MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010159	GCG	2	6	181290	181295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419253
3502	NC_010159	TAA	2	6	181296	181301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419253
3503	NC_010159	TAAG	2	8	181362	181369	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_010159	CAGT	2	8	181395	181402	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3505	NC_010159	GTA	2	6	181440	181445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_010159	A	6	6	181631	181636	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3507	NC_010159	GGC	2	6	181640	181645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_010159	AAT	2	6	181673	181678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_010159	GCAG	2	8	181686	181693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3510	NC_010159	GAA	2	6	181724	181729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_010159	GC	3	6	181750	181755	0 %	0 %	50 %	50 %	162420621
3512	NC_010159	GAAT	2	8	181771	181778	50 %	25 %	25 %	0 %	162420621
3513	NC_010159	T	6	6	181808	181813	0 %	100 %	0 %	0 %	162420621
3514	NC_010159	CCA	2	6	181826	181831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420621
3515	NC_010159	GGT	2	6	181838	181843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420621
3516	NC_010159	CGT	2	6	181871	181876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420621
3517	NC_010159	TCA	2	6	181951	181956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420621
3518	NC_010159	CGG	2	6	181976	181981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162420621
3519	NC_010159	GGT	2	6	181998	182003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420621
3520	NC_010159	TGC	2	6	182144	182149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420621
3521	NC_010159	CCG	2	6	182191	182196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420621
3522	NC_010159	CGG	2	6	182341	182346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_010159	CCA	2	6	182531	182536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3524	NC_010159	CAGC	2	8	182541	182548	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3525	NC_010159	TGG	2	6	182591	182596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_010159	CGC	2	6	182712	182717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_010159	GCG	2	6	182723	182728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_010159	C	6	6	182741	182746	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3529	NC_010159	TCA	2	6	182794	182799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_010159	AGC	2	6	182800	182805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_010159	ACCGCC	2	12	182824	182835	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_010159	AAT	2	6	182849	182854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_010159	GCT	2	6	182928	182933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_010159	CCA	2	6	182942	182947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3535	NC_010159	CGC	2	6	182949	182954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_010159	GAC	2	6	182998	183003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_010159	GCG	2	6	183064	183069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_010159	GGC	2	6	183070	183075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_010159	GCC	2	6	183115	183120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_010159	TGC	2	6	183127	183132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_010159	AGGC	2	8	183140	183147	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_010159	CTG	2	6	183171	183176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_010159	AAT	2	6	183180	183185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_010159	G	6	6	183200	183205	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_010159	GCA	2	6	183236	183241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_010159	GCTG	2	8	183263	183270	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3547	NC_010159	ACGGC	2	10	183307	183316	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3548	NC_010159	AG	3	6	183340	183345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_010159	GCG	2	6	183377	183382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3550	NC_010159	CTG	3	9	183387	183395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_010159	TGC	2	6	183437	183442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_010159	GGC	2	6	183464	183469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_010159	CGG	2	6	183515	183520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_010159	CAG	2	6	183522	183527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_010159	TGC	2	6	183544	183549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_010159	CAT	2	6	183561	183566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_010159	CAG	2	6	183603	183608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3558	NC_010159	ATC	2	6	183639	183644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3559	NC_010159	CAGC	2	8	183651	183658	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3560	NC_010159	CAC	2	6	183713	183718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_010159	ACC	2	6	183727	183732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_010159	AGA	2	6	183754	183759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_010159	GCC	2	6	183815	183820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_010159	CAC	2	6	183852	183857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_010159	CAGC	2	8	183870	183877	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3566	NC_010159	CCA	2	6	183957	183962	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3567	NC_010159	CAC	2	6	184029	184034	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419888
