MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 11651

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010159	TTTA	2	8	7	14	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010159	TTCG	2	8	245	252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_010159	AACC	2	8	443	450	50 %	0 %	0 %	50 %	162418840
4	NC_010159	GTGC	2	8	1194	1201	0 %	25 %	50 %	25 %	162418440
5	NC_010159	CATT	2	8	1644	1651	25 %	50 %	0 %	25 %	162419901
6	NC_010159	ATTC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	162419901
7	NC_010159	ATCA	2	8	2269	2276	50 %	25 %	0 %	25 %	162419901
8	NC_010159	TTTA	2	8	2762	2769	25 %	75 %	0 %	0 %	162419510
9	NC_010159	GTTG	2	8	2815	2822	0 %	50 %	50 %	0 %	162419510
10	NC_010159	ACTC	2	8	3148	3155	25 %	25 %	0 %	50 %	162419510
11	NC_010159	CTGG	2	8	3241	3248	0 %	25 %	50 %	25 %	162419510
12	NC_010159	ATTC	2	8	3772	3779	25 %	50 %	0 %	25 %	162419510
13	NC_010159	GCCA	2	8	4098	4105	25 %	0 %	25 %	50 %	162419989
14	NC_010159	TAAA	2	8	4117	4124	75 %	25 %	0 %	0 %	162419989
15	NC_010159	TGGC	2	8	4247	4254	0 %	25 %	50 %	25 %	162419989
16	NC_010159	CTGT	2	8	4455	4462	0 %	50 %	25 %	25 %	162419989
17	NC_010159	AGTG	2	8	4523	4530	25 %	25 %	50 %	0 %	162419989
18	NC_010159	TCAA	2	8	4875	4882	50 %	25 %	0 %	25 %	162419989
19	NC_010159	TTCT	2	8	5503	5510	0 %	75 %	0 %	25 %	162419989
20	NC_010159	GTTG	2	8	7074	7081	0 %	50 %	50 %	0 %	162419440
21	NC_010159	AATG	2	8	7255	7262	50 %	25 %	25 %	0 %	162419440
22	NC_010159	TTAT	2	8	7577	7584	25 %	75 %	0 %	0 %	162419440
23	NC_010159	CCCA	2	8	7630	7637	25 %	0 %	0 %	75 %	162419440
24	NC_010159	AATA	2	8	8340	8347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_010159	CCCG	2	8	8851	8858	0 %	0 %	25 %	75 %	162420036
26	NC_010159	TAAA	2	8	10665	10672	75 %	25 %	0 %	0 %	162421578
27	NC_010159	GCCA	2	8	10715	10722	25 %	0 %	25 %	50 %	162421578
28	NC_010159	AAAG	2	8	10861	10868	75 %	0 %	25 %	0 %	162421578
29	NC_010159	AAGG	2	8	10884	10891	50 %	0 %	50 %	0 %	162421578
30	NC_010159	AATT	2	8	11198	11205	50 %	50 %	0 %	0 %	162418549
31	NC_010159	AGTA	2	8	11637	11644	50 %	25 %	25 %	0 %	162418549
32	NC_010159	GAAA	2	8	11943	11950	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_010159	AACG	2	8	12035	12042	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_010159	GGCA	2	8	12106	12113	25 %	0 %	50 %	25 %	162419929
35	NC_010159	CAAA	2	8	12237	12244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_010159	GTAG	2	8	13684	13691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_010159	CTGA	2	8	14691	14698	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_010159	GTAC	2	8	14775	14782	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_010159	CGTC	2	8	15215	15222	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_010159	AAAG	2	8	15338	15345	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_010159	GCTG	2	8	16019	16026	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_010159	AGCT	2	8	16594	16601	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_010159	TTAA	2	8	17253	17260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_010159	AGGT	2	8	17554	17561	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010159	GATA	2	8	17693	17700	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_010159	TGGC	2	8	18556	18563	0 %	25 %	50 %	25 %	162420022
47	NC_010159	ATTG	2	8	19408	19415	25 %	50 %	25 %	0 %	162420544
