MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pseudotuberculosis PB1/+ chromosome

Total Repeats: 93196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_010634	CCGTAC	2	12	78245	78256	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	186893418
1502	NC_010634	GCTG	2	8	78264	78271	0 %	25 %	50 %	25 %	186893418
1503	NC_010634	CCAG	2	8	78283	78290	25 %	0 %	25 %	50 %	186893418
1504	NC_010634	GTTG	2	8	78325	78332	0 %	50 %	50 %	0 %	186893418
1505	NC_010634	CTG	2	6	78383	78388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893418
1506	NC_010634	ATT	2	6	78430	78435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893418
1507	NC_010634	AGCG	2	8	78457	78464	25 %	0 %	50 %	25 %	186893418
1508	NC_010634	CAT	2	6	78505	78510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893418
1509	NC_010634	GAG	2	6	78578	78583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186893418
1510	NC_010634	TGA	2	6	78588	78593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893418
1511	NC_010634	GAA	3	9	78758	78766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893418
1512	NC_010634	CTT	2	6	78894	78899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_010634	TCA	2	6	78907	78912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_010634	TGA	2	6	78940	78945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_010634	AAT	2	6	78951	78956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_010634	TCA	2	6	78961	78966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1517	NC_010634	AAAT	2	8	78971	78978	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_010634	CGG	2	6	79050	79055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1519	NC_010634	AC	3	6	79155	79160	50 %	0 %	0 %	50 %	186893419
1520	NC_010634	ATT	2	6	79214	79219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893419
1521	NC_010634	TGG	2	6	79227	79232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_010634	T	8	8	79237	79244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_010634	TAA	2	6	79290	79295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_010634	TGG	2	6	79439	79444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893420
1525	NC_010634	GGC	2	6	79468	79473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893420
1526	NC_010634	TGG	2	6	79488	79493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893420
1527	NC_010634	CT	3	6	79504	79509	0 %	50 %	0 %	50 %	186893420
1528	NC_010634	CT	3	6	79534	79539	0 %	50 %	0 %	50 %	186893420
1529	NC_010634	CTG	2	6	79545	79550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893420
1530	NC_010634	GAA	2	6	79553	79558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893420
1531	NC_010634	GGC	2	6	79591	79596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893420
1532	NC_010634	GTA	2	6	79760	79765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893420
1533	NC_010634	AC	3	6	79772	79777	50 %	0 %	0 %	50 %	186893420
1534	NC_010634	TGA	2	6	79824	79829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893420
1535	NC_010634	TGA	3	9	79981	79989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893420
1536	NC_010634	GCA	2	6	79993	79998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893420
1537	NC_010634	CCG	2	6	80056	80061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893420
1538	NC_010634	GGA	2	6	80101	80106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	186893420
1539	NC_010634	ATG	2	6	80108	80113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893420
1540	NC_010634	TCA	2	6	80194	80199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893420
1541	NC_010634	TGT	2	6	80212	80217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893420
1542	NC_010634	AT	3	6	80270	80275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_010634	TGA	2	6	80278	80283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_010634	GTG	3	9	80497	80505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893421
1545	NC_010634	TGC	2	6	80522	80527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893421
1546	NC_010634	GTT	2	6	80538	80543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893421
1547	NC_010634	CAG	2	6	80557	80562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893421
1548	NC_010634	GAA	2	6	80618	80623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893421
1549	NC_010634	GTT	2	6	80763	80768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893421
1550	NC_010634	GGT	2	6	80772	80777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893421
1551	NC_010634	CTG	2	6	80802	80807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893421
1552	NC_010634	AAG	2	6	80812	80817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893421
1553	NC_010634	T	6	6	80888	80893	0 %	100 %	0 %	0 %	186893421
1554	NC_010634	CTT	2	6	80944	80949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893421
1555	NC_010634	CCA	2	6	80951	80956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893421
1556	NC_010634	GGT	2	6	81024	81029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893421
1557	NC_010634	TGA	2	6	81068	81073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893421
1558	NC_010634	TTG	2	6	81124	81129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893421
1559	NC_010634	GAT	2	6	81147	81152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893421
1560	NC_010634	GTG	3	9	81229	81237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893421
1561	NC_010634	CTG	2	6	81294	81299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893421
1562	NC_010634	A	6	6	81318	81323	100 %	0 %	0 %	0 %	186893421
1563	NC_010634	GGT	2	6	81324	81329	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893421
1564	NC_010634	AATT	2	8	81367	81374	50 %	50 %	0 %	0 %	186893421
1565	NC_010634	TG	3	6	81377	81382	0 %	50 %	50 %	0 %	186893421