3568	NC_010159	CAGC	2	8	184054	184061	25 %	0 %	25 %	50 %	162419888
3569	NC_010159	GGC	2	6	184112	184117	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419888
3570	NC_010159	GATC	2	8	184177	184184	25 %	25 %	25 %	25 %	162419888
3571	NC_010159	GCC	2	6	184203	184208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419888
3572	NC_010159	CCG	2	6	184221	184226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419888
3573	NC_010159	CG	3	6	184268	184273	0 %	0 %	50 %	50 %	162419888
3574	NC_010159	GC	3	6	184299	184304	0 %	0 %	50 %	50 %	162419888
3575	NC_010159	A	6	6	184344	184349	100 %	0 %	0 %	0 %	162419888
3576	NC_010159	CAC	2	6	184371	184376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419888
3577	NC_010159	CAT	2	6	184387	184392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419888
3578	NC_010159	CAG	2	6	184424	184429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419888
3579	NC_010159	CA	3	6	184517	184522	50 %	0 %	0 %	50 %	162419888
3580	NC_010159	TGCC	2	8	184535	184542	0 %	25 %	25 %	50 %	162419888
3581	NC_010159	G	6	6	184629	184634	0 %	0 %	100 %	0 %	162419888
3582	NC_010159	AC	3	6	184716	184721	50 %	0 %	0 %	50 %	162418981
3583	NC_010159	CAT	2	6	184735	184740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418981
3584	NC_010159	CGC	2	6	184747	184752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418981
3585	NC_010159	GGC	2	6	184804	184809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418981
3586	NC_010159	CAC	2	6	184858	184863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418981
3587	NC_010159	CG	3	6	184996	185001	0 %	0 %	50 %	50 %	162418981
3588	NC_010159	TGAT	2	8	185006	185013	25 %	50 %	25 %	0 %	162418981
3589	NC_010159	CCA	2	6	185040	185045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418981
3590	NC_010159	GGCT	2	8	185058	185065	0 %	25 %	50 %	25 %	162418981
3591	NC_010159	CAG	2	6	185068	185073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3592	NC_010159	CAG	2	6	185080	185085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3593	NC_010159	AAC	2	6	185090	185095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418981
3594	NC_010159	GTT	2	6	185115	185120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418981
3595	NC_010159	CAG	2	6	185170	185175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3596	NC_010159	AGC	2	6	185279	185284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3597	NC_010159	CGG	2	6	185437	185442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418981
3598	NC_010159	GCA	2	6	185484	185489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3599	NC_010159	GC	3	6	185491	185496	0 %	0 %	50 %	50 %	162418981
3600	NC_010159	TGG	2	6	185552	185557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418981
3601	NC_010159	GCAG	2	8	185658	185665	25 %	0 %	50 %	25 %	162418981
3602	NC_010159	CAGCGT	2	12	185743	185754	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3603	NC_010159	GCA	2	6	185760	185765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418981
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3605	NC_010159	CGC	2	6	185821	185826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418981
3606	NC_010159	GGC	2	6	185832	185837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418981
3607	NC_010159	CATT	2	8	185912	185919	25 %	50 %	0 %	25 %	162418981
3608	NC_010159	AGG	2	6	185934	185939	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	162418981
3609	NC_010159	TGT	2	6	185942	185947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418981
3610	NC_010159	TGC	2	6	185954	185959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418981
3611	NC_010159	GAA	2	6	186111	186116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418479
3612	NC_010159	ATC	2	6	186183	186188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418479
3613	NC_010159	GTT	2	6	186228	186233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162418479
3614	NC_010159	CAG	2	6	186240	186245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418479
3615	NC_010159	TGG	2	6	186257	186262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418479
3616	NC_010159	CAG	2	6	186312	186317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418479
3617	NC_010159	GAA	2	6	186408	186413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418479
3618	NC_010159	GTA	2	6	186435	186440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418479
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3621	NC_010159	CAC	2	6	186569	186574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162418479
3622	NC_010159	CA	3	6	186597	186602	50 %	0 %	0 %	50 %	162418479
3623	NC_010159	AGC	2	6	186636	186641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418479
3624	NC_010159	CG	3	6	186761	186766	0 %	0 %	50 %	50 %	162418479
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4000	NC_010159	GTG	2	6	204433	204438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162418645

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