48	NC_010159	GCAT	2	8	20092	20099	25 %	25 %	25 %	25 %	162420127
49	NC_010159	TCAC	2	8	20200	20207	25 %	25 %	0 %	50 %	162420127
50	NC_010159	ATTG	2	8	20516	20523	25 %	50 %	25 %	0 %	162421614
51	NC_010159	TATC	2	8	20642	20649	25 %	50 %	0 %	25 %	162421614
52	NC_010159	GCCC	2	8	21279	21286	0 %	0 %	25 %	75 %	162421169
53	NC_010159	GCAA	2	8	22126	22133	50 %	0 %	25 %	25 %	162418848
54	NC_010159	TGTT	2	8	22378	22385	0 %	75 %	25 %	0 %	162418848
55	NC_010159	ATTT	2	8	22532	22539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_010159	ATAA	2	8	22717	22724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_010159	ACCG	2	8	23220	23227	25 %	0 %	25 %	50 %	162418335
58	NC_010159	TCCC	2	8	23493	23500	0 %	25 %	0 %	75 %	162418335
59	NC_010159	TGGG	2	8	23604	23611	0 %	25 %	75 %	0 %	162418335
60	NC_010159	AGAC	2	8	23739	23746	50 %	0 %	25 %	25 %	162418335
61	NC_010159	TGGC	2	8	23840	23847	0 %	25 %	50 %	25 %	162418335
62	NC_010159	ATTG	2	8	24625	24632	25 %	50 %	25 %	0 %	162418335
63	NC_010159	GCTG	2	8	24829	24836	0 %	25 %	50 %	25 %	162418335
64	NC_010159	TCAC	2	8	25474	25481	25 %	25 %	0 %	50 %	162418335
65	NC_010159	TGGT	2	8	25582	25589	0 %	50 %	50 %	0 %	162418335
66	NC_010159	ACCG	2	8	26422	26429	25 %	0 %	25 %	50 %	162420510
67	NC_010159	GTTA	2	8	26689	26696	25 %	50 %	25 %	0 %	162420510
68	NC_010159	GGAT	2	8	29188	29195	25 %	25 %	50 %	0 %	162421654
69	NC_010159	ACTG	2	8	30767	30774	25 %	25 %	25 %	25 %	162421177
70	NC_010159	CGGG	2	8	30783	30790	0 %	0 %	75 %	25 %	162421177
71	NC_010159	TTTG	2	8	30967	30974	0 %	75 %	25 %	0 %	162421177
72	NC_010159	CCAT	2	8	30987	30994	25 %	25 %	0 %	50 %	162421177
73	NC_010159	CAGT	2	8	31099	31106	25 %	25 %	25 %	25 %	162421177
74	NC_010159	GATA	2	8	31275	31282	50 %	25 %	25 %	0 %	162418453
75	NC_010159	AAAT	2	8	32357	32364	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_010159	TTAC	2	8	32466	32473	25 %	50 %	0 %	25 %	162421858
77	NC_010159	TCGC	2	8	33150	33157	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_010159	ACGC	2	8	33237	33244	25 %	0 %	25 %	50 %	162418660
79	NC_010159	GCCA	2	8	33465	33472	25 %	0 %	25 %	50 %	162418660
80	NC_010159	TGCG	2	8	33855	33862	0 %	25 %	50 %	25 %	162418660
81	NC_010159	AGCG	2	8	34815	34822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_010159	ATGG	2	8	35465	35472	25 %	25 %	50 %	0 %	162420145
83	NC_010159	CGAC	2	8	35619	35626	25 %	0 %	25 %	50 %	162420145
84	NC_010159	CTGT	2	8	36059	36066	0 %	50 %	25 %	25 %	162420145
85	NC_010159	GCTG	2	8	36298	36305	0 %	25 %	50 %	25 %	162420145
86	NC_010159	TCAC	2	8	36739	36746	25 %	25 %	0 %	50 %	162420145
87	NC_010159	CAAT	2	8	36908	36915	50 %	25 %	0 %	25 %	162420145
88	NC_010159	CCTG	2	8	37217	37224	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_010159	TGCC	2	8	38232	38239	0 %	25 %	25 %	50 %	162419107
90	NC_010159	CTGG	2	8	38497	38504	0 %	25 %	50 %	25 %	162419107
91	NC_010159	TCTG	2	8	39437	39444	0 %	50 %	25 %	25 %	162420449
92	NC_010159	CTGA	2	8	39636	39643	25 %	25 %	25 %	25 %	162420449
93	NC_010159	TGAG	2	8	39887	39894	25 %	25 %	50 %	0 %	162420449
94	NC_010159	CAGC	2	8	40056	40063	25 %	0 %	25 %	50 %	162420449
95	NC_010159	GAAT	2	8	40568	40575	50 %	25 %	25 %	0 %	162420449
96	NC_010159	GCGA	2	8	40623	40630	25 %	0 %	50 %	25 %	162420449
97	NC_010159	CGTT	2	8	40947	40954	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_010159	TTTG	2	8	41504	41511	0 %	75 %	25 %	0 %	162421692
