MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 58788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010159	TTA	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_010159	TTA	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_010159	ATT	2	6	68	73	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_010159	AGG	2	6	96	101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_010159	TGT	2	6	108	113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_010159	GTT	2	6	190	195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_010159	CTG	2	6	305	310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418840
8	NC_010159	TTG	2	6	387	392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
9	NC_010159	TGT	2	6	484	489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418840
10	NC_010159	TAA	2	6	501	506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418840
11	NC_010159	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418840
12	NC_010159	TCA	2	6	867	872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418440
13	NC_010159	TTG	2	6	885	890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
14	NC_010159	CTG	2	6	899	904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
15	NC_010159	TAA	2	6	934	939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418440
16	NC_010159	GTG	2	6	957	962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418440
17	NC_010159	CTT	2	6	979	984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162418440
18	NC_010159	AGC	2	6	1051	1056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418440
19	NC_010159	CGT	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
20	NC_010159	GTT	2	6	1072	1077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418440
21	NC_010159	TGC	2	6	1225	1230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418440
22	NC_010159	ATT	2	6	1315	1320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_010159	ACA	3	9	1457	1465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
24	NC_010159	CAA	2	6	1506	1511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
25	NC_010159	GCG	2	6	1878	1883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419901
26	NC_010159	TGG	2	6	2036	2041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419901
27	NC_010159	ATG	2	6	2065	2070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
28	NC_010159	ATG	2	6	2086	2091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419901
29	NC_010159	ATT	2	6	2139	2144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419901
30	NC_010159	TCT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419901
31	NC_010159	TGC	2	6	2344	2349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
32	NC_010159	ACA	2	6	2354	2359	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419901
33	NC_010159	CTG	2	6	2418	2423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419901
34	NC_010159	GGC	2	6	2505	2510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_010159	GCG	2	6	2537	2542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
36	NC_010159	TGG	2	6	2649	2654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
37	NC_010159	CTG	3	9	2657	2665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
38	NC_010159	GCC	2	6	2787	2792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419510
39	NC_010159	ACC	2	6	2801	2806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
40	NC_010159	ATT	2	6	2874	2879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419510
41	NC_010159	ATG	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
42	NC_010159	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
43	NC_010159	TCA	2	6	3030	3035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419510
44	NC_010159	GCG	2	6	3125	3130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419510
45	NC_010159	AAT	2	6	3183	3188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419510
46	NC_010159	TGA	2	6	3207	3212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
47	NC_010159	CCT	2	6	3223	3228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
48	NC_010159	GCA	2	6	3376	3381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
49	NC_010159	TGG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419510
50	NC_010159	CAC	2	6	3475	3480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
51	NC_010159	AAC	2	6	3534	3539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419510
52	NC_010159	TGA	3	9	3540	3548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419510
53	NC_010159	TCC	2	6	3741	3746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419510
54	NC_010159	GTT	2	6	3814	3819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419510
55	NC_010159	TGC	2	6	3905	3910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419510
56	NC_010159	ACC	2	6	3921	3926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419510
57	NC_010159	CAG	2	6	3959	3964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419510
58	NC_010159	TGT	2	6	4014	4019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
59	NC_010159	GTT	2	6	4030	4035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
60	NC_010159	TTG	2	6	4046	4051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
61	NC_010159	CCA	2	6	4066	4071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419989
62	NC_010159	GAT	2	6	4107	4112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
63	NC_010159	GTT	2	6	4153	4158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419989
64	NC_010159	CAG	3	9	4190	4198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
65	NC_010159	TGG	2	6	4202	4207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
66	NC_010159	ATC	2	6	4286	4291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
67	NC_010159	GAT	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
68	NC_010159	TGG	2	6	4533	4538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
69	NC_010159	TGC	2	6	4545	4550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
70	NC_010159	TAA	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419989
71	NC_010159	CAA	2	6	4628	4633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419989
72	NC_010159	TCA	2	6	4722	4727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
73	NC_010159	GAA	2	6	4736	4741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419989
74	NC_010159	GTA	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
75	NC_010159	CTT	2	6	4769	4774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
76	NC_010159	GCG	2	6	4778	4783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
77	NC_010159	TGG	2	6	4893	4898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419989
78	NC_010159	TTC	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
79	NC_010159	CTG	2	6	4956	4961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
80	NC_010159	CAG	2	6	4964	4969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419989
81	NC_010159	GCT	2	6	5045	5050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
82	NC_010159	CTT	3	9	5251	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419989
83	NC_010159	TCA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419989
84	NC_010159	GCG	2	6	5360	5365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419989
85	NC_010159	GGA	2	6	5391	5396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419989
86	NC_010159	TGC	2	6	5426	5431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419989
87	NC_010159	GAT	2	6	5520	5525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419989
