2	8	114271	114278	0 %	50 %	50 %	0 %	186893453
2254	NC_010634	CGCC	2	8	114353	114360	0 %	0 %	25 %	75 %	186893453
2255	NC_010634	TGA	2	6	114398	114403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893453
2256	NC_010634	CAA	2	6	114426	114431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893453
2257	NC_010634	TGG	2	6	114460	114465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893453
2258	NC_010634	CTTG	2	8	114506	114513	0 %	50 %	25 %	25 %	186893453
2259	NC_010634	ATT	2	6	114647	114652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893453
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2261	NC_010634	GAT	2	6	114840	114845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893453
2262	NC_010634	GATC	2	8	114905	114912	25 %	25 %	25 %	25 %	186893453
2263	NC_010634	CTG	2	6	114972	114977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893453
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2265	NC_010634	TGG	2	6	115084	115089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893453
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2271	NC_010634	CTG	2	6	115407	115412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893453
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2280	NC_010634	CTG	2	6	115996	116001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893453
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2282	NC_010634	GTAC	2	8	116160	116167	25 %	25 %	25 %	25 %	186893453
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2287	NC_010634	ATC	2	6	116425	116430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2288	NC_010634	ATAA	2	8	116510	116517	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2289	NC_010634	T	7	7	116568	116574	0 %	100 %	0 %	0 %	186893454
2290	NC_010634	GTCT	2	8	116606	116613	0 %	50 %	25 %	25 %	186893454
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2303	NC_010634	G	6	6	117457	117462	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2304	NC_010634	TGG	2	6	117479	117484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2306	NC_010634	TGG	2	6	117495	117500	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2307	NC_010634	TGG	2	6	117503	117508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2309	NC_010634	TGG	2	6	117519	117524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2310	NC_010634	TGG	2	6	117527	117532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2311	NC_010634	TGG	2	6	117535	117540	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2312	NC_010634	GTT	2	6	117564	117569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2321	NC_010634	GCT	2	6	117871	117876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2323	NC_010634	T	7	7	117936	117942	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2324	NC_010634	GA	3	6	117977	117982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2325	NC_010634	GC	3	6	118017	118022	0 %	0 %	50 %	50 %	186893456
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2336	NC_010634	CT	3	6	118727	118732	0 %	50 %	0 %	50 %	186893457
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2356	NC_010634	AGTTC	2	10	119642	119651	20 %	40 %	20 %	20 %	186893457
2357	NC_010634	GCTT	2	8	119665	119672	0 %	50 %	25 %	25 %	186893457
2358	NC_010634	ACGC	2	8	119796	119803	25 %	0 %	25 %	50 %	186893457
2359	NC_010634	CAA	2	6	119817	119822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893457
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2362	NC_010634	TTC	2	6	119995	120000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893457
2363	NC_010634	CAC	2	6	120032	120037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893457
2364	NC_010634	AGC	2	6	120142	120147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893457
2365	NC_010634	CCAT	2	8	120200	120207	25 %	25 %	0 %	50 %	186893457
2366	NC_010634	CCA	2	6	120320	120325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893457
2367	NC_010634	TCA	2	6	120346	120351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893457
2368	NC_010634	TCG	2	6	120379	120384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893457
2369	NC_010634	AACT	2	8	120402	120409	50 %	25 %	0 %	25 %	186893457
2370	NC_010634	ACG	2	6	120417	120422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893457
2371	NC_010634	TTG	2	6	120430	120435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893457
2372	NC_010634	CAGG	2	8	120474	120481	25 %	0 %	50 %	25 %	186893457
2373	NC_010634	GCG	2	6	120513	120518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893457
2374	NC_010634	TGGG	2	8	120531	120538	0 %	25 %	75 %	0 %	186893457
2375	NC_010634	AAT	2	6	120622	120627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893457
2376	NC_010634	AGT	2	6	120889	120894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893457
2377	NC_010634	GTTC	2	8	120935	120942	0 %	50 %	25 %	25 %	186893457
2378	NC_010634	GCTA	2	8	120990	120997	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2379	NC_010634	TCAC	2	8	121001	121008	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2380	NC_010634	CTTA	2	8	121033	121040	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2381	NC_010634	CTTA	2	8	121052	121059	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2382	NC_010634	ATTC	2	8	121075	121082	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2383	NC_010634	TGC	2	6	121086	121091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2384	NC_010634	A	7	7	121219	121225	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2385	NC_010634	CTG	2	6	121324	121329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893458
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2390	NC_010634	TGG	2	6	121758	121763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893458
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2392	NC_010634	C	6	6	121866	121871	0 %	0 %	0 %	100 %	186893458
2393	NC_010634	GCA	2	6	122006	122011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893458
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2398	NC_010634	TGAAC	2	10	122720	122729	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2399	NC_010634	TTG	2	6	122748	122753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893459
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2403	NC_010634	TG	3	6	123020	123025	0 %	50 %	50 %	0 %	186893459
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2440	NC_010634	ATT	2	6	124694	124699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2441	NC_010634	GACGAT	2	12	124700	124711	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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2443	NC_010634	GTAA	2	8	124766	124773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2444	NC_010634	AAC	2	6	124799	124804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2445	NC_010634	GCA	2	6	124889	124894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893462
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2450	NC_010634	CGG	2	6	125247	125252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893462
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2452	NC_010634	TGA	2	6	125392	125397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893462
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2462	NC_010634	GCCT	2	8	125793	125800	0 %	25 %	25 %	50 %	186893462
2463	NC_010634	AAG	2	6	125832	125837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893462
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2471	NC_010634	CGC	2	6	126180	126185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893462
2472	NC_010634	GGGC	2	8	126259	126266	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2473	NC_010634	TTA	2	6	126300	126305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2474	NC_010634	TAT	2	6	126319	126324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2475	NC_010634	TAA	2	6	126360	126365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2476	NC_010634	TCA	2	6	126392	126397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2477	NC_010634	GCG	2	6	126514	126519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2478	NC_010634	TGA	2	6	126523	126528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2479	NC_010634	AT	3	6	126555	126560	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2480	NC_010634	CTT	2	6	126580	126585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2481	NC_010634	TAA	2	6	126617	126622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_010634	GAAT	2	8	126641	126648	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2483	NC_010634	AC	3	6	126681	126686	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2484	NC_010634	TATT	2	8	126703	126710	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2485	NC_010634	CTT	2	6	126720	126725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2486	NC_010634	ATG	2	6	126758	126763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2487	NC_010634	TTG	2	6	126775	126780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2488	NC_010634	ATT	2	6	126796	126801	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2489	NC_010634	ATA	2	6	126835	126840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893463
2490	NC_010634	A	7	7	126852	126858	100 %	0 %	0 %	0 %	186893463
2491	NC_010634	AAT	2	6	126860	126865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893463
2492	NC_010634	TAT	2	6	126892	126897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893463
2493	NC_010634	TAA	3	9	126959	126967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893463
2494	NC_010634	AT	3	6	127029	127034	50 %	50 %	0 %	0 %	186893463
2495	NC_010634	AAC	2	6	127069	127074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893463
2496	NC_010634	CAA	2	6	127146	127151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893463
2497	NC_010634	AATA	2	8	127166	127173	75 %	25 %	0 %	0 %	186893463
2498	NC_010634	TGG	2	6	127331	127336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893463
2499	NC_010634	T	6	6	127388	127393	0 %	100 %	0 %	0 %	186893463
2500	NC_010634	GGGC	2	8	127412	127419	0 %	0 %	75 %	25 %	186893463

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