MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Yersinia pestis Angola chromosome

Total Repeats: 88007

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_010159	TGC	2	6	156810	156815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162421661
3002	NC_010159	CGG	2	6	156837	156842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162421661
3003	NC_010159	TCA	2	6	156879	156884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162421661
3004	NC_010159	GTTG	2	8	156929	156936	0 %	50 %	50 %	0 %	162421787
3005	NC_010159	TA	3	6	157020	157025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_010159	CGC	2	6	157133	157138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_010159	GCG	2	6	157140	157145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_010159	TGC	2	6	157197	157202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3009	NC_010159	ATTT	2	8	157215	157222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_010159	ATG	2	6	157248	157253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418954
3011	NC_010159	CAA	2	6	157260	157265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418954
3012	NC_010159	CAA	2	6	157371	157376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418954
3013	NC_010159	TGC	2	6	157417	157422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418954
3014	NC_010159	GGC	2	6	157445	157450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418954
3015	NC_010159	GAT	2	6	157461	157466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418954
3016	NC_010159	TAC	2	6	157494	157499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162418954
3017	NC_010159	A	7	7	157718	157724	100 %	0 %	0 %	0 %	162418954
3018	NC_010159	GCC	2	6	157735	157740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162418954
3019	NC_010159	ATG	2	6	157800	157805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418954
3020	NC_010159	GT	3	6	157821	157826	0 %	50 %	50 %	0 %	162418954
3021	NC_010159	GC	3	6	157899	157904	0 %	0 %	50 %	50 %	162418954
3022	NC_010159	A	6	6	157914	157919	100 %	0 %	0 %	0 %	162418954
3023	NC_010159	A	6	6	157939	157944	100 %	0 %	0 %	0 %	162418954
3024	NC_010159	TTA	2	6	157956	157961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418954
3025	NC_010159	C	6	6	157997	158002	0 %	0 %	0 %	100 %	162418954
3026	NC_010159	GGC	2	6	158016	158021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162418954
3027	NC_010159	AAG	2	6	158050	158055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418954
3028	NC_010159	CAG	2	6	158103	158108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162418954
3029	NC_010159	GAT	2	6	158196	158201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418954
3030	NC_010159	GCT	2	6	158250	158255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162418954
3031	NC_010159	TTA	2	6	158280	158285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162418954
3032	NC_010159	CAA	3	9	158316	158324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162418954
3033	NC_010159	GCA	2	6	158396	158401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_010159	T	6	6	158557	158562	0 %	100 %	0 %	0 %	162418537
3035	NC_010159	AAG	2	6	158574	158579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418537
3036	NC_010159	AAG	2	6	158650	158655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418537
3037	NC_010159	CAAA	2	8	158675	158682	75 %	0 %	0 %	25 %	162418537
3038	NC_010159	ATG	2	6	158712	158717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162418537
3039	NC_010159	AGA	2	6	158723	158728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162418537
3040	NC_010159	AGTA	2	8	158808	158815	50 %	25 %	25 %	0 %	162418537
3041	NC_010159	AAG	2	6	158870	158875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_010159	TCA	2	6	158977	158982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_010159	GAA	2	6	159001	159006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419798
3044	NC_010159	TTA	2	6	159035	159040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419798
3045	NC_010159	CAA	2	6	159055	159060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419798
3046	NC_010159	AAG	2	6	159159	159164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419798
3047	NC_010159	CGG	2	6	159279	159284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419798
3048	NC_010159	ATC	2	6	159302	159307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162419798
3049	NC_010159	TGA	2	6	159325	159330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162419798
3050	NC_010159	TCGA	2	8	159338	159345	25 %	25 %	25 %	25 %	162419798
3051	NC_010159	ACA	2	6	159411	159416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419798
3052	NC_010159	ATT	2	6	159462	159467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	162419798
3053	NC_010159	ACAAA	2	10	159472	159481	80 %	0 %	0 %	20 %	162419798
3054	NC_010159	TCGT	2	8	159515	159522	0 %	50 %	25 %	25 %	162419798
3055	NC_010159	CAG	2	6	159591	159596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419798
3056	NC_010159	GGT	2	6	159700	159705	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419798
3057	NC_010159	CCAA	2	8	159754	159761	50 %	0 %	0 %	50 %	162419798
3058	NC_010159	ATA	2	6	159789	159794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	162419798
3059	NC_010159	G	7	7	159841	159847	0 %	0 %	100 %	0 %	162419798
3060	NC_010159	CCT	2	6	159885	159890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162419798
3061	NC_010159	CGG	2	6	159895	159900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419798
3062	NC_010159	CATC	2	8	160004	160011	25 %	25 %	0 %	50 %	162419798
3063	NC_010159	CCG	2	6	160021	160026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419798
3064	NC_010159	AGA	2	6	160053	160058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419798
3065	NC_010159	CGC	2	6	160064	160069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419798
3066	NC_010159	TAA	2	6	160080	160085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_010159	AAT	2	6	160125	160130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_010159	CAG	2	6	160156	160161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_010159	A	6	6	160162	160167	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_010159	T	8	8	160279	160286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_010159	T	7	7	160336	160342	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_010159	TGT	2	6	160364	160369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162419380