88	NC_010159	TGA	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_010159	TTG	2	6	5614	5619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_010159	ATC	2	6	5637	5642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_010159	ATT	2	6	5644	5649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_010159	AAT	2	6	5709	5714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_010159	TCT	2	6	5755	5760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_010159	GTC	2	6	5993	5998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
95	NC_010159	AGG	2	6	6046	6051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162419440
96	NC_010159	TGG	2	6	6111	6116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
97	NC_010159	TGG	2	6	6130	6135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
98	NC_010159	CTT	2	6	6139	6144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
99	NC_010159	CGC	2	6	6208	6213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419440
100	NC_010159	TAT	2	6	6367	6372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
101	NC_010159	CGT	2	6	6564	6569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
102	NC_010159	ATT	2	6	6579	6584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
103	NC_010159	TTA	2	6	6599	6604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
104	NC_010159	CTT	2	6	6634	6639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162419440
105	NC_010159	ACC	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
106	NC_010159	ATT	2	6	6782	6787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
107	NC_010159	GGT	2	6	6853	6858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
108	NC_010159	GGC	3	9	6895	6903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
109	NC_010159	TCG	2	6	6993	6998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
110	NC_010159	TTG	2	6	7016	7021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419440
111	NC_010159	ATT	2	6	7060	7065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
112	NC_010159	TAT	3	9	7108	7116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
113	NC_010159	ACC	2	6	7118	7123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419440
114	NC_010159	GAT	2	6	7186	7191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
115	NC_010159	CGG	2	6	7233	7238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419440
116	NC_010159	ATT	2	6	7276	7281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419440
117	NC_010159	GGT	2	6	7411	7416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419440
118	NC_010159	GAT	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419440
119	NC_010159	CGT	2	6	7506	7511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419440
120	NC_010159	ATC	2	6	7708	7713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_010159	TAT	2	6	7722	7727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_010159	CAT	2	6	7728	7733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_010159	CTT	3	9	7756	7764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_010159	TCT	2	6	7819	7824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_010159	ACC	2	6	7985	7990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420591
126	NC_010159	AGA	2	6	8089	8094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420591
127	NC_010159	AAT	2	6	8105	8110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420591
128	NC_010159	TGC	2	6	8136	8141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420591
129	NC_010159	TGG	2	6	8366	8371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420036
130	NC_010159	GCA	2	6	8445	8450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420036
131	NC_010159	TGC	2	6	8493	8498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420036
132	NC_010159	GAT	2	6	8545	8550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
133	NC_010159	CGC	2	6	8722	8727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420036
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138	NC_010159	GAT	3	9	8950	8958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420036
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149	NC_010159	ATT	2	6	9502	9507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421578
150	NC_010159	GAT	2	6	9593	9598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421578
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245	NC_010159	ATG	2	6	17581	17586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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261	NC_010159	GAC	2	6	19027	19032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420022
262	NC_010159	GTT	2	6	19045	19050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420022
263	NC_010159	TAT	2	6	19125	19130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162420022
264	NC_010159	CGT	2	6	19309	19314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420544
265	NC_010159	TGT	2	6	19499	19504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420544
266	NC_010159	TAA	2	6	19684	19689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162420544
267	NC_010159	GCG	2	6	19731	19736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420544
268	NC_010159	TCA	2	6	19749	19754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420544
269	NC_010159	CTG	2	6	19790	19795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420127
270	NC_010159	TCA	2	6	19960	19965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420127
271	NC_010159	GCA	2	6	20543	20548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162421614
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273	NC_010159	GAA	2	6	20709	20714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162421614
274	NC_010159	ATT	2	6	20748	20753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162421614
275	NC_010159	ATT	2	6	20800	20805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_010159	TAT	2	6	20806	20811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_010159	TGT	2	6	20846	20851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_010159	AAC	2	6	20856	20861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162421169
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287	NC_010159	CAT	2	6	21775	21780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421169
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289	NC_010159	AGA	2	6	22210	22215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418848
290	NC_010159	GTG	2	6	22273	22278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418848
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294	NC_010159	ATG	2	6	22408	22413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418848
295	NC_010159	TGT	2	6	22460	22465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418848
296	NC_010159	CTG	2	6	22473	22478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418848
297	NC_010159	AAT	2	6	22486	22491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162418848
298	NC_010159	TTG	2	6	22514	22519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
299	NC_010159	TAA	2	6	22628	22633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_010159	TTG	3	9	22679	22687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
301	NC_010159	GAA	2	6	22971	22976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_010159	TTG	2	6	23013	23018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418335
303	NC_010159	CAC	2	6	23058	23063	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418335
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338	NC_010159	ATC	2	6	26152	26157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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346	NC_010159	GTC	2	6	26964	26969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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391	NC_010159	TGA	2	6	29913	29918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162421177
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