1566	NC_010634	AGA	2	6	81416	81421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893421
1567	NC_010634	GAA	2	6	81437	81442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893421
1568	NC_010634	CTCG	2	8	81461	81468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1569	NC_010634	AT	3	6	81549	81554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_010634	T	6	6	81577	81582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_010634	CCAA	2	8	81627	81634	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_010634	AAT	2	6	81648	81653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_010634	T	7	7	81653	81659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_010634	GAG	2	6	81660	81665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_010634	TTG	2	6	81706	81711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893422
1576	NC_010634	ATT	2	6	81741	81746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893422
1577	NC_010634	AGTA	2	8	81802	81809	50 %	25 %	25 %	0 %	186893422
1578	NC_010634	GGC	2	6	81856	81861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893422
1579	NC_010634	ATG	2	6	81929	81934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893422
1580	NC_010634	CAA	2	6	82013	82018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	186893422
1581	NC_010634	ATT	2	6	82136	82141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	186893422
1582	NC_010634	GGC	2	6	82143	82148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893422
1583	NC_010634	ATA	3	9	82169	82177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893422
1584	NC_010634	TTG	2	6	82268	82273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893422
1585	NC_010634	TGAA	2	8	82328	82335	50 %	25 %	25 %	0 %	186893422
1586	NC_010634	GT	3	6	82370	82375	0 %	50 %	50 %	0 %	186893422
1587	NC_010634	GGT	2	6	82401	82406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893422
1588	NC_010634	CAG	2	6	82523	82528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893422
1589	NC_010634	TGG	2	6	82590	82595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893422
1590	NC_010634	CGG	2	6	82629	82634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	186893422
1591	NC_010634	TGA	2	6	82641	82646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893422
1592	NC_010634	CAT	2	6	82710	82715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_010634	TGT	2	6	82811	82816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893423
1594	NC_010634	GCT	2	6	82842	82847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893423
1595	NC_010634	CTG	2	6	83022	83027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893424
1596	NC_010634	TGG	2	6	83164	83169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	186893424
1597	NC_010634	TCAG	2	8	83225	83232	25 %	25 %	25 %	25 %	186893424
1598	NC_010634	CGC	2	6	83238	83243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	186893424
1599	NC_010634	GCT	2	6	83305	83310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893424
1600	NC_010634	CTT	2	6	83331	83336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	186893424
1601	NC_010634	AATC	2	8	83400	83407	50 %	25 %	0 %	25 %	186893424
1602	NC_010634	CAC	2	6	83437	83442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893424
1603	NC_010634	CTC	2	6	83484	83489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	186893424
1604	NC_010634	TTG	2	6	83521	83526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893424
1605	NC_010634	CGA	2	6	83572	83577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	186893424
1606	NC_010634	TCG	2	6	83600	83605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893424
1607	NC_010634	TGC	2	6	83623	83628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893424
1608	NC_010634	AT	3	6	83691	83696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_010634	TAT	2	6	83703	83708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_010634	AATA	2	8	83783	83790	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_010634	CCA	2	6	83830	83835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893425
1612	NC_010634	CAC	2	6	83897	83902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893425
1613	NC_010634	GTT	2	6	83911	83916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	186893425
1614	NC_010634	GAT	2	6	83932	83937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893425
1615	NC_010634	ACC	2	6	83947	83952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893425
1616	NC_010634	CAC	2	6	83970	83975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	186893425
1617	NC_010634	TCG	2	6	83985	83990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	186893425
1618	NC_010634	ATA	2	6	84107	84112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893425
1619	NC_010634	GCCA	2	8	84185	84192	25 %	0 %	25 %	50 %	186893425
1620	NC_010634	ATG	2	6	84233	84238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	186893425
1621	NC_010634	CCAAA	2	10	84242	84251	60 %	0 %	0 %	40 %	186893425
1622	NC_010634	GAA	2	6	84279	84284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893425
1623	NC_010634	CAT	2	6	84285	84290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	186893425
1624	NC_010634	TGCCAT	2	12	84322	84333	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	186893425
1625	NC_010634	AAT	2	6	84374	84379	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	186893425
1626	NC_010634	AGA	2	6	84410	84415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	186893425
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1628	NC_010634	T	7	7	84492	84498	0 %	100 %	0 %	0 %	186893425
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1995	NC_010634	GATAA	2	10	101953	101962	60 %	20 %	20 %	0 %	186893441
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