3073	NC_010159	CGTAT	2	10	160462	160471	20 %	40 %	20 %	20 %	162419380
3074	NC_010159	TA	3	6	160490	160495	50 %	50 %	0 %	0 %	162419380
3075	NC_010159	CGC	2	6	160524	160529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419380
3076	NC_010159	GTG	2	6	160534	160539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419380
3077	NC_010159	GAA	2	6	160557	160562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419380
3078	NC_010159	TA	3	6	160586	160591	50 %	50 %	0 %	0 %	162419380
3079	NC_010159	GCA	2	6	160631	160636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3080	NC_010159	GAA	2	6	160723	160728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162419380
3081	NC_010159	CAAG	2	8	160749	160756	50 %	0 %	25 %	25 %	162419380
3082	NC_010159	CCA	2	6	160902	160907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419380
3083	NC_010159	CGC	2	6	160914	160919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162419380
3084	NC_010159	TGC	2	6	160946	160951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3085	NC_010159	TGC	2	6	160978	160983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3086	NC_010159	ACC	2	6	160984	160989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419380
3087	NC_010159	CTG	2	6	161014	161019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3088	NC_010159	GGT	2	6	161029	161034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162419380
3089	NC_010159	AAC	2	6	161035	161040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419380
3090	NC_010159	AGCCA	2	10	161146	161155	40 %	0 %	20 %	40 %	162419380
3091	NC_010159	GCAAA	2	10	161226	161235	60 %	0 %	20 %	20 %	162419380
3092	NC_010159	GCA	2	6	161238	161243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3093	NC_010159	GGC	2	6	161316	161321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419380
3094	NC_010159	CAC	2	6	161369	161374	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162419380
3095	NC_010159	CAG	2	6	161398	161403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419380
3096	NC_010159	AATAA	2	10	161453	161462	80 %	20 %	0 %	0 %	162419380
3097	NC_010159	ACT	2	6	161527	161532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_010159	AGA	2	6	161554	161559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	162420673
3099	NC_010159	GA	3	6	161573	161578	50 %	0 %	50 %	0 %	162420673
3100	NC_010159	ACC	2	6	161609	161614	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420673
3101	NC_010159	ATCG	2	8	161628	161635	25 %	25 %	25 %	25 %	162420673
3102	NC_010159	ATG	2	6	161700	161705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420673
3103	NC_010159	CCA	2	6	161868	161873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420673
3104	NC_010159	CTC	2	6	161902	161907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	162420673
3105	NC_010159	ATGA	2	8	161921	161928	50 %	25 %	25 %	0 %	162420673
3106	NC_010159	AGT	2	6	162002	162007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	162420673
3107	NC_010159	GGTGGC	2	12	162014	162025	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	162420673
3108	NC_010159	ATC	2	6	162084	162089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420673
3109	NC_010159	ACC	2	6	162170	162175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	162420673
3110	NC_010159	CGC	2	6	162264	162269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420673
3111	NC_010159	CGA	2	6	162283	162288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420673
3112	NC_010159	CA	3	6	162364	162369	50 %	0 %	0 %	50 %	162420673
3113	NC_010159	TCA	2	6	162541	162546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420673
3114	NC_010159	CGC	2	6	162578	162583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420673
3115	NC_010159	GCA	2	6	162609	162614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162420673
3116	NC_010159	AAC	2	6	162617	162622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420673
3117	NC_010159	TGC	2	6	162679	162684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420673
3118	NC_010159	CG	3	6	162716	162721	0 %	0 %	50 %	50 %	162420673
3119	NC_010159	TTCA	2	8	162725	162732	25 %	50 %	0 %	25 %	162420673
3120	NC_010159	GCC	2	6	162813	162818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	162420673
3121	NC_010159	CG	3	6	162861	162866	0 %	0 %	50 %	50 %	162420673
3122	NC_010159	GGT	2	6	162871	162876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420673
3123	NC_010159	C	6	6	162968	162973	0 %	0 %	0 %	100 %	162420673
3124	NC_010159	CAA	2	6	163015	163020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162420673
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3376	NC_010159	CTT	2	6	175498	175503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	162420667
3377	NC_010159	AC	3	6	175590	175595	50 %	0 %	0 %	50 %	162420667
3378	NC_010159	AG	3	6	175650	175655	50 %	0 %	50 %	0 %	162420667
3379	NC_010159	GGT	2	6	175684	175689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	162420667
3380	NC_010159	TTG	2	6	175700	175705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	162420667
3381	NC_010159	CGT	2	6	175807	175812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420667
3382	NC_010159	TCA	2	6	175841	175846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	162420667
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3384	NC_010159	CTG	2	6	175938	175943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420667
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3390	NC_010159	GA	3	6	176104	176109	50 %	0 %	50 %	0 %	162420667
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3398	NC_010159	TCAGT	2	10	176826	176835	20 %	40 %	20 %	20 %	162420092
3399	NC_010159	TGC	2	6	176843	176848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162420092
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3495	NC_010159	CCAG	2	8	181022	181029	25 %	0 %	25 %	50 %	162419253
3496	NC_010159	TGC	2	6	181045	181050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	162419253
3497	NC_010159	CGG	2	6	181055	181060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	162419253
3498	NC_010159	CAG	2	6	181188	181193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419253
3499	NC_010159	AAC	2	6	181198	181203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	162419253
3500	NC_010159	GCA	2	6	181252	181257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	162419253

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