99	NC_010159	TAAT	2	8	42058	42065	50 %	50 %	0 %	0 %	162421692
100	NC_010159	AGCC	2	8	42139	42146	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_010159	TGAT	2	8	42242	42249	25 %	50 %	25 %	0 %	162421773
102	NC_010159	GGGT	2	8	42291	42298	0 %	25 %	75 %	0 %	162421773
103	NC_010159	TGTT	2	8	42769	42776	0 %	75 %	25 %	0 %	162421773
104	NC_010159	ATCA	2	8	43111	43118	50 %	25 %	0 %	25 %	162421773
105	NC_010159	CTGG	2	8	43480	43487	0 %	25 %	50 %	25 %	162421773
106	NC_010159	TCAG	2	8	43628	43635	25 %	25 %	25 %	25 %	162421773
107	NC_010159	AGCC	2	8	43805	43812	25 %	0 %	25 %	50 %	162421773
108	NC_010159	TGTC	2	8	43921	43928	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_010159	GACC	2	8	44022	44029	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_010159	CGGT	2	8	45355	45362	0 %	25 %	50 %	25 %	162418696
111	NC_010159	TGGG	2	8	46190	46197	0 %	25 %	75 %	0 %	162418297
112	NC_010159	GGTT	2	8	46384	46391	0 %	50 %	50 %	0 %	162418297
113	NC_010159	TTTG	2	8	46420	46427	0 %	75 %	25 %	0 %	162418297
114	NC_010159	CAGC	2	8	46466	46473	25 %	0 %	25 %	50 %	162418297
115	NC_010159	ACCG	2	8	46759	46766	25 %	0 %	25 %	50 %	162418297
116	NC_010159	GTTA	2	8	46924	46931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_010159	ATGA	2	8	46987	46994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_010159	ATGA	2	8	47170	47177	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_010159	TGGA	2	8	48078	48085	25 %	25 %	50 %	0 %	162419548
120	NC_010159	GCCA	2	8	48282	48289	25 %	0 %	25 %	50 %	162419548
121	NC_010159	TCGG	2	8	48361	48368	0 %	25 %	50 %	25 %	162419548
122	NC_010159	CAGG	2	8	48755	48762	25 %	0 %	50 %	25 %	162419548
123	NC_010159	CAGA	2	8	49736	49743	50 %	0 %	25 %	25 %	162419568
124	NC_010159	CTGC	2	8	49834	49841	0 %	25 %	25 %	50 %	162419568
125	NC_010159	GATG	2	8	49895	49902	25 %	25 %	50 %	0 %	162419568
126	NC_010159	CAGA	2	8	49962	49969	50 %	0 %	25 %	25 %	162419568
127	NC_010159	AACC	2	8	50369	50376	50 %	0 %	0 %	50 %	162419160
128	NC_010159	GTGA	2	8	52004	52011	25 %	25 %	50 %	0 %	162419160
129	NC_010159	CTCG	2	8	53225	53232	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_010159	AGCC	2	8	53788	53795	25 %	0 %	25 %	50 %	162420613
131	NC_010159	ATTT	2	8	54021	54028	25 %	75 %	0 %	0 %	162420613
132	NC_010159	GATG	2	8	54096	54103	25 %	25 %	50 %	0 %	162420613
133	NC_010159	GCAA	2	8	54111	54118	50 %	0 %	25 %	25 %	162420613
134	NC_010159	GGCA	2	8	54419	54426	25 %	0 %	50 %	25 %	162420613
135	NC_010159	TTAA	2	8	54880	54887	50 %	50 %	0 %	0 %	162420613
136	NC_010159	GTTG	2	8	55010	55017	0 %	50 %	50 %	0 %	162420613
137	NC_010159	CAGG	2	8	55273	55280	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_010159	TTTC	2	8	55419	55426	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_010159	CCAA	2	8	55687	55694	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_010159	GTTA	2	8	55952	55959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_010159	CATT	2	8	55979	55986	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_010159	ATTT	2	8	55989	55996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_010159	AATC	2	8	56165	56172	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_010159	TCAA	2	8	56297	56304	50 %	25 %	0 %	25 %	162421145
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